Complete Genome Sequence of Escherichia coli Siphophage BRET.


Journal

Microbiology resource announcements
ISSN: 2576-098X
Titre abrégé: Microbiol Resour Announc
Pays: United States
ID NLM: 101728794

Informations de publication

Date de publication:
Jan 2019
Historique:
received: 09 12 2018
accepted: 07 01 2019
entrez: 5 2 2019
pubmed: 5 2 2019
medline: 5 2 2019
Statut: epublish

Résumé

The lytic Escherichia coli siphophage BRET was isolated from a chicken obtained at a local market in Abidjan, Côte d'Ivoire. Its linear genome sequence consists of 59,550 bp (43.4% GC content) and contains 88 predicted genes, including 4 involved in archaeosine biosynthesis. Phage BRET is related (95% nucleotide identity) to Enterobacteria phage JenK1.

Identifiants

pubmed: 30714038
doi: 10.1128/MRA.01644-18
pii: MRA01644-18
pmc: PMC6357644
pii:
doi:

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Références

Appl Environ Microbiol. 1994 Jun;60(6):1832-41
pubmed: 16349277
Appl Environ Microbiol. 2007 Nov;73(22):7358-66
pubmed: 17890338
Nucleic Acids Res. 2008 Jun;36(10):3420-35
pubmed: 18445632
J Comput Biol. 2010 Nov;17(11):1519-33
pubmed: 20958248
Bacteriophage. 2011 Mar;1(2):66-85
pubmed: 22334863
Viruses. 2014 Dec 19;6(12):5077-92
pubmed: 25533657
Genome Announc. 2015 Jul 16;3(4):null
pubmed: 26184932
Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Mar 15;113(11):E1452-9
pubmed: 26929322
Arch Virol. 2016 Aug;161(8):2219-26
pubmed: 27231007
Front Microbiol. 2016 Jun 08;7:882
pubmed: 27375602
RNA Biol. 2017 Sep 2;14(9):1175-1184
pubmed: 27937735
Genome Announc. 2018 Jun 21;6(25):null
pubmed: 29930030

Auteurs

Solange Ngazoa-Kakou (S)

Plateforme de Biologie Moléculaire, Département Technique & Technologie, Institut Pasteur de Côte d'Ivoire, Abidjan, Côte d'Ivoire.

Yuyu Shao (Y)

Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.
College of Food Engineering and Nutritional Science, Shaanxi Normal University, Xi'an, China.

Geneviève M Rousseau (GM)

Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.

Audrey A Addablah (AA)

Plateforme de Biologie Moléculaire, Département Technique & Technologie, Institut Pasteur de Côte d'Ivoire, Abidjan, Côte d'Ivoire.

Denise M Tremblay (DM)

Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.
Félix d'Hérelle Reference Center for Bacterial Viruses and GREB, Faculté de médecine dentaire, Université Laval, Québec, Canada.

Geoffrey Hutinet (G)

Department of Microbiology and Cell Science, University of Florida, Gainesville, Florida, USA.

Nicolas Lemire (N)

Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.

Pier-Luc Plante (PL)

Department of Molecular Medicine, Faculté de médecine, Université Laval, Québec City, Québec, Canada.

Jacques Corbeil (J)

Department of Molecular Medicine, Faculté de médecine, Université Laval, Québec City, Québec, Canada.

Aristide Koudou (A)

Plateforme de Biologie Moléculaire, Département Technique & Technologie, Institut Pasteur de Côte d'Ivoire, Abidjan, Côte d'Ivoire.

Benjamin K Soro (BK)

Plateforme de Biologie Moléculaire, Département Technique & Technologie, Institut Pasteur de Côte d'Ivoire, Abidjan, Côte d'Ivoire.

David N Coulibaly (DN)

Plateforme de Biologie Moléculaire, Département Technique & Technologie, Institut Pasteur de Côte d'Ivoire, Abidjan, Côte d'Ivoire.

Serge Aoussi (S)

Plateforme de Biologie Moléculaire, Département Technique & Technologie, Institut Pasteur de Côte d'Ivoire, Abidjan, Côte d'Ivoire.

Mireille Dosso (M)

Plateforme de Biologie Moléculaire, Département Technique & Technologie, Institut Pasteur de Côte d'Ivoire, Abidjan, Côte d'Ivoire.

Sylvain Moineau (S)

Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.
Félix d'Hérelle Reference Center for Bacterial Viruses and GREB, Faculté de médecine dentaire, Université Laval, Québec, Canada.

Classifications MeSH