Conformational Behavior of d-Lyxose in Gas and Solution Phases by Rotational and NMR Spectroscopies.


Journal

The journal of physical chemistry letters
ISSN: 1948-7185
Titre abrégé: J Phys Chem Lett
Pays: United States
ID NLM: 101526034

Informations de publication

Date de publication:
20 Jun 2019
Historique:
pubmed: 30 5 2019
medline: 30 5 2019
entrez: 30 5 2019
Statut: ppublish

Résumé

Understanding the conformational preferences of carbohydrates is crucial to explain the interactions with their biological targets and to improve their use as therapeutic agents. We present experimental data resolving the conformational landscape of the monosaccharide d-lyxose, for which quantum mechanical (QM) calculations offer model-dependent results. This study compares the structural preferences in the gas phase, determined by rotational spectroscopy, with those in solution, resolved by nuclear magnetic resonance (NMR) and molecular dynamics (MD) simulations. In contrast to QM calculations, d-lyxose adopts only pyranose forms in the gas phase, with the α-anomer exhibiting both the

Identifiants

pubmed: 31141365
doi: 10.1021/acs.jpclett.9b00978
doi:

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Pagination

3339-3345

Auteurs

Camilla Calabrese (C)

Departamento de Química Física, Facultad de Ciencia y Tecnología , Universidad del País Vasco (UPV/EHU) , 48080 Bilbao , Spain.
Instituto Biofisika (CSIC, UPV/EHU) , 48080 Bilbao , Spain.

Patricia Écija (P)

Departamento de Química Física, Facultad de Ciencia y Tecnología , Universidad del País Vasco (UPV/EHU) , 48080 Bilbao , Spain.

Ismael Compañón (I)

Departamento de Química, Centro de Investigación en Síntesis Química , Universidad de La Rioja , 26006 Logroño , Spain.

Montserrat Vallejo-López (M)

Departamento de Química Física, Facultad de Ciencia y Tecnología , Universidad del País Vasco (UPV/EHU) , 48080 Bilbao , Spain.

Álvaro Cimas (Á)

Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement, LAMBE UMR8587 , Université d'Évry val d'Essonne , 91025 Évry , France.

Maider Parra (M)

Departamento de Química Física, Facultad de Ciencia y Tecnología , Universidad del País Vasco (UPV/EHU) , 48080 Bilbao , Spain.
Instituto Biofisika (CSIC, UPV/EHU) , 48080 Bilbao , Spain.

Francisco J Basterretxea (FJ)

Departamento de Química Física, Facultad de Ciencia y Tecnología , Universidad del País Vasco (UPV/EHU) , 48080 Bilbao , Spain.

José I Santos (JI)

SGIker UPV/EHU , Centro Joxe Mari Korta , Tolosa Hiribidea 72 , 20018 Donostia , Spain.

Jesús Jiménez-Barbero (J)

Departamento de Química Orgánica II, Facultad de Ciencia y Tecnología , Universidad del País Vasco (UPV/EHU) , 48080 Bilbao , Spain.
IKERBASQUE, Basque Foundation for Science , 48009 Bilbao , Spain.
Chemical Glycobiology Laboratory, CIC bioGUNE , Bizkaia Technology Park , Building 800, 48160 Derio , Spain.

Alberto Lesarri (A)

Departamento de Química Física y Química Inorgánica-IU CINQUIMA, Facultad de Ciencias , Universidad de Valladolid , 47011 Valladolid , Spain.

Francisco Corzana (F)

Departamento de Química, Centro de Investigación en Síntesis Química , Universidad de La Rioja , 26006 Logroño , Spain.

Emilio J Cocinero (EJ)

Departamento de Química Física, Facultad de Ciencia y Tecnología , Universidad del País Vasco (UPV/EHU) , 48080 Bilbao , Spain.
Instituto Biofisika (CSIC, UPV/EHU) , 48080 Bilbao , Spain.

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