Expansion and improvement of MALDI-TOF MS databases for accurate identification of Achromobacter species.


Journal

Journal of microbiological methods
ISSN: 1872-8359
Titre abrégé: J Microbiol Methods
Pays: Netherlands
ID NLM: 8306883

Informations de publication

Date de publication:
05 2020
Historique:
received: 22 01 2020
revised: 10 03 2020
accepted: 10 03 2020
pubmed: 17 3 2020
medline: 4 6 2021
entrez: 16 3 2020
Statut: ppublish

Résumé

Different MALDI-TOF MS databases were evaluated for the identification of Achromobacter species. The in-house and extended database generated in this study rendered more accurate identification (58/64 and 57/64 isolates, respectively) in comparison with the Bruker commercial database (42/64 isolates), especially in those infrequent species that are not available or poorly represented.

Identifiants

pubmed: 32171844
pii: S0167-7012(20)30045-2
doi: 10.1016/j.mimet.2020.105889
pii:
doi:

Substances chimiques

Anti-Infective Agents 0

Types de publication

Journal Article Research Support, Non-U.S. Gov't

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

105889

Informations de copyright

Copyright © 2020 Elsevier B.V. All rights reserved.

Déclaration de conflit d'intérêts

Declaration of Competing Interest The authors declare that they have no known competing financial interests or personal relationships that could have appeared to influence the work reported in this paper.

Auteurs

Mariana Papalia (M)

Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, IBaViM, Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Junín 956, 8vo. Piso, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, CP 1113, Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina.

Roque Figueroa-Espinosa (R)

Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, IBaViM, Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Junín 956, 8vo. Piso, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, CP 1113, Argentina.

Carla Steffanowski (C)

Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, IBaViM, Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Junín 956, 8vo. Piso, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, CP 1113, Argentina.

Claudia Barberis (C)

Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, Hospital de Clínicas José de San Martín, Departamento de Bioquímica Clínica, Laboratorio de Bacteriología Clínica, Av. Córdoba 2351, 1er. piso, Ciudad Autónoma de Buenos Aires CP1113, Argentina.

Marisa Almuzara (M)

Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, Hospital de Clínicas José de San Martín, Departamento de Bioquímica Clínica, Laboratorio de Bacteriología Clínica, Av. Córdoba 2351, 1er. piso, Ciudad Autónoma de Buenos Aires CP1113, Argentina.

Rubén Barrios (R)

BD Life Science, Argentina.

Carlos Vay (C)

Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, Hospital de Clínicas José de San Martín, Departamento de Bioquímica Clínica, Laboratorio de Bacteriología Clínica, Av. Córdoba 2351, 1er. piso, Ciudad Autónoma de Buenos Aires CP1113, Argentina.

Gabriel Gutkind (G)

Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, IBaViM, Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Junín 956, 8vo. Piso, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, CP 1113, Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina.

José Di Conza (J)

Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, IBaViM, Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Junín 956, 8vo. Piso, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, CP 1113, Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina.

Marcela Radice (M)

Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquímica, IBaViM, Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Junín 956, 8vo. Piso, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, CP 1113, Argentina; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Argentina. Electronic address: mradice@ffyb.uba.ar.

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