The InBIO Barcoding Initiative Database: DNA barcodes of Portuguese Diptera 01.

Diptera COI DNA barcode continental Portugal occurrence records

Journal

Biodiversity data journal
ISSN: 1314-2828
Titre abrégé: Biodivers Data J
Pays: Bulgaria
ID NLM: 101619899

Informations de publication

Date de publication:
2020
Historique:
received: 08 01 2020
accepted: 21 02 2020
entrez: 8 4 2020
pubmed: 8 4 2020
medline: 8 4 2020
Statut: epublish

Résumé

The InBIO Barcoding Initiative (IBI) Diptera 01 dataset contains records of 203 specimens of Diptera. All specimens have been morphologically identified to species level, and belong to 154 species in total. The species represented in this dataset correspond to about 10% of continental Portugal dipteran species diversity. All specimens were collected north of the Tagus river in Portugal. Sampling took place from 2014 to 2018, and specimens are deposited in the IBI collection at CIBIO, Research Center in Biodiversity and Genetic Resources. This dataset contributes to the knowledge on the DNA barcodes and distribution of 154 species of Diptera from Portugal and is the first of the planned IBI database public releases, which will make available genetic and distribution data for a series of taxa. All specimens have their DNA barcodes made publicly available in the Barcode of Life Data System (BOLD) online database and the distribution dataset can be freely accessed through the Global Biodiversity Information Facility (GBIF).

Sections du résumé

BACKGROUND BACKGROUND
The InBIO Barcoding Initiative (IBI) Diptera 01 dataset contains records of 203 specimens of Diptera. All specimens have been morphologically identified to species level, and belong to 154 species in total. The species represented in this dataset correspond to about 10% of continental Portugal dipteran species diversity. All specimens were collected north of the Tagus river in Portugal. Sampling took place from 2014 to 2018, and specimens are deposited in the IBI collection at CIBIO, Research Center in Biodiversity and Genetic Resources.
NEW INFORMATION CONCLUSIONS
This dataset contributes to the knowledge on the DNA barcodes and distribution of 154 species of Diptera from Portugal and is the first of the planned IBI database public releases, which will make available genetic and distribution data for a series of taxa. All specimens have their DNA barcodes made publicly available in the Barcode of Life Data System (BOLD) online database and the distribution dataset can be freely accessed through the Global Biodiversity Information Facility (GBIF).

Identifiants

pubmed: 32256158
doi: 10.3897/BDJ.8.e49985
pii: 49985
pmc: PMC7101446
doi:

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Pagination

e49985

Informations de copyright

Sonia A Ferreira, Rui Andrade, Ana R Gonçalves, Pedro Sousa, Joana Paupério, Nuno A Fonseca, Pedro Beja.

Références

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pubmed: 27009885
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Mol Mar Biol Biotechnol. 1994 Oct;3(5):294-9
pubmed: 7881515

Auteurs

Sonia A Ferreira (SA)

CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.

Rui Andrade (R)

Rua Calouste Gulbenkian 237 4H3, 4050-145, Porto, Portugal Rua Calouste Gulbenkian 237 4H3, 4050-145 Porto Portugal.

Ana R Gonçalves (AR)

Computational Biology and Population Genomics Group, cE3c, Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa, Campo Grande, 1749-016, Lisboa, Portugal Computational Biology and Population Genomics Group, cE3c, Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa, Campo Grande, 1749-016 Lisboa Portugal.

Pedro Sousa (P)

CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.

Joana Paupério (J)

CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.

Nuno A Fonseca (NA)

CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.

Pedro Beja (P)

CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão, Vila do Conde, Portugal CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão Vila do Conde Portugal.
CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa, Tapada da Ajuda, 1349-017, Lisboa, Portugal CIBIO/InBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa, Tapada da Ajuda, 1349-017 Lisboa Portugal.

Classifications MeSH