Ancient genomes from present-day France unveil 7,000 years of its demographic history.


Journal

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
ISSN: 1091-6490
Titre abrégé: Proc Natl Acad Sci U S A
Pays: United States
ID NLM: 7505876

Informations de publication

Date de publication:
09 06 2020
Historique:
pubmed: 28 5 2020
medline: 25 8 2020
entrez: 28 5 2020
Statut: ppublish

Résumé

Genomic studies conducted on ancient individuals across Europe have revealed how migrations have contributed to its present genetic landscape, but the territory of present-day France has yet to be connected to the broader European picture. We generated a large dataset comprising the complete mitochondrial genomes, Y-chromosome markers, and genotypes of a number of nuclear loci of interest of 243 individuals sampled across present-day France over a period spanning 7,000 y, complemented with a partially overlapping dataset of 58 low-coverage genomes. This panel provides a high-resolution transect of the dynamics of maternal and paternal lineages in France as well as of autosomal genotypes. Parental lineages and genomic data both revealed demographic patterns in France for the Neolithic and Bronze Age transitions consistent with neighboring regions, first with a migration wave of Anatolian farmers followed by varying degrees of admixture with autochthonous hunter-gatherers, and then substantial gene flow from individuals deriving part of their ancestry from the Pontic steppe at the onset of the Bronze Age. Our data have also highlighted the persistence of Magdalenian-associated ancestry in hunter-gatherer populations outside of Spain and thus provide arguments for an expansion of these populations at the end of the Paleolithic Period more northerly than what has been described so far. Finally, no major demographic changes were detected during the transition between the Bronze and Iron Ages.

Identifiants

pubmed: 32457149
pii: 1918034117
doi: 10.1073/pnas.1918034117
pmc: PMC7293694
doi:

Substances chimiques

DNA, Ancient 0
DNA, Mitochondrial 0

Types de publication

Journal Article Research Support, Non-U.S. Gov't

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

12791-12798

Déclaration de conflit d'intérêts

The authors declare no competing interest.

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Auteurs

Samantha Brunel (S)

Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, 75205 Paris Cedex 13, France.

E Andrew Bennett (EA)

Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, 75205 Paris Cedex 13, France.

Laurent Cardin (L)

Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, 75205 Paris Cedex 13, France.
Institut de Recherche Criminelle de la Gendarmerie Nationale, 95000 Pontoise, France.

Damien Garraud (D)

Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, 75205 Paris Cedex 13, France.
Institut de Recherche Criminelle de la Gendarmerie Nationale, 95000 Pontoise, France.

Hélène Barrand Emam (H)

ANTEA-Archéologie, 68440 Habsheim, France.
UMR 7044 Archéologie et Histoire ancienne: Méditerranée - Europe (ArcHiMèdE), CNRS, Université de Strasbourg , 67083 Strasbourg Cedex, France.

Alexandre Beylier (A)

Service Archéologie Sète Agglopôle Mediterranée, 34110 Frontignan, France.
UMR 5140 Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), CNRS, Université Paul Valéry Montpellier 3, 34199 Montpellier, France.

Bruno Boulestin (B)

UMR 5199 De la Préhistoire à l'Actuel: Culture, Environnement et Anthropologie (PACEA), CNRS, Université de Bordeaux, 33615 Pessac Cedex, France.

Fanny Chenal (F)

UMR 7044 Archéologie et Histoire ancienne: Méditerranée - Europe (ArcHiMèdE), CNRS, Université de Strasbourg , 67083 Strasbourg Cedex, France.
Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.

Elsa Ciesielski (E)

UMR 5140 Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), CNRS, Université Paul Valéry Montpellier 3, 34199 Montpellier, France.

Fabien Convertini (F)

UMR 5140 Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), CNRS, Université Paul Valéry Montpellier 3, 34199 Montpellier, France.
Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.

Bernard Dedet (B)

UMR 5140 Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), CNRS, Université Paul Valéry Montpellier 3, 34199 Montpellier, France.

Stéphanie Desbrosse-Degobertiere (S)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.

Sophie Desenne (S)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.
UMR 8215 Trajectoires, CNRS, Université Paris 1 Pantheon Sorbonne, 92023 Nanterre, France.

Jerôme Dubouloz (J)

UMR 8215 Trajectoires, CNRS, Université Paris 1 Pantheon Sorbonne, 92023 Nanterre, France.

Henri Duday (H)

UMR 5199 De la Préhistoire à l'Actuel: Culture, Environnement et Anthropologie (PACEA), CNRS, Université de Bordeaux, 33615 Pessac Cedex, France.

Gilles Escalon (G)

UMR 5140 Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), CNRS, Université Paul Valéry Montpellier 3, 34199 Montpellier, France.
Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.

Véronique Fabre (V)

UMR 5140 Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), CNRS, Université Paul Valéry Montpellier 3, 34199 Montpellier, France.
Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.

Eric Gailledrat (E)

UMR 5140 Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), CNRS, Université Paul Valéry Montpellier 3, 34199 Montpellier, France.

Muriel Gandelin (M)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.
UMR 5608 Travaux et Recherches Archéologiques sur les Cultures, les Espaces et les Sociétés (TRACES), CNRS, Université de Toulouse II, 31058 Toulouse, France.

Yves Gleize (Y)

UMR 5199 De la Préhistoire à l'Actuel: Culture, Environnement et Anthropologie (PACEA), CNRS, Université de Bordeaux, 33615 Pessac Cedex, France.
Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.

Sébastien Goepfert (S)

ANTEA-Archéologie, 68440 Habsheim, France.

Jean Guilaine (J)

UMR 5608 Travaux et Recherches Archéologiques sur les Cultures, les Espaces et les Sociétés (TRACES), CNRS, Université de Toulouse II, 31058 Toulouse, France.
Collège de France, 75231 Paris cedex 05.

Lamys Hachem (L)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.
UMR 8215 Trajectoires, CNRS, Université Paris 1 Pantheon Sorbonne, 92023 Nanterre, France.

Michael Ilett (M)

UMR 8215 Trajectoires, CNRS, Université Paris 1 Pantheon Sorbonne, 92023 Nanterre, France.

François Lambach (F)

UMR 5199 De la Préhistoire à l'Actuel: Culture, Environnement et Anthropologie (PACEA), CNRS, Université de Bordeaux, 33615 Pessac Cedex, France.

Florent Maziere (F)

UMR 5140 Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), CNRS, Université Paul Valéry Montpellier 3, 34199 Montpellier, France.
Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.

Bertrand Perrin (B)

ANTEA-Archéologie, 68440 Habsheim, France.
UMR 7044 Archéologie et Histoire ancienne: Méditerranée - Europe (ArcHiMèdE), CNRS, Université de Strasbourg , 67083 Strasbourg Cedex, France.

Suzanne Plouin (S)

UMR 7044 Archéologie et Histoire ancienne: Méditerranée - Europe (ArcHiMèdE), CNRS, Université de Strasbourg , 67083 Strasbourg Cedex, France.

Estelle Pinard (E)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.
UMR 8215 Trajectoires, CNRS, Université Paris 1 Pantheon Sorbonne, 92023 Nanterre, France.

Ivan Praud (I)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.
UMR 8215 Trajectoires, CNRS, Université Paris 1 Pantheon Sorbonne, 92023 Nanterre, France.

Isabelle Richard (I)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.
UMR 7264 Cultures et Environnements Préhistoire, Antiquité, Moyen Âge (CEPAM), CNRS, Université Nice Sophia Antipolis, 06357 Nice Cedex 4, France.

Vincent Riquier (V)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.
UMR 8215 Trajectoires, CNRS, Université Paris 1 Pantheon Sorbonne, 92023 Nanterre, France.

Réjane Roure (R)

UMR 5140 Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), CNRS, Université Paul Valéry Montpellier 3, 34199 Montpellier, France.

Benoit Sendra (B)

UMR 5140 Archéologie des Sociétés Méditerranéennes (ASM), CNRS, Université Paul Valéry Montpellier 3, 34199 Montpellier, France.
Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.

Corinne Thevenet (C)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.
UMR 8215 Trajectoires, CNRS, Université Paris 1 Pantheon Sorbonne, 92023 Nanterre, France.

Sandrine Thiol (S)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.

Elisabeth Vauquelin (E)

Institut National de Recherches Archéologiques Préventives (INRAP), 75685 Paris Cedex 14, France.

Luc Vergnaud (L)

ANTEA-Archéologie, 68440 Habsheim, France.
UMR 7044 Archéologie et Histoire ancienne: Méditerranée - Europe (ArcHiMèdE), CNRS, Université de Strasbourg , 67083 Strasbourg Cedex, France.

Thierry Grange (T)

Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, 75205 Paris Cedex 13, France thierry.grange@ijm.fr eva-maria.geigl@ijm.fr melanie.pruvost@u-bordeaux.fr.

Eva-Maria Geigl (EM)

Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, 75205 Paris Cedex 13, France thierry.grange@ijm.fr eva-maria.geigl@ijm.fr melanie.pruvost@u-bordeaux.fr.

Melanie Pruvost (M)

Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, UMR 7592, 75205 Paris Cedex 13, France thierry.grange@ijm.fr eva-maria.geigl@ijm.fr melanie.pruvost@u-bordeaux.fr.
UMR 5199 De la Préhistoire à l'Actuel: Culture, Environnement et Anthropologie (PACEA), CNRS, Université de Bordeaux, 33615 Pessac Cedex, France.

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