Environmental Sampling for Avian Influenza Virus Detection in Commercial Layer Facilities.

The present study was designed to evaluate the utility of environmental samples for convenient but accurate detection of avian influenza virus (AIV) in commercial poultry houses. First, environmental samples from AIV-negative commercial layer facilities were spiked with an H5N2 low pathogenic AIV and were evaluated for their effect on the detection of viral RNA immediately or after incubation at -20 C, 4 C, 22 C, or 37 C for 24, 48, or 72 hr. Second, Swiffer pads, drag swabs, and boot cover swabs were evaluated for their efficiency in collecting feces and water spiked with the H5N2 LPAIV under a condition simulated for a poultry facility floor. Third, environmental samples collected from commercial layer facilities that experienced an H5N2 highly pathogenic AIV outbreak in 2014-15 were evaluated for the effect of sampling locations on AIV detection. The half-life of AIV was comparable across all environmental samples but decreased with increasing temperatures. Additionally, sampling devices did not differ significantly in their ability to collect AIV-spiked environmental samples from a concrete floor for viral RNA detection. Some locations within a poultry house, such as cages, egg belts, house floor, manure belts, and manure pits, were better choices for sampling than other locations (feed trough, ventilation fan, and water trays) to detect AIV RNA after cleaning and disinfection. Samples representing cages, floor, and manure belts yielded significantly more PCR positives than the other environmental samples. In conclusion, environmental samples can be routinely collected from a poultry barn as noninvasive samples for monitoring AIV. Muestreo ambiental para la detección del virus de la influenza aviar en instalaciones de aves de postura comerciales. El presente estudio fue diseñado para evaluar la utilidad de las muestras ambientales para la detección rápida pero precisa del virus de la influenza aviar (AIV) en casetas avícolas comerciales. Primero, muestras ambientales de las instalaciones comerciales de aves de postura negativas para influenza aviar se inocularon con un virus de la influenza de baja patogenicidad (LPAIV) H5N2 y se evaluaron para determinar su efecto en la detección de ARN viral inmediatamente o después de la incubación a -20 C, 4 C, 22 C o 37 C durante 24 hr, 48 hr o 72 horas. En segundo lugar, se evaluaron las esponjas marca Swiffer, los hisopos de arrastre y los cubre botas para muestreo ambiental para determinar su eficiencia en la recolección de heces y agua inoculada con el virus de influenza aviar de baja patogenicidad H5N2 en una condición simulada de piso de una instalación avícola. En tercer lugar, muestras ambientales recolectadas de instalaciones comerciales de ponedoras que experimentaron un brote de influenza aviar altamente patógena H5N2 en 2014-15, se evaluaron para determinar el efecto de la ubicación de muestreo en la detección de influenza aviar. La vida media del virus de la influenza aviar fue comparable en todas las muestras ambientales, pero disminuyó con el aumento de la temperatura. Además, los dispositivos de muestreo no difirieron significativamente en su capacidad para recolectar muestras ambientales inoculadas con influenza aviar de un piso de concreto para la detección de ARN viral. Algunas ubicaciones dentro de la caseta aviar, como jaulas, bandas transportadoras de huevo, piso de la caseta, bandas transportadoras de gallinasa y fosas de gallinasa, fueron las mejores opciones para el muestreo en comparación con otras ubicaciones (comederos, ventiladores y bandejas de agua) para detectar el ARN del virus de influenza después de la limpieza y desinfección. Las muestras que representan jaulas, piso y bandas transportadoras de gallinasa arrojaron significativamente más resultados positivos de PCR que las otras muestras ambientales. En conclusión, las muestras ambientales se pueden recolectar rutinariamente de uns granja avícola como muestras no invasivas para monitorear al virus de influenza aviar.