Distribution of HPV genotypes among women with abnormal cytology results in Alberta, Canada.

HPV genotypes genotype distribution human papillomavirus (HPV)

Journal

Journal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada = Journal officiel de l'Association pour la microbiologie medicale et l'infectiologie Canada
ISSN: 2371-0888
Titre abrégé: J Assoc Med Microbiol Infect Dis Can
Pays: Canada
ID NLM: 101763536

Informations de publication

Date de publication:
Jun 2021
Historique:
received: 24 11 2020
accepted: 21 02 2021
entrez: 7 11 2022
pubmed: 20 7 2021
medline: 20 7 2021
Statut: epublish

Résumé

Persistent infection with a subset of human papillomavirus (HPV) genotypes can cause abnormal cytology and invasive cervical cancer. This study examines the circulating HPV genotype strains in a local population of the province of Alberta (a largely unvaccinated population) to establish baseline frequency of vaccine and non-vaccine genotypes causing abnormal cervical cytology. Remnant liquid-based cytology specimens from the Alberta Cervical Cancer Screening Program (March 2014-January 2016) were examined. Only specimens from women who had a cytology grading of atypical squamous cells of undetermined significance or higher were included. HPV genotype was determined for all samples, and results were stratified by demographics and cytology results. Forty-four unique HPV genotypes were identified from 4,794 samples. Of the 4,241 samples with a genotype identified, the most common genotypes were HPV 16, 18, 31, and 51, with 1,599 (37.7%), 441 (12.2%), 329 (7.8%), and 354 (8.4%), respectively. HPV9 vaccine genotypes made up 73.2% of these genotyped samples. Compared with specimens in which HPV9 vaccine genotypes were not detected, those with a genotype covered by the HPV9 vaccine were from younger women (33 [interquartile range {IQR] 28 to 42] y versus 40 [IQR 32 to 51] y; The baseline distribution of HPV genotypes in this largely unvaccinated population indicates that the HPV9 vaccine provides good protection from high-risk HPV infections. Determining the frequency of genotypes causing abnormal cytology in this population post-vaccine implementation will be important to assess efficacy of vaccination and monitor for any potential genotype replacement. L’infection persistante par un sous-groupe de génotypes du virus du papillome humain (VPH) peut être responsable d’une cytologie anormale et d’un cancer invasif du col de l’utérus. La présente étude porte sur les souches du génotype du VPH en circulation dans une population locale de la province de l’Alberta (largement non vaccinée) pour établir la fréquence de base des génotypes vaccinaux et non vaccinaux responsables de cytologies du col de l’utérus anormales. Les chercheurs ont examiné les résidus de prélèvement de cytologie en milieu liquide du programme albertain de dépistage du cancer du col de l’utérus (de mars 2014 à janvier 2016). Seuls les prélèvements de femmes dont la cytologie était classée d’après la présence de cellules squameuses (ou malpighiennes) atypiques à caractère non déterminé ou plus graves ont été retenus. Les chercheurs ont déterminé le génotype du VPH de tous les prélèvements et stratifié les résultats selon les résultats démographiques et cytologiques. Les chercheurs ont retenu 44 génotypes uniques du VPH à partir de 4 794 prélèvements. Les VPH 16, 18, 31 et 51 étaient les principaux génotypes observés, correspondant à 1 599 (37,7 %), 441 (12,2 %), 329 (7,8 %) et 354 (8,4 %) cas, respectivement. Les génotypes du vaccin contre le VPH9 représentaient 73,2 % des prélèvements. Par rapport aux prélèvements dans lesquels les génotypes du vaccin contre le VPH9 n’avaient pas été décelés, ceux dont le génotype était couvert par le vaccin contre le VPH9 provenaient de femmes plus jeunes (33 ans [plage interquartile {PIQ} de 28 à 42] par rapport à 40 ans chez les autres [PIQ de 32 à 51]; Selon la distribution de référence des génotypes du VPH dans cette population largement non vaccinée, le vaccin contre le VPH9 assure une bonne protection contre les infections à VPH à haut risque. Il sera important de déterminer la fréquence des génotypes responsables d’une cytologie anormale dans cette population après l’adoption du vaccin pour en évaluer l’efficacité et surveiller le remplacement potentiel des génotypes.

Sections du résumé

Background UNASSIGNED
Persistent infection with a subset of human papillomavirus (HPV) genotypes can cause abnormal cytology and invasive cervical cancer. This study examines the circulating HPV genotype strains in a local population of the province of Alberta (a largely unvaccinated population) to establish baseline frequency of vaccine and non-vaccine genotypes causing abnormal cervical cytology.
Method UNASSIGNED
Remnant liquid-based cytology specimens from the Alberta Cervical Cancer Screening Program (March 2014-January 2016) were examined. Only specimens from women who had a cytology grading of atypical squamous cells of undetermined significance or higher were included. HPV genotype was determined for all samples, and results were stratified by demographics and cytology results.
Results UNASSIGNED
Forty-four unique HPV genotypes were identified from 4,794 samples. Of the 4,241 samples with a genotype identified, the most common genotypes were HPV 16, 18, 31, and 51, with 1,599 (37.7%), 441 (12.2%), 329 (7.8%), and 354 (8.4%), respectively. HPV9 vaccine genotypes made up 73.2% of these genotyped samples. Compared with specimens in which HPV9 vaccine genotypes were not detected, those with a genotype covered by the HPV9 vaccine were from younger women (33 [interquartile range {IQR] 28 to 42] y versus 40 [IQR 32 to 51] y;
Conclusions UNASSIGNED
The baseline distribution of HPV genotypes in this largely unvaccinated population indicates that the HPV9 vaccine provides good protection from high-risk HPV infections. Determining the frequency of genotypes causing abnormal cytology in this population post-vaccine implementation will be important to assess efficacy of vaccination and monitor for any potential genotype replacement.
Historique UNASSIGNED
L’infection persistante par un sous-groupe de génotypes du virus du papillome humain (VPH) peut être responsable d’une cytologie anormale et d’un cancer invasif du col de l’utérus. La présente étude porte sur les souches du génotype du VPH en circulation dans une population locale de la province de l’Alberta (largement non vaccinée) pour établir la fréquence de base des génotypes vaccinaux et non vaccinaux responsables de cytologies du col de l’utérus anormales.
Méthodologie UNASSIGNED
Les chercheurs ont examiné les résidus de prélèvement de cytologie en milieu liquide du programme albertain de dépistage du cancer du col de l’utérus (de mars 2014 à janvier 2016). Seuls les prélèvements de femmes dont la cytologie était classée d’après la présence de cellules squameuses (ou malpighiennes) atypiques à caractère non déterminé ou plus graves ont été retenus. Les chercheurs ont déterminé le génotype du VPH de tous les prélèvements et stratifié les résultats selon les résultats démographiques et cytologiques.
Résultats UNASSIGNED
Les chercheurs ont retenu 44 génotypes uniques du VPH à partir de 4 794 prélèvements. Les VPH 16, 18, 31 et 51 étaient les principaux génotypes observés, correspondant à 1 599 (37,7 %), 441 (12,2 %), 329 (7,8 %) et 354 (8,4 %) cas, respectivement. Les génotypes du vaccin contre le VPH9 représentaient 73,2 % des prélèvements. Par rapport aux prélèvements dans lesquels les génotypes du vaccin contre le VPH9 n’avaient pas été décelés, ceux dont le génotype était couvert par le vaccin contre le VPH9 provenaient de femmes plus jeunes (33 ans [plage interquartile {PIQ} de 28 à 42] par rapport à 40 ans chez les autres [PIQ de 32 à 51];
Conclusion UNASSIGNED
Selon la distribution de référence des génotypes du VPH dans cette population largement non vaccinée, le vaccin contre le VPH9 assure une bonne protection contre les infections à VPH à haut risque. Il sera important de déterminer la fréquence des génotypes responsables d’une cytologie anormale dans cette population après l’adoption du vaccin pour en évaluer l’efficacité et surveiller le remplacement potentiel des génotypes.

Autres résumés

Type: Publisher (fre)
L’infection persistante par un sous-groupe de génotypes du virus du papillome humain (VPH) peut être responsable d’une cytologie anormale et d’un cancer invasif du col de l’utérus. La présente étude porte sur les souches du génotype du VPH en circulation dans une population locale de la province de l’Alberta (largement non vaccinée) pour établir la fréquence de base des génotypes vaccinaux et non vaccinaux responsables de cytologies du col de l’utérus anormales.

Identifiants

pubmed: 36341027
doi: 10.3138/jammi-2020-0048
pmc: PMC9608700
doi:

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Pagination

94-103

Informations de copyright

Copyright © 2021, Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada (AMMI Canada).

Déclaration de conflit d'intérêts

CLC received grant funding from both Merck and Alberta Health for this study and outside the submitted work.

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Auteurs

Sabrina S Plitt (SS)

Centre for Communicable Diseases and Infection Control, Public Health Agency of Canada, Ottawa, Ontario, Canada.
School of Public Health, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada.

Ryan Kichuk (R)

Department of Medical Microbiology and Immunology, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada.

Sheena Geier (S)

Department of Laboratory Medicine, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada.

Trenton Smith (T)

School of Public Health, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada.

Felicia Roy (F)

National Microbiology Laboratory, Public Health Agency of Canada, Winnipeg, Manitoba, Canada.

Alberto Severini (A)

National Microbiology Laboratory, Public Health Agency of Canada, Winnipeg, Manitoba, Canada.
Department of Medical Microbiology, Faculty of Health Sciences, University of Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Canada.

Carmen L Charlton (CL)

Department of Laboratory Medicine, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada.
Public Health Laboratory (ProvLab), Edmonton, Alberta, Canada.
Li Ka Shing Institute for Virology, Edmonton, Alberta, Canada.

Classifications MeSH