How Single Site Mutations Can Help Understanding Structure Formation of Amyloid β
F19−L34 contact
amyloid β1−40
oligomers
single site mutation
structure formation
Journal
Macromolecular bioscience
ISSN: 1616-5195
Titre abrégé: Macromol Biosci
Pays: Germany
ID NLM: 101135941
Informations de publication
Date de publication:
05 2023
05 2023
Historique:
revised:
26
01
2023
received:
11
11
2022
medline:
18
5
2023
pubmed:
18
2
2023
entrez:
17
2
2023
Statut:
ppublish
Résumé
Amyloid fibrils represent the structural endpoint on the energetic (mis)folding landscape of very many proteins. Physiologically, amyloid fibrils are observed as a characteristic hallmark in misfolding diseases often associated with degenerative and neurodegenerative disorders. In the beginning of the scientific discussion, the focus is laid on the fibrillar state, but over the time it becomes increasingly clear that low molecular weight and transient aggregates are of crucial importance for pathological mechanisms. Structural studies find different intra- and intermolecular contacts for the most well-studied peptide amyloid β (Aβ) depending on the stage of fibrillation. In particular, the contact between residues phenylalanine 19 (F19) and leucine 34 (L34) seems to be highly conserved, suggesting that it must be of particular significance for Aβ misfolding and possibly the pathological properties of the peptide. This review aims to highlight the rational and the usefulness of point mutations in Aβ peptides and their impact on the critical interstrand contact F19-L34 depending on the stage of fibrillation. While the amyloid structure of Aβ is very robust against quite a few modifications, the toxicity of mutated Aβ molecules highly depends on the F19-L34 contact.
Identifiants
pubmed: 36798995
doi: 10.1002/mabi.202200489
doi:
Substances chimiques
Amyloid beta-Peptides
0
Amyloid
0
Peptide Fragments
0
Types de publication
Journal Article
Review
Research Support, Non-U.S. Gov't
Langues
eng
Sous-ensembles de citation
IM
Pagination
e2200489Informations de copyright
© 2023 The Authors. Macromolecular Bioscience published by Wiley-VCH GmbH.
Références
Y.-J. Wang, H.-D. Zhou, X.-F. Zhou, Drug Discovery Today 2006, 11, 931.
a) F. U. Hartl, A. Bracher, M. Hayer-Hartl, Nature 2011, 475, 324;
b) K. Schneider, A. Bertolotti, J. Cell Sci. 2015, 128, 3861.
a) E. Stroo, M. Koopman, E. A. A. Nollen, A. Mata-Cabana, Front. Neurosci. 2017, 11, 64;
b) T. Sinnige, Chem. Sci. 2022, 13, 7080;
c) E. H. Koo, P. T. Lansbury, J. W. Kelly, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999, 96, 9989;
d) G. Limorenko, H. A. Lashuel, Chem. Soc. Rev. 2022, 51, 513.
D. Cox, C. Raeburn, X. Sui, D. M. Hatters, Semin. Cell Dev. Biol. 2020, 99, 40.
D. Otzen, R. Riek, Cold Spring Harbor Perspect. Biol. 2019, 11, 263.
N. Balasco, C. Diaferia, G. Morelli, L. Vitagliano, A. Accardo, Front. Bioeng. Biotechnol. 2021, 9, 641372.
J. Adamcik, R. Mezzenga, Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2018, 57, 8370.
a) V. Vetri, V. Foderà, FEBS Lett. 2015, 589, 2448;
b) M. R. H. Krebs, K. R. Domike, A. M. Donald, Biochem. Soc. Trans. 2009, 37, 682.
C. B. Anfinsen, Science 1973, 181, 223.
M. Fändrich, M. A. Fletcher, C. M. Dobson, Nature 2001, 410, 165.
M. Sunde, C. C. Blake in Advances in Protein Chemistry, Vol. 50 (Ed: R. Wetzel), Academic Press, San Diego 1997, pp. 123-159.
a) M. R. Sawaya, S. Sambashivan, R. Nelson, M. I. Ivanova, S. A. Sievers, M. I. Apostol, M. J. Thompson, M. Balbirnie, J. J. W. Wiltzius, H. T. McFarlane, A. Ø. Madsen, C. Riekel, D. Eisenberg, Nature 2007, 447, 453;
b) M. McDonald, H. Box, W. Bian, A. Kendall, R. Tycko, G. Stubbs, J. Mol. Biol. 2012, 423, 454.
K. L. Morris, L. C. Serpell, in Methods in Molecular Biology, Vol. 849 (Eds: E. M. Sigurdsson, M. Calero, M. Gasset), Humana Press, Totowa, NJ 2012, pp. 121-135.
a) V. Lattanzi, I. André, U. Gasser, M. Dubackic, U. Olsson, S. Linse, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2021, 118, e2112783118;
b) J.-M. Lin, T.-L. Lin, U.-S. Jeng, Z.-H. Huang, Y.-S. Huang, Soft Matter 2009, 5, 3913;
c) T. Narayanan, A. Rüter, U. Olsson, Front. Bioeng. Biotechnol. 2021, 9, 654349.
a) A. Wickramasinghe, Y. Xiao, N. Kobayashi, S. Wang, K. P. Scherpelz, T. Yamazaki, S. C. Meredith, Y. Ishii, J. Am. Chem. Soc. 2021, 143, 11462;
b) J. J. Balbach, A. T. Petkova, N. A. Oyler, O. N. Antzutkin, D. J. Gordon, S. C. Meredith, R. Tycko, Biophys. J. 2002, 83, 1205;
c) M. D. Tuttle, G. Comellas, A. J. Nieuwkoop, D. J. Covell, D. A. Berthold, K. D. Kloepper, J. M. Courtney, J. K. Kim, A. M. Barclay, A. Kendall, W. Wan, G. Stubbs, C. D. Schwieters, V. M. Y. Lee, J. M. George, C. M. Rienstra, Nat. Struct. Mol. Biol. 2016, 23, 409;
d) F. Ravotti, M. A. Wälti, P. Güntert, R. Riek, A. Böckmann, B. H. Meier, Biomol. NMR Assignments 2016, 10, 269;
e) B. H. Meier, R. Riek, A. Böckmann, Trends Biochem. Sci. 2017, 42, 777.
C. P. Jaroniec, J. Magn. Reson. 2019, 306, 42.
A. W. P. Fitzpatrick, G. T. Debelouchina, M. J. Bayro, D. K. Clare, M. A. Caporini, V. S. Bajaj, C. P. Jaroniec, L. Wang, V. Ladizhansky, S. A. Müller, C. E. MacPhee, C. A. Waudby, H. R. Mott, A. de Simone, T. P. J. Knowles, H. R. Saibil, M. Vendruscolo, E. V. Orlova, R. G. Griffin, C. M. Dobson, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013, 110, 5468.
M. Kollmer, W. Close, L. Funk, J. Rasmussen, A. Bsoul, A. Schierhorn, M. Schmidt, C. J. Sigurdson, M. Jucker, M. Fändrich, Nat. Commun. 2019, 10, 4760.
A. W. Fitzpatrick, H. R. Saibil, Curr. Opin. Struct. Biol. 2019, 58, 34.
C. Röder, T. Kupreichyk, L. Gremer, L. U. Schäfer, K. R. Pothula, R. B. G. Ravelli, D. Willbold, W. Hoyer, G. F. Schröder, Nat. Struct. Mol. Biol. 2020, 27, 660.
L. Gremer, D. Schölzel, C. Schenk, E. Reinartz, J. Labahn, R. B. G. Ravelli, M. Tusche, C. Lopez-Iglesias, W. Hoyer, H. Heise, D. Willbold, G. F. Schröder, Science 2017, 358, 116.
J. D. Harper, S. S. Wong, C. M. Lieber, P. T. Lansbury, Chem. Biol. 1997, 4, 119.
I. Bertini, L. Gonnelli, C. Luchinat, J. Mao, A. Nesi, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 16013.
a) R. Tycko, Cold Spring Harbor Perspect. Med. 2016, 6, a024083;
b) R. Tycko, R. B. Wickner, Acc. Chem. Res. 2013, 46, 1487.
U. Ghosh, K. R. Thurber, W.-M. Yau, R. Tycko, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2021, 118, e2023089118.
J.-X. Lu, W. Qiang, W.-M. Yau, C. D. Schwieters, S. C. Meredith, R. Tycko, Cell 2013, 154, 1257.
A. K. Paravastu, R. D. Leapman, W.-M. Yau, R. Tycko, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008, 105, 18349.
S. Shivaprasad, R. Wetzel, J. Biol. Chem. 2006, 281, 993.
A. D. Williams, S. Shivaprasad, R. Wetzel, J. Mol. Biol. 2006, 357, 1283.
A. D. Williams, E. Portelius, I. Kheterpal, J. Guo, K. D. Cook, Y. Xu, R. Wetzel, J. Mol. Biol. 2004, 335, 833.
A. I. P. Taylor, R. A. Staniforth, Front. Neurosci. 2022, 16, 878869.
A. T. Petkova, Y. Ishii, J. J. Balbach, O. N. Antzutkin, R. D. Leapman, F. Delaglio, R. Tycko, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 16742.
W. Qiang, W.-M. Yau, Y. Luo, M. P. Mattson, R. Tycko, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109, 4443.
a) F. Chiti, C. M. Dobson, Annu. Rev. Biochem. 2017, 86, 27;
b) C. M. Dobson, Nature 2003, 426, 884;
c) D. J. Selkoe, Nature 2003, 426, 900;
d) T. Eichner, S. E. Radford, Mol. Cell 2011, 43, 8.
F. Hasecke, T. Miti, C. Perez, J. Barton, D. Schölzel, L. Gremer, C. S. R. Grüning, G. Matthews, G. Meisl, T. P. J. Knowles, D. Willbold, P. Neudecker, H. Heise, G. Ullah, W. Hoyer, M. Muschol, Chem. Sci. 2018, 9, 5937.
Z. L. Almeida, R. M. M. Brito, Molecules 2020, 25, 1195.
P. N. Nirmalraj, J. List, S. Battacharya, G. Howe, L. Xu, D. Thompson, M. Mayer, Sci. Adv. 2020, 6, eaaz6014.
a) T. P. J. Knowles, C. A. Waudby, G. L. Devlin, S. I. A. Cohen, A. Aguzzi, M. Vendruscolo, E. M. Terentjev, M. E. Welland, C. M. Dobson, Science 2009, 326, 1533;
b) W.-F. Xue, A. L. Hellewell, E. W. Hewitt, S. E. Radford, Prion 2010, 4, 20.
G. P. Lotz, J. Legleiter, J. Mol. Med. 2013, 91, 653.
H. A. Scheidt, I. Morgado, S. Rothemund, D. Huster, M. Fändrich, Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2011, 50, 2837.
B. Sarkar, V. S. Mithu, B. Chandra, A. Mandal, M. Chandrakesan, D. Bhowmik, P. K. Madhu, S. Maiti, Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2014, 53, 6888.
S. Chimon, Y. Ishii, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 13472.
J. N. Fawver, K. T. Duong, O. Wise-Scira, R. Petrofes Chapa, H. E. Schall, O. Coskuner, X. Zhu, L. V. Colom, I. V. J. Murray, J. Alzheimer's Dis. 2012, 32, 197.
A. Sandberg, L. M. Luheshi, S. Söllvander, T. Pereira de Barros, B. Macao, T. P. J. Knowles, H. Biverstål, C. Lendel, F. Ekholm-Petterson, A. Dubnovitsky, L. Lannfelt, C. M. Dobson, T. Härd, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010, 107, 15595.
B. Mannini, J. Habchi, S. Chia, F. S. Ruggeri, M. Perni, T. P. J. Knowles, C. M. Dobson, M. Vendruscolo, ACS Chem. Neurosci. 2018, 9, 2959.
K. L. Sciarretta, D. J. Gordon, A. T. Petkova, R. Tycko, S. C. Meredith, Biochemistry 2005, 44, 6003.
V. S. Mithu, B. Sarkar, D. Bhowmik, M. Chandrakesan, S. Maiti, P. K. Madhu, Biophys. J. 2011, 101, 2825.
A. K. Das, A. Rawat, D. Bhowmik, R. Pandit, D. Huster, S. Maiti, ACS Chem. Neurosci. 2015, 6, 1290.
C. S. Goldsbury, S. Wirtz, S. A. Müller, S. Sunderji, P. Wicki, U. Aebi, P. Frey, J. Struct. Biol. 2000, 130, 217.
W. Close, M. Neumann, A. Schmidt, M. Hora, K. Annamalai, M. Schmidt, B. Reif, V. Schmidt, N. Grigorieff, M. Fändrich, Nat. Commun. 2018, 9, 699.
K. Ono, M. Tsuji, Int. J. Mol. Sci. 2020, 21, 952.
A. T. Petkova, W.-M. Yau, R. Tycko, Biochemistry 2006, 45, 498.
Y. Xiao, B. Ma, D. McElheny, S. Parthasarathy, F. Long, M. Hoshi, R. Nussinov, Y. Ishii, Nat. Struct. Mol. Biol. 2015, 22, 499.
a) R. Kodali, A. D. Williams, S. Chemuru, R. Wetzel, J. Mol. Biol. 2010, 401, 503;
b) L. A. Popova, R. Kodali, R. Wetzel, I. K. Lednev, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 6324.
M. A. Wälti, F. Ravotti, H. Arai, C. G. Glabe, J. S. Wall, A. Böckmann, P. Güntert, B. H. Meier, R. Riek, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2016, 113, E4976.
Y. Yang, D. Arseni, W. Zhang, M. Huang, S. Lövestam, M. Schweighauser, A. Kotecha, A. G. Murzin, S. Y. Peak-Chew, J. Macdonald, I. Lavenir, H. J. Garringer, E. Gelpi, K. L. Newell, G. G. Kovacs, R. Vidal, B. Ghetti, B. Ryskeldi-Falcon, S. H. W. Scheres, M. Goedert, Science 2022, 375, 167.
C. G. Glabe, J. Biol. Chem. 2008, 283, 29639.
A. T. Petkova, R. D. Leapman, Z. Guo, W.-M. Yau, M. P. Mattson, R. Tycko, Science 2005, 307, 262.
R. Kodali, R. Wetzel, Curr. Opin. Struct. Biol. 2007, 17, 48.
X. Yu, J. Zheng, PLoS One 2011, 6, e20575.
A. K. Paravastu, A. T. Petkova, R. Tycko, Biophys. J. 2006, 90, 4618.
a) M. J. Thompson, S. A. Sievers, J. Karanicolas, M. I. Ivanova, D. Baker, D. Eisenberg, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006, 103, 4074;
b) A. B. Ahmed, A. V. Kajava, FEBS Lett. 2013, 587, 1089;
c) A. W. Bryan, M. Menke, L. J. Cowen, S. L. Lindquist, B. Berger, PLoS Comput. Biol. 2009, 5, e1000333;
d) C. W. O'Donnell, J. Waldispühl, M. Lis, R. Halfmann, S. Devadas, S. Lindquist, B. Berger, Bioinformatics 2011, 27, i34.
M. Ahmed, J. Davis, D. Aucoin, T. Sato, S. Ahuja, S. Aimoto, J. I. Elliott, W. E. van Nostrand, S. O. Smith, Nat. Struct. Mol. Biol. 2010, 17, 561.
M. Chandrakesan, B. Sarkar, V. S. Mithu, R. Abhyankar, D. Bhowmik, S. Nag, B. Sahoo, R. Shah, S. Gurav, R. Banerjee, S. Dandekar, J. C. Jose, N. Sengupta, P. K. Madhu, S. Maiti, Chem. Phys. 2013, 422, 80.
J. Adler, M. Baumann, B. Voigt, H. A. Scheidt, D. Bhowmik, T. Häupl, B. Abel, P. K. Madhu, J. Balbach, S. Maiti, D. Huster, ChemPhysChem 2016, 17, 2744.
A. Potapov, W.-M. Yau, R. Ghirlando, K. R. Thurber, R. Tycko, J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 8294.
J. Adler, H. A. Scheidt, M. Krüger, L. Thomas, D. Huster, Phys. Chem. Chem. Phys. 2014, 16, 7461.
M. Chandrakesan, D. Bhowmik, B. Sarkar, R. Abhyankar, H. Singh, M. Kallianpur, S. P. Dandekar, P. K. Madhu, S. Maiti, V. S. Mithu, J. Biol. Chem. 2015, 290, 30099.
N. Rezaei-Ghaleh, M. Amininasab, K. Giller, S. Kumar, A. Stündl, A. Schneider, S. Becker, J. Walter, M. Zweckstetter, J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 4913.
W. Hoyer, C. Grönwall, A. Jonsson, S. Ståhl, T. Härd, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008, 105, 5099.
H. A. Scheidt, I. Morgado, D. Huster, J. Biol. Chem. 2012, 287, 22822.
S. Chimon, M. A. Shaibat, C. R. Jones, D. C. Calero, B. Aizezi, Y. Ishii, Nat. Struct. Mol. Biol. 2007, 14, 1157.
G. Habicht, C. Haupt, R. P. Friedrich, P. Hortschansky, C. Sachse, J. Meinhardt, K. Wieligmann, G. P. Gellermann, M. Brodhun, J. Götz, K.-J. Halbhuber, C. Röcken, U. Horn, M. Fändrich, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104, 19232.
S. Noël, S. Cadet, E. Gras, C. Hureau, Chem. Soc. Rev. 2013, 42, 7747.
E. I. Yakupova, L. G. Bobyleva, I. M. Vikhlyantsev, A. G. Bobylev, Biosci. Rep. 2019, 39, BSR20181415.
A. Hawe, M. Sutter, W. Jiskoot, Pharm. Res. 2008, 25, 1487.
J. Barton, D. S. Arias, C. Niyangoda, G. Borjas, N. Le, S. Mohamed, M. Muschol, Biomolecules 2019, 9, 539.
A. Das, A. Gupta, Y. Hong, J. A. Carver, S. Maiti, Biochemistry 2020, 59, 1813.
M. Biancalana, S. Koide, Biochim. Biophys. Acta 2010, 1804, 1405.
a) P. J. Salveson, R. K. Spencer, J. S. Nowick, J. Am. Chem. Soc. 2016, 138, 4458;
b) A. G. Kreutzer, J. S. Nowick, Acc. Chem. Res. 2018, 51, 706.
K. Takegoshi, S. Nakamura, T. Terao, Chem. Phys. Lett. 2001, 344, 631.
M. T. Colvin, R. Silvers, B. Frohm, Y. Su, S. Linse, R. G. Griffin, J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 7509.
a) M. Munowitz, W. P. Aue, R. G. Griffin, J. Chem. Phys. 1982, 77, 1686;
b) D. Huster, S. Yamaguchi, M. Hong, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 11320.
B. Schwarze, A. Korn, C. Höfling, U. Zeitschel, M. Krueger, S. Roßner, D. Huster, Sci. Rep. 2021, 11, 23767.
H. A. Scheidt, I. Morgado, S. Rothemund, D. Huster, J. Biol. Chem. 2012, 287, 2017.
a) T. K. Karamanos, A. P. Kalverda, G. S. Thompson, S. E. Radford, Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2015, 88-89, 86;
b) L. Hou, H. Shao, Y. Zhang, H. Li, N. K. Menon, E. B. Neuhaus, J. M. Brewer, I.-J. L. Byeon, D. G. Ray, M. P. Vitek, T. Iwashita, R. A. Makula, A. B. Przybyla, M. G. Zagorski, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1992.
T. Lührs, C. Ritter, M. Adrian, D. Riek-Loher, B. Bohrmann, H. Döbeli, D. Schubert, R. Riek, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 17342.
a) P. Juszczyk, A. S. Kołodziejczyk, Z. Grzonka, Acta Biochim. Pol. 2005, 52, 425;
b) A. Micsonai, F. Wien, L. Kernya, Y.-H. Lee, Y. Goto, M. Réfrégiers, J. Kardos, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2015, 112, E3095.
T. Harada, R. Kuroda, Biopolymers 2011, 95, 127.
a) H. Li, R. Lantz, D. Du, Molecules 2019, 24, 186;
b) O. Klementieva, K. Willén, I. Martinsson, B. Israelsson, A. Engdahl, J. Cladera, P. Uvdal, G. K. Gouras, Nat. Commun. 2017, 8, 14726;
c) R. Sarroukh, E. Cerf, S. Derclaye, Y. F. Dufrêne, E. Goormaghtigh, J.-M. Ruysschaert, V. Raussens, Cell. Mol. Life Sci. 2011, 68, 1429;
d) J. P. Lomont, K. L. Rich, M. Maj, J.-J. Ho, J. S. Ostrander, M. T. Zanni, J. Phys. Chem. B 2018, 122, 144.
J. Fritzsch, A. Korn, D. Surendran, M. Krueger, H. A. Scheidt, K. R. Mote, P. K. Madhu, S. Maiti, D. Huster, Biomolecules 2021, 11, 1848.
A. Korn, C. Höfling, U. Zeitschel, M. Krueger, S. Roßner, D. Huster, ACS Chem. Neurosci. 2020, 11, 1038.
Y.-R. Chen, H. Huang, C.-J. Lo, C.-C. Wang, C.-L. Su, H.-T. Liu, M.-S. Shiao, T.-H. Lin, Y.-C. Chen, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2011, 405, 91.
a) J. C. Janssen, J. A. Beck, T. A. Campbell, A. Dickinson, N. C. Fox, R. J. Harvey, H. Houlden, M. N. Rossor, J. Collinge, Neurology 2003, 60, 235;
b) J. Hardy, Trends Neurosci. 1997, 20, 154;
c) A. Hatami, S. Monjazeb, S. Milton, C. G. Glabe, J. Biol. Chem. 2017, 292, 3172.
a) L. Vugmeyster, D. F. Au, D. Ostrovsky, B. Kierl, R. Fu, Z.-W. Hu, W. Qiang, Biophys. J. 2019, 117, 1524;
b) Z.-W. Hu, D. F. Au, L. Cruceta, L. Vugmeyster, W. Qiang, ACS Chem. Neurosci. 2020, 11, 2058;
c) M. P. Kummer, M. T. Heneka, Alzheimer's Res. Ther. 2014, 6, 28;
d) M. P. Kummer, M. Hermes, A. Delekarte, T. Hammerschmidt, S. Kumar, D. Terwel, J. Walter, H.-C. Pape, S. König, S. Roeber, F. Jessen, T. Klockgether, M. Korte, M. T. Heneka, Neuron 2011, 71, 833.
S. Schilling, U. Zeitschel, T. Hoffmann, U. Heiser, M. Francke, A. Kehlen, M. Holzer, B. Hutter-Paier, M. Prokesch, M. Windisch, W. Jagla, D. Schlenzig, C. Lindner, T. Rudolph, G. Reuter, H. Cynis, D. Montag, H.-U. Demuth, S. Rossner, Nat. Med. 2008, 14, 1106.
Z.-W. Hu, L. Vugmeyster, D. F. Au, D. Ostrovsky, Y. Sun, W. Qiang, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2019, 116, 11253.
N. Rezaei-Ghaleh, M. Amininasab, S. Kumar, J. Walter, M. Zweckstetter, Nat. Commun. 2016, 7, 11359.
C. K. Smith, J. M. Withka, L. Regan, Biochemistry 1994, 33, 5510.
S. Shivaprasad, R. Wetzel, in Methods in Enzymology, (Eds: I. Kheterpal, R. Wetzel), Academic Press, Amsterdam, Boston, 2006, pp. 182-198.
K. L. Sciarretta, A. Boire, D. J. Gordon, S. C. Meredith, Biochemistry 2006, 45, 9485.
D. J. Gordon, R. Tappe, S. C. Meredith, J. Pept. Res. 2002, 60, 37.
Y. Mao, C. O. Zlatic, M. D. W. Griffin, G. J. Howlett, N. Todorova, I. Yarovsky, P. R. Gooley, Biochemistry 2015, 54, 4805.
Y. Mao, C. L. Teoh, S. Yang, C. O. Zlatic, Z. K. Rosenes, P. R. Gooley, G. J. Howlett, M. D. W. Griffin, Biochemistry 2015, 54, 1421.
N. Todorova, C. O. Zlatic, Y. Mao, I. Yarovsky, G. J. Howlett, P. R. Gooley, M. D. W. Griffin, Biochemistry 2017, 56, 1757.
H. Vignaud, C. Bobo, I. Lascu, K. M. Sörgjerd, T. Zako, M. Maeda, B. Salin, S. Lecomte, C. Cullin, PLoS One 2013, 8, e80262.
K. Berthelot, C. Cullin, S. Lecomte, Biochimie 2013, 95, 12.
B. Chandra, D. Bhowmik, B. K. Maity, K. R. Mote, D. Dhara, R. Venkatramani, S. Maiti, P. K. Madhu, Biophys. J. 2017, 113, 805.
F. Hoffmann, J. Adler, B. Chandra, K. R. Mote, G. Bekçioğlu-Neff, D. Sebastiani, D. Huster, J. Phys. Chem. Lett. 2017, 8, 4740.
B. Chandra, A. Korn, B. K. Maity, J. Adler, A. Rawat, M. Krueger, D. Huster, S. Maiti, J. Phys. Chem. B 2017, 121, 1835.
A. Korn, D. Surendran, M. Krueger, S. Maiti, D. Huster, Chem. Commun. 2018, 54, 5430.
A. Korn, S. McLennan, J. Adler, M. Krueger, D. Surendran, S. Maiti, D. Huster, ACS Chem. Neurosci. 2018, 9, 790.
C.-T. Liang, H. Huang, C.-C. Wang, Y.-R. Chen, C.-F. Chang, M.-S. Shiao, Y.-C. Chen, T.-H. Lin, PLoS One 2016, 11, e0154327.
H. A. Scheidt, J. Adler, U. Zeitschel, C. Höfling, A. Korn, M. Krueger, S. Roßner, D. Huster, Chem. - Eur. J. 2017, 23, 15834.
H. A. Scheidt, J. Adler, M. Krueger, D. Huster, Sci. Rep. 2016, 6, 33531.
M. Wulff, M. Baumann, A. Thümmler, J. K. Yadav, L. Heinrich, U. Knüpfer, D. Schlenzig, A. Schierhorn, J.-U. Rahfeld, U. Horn, J. Balbach, H.-U. Demuth, M. Fändrich, Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2016, 55, 5081.
J. Adler, H. A. Scheidt, K. Lemmnitzer, M. Krueger, D. Huster, Phys. Chem. Chem. Phys. 2017, 19, 1839.
A. Päiviö, E. Nordling, Y. Kallberg, J. Thyberg, J. Johansson, Protein Sci. 2004, 13, 1251.
A. Das, A. Korn, A. Carroll, J. A. Carver, S. Maiti, J. Phys. Chem. B 2021, 125, 12426.
S. Hovmöller, T. Zhou, T. Ohlson, Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2002, 58, 768.
T. E. Creighton (Ed.) Proteins: Structures and Molecular Properties, Freeman, New York 1992.
C. Chothia, J. Janin, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1981, 78, 4146.
D. Ting, G. Wang, M. Shapovalov, R. Mitra, M. I. Jordan, R. L. Dunbrack, PLoS Comput. Biol. 2010, 6, e1000763.
D. A. Dougherty, Science 1996, 271, 163.
D. Bhowmik, A. K. Das, S. Maiti, Langmuir 2015, 31, 4049.
O. A. Koksharova, N. A. Safronova, Toxins 2022, 14, 539.
a) R. A. Dunlop, G. J. Guillemin, Neurotoxic. Res. 2019, 36, 602;
b) J. Pablo, S. A. Banack, P. A. Cox, T. E. Johnson, S. Papapetropoulos, W. G. Bradley, A. Buck, D. C. Mash, Acta Neurol. Scand. 2009, 120, 216.
a) J. P. Meneely, O. P. Chevallier, S. Graham, B. Greer, B. D. Green, C. T. Elliott, Sci. Rep. 2016, 6, 36363;
b) R. A. Dunlop, P. A. Cox, S. A. Banack, K. J. Rodgers, PLoS One 2013, 8, e75376.
M. G. Munowitz, R. G. Griffin, G. Bodenhausen, T. H. Huang, J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 2529.
K.-C. He, Y.-R. Chen, C.-T. Liang, S.-J. Huang, C.-Y. Tzeng, C.-F. Chang, S.-J. Huang, H. Huang, T.-H. Lin, Int. J. Mol. Sci. 2020, 21, 2571.
J. T. Jarrett, P. T. Lansbury, Cell 1993, 73, 1055.
R. K. Saini, S. Shuaib, D. Goyal, B. Goyal, J. Cell. Biochem. 2018, 119, 8949.
N. Fortelny, P. Pavlidis, C. M. Overall, Proteomics 2015, 15, 2547.
a) N. P. Sargaeva, C. Lin, P. B. O'Connor, Anal. Chem. 2009, 81, 9778;
b) A. E. Roher, J. D. Lowenson, S. Clarke, C. Wolkow, R. Wang, R. J. Cotter, I. M. Reardon, H. A. Zürcher-Neely, R. L. Heinrikson, M. J. Ball, J. Biol. Chem. 1993, 268, 3072.
W. He, C. J. Barrow, Biochemistry 1999, 38, 10871.
T. Hoffmann, J.-U. Rahfeld, M. Schenk, F. Ponath, K. Makioka, B. Hutter-Paier, I. Lues, C. A. Lemere, S. Schilling, Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 11791.
S. Schilling, T. Lauber, M. Schaupp, S. Manhart, E. Scheel, G. Böhm, H.-U. Demuth, Biochemistry 2006, 45, 12393.
J. O. Matos, G. Goldblatt, J. Jeon, B. Chen, S. A. Tatulian, J. Phys. Chem. B 2014, 118, 5637.
D. Schlenzig, R. Rönicke, H. Cynis, H.-H. Ludwig, E. Scheel, K. Reymann, T. Saido, G. Hause, S. Schilling, H.-U. Demuth, J. Neurochem. 2012, 121, 774.
J. M. Nussbaum, S. Schilling, H. Cynis, A. Silva, E. Swanson, T. Wangsanut, K. Tayler, B. Wiltgen, A. Hatami, R. Rönicke, K. Reymann, B. Hutter-Paier, A. Alexandru, W. Jagla, S. Graubner, C. G. Glabe, H.-U. Demuth, G. S. Bloom, Nature 2012, 485, 651.
M. Morawski, S. Schilling, M. Kreuzberger, A. Waniek, C. Jäger, B. Koch, H. Cynis, A. Kehlen, T. Arendt, M. Hartlage-Rübsamen, H.-U. Demuth, S. Roßner, J. Alzheimer's Dis. 2014, 39, 385.
A. P. Gunn, B. X. Wong, T. Johanssen, J. C. Griffith, C. L. Masters, A. I. Bush, K. J. Barnham, J. A. Duce, R. A. Cherny, J. Biol. Chem. 2016, 291, 6134.
E. J. Fernandez-Perez, C. Peters, L. G. Aguayo, Curr. Pharm. Des. 2016, 22, 1295.
Z. Jaunmuktane, S. Brandner, Neuropathol. Appl. Neurobiol. 2020, 46, 522.
H. A. Scheidt, A. Das, A. Korn, M. Krueger, S. Maiti, D. Huster, Phys. Chem. Chem. Phys. 2020, 22, 16887.
B. K. Maity, A. K. Das, S. Dey, U. K. Moorthi, A. Kaur, A. Dey, D. Surendran, R. Pandit, M. Kallianpur, B. Chandra, M. Chandrakesan, S. Arumugam, S. Maiti, ACS Chem. Neurosci. 2019, 10, 2498.
a) J. Li, T. Kanekiyo, M. Shinohara, Y. Zhang, M. J. LaDu, H. Xu, G. Bu, J. Biol. Chem. 2012, 287, 44593;
b) A. M. Cataldo, S. Petanceska, N. B. Terio, C. M. Peterhoff, R. Durham, M. Mercken, P. D. Mehta, J. Buxbaum, V. Haroutunian, R. A. Nixon, Neurobiol. Aging 2004, 25, 1263.
X. Wang, B. Su, G. Perry, M. A. Smith, X. Zhu, Free Radical Biol. Med. 2007, 43, 1569.
U. Unterberger, R. Höftberger, E. Gelpi, H. Flicker, H. Budka, T. Voigtländer, J. Neuropathol. Exp. Neurol. 2006, 65, 348.
G. Joshi, M. E. Bekier, Y. Wang, Front. Neurosci. 2015, 9, 340.
K. Ditaranto, T. L. Tekirian, A. J. Yang, Neurobiol. Dis. 2001, 8, 19.
B. Maloney, D. K. Lahiri, Gene 2011, 488, 1.
C. Morris, S. Cupples, T. W. Kent, E. A. Elbassal, E. P. Wojcikiewicz, P. Yi, D. Du, Chem. - Eur. J. 2018, 24, 9494.
D. Mrdenovic, I. S. Pieta, R. Nowakowski, W. Kutner, J. Lipkowski, P. Pieta, Int. J. Biol. Macromol. 2022, 200, 520.
C. Lendel, T. Sparrman, M. Mayzel, C. E. Andersson, G. Karlsson, T. Härd, ChemistrySelect 2016, 1, 5850.
K. Przygońska, J. Poznański, U. H. Mistarz, K. D. Rand, M. Dadlez, PLoS One 2018, 13, e0201761.
S. Pfaender, A. M. Grabrucker, Metallomics 2014, 6, 960.
a) P. Faller, C. Hureau, O. Berthoumieu, Inorg. Chem. 2013, 52, 12193;
b) K. P. Kepp, Chem. Rev. 2012, 112, 5193;
c) S. Parthasarathy, F. Long, Y. Miller, Y. Xiao, D. McElheny, K. Thurber, B. Ma, R. Nussinov, Y. Ishii, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 3390;
d) S. Wärmländer, A. Tiiman, A. Abelein, J. Luo, J. Jarvet, K. L. Söderberg, J. Danielsson, A. Gräslund, ChemBioChem 2013, 14, 1692;
e) D. Beauchemin, R. Kisilevsky, Anal. Chem. 1998, 70, 1026.
a) X. Dai, Y. Sun, Z. Gao, Z. Jiang, J. Mol. Neurosci. 2010, 41, 66;
b) J. S. Cristóvão, G. G. Moreira, A. M. Grabrucker, C. M. Gomes, in Protein Homeostasis Diseases (Ed: A. L. Pey), Elsevier, New York 2020, pp. 181-195.
a) J. A. Hardy, G. A. Higgins, Science 1992, 256, 184;
b) R. Ricciarelli, E. Fedele, Curr. Neuropharmacol. 2017, 15, 926.
R. Lal, H. Lin, A. P. Quist, Biochim. Biophys. Acta 2007, 1768, 1966.
M. F. Sciacca, F. Lolicato, C. Tempra, F. Scollo, B. R. Sahoo, M. D. Watson, S. García-Viñuales, D. Milardi, A. Raudino, J. C. Lee, A. Ramamoorthy, C. La Rosa, ACS Chem. Neurosci. 2020, 11, 4336.
P. J. Casey, Science 1995, 268, 221.
H. Jiang, X. Zhang, X. Chen, P. Aramsangtienchai, Z. Tong, H. Lin, Chem. Rev. 2018, 118, 919.
a) L. Brunsveld, H. Waldmann, D. Huster, Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 273;
b) G. Reuther, K.-T. Tan, J. Köhler, C. Nowak, A. Pampel, K. Arnold, J. Kuhlmann, H. Waldmann, D. Huster, Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2006, 45, 5387.
a) S. Dehn, V. Castelletto, I. W. Hamley, S. Perrier, Biomacromolecules 2012, 13, 2739;
b) I. W. Hamley, M. J. Krysmann, Langmuir 2008, 24, 8210;
c) A. Rösler, H.-A. Klok, I. W. Hamley, V. Castelletto, O. O. Mykhaylyk, Biomacromolecules 2003, 4, 859;
d) T. S. Burkoth, T. L. S. Benzinger, D. N. M. Jones, K. Hallenga, S. C. Meredith, D. G. Lynn, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7655;
e) V. Castelletto, G. E. Newby, Z. Zhu, I. W. Hamley, L. Noirez, Langmuir 2010, 26, 9986;
f) Z. Evgrafova, S. Rothemund, B. Voigt, G. Hause, J. Balbach, W. H. Binder, Macromol. Rapid Commun. 2020, 41, e1900378.
a) J. A. Maloney, T. Bainbridge, A. Gustafson, S. Zhang, R. Kyauk, P. Steiner, M. van der Brug, Y. Liu, J. A. Ernst, R. J. Watts, J. K. Atwal, J. Biol. Chem. 2014, 289, 30990;
b) T. Jonsson, J. K. Atwal, S. Steinberg, J. Snaedal, P. V. Jonsson, S. Bjornsson, H. Stefansson, P. Sulem, D. Gudbjartsson, J. Maloney, K. Hoyte, A. Gustafson, Y. Liu, Y. Lu, T. Bhangale, R. R. Graham, J. Huttenlocher, G. Bjornsdottir, O. A. Andreassen, E. G. Jönsson, A. Palotie, T. W. Behrens, O. T. Magnusson, A. Kong, U. Thorsteinsdottir, R. J. Watts, K. Stefansson, Nature 2012, 488, 96;
c) I. Benilova, R. Gallardo, A.-A. Ungureanu, V. Castillo Cano, A. Snellinx, M. Ramakers, C. Bartic, F. Rousseau, J. Schymkowitz, B. de Strooper, J. Biol. Chem. 2014, 289, 30977.
G. Di Fede, M. Catania, M. Morbin, G. Giaccone, M. L. Moro, R. Ghidoni, L. Colombo, M. Messa, A. Cagnotto, M. Romeo, M. Stravalaci, L. Diomede, M. Gobbi, M. Salmona, F. Tagliavini, Prog. Neurobiol. 2012, 99, 281.
G. Giaccone, M. Morbin, F. Moda, M. Botta, G. Mazzoleni, A. Uggetti, M. Catania, M. L. Moro, V. Redaelli, A. Spagnoli, R. S. Rossi, M. Salmona, G. Di Fede, F. Tagliavini, Acta Neuropathol. 2010, 120, 803.
P. Das, B. Murray, G. Belfort, Biophys. J. 2015, 108, 738.
S. Kumar, N. Rezaei-Ghaleh, D. Terwel, D. R. Thal, M. Richard, M. Hoch, J. M. Mc Donald, U. Wüllner, K. Glebov, M. T. Heneka, D. M. Walsh, M. Zweckstetter, J. Walter, EMBO J. 2011, 30, 2255.
B. Chandra, S. Halder, J. Adler, A. Korn, D. Huster, S. Maiti, Chem. Phys. Lett. 2017, 675, 51.
a) S. Ciudad, E. Puig, T. Botzanowski, M. Meigooni, A. S. Arango, J. Do, M. Mayzel, M. Bayoumi, S. Chaignepain, G. Maglia, S. Cianferani, V. Orekhov, E. Tajkhorshid, B. Bardiaux, N. Carulla, Nat. Commun. 2020, 11, 3014;
b) C. Lendel, M. Bjerring, A. Dubnovitsky, R. T. Kelly, A. Filippov, O. N. Antzutkin, N. C. Nielsen, T. Härd, Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2014, 53, 12756.
M. Fränzl, T. Thalheim, J. Adler, D. Huster, J. Posseckardt, M. Mertig, F. Cichos, Nat. Methods 2019, 16, 611.