Whole Exome Analysis to Select Targeted Therapies for Patients with Metastatic Breast Cancer - A Feasibility Study.

breast cancer decision making platform targeted therapy whole exome sequencing

Journal

Geburtshilfe und Frauenheilkunde
ISSN: 0016-5751
Titre abrégé: Geburtshilfe Frauenheilkd
Pays: Germany
ID NLM: 0370732

Informations de publication

Date de publication:
Sep 2023
Historique:
received: 30 04 2023
accepted: 09 08 2023
medline: 14 9 2023
pubmed: 14 9 2023
entrez: 14 9 2023
Statut: epublish

Résumé

The purpose of this feasibility study was to select targeted therapies according to "ESMO Scale for Clinical Actionability of molecular Targets (ESCAT)". Data interpretation was further supported by a browser-based Treatment Decision Support platform (MH Guide, Molecular Health, Heidelberg, Germany). We applied next generation sequencing based whole exome sequencing of tumor tissue and peripheral blood of patients with metastatic breast cancer (n = 44) to detect somatic as well as germline mutations. In 32 metastatic breast cancer patients, data interpretation was feasible. We identified 25 genomic alterations with ESCAT Level of Evidence I or II in 18/32 metastatic breast cancer patients, which were available for evaluation: three copy number gains in Resulting treatment options were discussed in a tumor board and could be recommended in a small but relevant proportion of patients with metastatic breast cancer (7/18). Thus, this study is a valuable preliminary work for the establishment of a molecular tumor board within the German initiative "Center for Personalized Medicine" which aims to shorten time for analyses and optimize selection of targeted therapies. Ziel dieser Machbarkeitsstudie war es, zielgerichtete Therapien entsprechend der ESCAT-Skala (ESMO Scale for Clinical Actionability of molecular Targets) zu bestimmen. Für die Interpretation der Daten wurde eine browserbasierte Plattform zur Entscheidungsfindung (MH Guide, Molecular Health, Heidelberg, Germany) eingesetzt. Es wurde eine Exomsequenzierung von Tumorgewebe und peripherem Blut von Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom (n = 44) durchgeführt, um somatische sowie Keimbahnmutationen zu identifizieren. Bei 32 Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom konnte eine Dateninterpretation durchgeführt werden. Es wurden 25 genomische Veränderungen (ESCAT-Evidenzstufe I oder II) bei 18/32 Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom identifiziert und abschließend ausgewertet: darunter fanden sich 3 Fälle mit höheren Vervielfältigungszahlen bei Die daraus abzuleitenden Behandlungsoptionen wurden in einer Tumorkonferenz diskutiert und dann einer kleinen, aber relevanten Anzahl von Patientinnen mit metastasiertem Mammakarzinom (7/18) empfohlen. Die hier vorgestellte Arbeit stellt eine wertvolle Vorstudie dar, die dazu beitragen kann, molekulare Tumorboards innerhalb des Deutschen Netzwerks für Personalisierte Medizin zu etablieren. Ziel ist, die für Analysen benötigte Zeit zu verkürzen und die Wahl zielgerichteter Therapien zu optimieren.

Autres résumés

Type: Publisher (ger)
Ziel dieser Machbarkeitsstudie war es, zielgerichtete Therapien entsprechend der ESCAT-Skala (ESMO Scale for Clinical Actionability of molecular Targets) zu bestimmen. Für die Interpretation der Daten wurde eine browserbasierte Plattform zur Entscheidungsfindung (MH Guide, Molecular Health, Heidelberg, Germany) eingesetzt.

Identifiants

pubmed: 37706056
doi: 10.1055/a-2150-9440
pii: GebFra-2023-04-1994-O
pmc: PMC10497348
doi:

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Pagination

1138-1147

Informations de copyright

The Author(s). This is an open access article published by Thieme under the terms of the Creative Commons Attribution-NonDerivative-NonCommercial-License, permitting copying and reproduction so long as the original work is given appropriate credit. Contents may not be used for commercial purposes, or adapted, remixed, transformed or built upon. (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).

Déclaration de conflit d'intérêts

Conflict of Interest The authors declare that they have no conflict of interest.

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Auteurs

Bernadette Anna Sophia Jaeger (BAS)

Department of Obstetrics and Gynecology, University Hospital and Medical Faculty of the Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Natalia Krawczyk (N)

Department of Obstetrics and Gynecology, University Hospital and Medical Faculty of the Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Anna Sophia Japp (AS)

Institute of Pathology, University Hospital and Medical Faculty of the Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Ellen Honisch (E)

Department of Obstetrics and Gynecology, University Hospital and Medical Faculty of the Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Karl Köhrer (K)

Biologisch-Medizinisches Forschungszentrum (BMFZ), Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Sibylle Scheuring (S)

Biologisch-Medizinisches Forschungszentrum (BMFZ), Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Patrick Petzsch (P)

Biologisch-Medizinisches Forschungszentrum (BMFZ), Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Hans Neubauer (H)

Department of Obstetrics and Gynecology, University Hospital and Medical Faculty of the Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Anne Kathrin Volkmer (AK)

Department of Obstetrics and Gynecology, University Hospital and Medical Faculty of the Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Irene Esposito (I)

Institute of Pathology, University Hospital and Medical Faculty of the Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Eugen Ruckhäberle (E)

Department of Obstetrics and Gynecology, University Hospital and Medical Faculty of the Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Dieter Niederacher (D)

Department of Obstetrics and Gynecology, University Hospital and Medical Faculty of the Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Tanja Fehm (T)

Department of Obstetrics and Gynecology, University Hospital and Medical Faculty of the Heinrich-Heine University Düsseldorf, Düsseldorf, Germany.

Classifications MeSH