Evaluating plant lineage losses and gains in temperate forest understories: a phylogenetic perspective on climate change and nitrogen deposition.
biodiversity change
biogeography
forestREplot
global change
phylogeny
plant functional traits
time lag
vegetation resurvey
Journal
The New phytologist
ISSN: 1469-8137
Titre abrégé: New Phytol
Pays: England
ID NLM: 9882884
Informations de publication
Date de publication:
21 Dec 2023
21 Dec 2023
Historique:
received:
13
06
2023
accepted:
25
11
2023
medline:
21
12
2023
pubmed:
21
12
2023
entrez:
21
12
2023
Statut:
aheadofprint
Résumé
Global change has accelerated local species extinctions and colonizations, often resulting in losses and gains of evolutionary lineages with unique features. Do these losses and gains occur randomly across the phylogeny? We quantified: temporal changes in plant phylogenetic diversity (PD); and the phylogenetic relatedness (PR) of lost and gained species in 2672 semi-permanent vegetation plots in European temperate forest understories resurveyed over an average period of 40 yr. Controlling for differences in species richness, PD increased slightly over time and across plots. Moreover, lost species within plots exhibited a higher degree of PR than gained species. This implies that gained species originated from a more diverse set of evolutionary lineages than lost species. Certain lineages also lost and gained more species than expected by chance, with Ericaceae, Fabaceae, and Orchidaceae experiencing losses and Amaranthaceae, Cyperaceae, and Rosaceae showing gains. Species losses and gains displayed no significant phylogenetic signal in response to changes in macroclimatic conditions and nitrogen deposition. As anthropogenic global change intensifies, temperate forest understories experience losses and gains in specific phylogenetic branches and ecological strategies, while the overall mean PD remains relatively stable. El canvi global ha accelerat les extincions i colonitzacions a escala local, cosa que sovint ha suposat pèrdues i guanys de llinatges evolutius amb característiques singulars. Ara bé, aquestes pèrdues i guanys ocorren aleatòriament al llarg de la filogènia? En aquest estudi quantifiquem: els canvis temporals en la diversitat filogenètica de les plantes; i la relació filogenètica de les espècies perdudes i guanyades en 2.672 parcel·les de vegetació semi-permanent en sotaboscos temperats europeus i re-mostrejades durant un període mitjà de 40 anys. En controlar per les diferències en la riquesa d’espècies, la diversitat filogenètica va augmentar lleugerament amb el temps i entre parcel·les. A més, les espècies perdudes dins de les parcel·les presentaven un grau més alt de relació filogenètica que les espècies guanyades. Això implica que les espècies guanyades s’originaren en un conjunt de llinatges evolutius més diversos que les espècies perdudes. Certs llinatges també van perdre i van guanyar més espècies de les esperades aleatòriament: Ericaceae, Fabaceae i Orchidaceae van experimentar pèrdues i Amaranthaceae, Cyperaceae i Rosaceae van mostrar guanys. Les pèrdues i els guanys d’espècies no van mostrar cap senyal filogenètic significatiu en resposta als canvis en les condicions macro-climàtiques i la deposició de nitrogen. A mesura que s’intensifica el canvi global antropogènic, els sotaboscos temperats experimenten pèrdues i guanys en branques filogenètiques i estratègies ecològiques específiques, mentre que la diversitat filogenètica mitjana general roman relativament constant. 全球变化正在加速物种的灭绝和迁徙以及殖民化,常常导致具有独特特征的进化谱系在群落水平的损失和增益。这些损失和增益在系统发育树上是随机发生的吗? 我们对欧洲温带森林林下的 2672 个半永久植被样地在平均 40 年后进行了重新调查并用这些数据量化了: 植物系统发育多样性的时间变化; 和 本地灭绝和新增的物种的系统发育关系。 在控制物种多样性差异的情况下,样地的系统发育多样性随时间略有增加。此外,样地内失去的物种比新增的物种具有更高的系统发育关联度。这意味着新增的物种来自比失去的物种更多样化的演化谱系。在群落水平上,某些谱系也失去和获得了比预期更多的物种,比如 Ericaceae、Fabaceae 和 Orchidaceae 经历了损失,而 Amaranthaceae、Cyperaceae 和 Rosaceae显示出增益。物种的损失和增益对气候条件和氮沉降的响应没有明显的系统发育信号。 随着全球变化的加剧,我们的研究表明温带森林林下植被经历了特定系统发育分支和生态策略的损失和增益,而整体的平均系统发育多样性保持相对稳定。. Globální změna urychlila procesy lokálního vymírání druhů a kolonizace, často vedoucí ke ztrátám a ziskům evolučních větví s unikátními vlastnostmi. Dochází však k těmto ztrátám a ziskům náhodně napříč fylogenetickým stromem? Kvantifikovali jsme: časové změny ve fylogenetické diverzitě rostlin; a fylogenetickou příbuznost vymizelých a nových druhů na základě souboru 2672 fytocenologických snímků podrostu evropských lesů mírného pásma, které byly zkoumány ve dvou časových obdobích vzdálených od sebe v průměru 40 let. Při zohlednění rozdílů v druhového bohatství mezi snímky došlo v průběhu času k mírnému zvýšení fylogenetické diverzity. Kromě toho vymizelé druhy v rámci ploch vykazovaly mezi sebou vyšší stupeň fylogenetické příbuznosti než druhy nově objevené. To znamená, že nové druhy pocházejí z rozmanitějšího souboru evolučních linií než druhy vyhynulé. Některé linie ztratily nebo získaly více druhů, než by odpovídalo náhodě, přičemž u čeledí Ericaceae, Fabaceae a Orchidaceae došlo ke ztrátám a u čeledí Amaranthaceae, Cyperaceae a Rosaceae k ziskům druhů. Ztráty a zisky druhů nebyly významně ovlivněné změnami makroklimatických podmínek ani depozicí dusíku. V důsledku intenzivnějších globálních změn dochází v podrostu lesů mírného pásma k úbytkům a ziskům určitých fylogenetických linií a ekologických strategií, přičemž celková průměrná fylogenetická diverzita zůstává relativně stabilní. Verandering van het milieu door de mens heeft lokaal uitsterven maar ook kolonisatie van nieuwe soorten versneld. Vaak resulteert dit in verlies en gewin van bepaalde evolutionaire lijnen met unieke kenmerken. Treden deze verliezen en winsten willekeurig op over de plantenstamboom (fylogenie)? We hebben: temporele veranderingen in fylogenetische diversiteit van planten (i.e. hoe verspreid zitten de planten die voorkomen op een bepaalde plaats in die stamboom); en de verwantschap van verloren en gewonnen soorten gekwantificeerd. Dit op basis van vegetatieopnamen en heropnamen in 2.672 quasi-permanente proefvlakken die de kruidlaag in gematigde Europese bossen vergelijken over een gemiddelde periode van 40 jaar. Rekening houdend met verschillen in soortenrijkdom, nam de fylogenetische diversiteit in de loop van de tijd en over proefvlakken licht toe. Bovendien vertoonden verloren soorten binnen proefvlakken een hogere mate van fylogenetische verwantschap dan gewonnen soorten. Dit impliceert dat gewonnen soorten afkomstig waren van een meer diverse set van evolutionaire lijnen dan verloren soorten. Bepaalde lijnen verloren en wonnen ook meer soorten dan verwacht bij toeval, met vooral verliezen bij de families Ericaceae, Fabaceae en Orchidaceae en winsten bij Amaranthaceae, Cyperaceae en Rosaceae. Soortverliezen en -winsten vertoonden geen significant fylogenetisch signaal in respons op veranderingen in macroklimatologische omstandigheden en stikstofdepositie. Met toenemende door de mens veroorzaakte milieuveranderingen, vertoont de kruidlaag van gematigde bossen verliezen en winsten in specifieke evolutionaire lijnen en ecologische strategieën, terwijl algemeen de gemiddelde fylogenetische diversiteit relatief stabiel blijft. Les changements globaux accélèrent les processus de colonisation et d’extinction locales d’espèces, aboutissant à des gains ou à des pertes de lignées évolutives uniques. Ces gains et pertes se produisent-ils de manière aléatoire dans l’arbre phylogénétique ? Nous avons mesuré: les changements de diversité phylogénétique; et la parenté phylogénétique des espèces végétales gagnées ou perdues dans 2672 placettes semi-permanentes disposées dans le sous-bois de forêts tempérées d’Europe sur une période moyenne de 40 ans. Une fois corrigée par la richesse spécifique, la diversité phylogénétique a légèrement augmenté au cours du temps dans les différentes placettes. Les espèces perdues ont une plus grande parenté phylogénétique que les espèces gagnées. Les espèces gagnées sont donc issues d’un plus grand nombre de lignées évolutives que les espèces perdues. Certaines lignées ont gagné ou perdu davantage d’espèces que ce qui est prédit par le hasard : les Ericaceae, les Fabaceae et les Orchidaceae ayant davantage perdu, tandis que les Amaranthaceae, les Cyperaceae, et les Rosaceae ont plus gagné. Il n’y a pas de signal phylogénétique des gains ou pertes d’espèces en réponse aux changements de conditions macroclimatiques ou des dépôts atmosphériques d’azote. Alors que les changements globaux d’origine anthropique s’intensifient, les sous-bois des forêts tempérées connaissent des gains et des pertes de certaines lignées évolutives et de certaines stratégies écologiques, sans que la diversité phylogénétique moyenne ne s’en trouve véritablement affectée. Der globale Wandel hat lokale Aussterbe- oder Besiedlungsprozesse beschleunigt, was oft zu einem Verlust oder Gewinn von eng verwandten Arten mit gemeinsamen Merkmalen geführt hat (beschrieben durch die Phylogenie der Arten). Hier soll die Frage beantwortet werden, ob diese Verluste und Gewinne zufällig verteilt über alle Verwandtschaftsgruppen auftreten. Wir haben: die zeitliche Veränderungen in der phylogenetischen Vielfalt der Pflanzen; und die phylogenetische Verwandtschaft der lokal verloren gegangenen und hinzugekommenen Arten quantifiziert basierend auf 2672 Dauerbeobachtungsflächen in europäischen Wäldern der gemäßigten Breiten über einen Zeitraum von durchschnittlich 40 Jahren. Bei Berücksichtigung der Unterschiede im Artenreichtum nahm die phylogenetische Vielfalt zwischen den Flächen im Laufe der Zeit leicht zu. Die lokal ausgestorbenen Arten weisen innerhalb der Flächen eine engere phylogenetische Verwandtschaft auf als die hinzugekommenen Arten. Dies deutet darauf hin, dass die neuen Arten aus diverseren evolutionären Linien stammen als die lokal verschwundenen Arten. Insbesondere die Pflanzenfamilien der Ericaceae, Fabaceae und Orchidaceae weisen Artenverluste auf, wogegen die Amaranthaceae, Cyperaceae und Rosaceae Artengewinne in der genetischen Vielfalt verzeichnen konnten. Artenverluste und -gewinne zeigten keine signifikanten phylogenetischen Signale als Reaktion auf Veränderungen der makroklimatischen Bedingungen und der Stickstoffdeposition. Mit der Intensivierung des anthropogenen globalen Wandels kommt es in der Bodenvegetation von Wäldern der gemäßigten Breiten zu Verlusten und Gewinnen bei einigen phylogenetischen Zweigen und ökologischen Strategietypen, während die durchschnittliche phylogenetische Vielfalt insgesamt relativ stabil bleibt. Globalne zmiany przyspieszają lokalne wymieranie i kolonizacje gatunków, często skutkując zanikaniem lub pojawianiem się linii ewolucyjnych o unikalnych cechach. Czy te straty i zyski występują losowo w całym drzewie filogenetycznym? Określiliśmy ilościowo: zmiany różnorodności filogenetycznej roślin w czasie; oraz filogenetyczne pokrewieństwo gatunków utraconych i gatunków, które wkroczyły na 2672 półstałe powierzchnie badawcze w europejskich lasach strefy umiarkowanej, zbadane średnio po 40 latach od pierwszych badań. Uwzględniając różnice w bogactwie gatunkowym, różnorodność filogenetyczna nieznacznie wzrosła w czasie i na powierzchniach. Co więcej, gatunki utracone w obrębie powierzchni wykazywały wyższy stopień pokrewieństwa filogenetycznego niż gatunki, które na nie wkroczyły. Oznacza to, że wkraczające gatunki pochodzą z bardziej zróżnicowanego zestawu linii ewolucyjnych niż gatunki utracone. Niektóre linie również straciły i zyskały więcej gatunków niż oczekiwano losowo, przy czym Ericaceae, Fabaceae i Orchidaceae doświadczyły strat, a Amaranthaceae, Cyperaceae i Rosaceae przyrostu liczby gatunków. Spadki i wzrosty liczby gatunków nie wykazywały istotnego sygnału filogenetycznego w odpowiedzi na zmiany warunków makroklimatycznych i depozycję azotu. W miarę nasilania się globalnych zmian antropogenicznych, runo lasów strefy umiarkowanej doświadcza strat i zysków gatunków w określonych gałęziach filogenetycznych i strategiach ekologicznych, podczas gdy ogólna średnia różnorodność filogenetyczna pozostaje względnie stabilna. Globálne zmeny prostredia zrýchlili lokálne vyhynutie druhov a kolonizáciu novými druhmi, čo často vedie ku stratám alebo ziskom genetických vývojových línií s unikátnymi vlastnosťami. Vyskytujú sa tieto straty a zisky v rámci fylogenézy náhodne? Kvantifikovali sme: časové zmeny vo fylogenetickej diverzite rastlín; a fylogenetickú príbuznosť lokálne vyhynutých a kolonizujúcich druhov na 2672 polo-trvalých plochách v temperátnych lesoch Európy, ktorých vegetácia bola opakovane preskúmaná v priemere po 40 rokoch. Zohľadňujúc rozdiely v počte druhov, fylogenetická diverzita mierne vzrástla v čase a naprieč plochami. Preukázalo sa, že vyhynuté druhy majú vyššiu fylogenetickú príbuznosť ako kolonizujúce druhy. To znamená, že kolonizujúce druhy pochádzajú z rôznorodejšej skupiny vývojových línií ako druhy vyhynuté. Určité línie tiež stratili alebo získali viac druhov, ako by tomu bolo len náhodou. Čeľade Ericaceae, Fabaceae a Orchidaceae preukázali straty, kým Amaranthaceae, Cyperaceae a Rosaceae zisky. Straty a zisky druhov nemali žiadny signifikantný vzťah ku zmenám makroklimatických podmienok a depozícií dusíka. Ako sa globálne antropogénne zmeny zintenzívňujú, lesná vegetácia čelí stratám a ziskom v špecifických fylogenetických vetvách a ekologických stratégiách, kým celková priemerná fylogenetická diverzita zostáva relatívne stabilná. El cambio global ha acelerado las extinciones y colonizaciones a escala local, lo que a menudo ha supuesto pérdidas y ganancias de linajes evolutivos con características únicas. Ahora bien, ¿estas pérdidas y ganancias ocurren aleatoriamente a lo largo de la filogenia? Cuantificamos: los cambios temporales en la diversidad filogenética de las plantas; y la relación filogenética de las especies perdidas y ganadas en 2.672 parcelas de vegetación semipermanente en sotobosques templados europeos y re-muestreadas durante un período promedio de 40 años. Al controlar por las diferencias en la riqueza de especies, la diversidad filogenética aumentó ligeramente con el tiempo y entre parcelas. Además, las especies perdidas dentro de las parcelas exhibieron un mayor grado de relación filogenética que las especies ganadas. Esto implica que las especies ganadas se originaron en un conjunto de linajes evolutivos más diversos que las especies perdidas. Ciertos linajes también perdieron y ganaron más especies de las esperadas aleatoriamente: Ericaceae, Fabaceae y Orchidaceae experimentaron pérdidas y Amaranthaceae, Cyperaceae y Rosaceae mostraron ganancias. Las pérdidas y ganancias de especies no mostraron ninguna señal filogenética significativa en respuesta a los cambios en las condiciones macro-climáticas y la deposición de nitrógeno. A medida que se intensifica el cambio global antropogénico, los sotobosques temperados experimentan pérdidas y ganancias en ramas filogenéticas y estrategias ecológicas específicas, mientras que la diversidad filogenética media general permanece relativamente estable.
Autres résumés
Type: Publisher
(cat)
El canvi global ha accelerat les extincions i colonitzacions a escala local, cosa que sovint ha suposat pèrdues i guanys de llinatges evolutius amb característiques singulars. Ara bé, aquestes pèrdues i guanys ocorren aleatòriament al llarg de la filogènia? En aquest estudi quantifiquem: els canvis temporals en la diversitat filogenètica de les plantes; i la relació filogenètica de les espècies perdudes i guanyades en 2.672 parcel·les de vegetació semi-permanent en sotaboscos temperats europeus i re-mostrejades durant un període mitjà de 40 anys. En controlar per les diferències en la riquesa d’espècies, la diversitat filogenètica va augmentar lleugerament amb el temps i entre parcel·les. A més, les espècies perdudes dins de les parcel·les presentaven un grau més alt de relació filogenètica que les espècies guanyades. Això implica que les espècies guanyades s’originaren en un conjunt de llinatges evolutius més diversos que les espècies perdudes. Certs llinatges també van perdre i van guanyar més espècies de les esperades aleatòriament: Ericaceae, Fabaceae i Orchidaceae van experimentar pèrdues i Amaranthaceae, Cyperaceae i Rosaceae van mostrar guanys. Les pèrdues i els guanys d’espècies no van mostrar cap senyal filogenètic significatiu en resposta als canvis en les condicions macro-climàtiques i la deposició de nitrogen. A mesura que s’intensifica el canvi global antropogènic, els sotaboscos temperats experimenten pèrdues i guanys en branques filogenètiques i estratègies ecològiques específiques, mentre que la diversitat filogenètica mitjana general roman relativament constant.
Type: Publisher
(chi)
全球变化正在加速物种的灭绝和迁徙以及殖民化,常常导致具有独特特征的进化谱系在群落水平的损失和增益。这些损失和增益在系统发育树上是随机发生的吗? 我们对欧洲温带森林林下的 2672 个半永久植被样地在平均 40 年后进行了重新调查并用这些数据量化了: 植物系统发育多样性的时间变化; 和 本地灭绝和新增的物种的系统发育关系。 在控制物种多样性差异的情况下,样地的系统发育多样性随时间略有增加。此外,样地内失去的物种比新增的物种具有更高的系统发育关联度。这意味着新增的物种来自比失去的物种更多样化的演化谱系。在群落水平上,某些谱系也失去和获得了比预期更多的物种,比如 Ericaceae、Fabaceae 和 Orchidaceae 经历了损失,而 Amaranthaceae、Cyperaceae 和 Rosaceae显示出增益。物种的损失和增益对气候条件和氮沉降的响应没有明显的系统发育信号。 随着全球变化的加剧,我们的研究表明温带森林林下植被经历了特定系统发育分支和生态策略的损失和增益,而整体的平均系统发育多样性保持相对稳定。.
Type: Publisher
(cze)
Globální změna urychlila procesy lokálního vymírání druhů a kolonizace, často vedoucí ke ztrátám a ziskům evolučních větví s unikátními vlastnostmi. Dochází však k těmto ztrátám a ziskům náhodně napříč fylogenetickým stromem? Kvantifikovali jsme: časové změny ve fylogenetické diverzitě rostlin; a fylogenetickou příbuznost vymizelých a nových druhů na základě souboru 2672 fytocenologických snímků podrostu evropských lesů mírného pásma, které byly zkoumány ve dvou časových obdobích vzdálených od sebe v průměru 40 let. Při zohlednění rozdílů v druhového bohatství mezi snímky došlo v průběhu času k mírnému zvýšení fylogenetické diverzity. Kromě toho vymizelé druhy v rámci ploch vykazovaly mezi sebou vyšší stupeň fylogenetické příbuznosti než druhy nově objevené. To znamená, že nové druhy pocházejí z rozmanitějšího souboru evolučních linií než druhy vyhynulé. Některé linie ztratily nebo získaly více druhů, než by odpovídalo náhodě, přičemž u čeledí Ericaceae, Fabaceae a Orchidaceae došlo ke ztrátám a u čeledí Amaranthaceae, Cyperaceae a Rosaceae k ziskům druhů. Ztráty a zisky druhů nebyly významně ovlivněné změnami makroklimatických podmínek ani depozicí dusíku. V důsledku intenzivnějších globálních změn dochází v podrostu lesů mírného pásma k úbytkům a ziskům určitých fylogenetických linií a ekologických strategií, přičemž celková průměrná fylogenetická diverzita zůstává relativně stabilní.
Type: Publisher
(dut)
Verandering van het milieu door de mens heeft lokaal uitsterven maar ook kolonisatie van nieuwe soorten versneld. Vaak resulteert dit in verlies en gewin van bepaalde evolutionaire lijnen met unieke kenmerken. Treden deze verliezen en winsten willekeurig op over de plantenstamboom (fylogenie)? We hebben: temporele veranderingen in fylogenetische diversiteit van planten (i.e. hoe verspreid zitten de planten die voorkomen op een bepaalde plaats in die stamboom); en de verwantschap van verloren en gewonnen soorten gekwantificeerd. Dit op basis van vegetatieopnamen en heropnamen in 2.672 quasi-permanente proefvlakken die de kruidlaag in gematigde Europese bossen vergelijken over een gemiddelde periode van 40 jaar. Rekening houdend met verschillen in soortenrijkdom, nam de fylogenetische diversiteit in de loop van de tijd en over proefvlakken licht toe. Bovendien vertoonden verloren soorten binnen proefvlakken een hogere mate van fylogenetische verwantschap dan gewonnen soorten. Dit impliceert dat gewonnen soorten afkomstig waren van een meer diverse set van evolutionaire lijnen dan verloren soorten. Bepaalde lijnen verloren en wonnen ook meer soorten dan verwacht bij toeval, met vooral verliezen bij de families Ericaceae, Fabaceae en Orchidaceae en winsten bij Amaranthaceae, Cyperaceae en Rosaceae. Soortverliezen en -winsten vertoonden geen significant fylogenetisch signaal in respons op veranderingen in macroklimatologische omstandigheden en stikstofdepositie. Met toenemende door de mens veroorzaakte milieuveranderingen, vertoont de kruidlaag van gematigde bossen verliezen en winsten in specifieke evolutionaire lijnen en ecologische strategieën, terwijl algemeen de gemiddelde fylogenetische diversiteit relatief stabiel blijft.
Type: Publisher
(fre)
Les changements globaux accélèrent les processus de colonisation et d’extinction locales d’espèces, aboutissant à des gains ou à des pertes de lignées évolutives uniques. Ces gains et pertes se produisent-ils de manière aléatoire dans l’arbre phylogénétique ? Nous avons mesuré: les changements de diversité phylogénétique; et la parenté phylogénétique des espèces végétales gagnées ou perdues dans 2672 placettes semi-permanentes disposées dans le sous-bois de forêts tempérées d’Europe sur une période moyenne de 40 ans. Une fois corrigée par la richesse spécifique, la diversité phylogénétique a légèrement augmenté au cours du temps dans les différentes placettes. Les espèces perdues ont une plus grande parenté phylogénétique que les espèces gagnées. Les espèces gagnées sont donc issues d’un plus grand nombre de lignées évolutives que les espèces perdues. Certaines lignées ont gagné ou perdu davantage d’espèces que ce qui est prédit par le hasard : les Ericaceae, les Fabaceae et les Orchidaceae ayant davantage perdu, tandis que les Amaranthaceae, les Cyperaceae, et les Rosaceae ont plus gagné. Il n’y a pas de signal phylogénétique des gains ou pertes d’espèces en réponse aux changements de conditions macroclimatiques ou des dépôts atmosphériques d’azote. Alors que les changements globaux d’origine anthropique s’intensifient, les sous-bois des forêts tempérées connaissent des gains et des pertes de certaines lignées évolutives et de certaines stratégies écologiques, sans que la diversité phylogénétique moyenne ne s’en trouve véritablement affectée.
Type: Publisher
(ger)
Der globale Wandel hat lokale Aussterbe- oder Besiedlungsprozesse beschleunigt, was oft zu einem Verlust oder Gewinn von eng verwandten Arten mit gemeinsamen Merkmalen geführt hat (beschrieben durch die Phylogenie der Arten). Hier soll die Frage beantwortet werden, ob diese Verluste und Gewinne zufällig verteilt über alle Verwandtschaftsgruppen auftreten. Wir haben: die zeitliche Veränderungen in der phylogenetischen Vielfalt der Pflanzen; und die phylogenetische Verwandtschaft der lokal verloren gegangenen und hinzugekommenen Arten quantifiziert basierend auf 2672 Dauerbeobachtungsflächen in europäischen Wäldern der gemäßigten Breiten über einen Zeitraum von durchschnittlich 40 Jahren. Bei Berücksichtigung der Unterschiede im Artenreichtum nahm die phylogenetische Vielfalt zwischen den Flächen im Laufe der Zeit leicht zu. Die lokal ausgestorbenen Arten weisen innerhalb der Flächen eine engere phylogenetische Verwandtschaft auf als die hinzugekommenen Arten. Dies deutet darauf hin, dass die neuen Arten aus diverseren evolutionären Linien stammen als die lokal verschwundenen Arten. Insbesondere die Pflanzenfamilien der Ericaceae, Fabaceae und Orchidaceae weisen Artenverluste auf, wogegen die Amaranthaceae, Cyperaceae und Rosaceae Artengewinne in der genetischen Vielfalt verzeichnen konnten. Artenverluste und -gewinne zeigten keine signifikanten phylogenetischen Signale als Reaktion auf Veränderungen der makroklimatischen Bedingungen und der Stickstoffdeposition. Mit der Intensivierung des anthropogenen globalen Wandels kommt es in der Bodenvegetation von Wäldern der gemäßigten Breiten zu Verlusten und Gewinnen bei einigen phylogenetischen Zweigen und ökologischen Strategietypen, während die durchschnittliche phylogenetische Vielfalt insgesamt relativ stabil bleibt.
Type: Publisher
(pol)
Globalne zmiany przyspieszają lokalne wymieranie i kolonizacje gatunków, często skutkując zanikaniem lub pojawianiem się linii ewolucyjnych o unikalnych cechach. Czy te straty i zyski występują losowo w całym drzewie filogenetycznym? Określiliśmy ilościowo: zmiany różnorodności filogenetycznej roślin w czasie; oraz filogenetyczne pokrewieństwo gatunków utraconych i gatunków, które wkroczyły na 2672 półstałe powierzchnie badawcze w europejskich lasach strefy umiarkowanej, zbadane średnio po 40 latach od pierwszych badań. Uwzględniając różnice w bogactwie gatunkowym, różnorodność filogenetyczna nieznacznie wzrosła w czasie i na powierzchniach. Co więcej, gatunki utracone w obrębie powierzchni wykazywały wyższy stopień pokrewieństwa filogenetycznego niż gatunki, które na nie wkroczyły. Oznacza to, że wkraczające gatunki pochodzą z bardziej zróżnicowanego zestawu linii ewolucyjnych niż gatunki utracone. Niektóre linie również straciły i zyskały więcej gatunków niż oczekiwano losowo, przy czym Ericaceae, Fabaceae i Orchidaceae doświadczyły strat, a Amaranthaceae, Cyperaceae i Rosaceae przyrostu liczby gatunków. Spadki i wzrosty liczby gatunków nie wykazywały istotnego sygnału filogenetycznego w odpowiedzi na zmiany warunków makroklimatycznych i depozycję azotu. W miarę nasilania się globalnych zmian antropogenicznych, runo lasów strefy umiarkowanej doświadcza strat i zysków gatunków w określonych gałęziach filogenetycznych i strategiach ekologicznych, podczas gdy ogólna średnia różnorodność filogenetyczna pozostaje względnie stabilna.
Type: Publisher
(slo)
Globálne zmeny prostredia zrýchlili lokálne vyhynutie druhov a kolonizáciu novými druhmi, čo často vedie ku stratám alebo ziskom genetických vývojových línií s unikátnymi vlastnosťami. Vyskytujú sa tieto straty a zisky v rámci fylogenézy náhodne? Kvantifikovali sme: časové zmeny vo fylogenetickej diverzite rastlín; a fylogenetickú príbuznosť lokálne vyhynutých a kolonizujúcich druhov na 2672 polo-trvalých plochách v temperátnych lesoch Európy, ktorých vegetácia bola opakovane preskúmaná v priemere po 40 rokoch. Zohľadňujúc rozdiely v počte druhov, fylogenetická diverzita mierne vzrástla v čase a naprieč plochami. Preukázalo sa, že vyhynuté druhy majú vyššiu fylogenetickú príbuznosť ako kolonizujúce druhy. To znamená, že kolonizujúce druhy pochádzajú z rôznorodejšej skupiny vývojových línií ako druhy vyhynuté. Určité línie tiež stratili alebo získali viac druhov, ako by tomu bolo len náhodou. Čeľade Ericaceae, Fabaceae a Orchidaceae preukázali straty, kým Amaranthaceae, Cyperaceae a Rosaceae zisky. Straty a zisky druhov nemali žiadny signifikantný vzťah ku zmenám makroklimatických podmienok a depozícií dusíka. Ako sa globálne antropogénne zmeny zintenzívňujú, lesná vegetácia čelí stratám a ziskom v špecifických fylogenetických vetvách a ekologických stratégiách, kým celková priemerná fylogenetická diverzita zostáva relatívne stabilná.
Type: Publisher
(spa)
El cambio global ha acelerado las extinciones y colonizaciones a escala local, lo que a menudo ha supuesto pérdidas y ganancias de linajes evolutivos con características únicas. Ahora bien, ¿estas pérdidas y ganancias ocurren aleatoriamente a lo largo de la filogenia? Cuantificamos: los cambios temporales en la diversidad filogenética de las plantas; y la relación filogenética de las especies perdidas y ganadas en 2.672 parcelas de vegetación semipermanente en sotobosques templados europeos y re-muestreadas durante un período promedio de 40 años. Al controlar por las diferencias en la riqueza de especies, la diversidad filogenética aumentó ligeramente con el tiempo y entre parcelas. Además, las especies perdidas dentro de las parcelas exhibieron un mayor grado de relación filogenética que las especies ganadas. Esto implica que las especies ganadas se originaron en un conjunto de linajes evolutivos más diversos que las especies perdidas. Ciertos linajes también perdieron y ganaron más especies de las esperadas aleatoriamente: Ericaceae, Fabaceae y Orchidaceae experimentaron pérdidas y Amaranthaceae, Cyperaceae y Rosaceae mostraron ganancias. Las pérdidas y ganancias de especies no mostraron ninguna señal filogenética significativa en respuesta a los cambios en las condiciones macro-climáticas y la deposición de nitrógeno. A medida que se intensifica el cambio global antropogénico, los sotobosques temperados experimentan pérdidas y ganancias en ramas filogenéticas y estrategias ecológicas específicas, mientras que la diversidad filogenética media general permanece relativamente estable.
Types de publication
Journal Article
Langues
eng
Sous-ensembles de citation
IM
Subventions
Organisme : Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca
ID : 2020-BP-00013
Organisme : Agentúra na Podporu Výskumu a Vývoja
ID : APVV-19-0319
Organisme : Akademie Věd České Republiky
ID : RVO 67985939
Organisme : EU Horizon 2020-funded eLTER PLUS project
ID : 871128
Organisme : Grantová Agentura České Republiky
ID : 19-28491X
Organisme : National Science Foundation
ID : DEB 2213567
Informations de copyright
© 2023 The Authors. New Phytologist © 2023 New Phytologist Foundation.
Références
Archaux F, Wolters V. 2006. Impact of summer drought on forest biodiversity: what do we know? Annals of Forest Science 63: 645-652.
Barber N, Jones HP, Duvall MR, Wysocki WP, Hansen MJ, Gibson DJ. 2016. Phylogenetic diversity is maintained despite richness losses over time in restored tallgrass prairie plant communities. Journal of Applied Ecology 54: 137-144.
Berendse F, Geerts R, Elberse WT, Bezemer TM, Goedhart PW, Xue W, Noordijk E, ter Braak CJF, Korevaar H. 2021. A matter of time: recovery of plant species diversity in wild plant communities at declining nitrogen deposition. Diversity and Distributions 27: 1180-1193.
Bernhardt-Römermann M, Baeten L, Craven D, De Frenne P, Hédl R, Lenoir J, Bert D, Brunet J, Chudomelová M, Decocq G et al. 2015. Drivers of temporal changes in temperate forest plant diversity vary across spatial scales. Global Change Biology 21: 3726-3737.
Bruelheide H, Dengler J, Purschke O, Lenoir J, Jiménez-Alfaro B, Hennekens SM, Botta-Dukát Z, Chytrý M, Field R, Jansen F et al. 2018. Global trait-environment relationships of plant communities. Nature Ecology & Evolution 2: 1906-1917.
Cavender-Bares J, Ackerly DD, Baum DA, Bazzaz FA. 2004. Phylogenetic overdispersion in Floridian oak communities. American Naturalist 163: 823-843.
Chai Y, Yue M, Liu X, Guo Y, Wang M, Xu J, Zhang C, Chen Y, Zhang L, Zhang R. 2016. Patterns of taxonomic, phylogenetic diversity during a long-term succession of forest on the Loess Plateau, China: insights into assembly process. Scientific Reports 6: 27087.
Chao A, Chiu C-H, Jost L. 2010. Phylogenetic diversity measures based on Hill numbers. Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences 365: 3599-3609.
CITES. 2019. CITES Appendix II. [WWW document] URL https://cites.org/sites/default/files/eng/app/2019/E-Appendices-2019-11-26.pdf [Accessed 24 November 2022].
Clayton WD. 1981. Evolution and distribution of grasses. Annals of the Missouri Botanical Garden 68: 5-14.
Closset-Kopp D, Hattab T, Decocq G. 2019. Do drivers of forestry vehicles also drive herb layer changes (1970-2015) in a temperate forest with contrasting habitat and management conditions? Journal of Ecology 107: 1439-1456.
Cohen J. 1998. Statistical power analysis for the behavioral sciences, 2nd edn. Mahwah, NJ, USA: Erlbaum.
De Frenne P, Rodríguez-Sánchez F, Coomes DA, Baeten L, Verstraeten G, Vellend M, Bernhardt-Römermann M, Brown CD, Brunet J, Cornelis J et al. 2013. Microclimate moderates plant responses to macroclimate warming. Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 110: 18561-18565.
De Pauw K, Meeussen C, Govaert S, Sanczuk P, Vanneste T, Bernhardt-Römermann M, Bollmann K, Brunet J, Calders K, Cousins SAO et al. 2021. Taxonomic, phylogenetic and functional diversity of understorey plants respond differently to environmental conditions in European forest edges. Journal of Ecology 109: 2629-2648.
Debastiani VJ, Bastazini VAG, Pillar VD. 2021. Using phylogenetic information to impute missing functional trait values in ecological databases. Ecological Informatics 63: 101315.
Díaz S, Cabido M, Casanoves F. 1998. Plant functional traits and environmental filters at a regional scale. Journal of Vegetation Science 9: 113-122.
Díaz S, Kattge J, Cornelissen JHC, Wright IJ, Lavorel S, Dray S, Reu B, Kleyer M, Wirth C, Prentice IC et al. 2016. The global spectrum of plant form and function. Nature 529: 167-171.
Duprè C, Stevens CJ, Ranke T, Bleeker A, Peppler-Lisbach C, Gowing DJG, Dise NB, Dorland E, Bobbink R, Diekmann M. 2010. Changes in species richness and composition in European acidic grasslands over the past 70 years: the contribution of cumulative atmospheric nitrogen deposition. Global Change Biology 16: 344-357.
Eiserhardt WL, Borchsenius F, Plum CM, Ordonez A, Svenning J-C. 2015. Climate-driven extinctions shape the phylogenetic structure of temperate tree floras. Ecology Letters 18: 263-272.
European Commission. 2022. European State of the Climate (ESOTC) 2022. [WWW document] URL https://climate.copernicus.eu/esotc/2022 [accessed 2 August 2023].
Faith DP. 1992. Conservation evaluation and phylogenetic diversity. Biological Conservation 61: 1-10.
Gerhold P, Cahill JF, Winter M, Bartish IV, Prinzing A. 2015. Phylogenetic patterns are not proxies of community assembly mechanisms (they are far better). Functional Ecology 29: 600-614.
Gilliam FS. 2007. The ecological significance of the herbaceous layer in temperate forest ecosystems. Bioscience 57: 845-858.
Haddad NM, Brudvig LA, Clobert J, Davies KF, Gonzalez A, Holt RD, Lovejoy TE, Sexton JO, Austin MP, Collins CD et al. 2015. Habitat fragmentation and its lasting impact on Earth's ecosystems. Science Advances 1: e1500052.
Harris C, Brummitt N, Cobbold CA, Reeve R. 2022a. Strong phylogenetic signals in global plant bioclimatic envelopes. Global Ecology and Biogeography 31: 2191-2203.
Harris IC, Jones PD, Osborn T. 2022b. CRU TS4.06: Climatic Research Unit (CRU) Time-Series (TS) version 4.06 of high-resolution gridded data of month-by-month variation in climate (Jan. 1901- Dec. 2021). NERC EDS Centre for Environmental Data Analysis. [WWW document] URL https://catalogue.ceda.ac.uk/uuid/e0b4e1e56c1c4460b796073a31366980 [accessed 17 November 2022].
Hawkins BA, Rueda M, Rangel TF, Field R, Diniz-Filho JAF. 2014. Community phylogenetics at the biogeographical scale: cold tolerance, niche conservatism and the structure of North American forests. Journal of Biogeography 41: 23-38.
IPBES. 2019. Summary for policymakers of the global assessment report on biodiversity and ecosystem services of the Intergovernmental Science-Policy Platform on Biodiversity and Ecosystem Services. Bonn, Germany: IPBES Secretariat.
Ives AR, Zhu J. 2006. Statistics for correlated data: phylogenies, space, and time. Ecological Applications 16: 20-32.
Jandt U, Bruelheide H, Jansen F, Bonn A, Grescho V, Klenke RA, Sabatini FM, Bernhardt-Römermann M, Blüml V, Dengler J et al. 2022. More losses than gains during one century of plant biodiversity change in Germany. Nature 611: 512-518.
Jin Y, Qian H. 2022. V.PhyloMaker2: an updated and enlarged R package that can generate very large phylogenies for vascular plants. Plant Diversity 4: 335-339.
Kattge J, Bönisch G, Díaz S, Lavorel S, Prentice IC, Leadley P, Tautenhahn S, Werner GDA, Aakala T, Abedi M et al. 2020. TRY plant trait database -enhanced coverage and open access. Global Change Biology 26: 119-188.
Keddy PA. 1992. Assembly and response rules -two goals for predictive community ecology. Journal of Vegetation Science 3: 157-164.
Kindt R. 2020. WorldFlora: an R package for exact and fuzzy matching of plant names against the World Flora Online taxonomic backbone data. Applications in Plant Sciences 8: e11388.
Kopecký M, Hédl R, Szabó P. 2012. Non-random extinctions dominate plant community changes in abandoned coppices. Journal of Applied Ecology 50: 79-87.
Lavorel S, Garnier E. 2002. Predicting changes in community composition and ecosystem functioning from plant traits: revisiting the Holy Grail. Functional Ecology 16: 545-556.
Letten AD, Keith DA, Tozer MG. 2014. Phylogenetic and functional dissimilarity does not increase during temporal heathland succession. Proceedings of the Royal Society B 281: 20142102.
Li D, Olden JD, Lockwood JL, Record S, McKinney ML, Baiser B. 2020. Changes in taxonomic and phylogenetic diversity in the Anthropocene. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 287: 20200777.
Li D, Waller D. 2017. Fire exclusion and climate change interact to affect long-term changes in the functional composition of plant communities. Diversity and Distributions 23: 496-506.
Li SP, Cadotte MW, Meiners SJ, Hua ZS, Jiang L, Shu WS. 2015. Species colonisation, not competitive exclusion, drives community overdispersion over long-term succession. Ecology Letters 18: 964-973.
Loidi J, Chytrý M, Jiménez-Alfaro B, Alessi N, Biurrun I, Campos JA, Čarni A, Fernández-Pascual E, Font Castell X, Gholizadeh H et al. 2021. Life-form diversity across temperate deciduous forests of Western Eurasia: a different story in the understory. Journal of Biogeography 48: 2932-2945.
Losos JB. 2008. Phylogenetic niche conservatism, phylogenetic signal and the relationship between phylogenetic relatedness and ecological similarity among species. Ecology Letters 11: 995-1007.
Mace GM, Gittleman JL, Purvis A. 2003. Preserving the tree of life. Science 300: 1707-1709.
Magurran AE, Henderson PA. 2010. Temporal turnover and the maintenance of diversity in ecological communities. Philosophical Transactions of the Royal Society B 365: 3611-3620.
Mathakutha R, Steyn C, le Roux PC, Blom IJ, Chown SL, Daru BH, Ripley BS, Louw A, Greve M. 2019. Invasive species differ in key functional traits from native and non-invasive alien plant species. Journal of Vegetation Science 30: 994-1006.
Mohieddinne H, Brasseur B, Gallet-Moron E, Lenoir J, Spicher F, Kobaissi A, Horen H. 2022. Assessment of soil compaction and rutting in managed forests through an airborne LiDAR technique. Land Degradation & Development 34: 1558-1569.
Naimi B, Hamm N, Groen TA, Skidmore AK, Toxopeus AG. 2014. Where is positional uncertainty a problem for species distribution modelling. Ecography 37: 191-203.
Navarro DJ. 2015. Learning statistics with R: a tutorial for psychology students and other beginners. Adelaide, SA, Australia: University of Adelaide.
Orme D, Freckleton R, Thomas G, Petzoldt T, Fritz S, Isaac N, Pearse W. 2018. caper: comparative analyses of phylogenetics and evolution in R. R package v.1.0.1. [WWW document] URL https://CRAN.R-project.org/package=caper [accessed 11 April 2023].
Owen NR, Gumbs R, Gray CL, Faith DP. 2019. Global conservation of phylogenetic diversity captures more than just functional diversity. Nature Communications 10: 859.
Pagel M. 1999. Inferring the historical patterns of biological evolution. Nature 401: 877-884.
Penone C, Davidson AD, Shoemaker KT, Di Marco M, Rondinini C, Brooks TM, Young BE, Graham CH, Costa GC. 2014. Imputation of missing data in life-history trait datasets: which approach performs the best? Methods in Ecology and Evolution 5: 961-970.
Perring MP, Bernhardt-Römermann M, Baeten L, Midolo G, Blondeel H, Depauw L, Landuyt D, Maes SL, de Lombaerde E, Carón MM et al. 2018. Global environmental change effects on plant community composition trajectories depend upon management legacies. Global Change Biology 24: 1722-1740.
Pilon NA, Durigan G, Rickenback J, Pennington RT, Dexter KG, Hoffmann WA, Landuyt D, Maes SL, De Lombaerde E, Carón MM et al. 2020. Shade alters savanna grass layer structure and function along a gradient of canopy cover. Journal of Vegetation Science 32: e12959.
Pinheiro J, Bates D, R Core Team. 2022. nlme: linear and nonlinear mixed effects models. R package v.3.1.157. https://CRAN.R-project.org/package=nlme [accessed 5 April 2023].
Poggio L, de Sousa LM, Batjes NH, Heuvelink GBM, Kempen B, Ribeiro E, Rossiter D. 2021. SoilGrids 2.0: producing soil information for the globe with quantified spatial uncertainty. The Soil 7: 217-240.
Purschke O, Schmid BC, Sykes MT, Poschlod P, Michalski SG, Durka W, Kühn I, Winter M, Prentice HC. 2013. Contrasting changes in taxonomic, phylogenetic and functional diversity during a long-term succession: insights into assembly processes. Journal of Ecology 101: 857-866.
Qian H, Jin Y. 2016. An updated megaphylogeny of plants, a tool for generating plant phylogenies and an analysis of phylogenetic community structure. Journal of Plant Ecology 9: 233-239.
Qian H, Jin Y. 2021. Are phylogenies resolved at the genus level appropriate for studies on phylogenetic structure of species assemblages? Plant Diversity 4: 255-263.
R Core Team. 2022. R: a language and environment for statistical computing. Vienna, Austria: R Foundation for Statistical. [WWW document] URL https://www.R-project.org/ [accessed 1 March 2023].
Revell LJ. 2012. phytools: an R package for phylogenetic comparative biology (and other things). Methods in Ecology and Evolution 3: 217-223.
Santos T. 2018. Pvr: phylogenetic eigenvectors regression and phylogenetic signal-representation curve. R Package v.0.3. [WWW document] URL https://CRAN.R-project.org/package=PVR [accessed 1 August 2023].
Segar J, Pereira HM, Baeten L, Bernhardt-Römermann M, De Frenne P, Fernández N, Gilliam FS, Lenoir J, Ortmann-Ajkai A, Verheyen K et al. 2022. Divergent roles of herbivory in eutrophying forests. Nature Communications 13: 7837.
Simkin SM, Allen EB, Bowman WD, Clark CM, Belnap J, Brooks ML, Cade BS, Collins SL, Geiser LH, Gilliam FS et al. 2016. Conditional vulnerability of plant diversity to atmospheric nitrogen deposition across the United States. Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 113: 4086-4091.
Smith SA, Brown JW. 2018. Constructing a broadly inclusive seed plant phylogeny. American Journal of Botany 105: 302-314.
Sodhi NS, Koh LP, Peh KS-H, Tan HTW, Chazdon RL, Corlett RT, Lee TM, Colwell RK, Brook BW, Sekercioglu CH et al. 2008. Correlates of extinction proneness in tropical angiosperms. Diversity and Distributions 14: 1-10.
Staude IR, Waller DM, Bernhardt-Römermann M, Bjorkman AD, Brunet J, De Frenne P, Hédl R, Jandt U, Lenoir J, Máliš F et al. 2020. Replacements of small- by large-ranged species scale up to diversity loss in Europe's temperate forest biome. Nature Ecology & Evolution 4: 802-808.
Stekhoven DJ. 2022. missForest: nonparametric missing value imputation using random forest. R package v.1.5. [WWW document] URL https://cran.r-project.org/web/packages/missForest/ [accessed 1 August 2023].
van Strien AJ, Boomsluiter M, Noordeloos ME, Verweij RJT, Kuyper TW. 2017. Woodland ectomycorrhizal fungi benefit from large-scale reduction in nitrogen deposition in The Netherlands. Journal of Applied Ecology 55: 290-298.
Suggitt AJ, Wilson RJ, Isaac NJB, Beale CM, Auffret AG, August T, Bennie JJ, Crick HQP, Duffield S, Fox R et al. 2018. Extinction risk from climate change is reduced by microclimatic buffering. Nature Climate Change 8: 713-717.
Tsirogiannis C, Sandel B. 2016. PhyloMeasures: a package for computing phylogenetic biodiversity measures and their statistical moments. Ecography 39: 709-714.
Valiente-Banuet A, Verdú M. 2013. Plant facilitation and phylogenetics. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 44: 347-366.
Vamosi JC, Wilson JRU. 2008. Nonrandom extinction leads to elevated loss of angiosperm evolutionary history. Ecology Letters 11: 1047-1053.
Vellend M, Baeten L, Myers-Smith IH, Elmendorf SC, Beauséjour R, Brown CD, De Frenne P, Verheyen K, Wipf S. 2013. Global meta-analysis reveals no net change in local-scale plant biodiversity over time. Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 110: 19456-19459.
Verheyen K, Bažány M, Chećko E, Chudomelová M, Closset-Kopp D, Czortek P, Decocq G, De Frenne P, De Keersmaeker L, Enríquez García C et al. 2018. Observer and relocation errors matter in resurveys of historical vegetation plots. Journal of Vegetation Science 29: 812-823.
Verheyen K, De Frenne P, Baeten L, Waller DM, Hédl R, Perring MP, Blondeel H, Brunet J, Chudomelová M, Decocq G et al. 2017. Combining biodiversity resurveys across regions to advance global change research. Bioscience 67: 73-83.
Webb CO, Ackerly DD, Kembel SW. 2008. Phylocom: software for the analysis of phylogenetic community structure and trait evolution. Bioinformatics 18: 2098-2100.
Webb CO, Ackerly DD, McPeek MA, Donoghue MJ. 2002. Phylogenies and community ecology. Annual Review of Ecology and Systematics 3: 475-505.
Westoby M. 1998. A leaf-height-seed (LHS) plant ecology strategy scheme. Plant and Soil 19: 213-227.
Zellweger F, De Frenne P, Lenoir J, Vangansbeke P, Verheyen K, Bernhardt-Römermann M, Baeten L, Hédl R, Berki I, Brunet J et al. 2020. Forest microclimate dynamics drive plant responses to warming. Science 368: 772-775.
Zuur AF, Leno EN, Smith GM. 2007. Analysing ecological data. New York, NY, USA: Springer.