Structural Variant Disrupting the Expression of the Remote

Axenfeld–Rieger FOXC1 eye malformation inversion microphthalmia structural variant

Journal

International journal of molecular sciences
ISSN: 1422-0067
Titre abrégé: Int J Mol Sci
Pays: Switzerland
ID NLM: 101092791

Informations de publication

Date de publication:
25 Feb 2024
Historique:
received: 17 01 2024
revised: 21 02 2024
accepted: 23 02 2024
medline: 13 3 2024
pubmed: 13 3 2024
entrez: 13 3 2024
Statut: epublish

Résumé

Ocular malformations (OMs) arise from early defects during embryonic eye development. Despite the identification of over 100 genes linked to this heterogeneous group of disorders, the genetic cause remains unknown for half of the individuals following Whole-Exome Sequencing. Diagnosis procedures are further hampered by the difficulty of studying samples from clinically relevant tissue, which is one of the main obstacles in OMs. Whole-Genome Sequencing (WGS) to screen for non-coding regions and structural variants may unveil new diagnoses for OM individuals. In this study, we report a patient exhibiting a syndromic OM with a de novo 3.15 Mb inversion in the 6p25 region identified by WGS. This balanced structural variant was located 100 kb away from the

Identifiants

pubmed: 38473917
pii: ijms25052669
doi: 10.3390/ijms25052669
pii:
doi:

Types de publication

Case Reports

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Auteurs

Julie Plaisancié (J)

Laboratoire de Référence des Anomalies Malformatives de l'Œil, Institut Fédératif de Biologie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.
Centre de Référence des Affections Rares en Génétique Ophtalmologique (CARGO), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.
Molecular, Cellular and Developmental Biology Unit (MCD), Centre de Biologie Intégrative (CBI), (CNRS), Université Toulouse III Paul Sabatier (UPS), Université de Toulouse, 31062 Toulouse, France.

Bertrand Chesneau (B)

Laboratoire de Référence des Anomalies Malformatives de l'Œil, Institut Fédératif de Biologie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.
Centre de Référence des Affections Rares en Génétique Ophtalmologique (CARGO), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.
Molecular, Cellular and Developmental Biology Unit (MCD), Centre de Biologie Intégrative (CBI), (CNRS), Université Toulouse III Paul Sabatier (UPS), Université de Toulouse, 31062 Toulouse, France.

Lucas Fares-Taie (L)

Laboratoire de Génétique Ophtalmologique, Institut national de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) U1163, Institut Imagine, 75015 Paris, France.

Jean-Michel Rozet (JM)

Laboratoire de Génétique Ophtalmologique, Institut national de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) U1163, Institut Imagine, 75015 Paris, France.

Jacmine Pechmeja (J)

Centre de Référence des Affections Rares en Génétique Ophtalmologique (CARGO), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.
Service d'Ophtalmologie, Hôpital Purpan, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.

Julien Noero (J)

Laboratoire de Référence des Anomalies Malformatives de l'Œil, Institut Fédératif de Biologie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.
Molecular, Cellular and Developmental Biology Unit (MCD), Centre de Biologie Intégrative (CBI), (CNRS), Université Toulouse III Paul Sabatier (UPS), Université de Toulouse, 31062 Toulouse, France.

Véronique Gaston (V)

Laboratoire de Référence des Anomalies Malformatives de l'Œil, Institut Fédératif de Biologie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.

Isabelle Bailleul-Forestier (I)

Competence Centre of Oral Diseases, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.

Patrick Calvas (P)

Laboratoire de Référence des Anomalies Malformatives de l'Œil, Institut Fédératif de Biologie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.
Centre de Référence des Affections Rares en Génétique Ophtalmologique (CARGO), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.

Nicolas Chassaing (N)

Laboratoire de Référence des Anomalies Malformatives de l'Œil, Institut Fédératif de Biologie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.
Centre de Référence des Affections Rares en Génétique Ophtalmologique (CARGO), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31300 Toulouse, France.
Laboratoire AURAGEN, 69003 Lyon, France.

Classifications MeSH