Chemoselective Proteomics, Zinc Fingers, and a Zinc(II) Model for H
hydrogen sulfide
persulfidation
proteomics
small molecules
zinc finger proteins
Journal
Angewandte Chemie (International ed. in English)
ISSN: 1521-3773
Titre abrégé: Angew Chem Int Ed Engl
Pays: Germany
ID NLM: 0370543
Informations de publication
Date de publication:
29 May 2024
29 May 2024
Historique:
received:
15
01
2024
medline:
29
5
2024
pubmed:
29
5
2024
entrez:
29
5
2024
Statut:
aheadofprint
Résumé
The gasotransmitter hydrogen sulfide (H
Identifiants
pubmed: 38808693
doi: 10.1002/anie.202401003
doi:
Types de publication
Journal Article
Langues
eng
Sous-ensembles de citation
IM
Pagination
e202401003Subventions
Organisme : NIH HHS
ID : R01GM139854
Pays : United States
Organisme : NIH HHS
ID : R35GM149233
Pays : United States
Informations de copyright
© 2024 Wiley-VCH GmbH.
Références
M. R. Filipovic, J. Zivanovic, B. Alvarez, R. Banerjee, Chem. Rev. 2018, 118, 1253–1337.
K. R. Olson, Free Radic. Biol. Med. 2019, 140, 74–83.
R. Hosoki, N. Matsuki, H. Kimura, Biochem. Biophys. Res. Commun. 1997, 237, 527–531;
B. D. Paul, S. H. Snyder, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2012, 13, 499–507;
M. D. Hartle, M. D. Pluth, Chem. Soc. Rev. 2016, 45, 6108–6117.
B. He, Z. Zhang, Z. Huang, X. Duan, Y. Wang, J. Cao, L. Li, K. He, E. C. Nice, W. He, W. Gao, Z. Shen, Biochem. Pharmacol. 2023, 209, 115444;
J. I. Sbodio, S. H. Snyder, B. D. Paul, Br. J. Pharmacol. 2019, 176, 583–593.
E. Donnarumma, R. K. Trivedi, D. J. Lefer, Compr. Physiol. 2017, 7, 583–602;
H. Kimura, Antioxid. Redox Signal. 2015, 22, 362–376.
D. Basudhar, L. A. Ridnour, R. Cheng, A. H. Kesarwala, J. Heinecke, D. A. Wink, Coord. Chem. Rev. 2016, 306, 708–723;
O. Kabil, R. Banerjee, Antioxid. Redox Signal. 2014, 20, 770–782;
J. M. Fukuto, L. J. Ignarro, P. Nagy, D. A. Wink, C. G. Kevil, M. Feelisch, M. M. Cortese-Krott, C. L. Bianco, Y. Kumagai, A. J. Hobbs, J. Lin, T. Ida, T. Akaike, FEBS Lett. 2018, 592, 2140–2152;
V. Vitvitsky, J. L. Miljkovic, T. Bostelaar, B. Adhikari, P. K. Yadav, A. K. Steiger, R. Torregrossa, M. D. Pluth, M. Whiteman, R. Banerjee, M. R. Filipovic, ACS Chem. Biol. 2018, 13, 2300–2307;
É. Dóka, T. Ida, M. Dagnell, Y. Abiko, N. C. Luong, N. Balog, T. Takata, B. Espinosa, A. Nishimura, Q. Cheng, Y. Funato, H. Miki, J. M. Fukuto, J. R. Prigge, E. E. Schmidt, E. S. J. Arnér, Y. Kumagai, T. Akaike, P. Nagy, Sci. Adv. 2020, 6, eaax8358.
E. Cuevasanta, M. Lange, J. Bonanata, E. L. Coitiño, G. Ferrer-Sueta, M. R. Filipovic, B. Alvarez, J. Biol. Chem. 2015, 290, 26866–26880;
B. D. Paul, S. H. Snyder, Trends Biochem. Sci. 2015, 40, 687–700;
T. Vignane, M. R. Filipovic, Antioxid. Redox Signal. 2023, 39, 19–39.
C. Andreini, L. Banci, I. Bertini, A. Rosato, J. Proteome Res. 2006, 5, 196–201;
C. Andreini, L. Banci, I. Bertini, A. Rosato, J. Proteome Res. 2006, 5, 3173–3178;
K. Ok, M. R. Filipovic, S. L. J. Michel, Eur. J. Inorg. Chem. 2021, 2021, 3795–3805;
C. Wiedemann, A. Kumar, A. Lang, O. Ohlenschläger, Front. Chem. 2020, 8, 280.
S. J. Lee, S. L. J. Michel, Acc. Chem. Res. 2014, 47, 2643–2650.
N. J. Pace, E. Weerapana, Biomolecules 2014, 4, 419–434.
M. Lange, K. Ok, G. D. Shimberg, B. Bursac, L. Markó, I. Ivanović-Burmazović, S. L. J. Michel, M. R. Filipovic, Angew. Chem. Int. Ed. 2019, 58, 7997–8001;
M. S. Vandiver, B. D. Paul, R. Xu, S. Karuppagounder, F. Rao, A. M. Snowman, H. S. Ko, Y. I. Lee, V. L. Dawson, T. M. Dawson, N. Sen, S. H. Snyder, Nat. Commun. 2013, 4, 1626;
K. Zhao, S. Li, L. Wu, C. Lai, G. Yang, J. Biol. Chem. 2014, 289, 20824–20835;
S. Saha, P. K. Chakraborty, X. Xiong, S. K. Dwivedi, S. B. Mustafi, N. R. Leigh, R. Ramchandran, P. Mukherjee, R. Bhattacharya, FASEB J. 2016, 30, 441–456;
Y. Yuan, L. Zhu, L. Li, J. Liu, Y. Chen, J. Cheng, T. Peng, Y. Lu, Antioxid. Redox Signal. 2019, 31, 1302–1319;
C. Du, X. Lin, W. Xu, F. Zheng, J. Cai, J. Yang, Q. Cui, C. Tang, J. Cai, G. Xu, B. Geng, Antioxid. Redox Signal. 2019, 30, 184–197;
A. Dey, S. Prabhudesai, Y. Zhang, G. Rao, K. Thirugnanam, M. N. Hossen, S. K. D. Dwivedi, R. Ramchandran, P. Mukherjee, R. Bhattacharya, Sci. Adv. 2020, 6, eaaz8534;
D. Liu, H. Song, Y. Li, R. Huang, H. Liu, K. Tang, N. Jiao, J. Liu, Antioxidants 2023, 12, 423.
C. Tiedje, M. D. Diaz-Muñoz, P. Trulley, H. Ahlfors, K. Laaβ, P. J. Blackshear, M. Turner, M. Gaestel, Nucleic Acids Res. 2016, 44, 7418–7440;
R. Alkallas, L. Fish, H. Goodarzi, H. S. Najafabadi, Nat. Commun. 2017, 8, 909.
I. Bertini, L. Decaria, A. Rosato, J. Biol. Inorg. Chem. 2010, 15, 1071–1078.
J. Zivanovic, E. Kouroussis, J. B. Kohl, B. Adhikari, B. Bursac, S. Schott-Roux, D. Petrovic, J. L. Miljkovic, D. Thomas-Lopez, Y. Jung, M. Miler, S. Mitchell, V. Milosevic, J. E. Gomes, M. Benhar, B. Gonzalez-Zorn, I. Ivanovic-Burmazovic, R. Torregrossa, J. R. Mitchell, M. Whiteman, G. Schwarz, S. H. Snyder, B. D. Paul, K. S. Carroll, M. R. Filipovic, Cell Metab. 2019, 30, 1152–1170;
A. Aroca, A. Jurado-Flores, M. R. Filipovic, C. Gotor, L. C. Romero, Methods Enzymol. 2022, 676, 385–402;
B. Pedre, D. Talwar, U. Barayeu, D. Schilling, M. Luzarowski, M. Sokolowski, S. Glatt, T. P. Dick, Nat. Chem. Biol. 2023, 19, 507–517;
M. García-Calderón, T. Vignane, M. R. Filipovic, M. T. Ruiz, L. C. Romero, A. J. Márquez, C. Gotor, A. Aroca, New Phytol. 2023, 238, 1431–1445;
S. I. Bibli, J. Hu, M. Looso, A. Weigert, C. Ratiu, J. Wittig, M. K. Drekolia, L. Tombor, V. Randriamboavonjy, M. S. Leisegang, P. Goymann, F. Delgado Lagos, B. Fisslthaler, S. Zukunft, A. Kyselova, A. F. O. Justo, J. Heidler, D. Tsilimigras, R. P. Brandes, S. Dimmeler, A. Papapetropoulos, S. Knapp, S. Offermanns, I. Wittig, S. L. Nishimura, F. Sigala, I. Fleming, Circulation 2021, 143, 935–948.
L. Fu, K. Liu, J. He, C. Tian, X. Yu, J. Yang, Antioxid. Redox Signaling 2020, 33, 1061–1076.
S. Negi, M. Imanishi, M. Hamori, Y. Kawahara-Nakagawa, W. Nomura, K. Kishi, N. Shibata, Y. Sugiura, J. Biol. Inorg. Chem. 2023, 28, 249–261.
S. L. J. Michel, A. L. Guerrerio, J. M. Berg, Biochemistry 2003, 42, 4626–4630.
A. T. Stoltzfus, C. J. Campbell, M. M. Worth, K. Hom, T. L. Stemmler, S. L. J. Michel, J. Biol. Inorg. Chem. 2023, 28, 85–100.
H. R. Ellis, L. B. Poole, Biochemistry 1997, 36, 15013–15018.
P. B. Ghosh, M. W. Whitehouse, Biochem. J. 1968, 108, 155–156;
V. Gupta, K. S. Carroll, Biochim. Biophys. Acta Gen. Subj. 2014, 1840, 847–875.
M. Hardy, J. Zielonka, H. Karoui, A. Sikora, R. Michalski, R. Podsiadly, M. Lopez, J. Vasquez-Vivar, B. Kalyanaraman, O. Ouari, Antioxid. Redox Signal. 2018, 28, 1416–1432.
H. Zhao, S. Kalivendi, H. Zhang, J. Joseph, K. Nithipatikom, J. Vásquez-Vivar, B. Kalyanaraman, Free Radic. Biol. Med. 2003, 34, 1359–1368.
M. Ballesteros, E. Y. Tsui, Inorg. Chem. 2019, 58, 10501–10507;
W. T. M. Seo, M. Ballesteros, E. Y. Tsui, J. Am. Chem. Soc. 2022, 144, 20630–20640.
S. Chang, V. V. Karambelkar, R. C. diTargiani, D. P. Goldberg, Inorg. Chem. 2001, 40, 194–195.
M. D. Hartle, M. Delgado, J. D. Gilbertson, M. D. Pluth, Chem. Commun. 2016, 52, 7680–7682;
J. G. Melnick, A. Docrat, G. Parkin, Chem. Commun. 2004, 2870–2871.
U. Brand, H. Vahrenkamp, Inorganica Chim. Acta 2000, 308, 97–102.
R. A. Hankins, S. I. Suarez, M. A. Kalk, N. M. Green, M. N. Harty, J. C. Lukesh, Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59, 22238–22245.
N. Sen, B. D. Paul, M. M. Gadalla, A. K. Mustafa, T. Sen, R. Xu, S. Kim, S. H. Snyder, Mol. Cell 2012, 45, 13–24.
J. P. Emerson, E. G. Kovaleva, E. R. Farquhar, J. D. Lipscomb, L. Que Jr., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 7347–7352.
M. B. Ward, A. Scheitler, M. Yu, L. Senft, A. S. Zillmann, J. D. Gorden, D. D. Schwartz, I. Ivanović-Burmazović, C. R. Goldsmith, Nat. Chem. 2018, 10, 1207–1212.
A. Dey, P. K. Pramanik, S. K. D. Dwivedi, F. Neizer-Ashun, T. Kiss, A. Ganguly, H. Rice, P. Mukherjee, C. Xu, M. Ahmad, A. Csiszar, R. Bhattacharya, Redox Biol. 2023, 68, 102958.
S. A. Cohen, D. J. Strydom, Anal. Biochem. 1988, 174, 1–16.
R. G. W. Gingerich, R. J. Angelici, J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 5604–5608.
V. Bogdándi, T. Ida, T. R. Sutton, C. Bianco, T. Ditrói, G. Koster, H. A. Henthorn, M. Minnion, J. P. Toscano, A. van der Vliet, M. D. Pluth, M. Feelisch, J. M. Fukuto, T. Akaike, P. Nagy, Br. J. Pharmacol. 2019, 176, 646–670;
T. S. Bailey, H. A. Henthorn, M. D. Pluth, Inorg. Chem. 2016, 55, 12618–12625.
T. J. Sherbow, L. N. Zakharov, D. W. Johnson, M. D. Pluth, Inorg. Chem. 2020, 59, 15574–15578;
K. Li, L. N. Zakharov, M. D. Pluth, J. Am. Chem. Soc. 2023, 145, 13435–13443.
G. M. Sheldrick, Acta Crystallogr. 2015, 71, 3–8.