Controlling Pericellular Oxygen Tension in Cell Culture Reveals Distinct Breast Cancer Responses to Low Oxygen Tensions.
anoxia
breast cancer
cancer metabolism
cell culture
hypoxia
hypoxia‐inducible factors
oxygen
physioxia
Journal
Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
ISSN: 2198-3844
Titre abrégé: Adv Sci (Weinh)
Pays: Germany
ID NLM: 101664569
Informations de publication
Date de publication:
14 Jun 2024
14 Jun 2024
Historique:
revised:
11
04
2024
received:
14
03
2024
medline:
14
6
2024
pubmed:
14
6
2024
entrez:
14
6
2024
Statut:
aheadofprint
Résumé
In oxygen (O
Identifiants
pubmed: 38874400
doi: 10.1002/advs.202402557
doi:
Types de publication
Journal Article
Langues
eng
Sous-ensembles de citation
IM
Pagination
e2402557Subventions
Organisme : National Science Foundation
ID : DMR-1847843|TI-2141019
Organisme : NIH HHS
ID : 1R01EB027705
Pays : United States
Informations de copyright
© 2024 The Author(s). Advanced Science published by Wiley‐VCH GmbH.
Références
S. Breslin, L. O'Driscoll, Drug Discov. Today 2013, 18, 240.
S. A. Langhans, Front. in Pharmacol. 2018, 9, 6.
X. Wang, I. Rivière, Cancer Gene Ther. 2015, 22, 85.
J. G. Hunsberger, T. Shupe, A. Atala, Stem Cells Transl. Med. 2018, 7, 564.
J. Lou, D. J. Mooney, Nat. Rev. Chem. 2022, 6, 726.
T. Colombani, Z. J. Rogers, K. Bhatt, J. Sinoimeri, L. Gerbereux, M. Hamrangsekachaee, S. A. Bencherif, Bioactive Mater. 2023, 29, 279.
J. Lou, D. J. Mooney, Nat. Rev. Chem. 2022, 6, 726.
S. P. Pașca, Nature 2018, 553, 437.
B. L. LeSavage, R. A. Suhar, N. Broguiere, M. P. Lutolf, S. C. Heilshorn, Nat. Mater. 2022, 21, 143.
M. Grönholm, M. Feodoroff, G. Antignani, B. Martins, F. Hamdan, V. Cerullo, Cancer Res. 2021, 81, 3149.
T. Ast, V. K. Mootha, Nat. Metabol. 2019, 1, 858.
W. R. Flanigan, I. H. Jain, Nat. Cardiovascular Res. 2022, 1, 1101.
H. E. Abaci, Y. I. Shen, S. Tan, S. Gerecht, Sci Rep. 2014, 4, 4951.
D. C. J. Ferguson, G. R. Smerdon, L. W. Harries, N. J. F. Dodd, M. P. Murphy, A. Curnow, P. G. Winyard, Free Radic. Biol. Med. 2018, 126, 322.
J. A. Stuart, J. Fonseca, F. Moradi, C. Cunningham, B. Seliman, C. R. Worsfold, S. Dolan, J. Abando, L. A. Maddalena, Oxid. Med. Cell Longev. 2018, 2018, 8238459.
H. Sies, V. V. Belousov, N. S. Chandel, M. J. Davies, D. P. Jones, G. E. Mann, M. P. Murphy, M. Yamamoto, C. Winterbourn, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2022, 23, 499.
T. P. Keeley, G. E. Mann, Physiol. Rev. 2019, 99, 161.
R. Alva, M. Mirza, A. Baiton, L. Lazuran, L. Samokysh, A. Bobinski, C. Cowan, A. Jaimon, D. Obioru, T. Al Makhoul, J. A. Stuart, Cell Biol. Toxicol. 2023, 39, 111.
H. Sies, C. Berndt, D. P. Jones, Oxid. Stress. Annual Rev. Biochem. 2017, 86, 715.
S. Timpano, B. D. Guild, E. J. Specker, G. Melanson, P. J. Medeiros, S. L. J. Sproul, J. Uniacke, Faseb j. 2019, 33, 5716.
L. A. Maddalena, S. M. Selim, J. Fonseca, H. Messner, S. McGowan, J. A. Stuart, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2017, 493, 246.
A. H. Baik, A. G. Haribowo, X. Chen, B. B. Queliconi, A. M. Barrios, A. Garg, M. Maishan, A. R. Campos, M. A. Matthay, I. H. Jain, Mol. Cell 2023, 83, 942.
T. Ast, V. K. Mootha, Nat. Metab. 2019, 1, 858.
G. Sevimli, M. J. Smith, T. A. Caglar, S. Bilir, M. Secilmis, H. Y. Altun, E. N. Yigit, F. Yang, T. P. Keeley, R. Malli, G. Öztürk, G. E. Mann, E. Eroglu, Redox Biol. 2022, 53, 102319.
K. R. Atkuri, L. A. Herzenberg, A.‐K. Niemi, T. Cowan, L. A. Herzenberg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 4547.
S. Parrinello, E. Samper, A. Krtolica, J. Goldstein, S. Melov, J. Campisi, Nat. Cell Biol. 2003, 5, 741.
R. A. Busuttil, M. Rubio, M. E. Dollé, J. Campisi, J. Vijg, Aging Cell 2003, 2, 287.
C. L. Murphy, J. M. Polak, J. Cell. Physiol. 2004, 199, 451.
M. Yazdani, Interdiscip. Toxicol. 2016, 9, 85.
C. W. Strey, J. Gestrich, T. Beckhaus, R. M. Marquez‐Pinilla, E. Oppermann, C. Mönch, J. D. Lambris, M. Karas, W. O. Bechstein, Int. J. Mol. Med. 2010, 26, 577.
N. S. Joe, Y. Wang, H. H. Oza, I. Godet, N. Milki, G. J. Riggins, D. M. Gilkes, Cancers (Basel) 2023, 15, 1330.
H. Xie, J. Song, J. Godfrey, R. Riscal, N. Skuli, I. Nissim, M. C. Simon, Nat. Metabol. 2021, 3, 327.
I. Godet, Y. J. Shin, J. A. Ju, I. C. Ye, G. Wang, D. M. Gilkes, Nat. Commun. 2019, 10, 4862.
I. H. Jain, S. E. Calvo, A. L. Markhard, O. S. Skinner, T.‐L. To, T. Ast, V. K. Mootha, Cell 2020, 181, 716.
N. S. Joe, Y. Wang, H. H. Oza, I. Godet, N. Milki, G. J. Riggins, D. M. Gilkes, Cancers 2023, 15, 330.
C. T. Taylor, S. P. Colgan, Nat. Rev. Immunol. 2017, 17, 774.
C. T. Taylor, C. C. Scholz, Nat. Rev. Nephrol. 2022, 18, 573.
J. Fandrey, J. Schödel, K.‐U. Eckardt, D. M. Katschinski, R. H. Wenger, Pflügers Archiv – European J. Physiol. 2019, 471, 1343.
E. E. Wicks, G. L. Semenza, The J. Clin. Invest. 2022, 132, e159839.
W. F. McLimans, E. J. Crouse, K. V. Tunnah, G. E. Moore, I. Experiment. Biotechnol. Bioeng. 1968, 10, 725.
W. F. McLimans, L. E. Blumenson, K. V. Tunnah, II. The. Biotechnol. Bioeng. 1968, 10, 741.
C. J. Peniche Silva, G. Liebsch, R. J. Meier, M. S. Gutbrod, E. R. Balmayor, M. van Griensven, Fron.t Bioeng. Biotechnol. 2020, 8, 595.
B. A. Wagner, S. Venkataraman, G. R. Buettner, Free Radic. Biol. Med. 2011, 51, 700.
T. L. Place, F. E. Domann, A. J. Case, Free Radic. Biol. Med. 2017, 113, 311.
J. Pavlacky, J. Polak, Front. Endocrinol (Lausanne) 2020, 11, 57.
H. Hu, N. Takano, L. Xiang, D. M. Gilkes, W. Luo, G. L. Semenza, Oncotarget 2014, 5, 8853.
O. S. Wolfbeis, BioEssays 2015, 37, 921.
W. X‐d, W. OS, Chem. Soc. Rev. 2014, 43, 3666.
P. Lee, N. S. Chandel, M. C. Simon, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2020, 21, 268.
B. A. Wagner, S. Venkataraman, G. R. Buettner, Free Radic. Biol. Med. 2011, 51, 700.
J. Kirchmair, A. H. Göller, D. Lang, J. Kunze, B. Testa, I. D. Wilson, R. C. Glen, G. Schneider, Nat. Rev. Drug Discov. 2015, 14, 387.
M. S. Nakazawa, B. Keith, M. C. Simon, Nat. Rev. Cancer 2016, 16, 663.
R. C. Sun, N. C. Denko, Cell Metab. 2014, 19, 285.
K. J. Briggs, P. Koivunen, S. Cao, K. M. Backus, B. A. Olenchock, H. Patel, Q. Zhang, S. Signoretti, G. J. Gerfen, A. L. Richardson, A. K. Witkiewicz, B. F. Cravatt, J. Clardy, W. G. Kaelin, Cell 2016, 166, 126.
S. Koda, J. Hu, X. Ju, G. Sun, S. Shao, R. X. Tang, K. Y. Jheng, J. Yan, Review. Front. Immunol. 2023, 14, 1123841.
M. V. Sitkovsky, S. Hatfield, R. Abbott, B. Belikoff, D. Lukashev, O. A. Hostile, Cancer Immunol. Res. 2014, 2, 598.
S. M. Hatfield, J. Kjaergaard, D. Lukashev, T. H. Schreiber, B. Belikoff, R. Abbott, S. Sethumadhavan, P. Philbrook, K. Ko, R. Cannici, M. Thayer, S. Rodig, J. L. Kutok, E. K. Jackson, B. Karger, E. R. Podack, A. Ohta, M. V. Sitkovsky, Sci. Transl. Med. 2015, 7, 277ra30.
D. G. Hardie, B. E. Schaffer, A. Brunet, Trends Cell Biol. 2016, 26, 190.
I. M. N. Wortel, L. T. van der Meer, M. S. Kilberg, F. N. van Leeuwen, Trends Endocrinol. Metab. 2017, 28, 794.
J. Derks, A. Leduc, G. Wallmann, R. G. Huffman, M. Willetts, S. Khan, H. Specht, M. Ralser, V. Demichev, N. Slavov, Nat. Biotechnol. 2023, 41, 50.
J. D. Gordan, C. B. Thompson, M. C. Simon, Cancer Cell 2007, 12, 108.
K. J. Igarashi, I. Kucinski, Y. Y. i. Chan, T.‐K. Tan, H. M. Khoo, D. Kealy, J. Bhadury, I. Hsu, P. Y. Ho, K. Niizuma, J. W. Hickey, G. P. Nolan, K. S. Bridge, A. Czechowicz, B. Gottgens, H. Nakauchi, A. C. Wilkinson, Blood Adv. 2023, 7, 3366.
C. Chen, Q. Tang, Y. Zhang, M. Yu, W. Jing, W. Tian, Stem Cell Res. Ther. 2018, 9, 148.
D.‐Y. Shin, X. Huang, C.‐H. Gil, A. Aljoufi, J. Ropa, H. E. Broxmeyer, Stem Cells 2020, 38, 1454.
M.‐Y. u. Wu, G.‐T. Yiang, W.‐T. Liao, A. P. o.‐Y. i. Tsai, Y.‐L. Cheng, P.‐W. Cheng, C.‐Y. Li, C.‐J. Li, Cell. Physiol. Biochem. 2018, 46, 1650.
H. Bugger, K. Pfeil, Biochim. Biophys. Acta Mol. Basis Dis. 2020, 1866, 165768.
G. Tiegs, A. K. Horst, Semin. Immunopathol. 2022, 44, 445.
H. Hirao, K. Nakamura, J. W. Kupiec‐Weglinski, Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. 2022, 19, 239.
Z. Zhou, M.‐J. Xu, B. Gao, Cell Mol. Immunol. 2016, 13, 301.
C. Gan, Q. Cai, C. Tang, J. Gao, Rev. Front. Immunol. 2022, 13, 896473.
E. L. Pagé, G. A. Robitaille, J. Pouysségur, D. E. Richard, J. Bio. Chem. 2002, 277, 48403.
N. Koshikawa, J. Hayashi, A. Nakagawara, K. Takenaga, J. Biol. Chem. 2009, 284, 33185.
B. H. Jiang, G. L. Semenza, C. Bauer, H. H. Marti, Am. J. Physiol., Cell Physiol. 1996, 271, C1172.
E. B. Rankin, A. J. Giaccia, Science 2016, 352, 175.
A. B. Mariotto, R. Etzioni, M. Hurlbert, L. Penberthy, M. Mayer, Cancer Epidemiol. Biomarkers & Prevent. 2017, 26, 809.
D. C. Fuhrmann, B. Brüne, Redox Biol. 2017, 12, 208.
P. Vaupel, M. Höckel, A. Mayer, Antioxid. Redox Signal. 2007, 9, 1221.
Z. J. Rogers, K. Bhatt, S. A. Bencherif, In Hypoxia, Methods and Protocols, Ed: D. M. Gilkes, Springer, US, 2024, pp. 125‐131.
W. Posch, C. Lass‐Flörl, D. Wilflingseder, J. Vis. Exp. 2016, 54968.
A. M. Bolger, M. Lohse, B. Usadel, Bioinformatics 2014, 30, 2114.
A. Dobin, C. A. Davis, F. Schlesinger, J. Drenkow, C. Zaleski, S. Jha, P. Batut, M. Chaisson, T. R. Gingeras, Bioinformatics 2012, 29, 15.
Y. Liao, G. K. Smyth, W. Shi, Bioinformatics 2013, 30, 923.
M. I. Love, W. Huber, S. Anders, Genome Biol. 2014, 15, 550.
A. Subramanian, P. Tamayo, V. K. Mootha, S. Mukherjee, B. L. Ebert, M. A. Gillette, A. Paulovich, S. L. Pomeroy, T. R. Golub, E. S. Lander, J. P. Mesirov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 15545.
G. Yu, L.‐G. Wang, Y. Han, Q.‐Y. He, OMICS, A J. Integrat. Biol. 2012, 16, 284.
P. A. Sanford, K. G. Miller, K. O. Hoyt, B. M. Woolston, FEMS Microbiol. Lett. 2023, 370, fnad030.
B. M. Woolston, D. F. Emerson, D. H. Currie, G. Stephanopoulos, Metab. Eng. 2018, 48, 243.
T. Colombani, L. J. Eggermont, Z. J. Rogers, L. G. A. McKay, L. E. Avena, R. I. Johnson, N. Storm, A. Griffiths, S. A. Bencherif, Adv. Sci. 2021, 8, 2100316.
H. Specht, N. Slavov, J. Proteome Res. 2021, 20, 880.
H. Specht, E. Emmott, A. A. Petelski, R. G. Huffman, D. H. Perlman, M. Serra, P. Kharchenko, A. Koller, N. Slavov, Genome Biol. 2021, 22, 50.
A. A. Petelski, E. Emmott, A. Leduc, R. G. Huffman, H. Specht, D. H. Perlman, N. Slavov, Nature Protocols 2021, 16, 5398.
V. Demichev, C. B. Messner, S. I. Vernardis, K. S. Lilley, M. Ralser, Nat. Methods 2020, 17, 41.
J. T. Leek, W. E. Johnson, H. S. Parker, A. E. Jaffe, J. D. Storey, Bioinformatics 2012, 28, 882.
M. E. Ritchie, B. Phipson, D.i Wu, Y. Hu, C. W. Law, W. Shi, G. K. Smyth, Nucleic Acids Res. 2015, 43, e47.