Endolithic Fungal Diversity in Antarctic Oligocene Rock Samples Explored Using DNA Metabarcoding.

Antarctica eDNA environmental drivers fungi

Journal

Biology
ISSN: 2079-7737
Titre abrégé: Biology (Basel)
Pays: Switzerland
ID NLM: 101587988

Informations de publication

Date de publication:
05 Jun 2024
Historique:
received: 18 04 2024
revised: 15 05 2024
accepted: 22 05 2024
medline: 27 6 2024
pubmed: 27 6 2024
entrez: 27 6 2024
Statut: epublish

Résumé

In this study, we evaluated the fungal diversity present associated with cores of Oligocene rocks using a DNA metabarcoding approach. We detected 940,969 DNA reads grouped into 198 amplicon sequence variants (ASVs) representing the phyla

Identifiants

DOI: 10.3390/biology13060414 PMID: 38927294
pubmed: 38927294
pii: biology13060414
doi: 10.3390/biology13060414
pii:
doi:

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Auteurs

Natana G Rabelo (NG)

Departamento de Microbiologia, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte 31270-901, Brazil.

Vívian N Gonçalves (VN)

Departamento de Microbiologia, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte 31270-901, Brazil.

Marcelo A Carvalho (MA)

Departamento de Geologia e Paleontologia, Museu Nacional, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 20940-040, Brazil.
ORCID: 0000-0001-6088-5718

Sandro M Scheffler (SM)

Departamento de Geologia e Paleontologia, Museu Nacional, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 20940-040, Brazil.

Gustavo Santiago (G)

Departamento de Geologia e Paleontologia, Museu Nacional, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 20940-040, Brazil.

Paula A Sucerquia (PA)

Departmento de Geologia, Universidade Federal de Pernambuco, Recife 50740-540, Brazil.
ORCID: 0000-0002-5754-2703

Fabio S Oliveira (FS)

Departamento de Geografia, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte 31270-901, Brazil.

Larissa P Campos (LP)

Departamento de Geografia, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte 31270-901, Brazil.

Fabyano A C Lopes (FAC)

Laboratório de Microbiologia, Universidade Federal do Tocantins, Porto Nacional 77500-000, Brazil.
ORCID: 0000-0002-4565-9103

Karita C R Santos (KCR)

Laboratório de Microbiologia, Universidade Federal do Tocantins, Porto Nacional 77500-000, Brazil.
ORCID: 0000-0002-1013-6900

Micheline C Silva (MC)

Departamento de Botânica, Universidade de Brasília, Brasília 70297-400, Brazil.
ORCID: 0000-0002-2389-3804

Peter Convey (P)

British Antarctic Survey, NERC, High Cross, Madingley Road, Cambridge CB3 0ET, UK.
Department of Zoology, University of Johannesburg, Auckland Park 2006, South Africa.
Millennium Institute Biodiversity of Antarctic and Subantarctic Ecosystems (BASE), Las Palmeras 3425, Santiago 8320000, Chile.
Cape Horn International Center (CHIC), Puerto Williams 6350000, Chile.
ORCID: 0000-0001-8497-9903

Paulo E A S Câmara (PEAS)

Departamento de Botânica, Universidade de Brasília, Brasília 70297-400, Brazil.
Programa de Pós-Graduação em Fungos, Algas e Plantas, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-900, Brazil.

Luiz H Rosa (LH)

Departamento de Microbiologia, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte 31270-901, Brazil.
ORCID: 0000-0001-9749-5182

Classifications MeSH