THE IMS LIBRARY: FROM IN-STOCK TO VIRTUAL.

Drug-like R-groups Scaffold combinatorial

Journal

ChemMedChem
ISSN: 1860-7187
Titre abrégé: ChemMedChem
Pays: Germany
ID NLM: 101259013

Informations de publication

Date de publication:
21 Jun 2024
Historique:
revised: 18 06 2024
received: 19 05 2024
accepted: 19 06 2024
medline: 20 7 2024
pubmed: 20 7 2024
entrez: 20 7 2024
Statut: aheadofprint

Résumé

A chemical library is a key element in the early stages of pharmaceutical research. Its design encompasses various factors, such as diversity, size, ease of synthesis, aimed at increasing the likelihood of success in drug discovery. This article explores the collaborative efforts of computational and synthetic chemists in tailoring chemical libraries for cost-effective and resource-efficient use, particularly in the context of academic research projects. It proposes chemoinformatics methodologies that address two pivotal questions: first, crafting a diverse panel of under 1000 compounds from an existing pool through synthetic efforts, leveraging the expertise of organic chemists; and second, expanding pharmacophoric diversity within this panel by creating a highly accessible virtual chemical library. Chemoinformatics tools were developed to analyse initial panel of about 10,000 compounds into two tailored libraries: eIMS and vIMS. The eIMS Library comprises 578 diverse in-stock compounds ready for screening. Its virtual counterpart, vIMS, features novel compounds guided by chemists, ensuring synthetic accessibility. vIMS offers a broader array of binding motifs and improved drug-like characteristics achieved through the addition of diverse functional groups to eIMS scaffolds followed by filtering of reactive or unusual structures. The uniqueness of vIMS is emphasized through a comparison with commercial suppliers' virtual chemical space.

Identifiants

pubmed: 39031900
doi: 10.1002/cmdc.202400381
doi:

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

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IM

Pagination

e202400381

Informations de copyright

© 2024 Wiley‐VCH GmbH.

Auteurs

Esther Kellenberger (E)

Universite de Strasbourg, UMR7200 Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, Faculté de Pharamcie, 74 Route du Rhin, 67401, Illkirch, FRANCE.

Teodora Djikic-Stojsic (T)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, Chémogénomique et Chimie médicinale, Faculté de Pharmacie, LIT UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkirch-Graffenstaden, FRANCE.

Guillaume Bret (G)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, Chémogénomique et Chimie médicinale, Faculté de Pharmacie, UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkirch-Graffenstaden, FRANCE.

Gaëlle Blond (G)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, SOMHet, Faculté de Pharmacie, UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkirch-Graffenstaden, FRANCE.

Nicolas Girard (N)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, SOMHet, Faculté de Pharmacie, UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkirch-Graffenstaden, FRANCE.

Clothilde Le Guen (C)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, Chimie Biologie Intégrative, Faculté de Pharmacie, UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkirch-Graffenstaden, FRANCE.

Claire Marsol (C)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, Chimie Biologie Intégrative, Faculté de Pharmacie, UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkrich-Graffenstaden, FRANCE.

Martine Schmitt (M)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, Chémogénomique et Chimie médicinale, Faculté de Pharmacie, UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkirch-Graffenstaden, FRANCE.

Séverine Schneider (S)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, Chémogénomique et Chimie médicinale, Faculté de Pharmacie, UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkirch-Graffenstaden, FRANCE.

Frederic Bihel (F)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, Chémogénomique et Chimie médicinale, Faculté de Pharmacie, UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkirch-Graffenstaden, FRANCE.

Dominique Bonnet (D)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, Chimie Biologie Intégrative, Faculté de Pharmacie, UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkirch-Graffenstaden, FRANCE.

Mihaela Gulea (M)

Laboratoire d'Innovation Thérapeutique, SOMHet, Faculté de Pharmacie, UMR7200 CNRS Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, 67400, Illkirch-Graffenstaden, FRANCE.

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