Discriminating woody species assemblages from National Forest Inventory data based on phylogeny in Georgia.

Georgia National Forest Inventory beta diversity community discrimination dissimilarity diversity monitoring phylogeny unsupervised clustering

Journal

Ecology and evolution
ISSN: 2045-7758
Titre abrégé: Ecol Evol
Pays: England
ID NLM: 101566408

Informations de publication

Date de publication:
Jul 2024
Historique:
received: 04 03 2024
revised: 30 05 2024
accepted: 31 05 2024
medline: 24 7 2024
pubmed: 24 7 2024
entrez: 24 7 2024
Statut: epublish

Résumé

Classifications of forest vegetation types and characterization of related species assemblages are important analytical tools for mapping and diversity monitoring of forest communities. The discrimination of forest communities is often based on β-diversity, which can be quantified via numerous indices to derive compositional dissimilarity between samples. This study aims to evaluate the applicability of unsupervised classification for National Forest Inventory data from Georgia by comparing two cluster hierarchies. We calculated the mean basal area per hectare for each woody species across 1059 plot observations and quantified interspecies distances for all 87 species. Following an unspuervised cluster analysis, we compared the results derived from the species-neutral dissimilarity (Bray-Curtis) with those based on the Discriminating Avalanche dissimilarity, which incorporates interspecies phylogenetic variation. Incorporating genetic variation in the dissimilarity quantification resulted in a more nuanced discrimination of woody species assemblages and increased cluster coherence. Favorable statistics include the total number of clusters (23 vs. 20), mean distance within clusters (0.773 vs. 0.343), and within sum of squares (344.13 vs. 112.92). Clusters derived from dissimilarities that account for genetic variation showed a more robust alignment with biogeographical units, such as elevation and known habitats. We demonstrate that the applicability of unsupervised classification of species assemblages to large-scale forest inventory data strongly depends on the underlying quantification of dissimilarity. Our results indicate that by incorporating phylogenetic variation, a more precise classification aligned with biogeographic units is attained. This supports the concept that the genetic signal of species assemblages reflects biogeographical patterns and facilitates more precise analyses for mapping, monitoring, and management of forest diversity. ტყის მცენარეულობის ტიპების კლასიფიკაცია და მონათესავე სახეობათა შეკრების დახასიათება მნიშვნელოვანი ანალიტიკური ინსტრუმენტებია ტყის ტიპების აღწერისა და მრავალფეროვნების მონიტორინგისთვის. ტყის ტიპების განსხვავება ხშირად ემყარება β‐მრავალფეროვნებას, რომლის რაოდენობრივი დადგენა შესაძლებელია მრავალი ინდექსის მეშვეობით ნიმუშებს შორის კომპოზიციური განსხვავებულობის გამოსათვლელად. ეს კვლევა მიზნად ისახავს შეაფასოს საქართველოს ეროვნული ტყის ინვენტარიზაციის ზედამხედველობის გარეშე კლასიფიკაციის გამოყენებადობა ორი კლასტერული იერარქიის შედარების გზით. ჩვენ გამოვთვალეთ საშუალო ბაზალური ფართობი ჰექტარზე თითოეული მერქნიანი სახეობისთვის 1059 ნაკვეთზე დაკვირვებით და რაოდენობრივად დავადგინეთ სახეობათაშორისი მანძილი 87‐ვე სახეობისთვის. ჩვენ შევადარეთ სახეობების ნეიტრალური განსხვავებულობიდან მიღებული შედეგები (ბრეი‐კურტისი) ზვავის დისკრიმინაციული განსხვავებულობის საფუძველზე, რომელიც აერთიანებს სახეობათაშორის ფილოგენეტიკურ ვარიაციებს. გენეტიკური ცვალებადობის ჩართვამ განსხვავებულობის რაოდენობრივ განსაზღვრებაში გამოიწვია მერქნიანი სახეობების შეკრების უფრო ნიუანსური განსხვავება და გაზრდილი კლასტერული თანმიმდევრულობა. ხელსაყრელი სტატისტიკა მოიცავს მტევანთა საერთო რაოდენობას (23 v. 20), საშუალო მანძილს მტევნის შიგნით (0.773 vs. 0.343) და კვადრატების ჯამის ფარგლებში (344.13 vs. 112.92). განსხვავებებიდან მიღებული კლასტერებმა, რომლებიც ითვალისწინებენ გენეტიკურ ვარიაციებს, აჩვენეს უფრო მძლავრი გასწორება ბიოგეოგრაფიულ ერთეულებთან, როგორიცაა სიმაღლე და ცნობილი ჰაბიტატები. ჩვენ ვაჩვენებთ, რომ სახეობების შეკრების უკონტროლო კლასიფიკაციის გამოყენებადობა ფართომასშტაბიანი ტყის ინვენტარიზაციის მონაცემებზე მტკიცედ არის დამოკიდებული განსხვავებულობის ფუძემდებლური რაოდენობრივი განსაზღვრაზე. ჩვენი შედეგები მიუთითებს, რომ ფილოგენეტიკური ვარიაციით, უფრო ზუსტი კლასიფიკაციაა შესაძლებელი, რომელიც შეესაბამება ბიოგეოგრაფიულ ერთეულებს. ეს ამტიცებს კონცეფციას, რომ სახეობათა შეკრების გენეტიკური სიგნალი ასახავს ბიოგეოგრაფიულ ნიმუშებს და ხელს უწყობს ტყის მრავალფეროვნების აღწერას მონიტორინგისა და მართვის უფრო ზუსტ ანალიზს.

Autres résumés

Type: Publisher (est)
ტყის მცენარეულობის ტიპების კლასიფიკაცია და მონათესავე სახეობათა შეკრების დახასიათება მნიშვნელოვანი ანალიტიკური ინსტრუმენტებია ტყის ტიპების აღწერისა და მრავალფეროვნების მონიტორინგისთვის. ტყის ტიპების განსხვავება ხშირად ემყარება β‐მრავალფეროვნებას, რომლის რაოდენობრივი დადგენა შესაძლებელია მრავალი ინდექსის მეშვეობით ნიმუშებს შორის კომპოზიციური განსხვავებულობის გამოსათვლელად. ეს კვლევა მიზნად ისახავს შეაფასოს საქართველოს ეროვნული ტყის ინვენტარიზაციის ზედამხედველობის გარეშე კლასიფიკაციის გამოყენებადობა ორი კლასტერული იერარქიის შედარების გზით. ჩვენ გამოვთვალეთ საშუალო ბაზალური ფართობი ჰექტარზე თითოეული მერქნიანი სახეობისთვის 1059 ნაკვეთზე დაკვირვებით და რაოდენობრივად დავადგინეთ სახეობათაშორისი მანძილი 87‐ვე სახეობისთვის. ჩვენ შევადარეთ სახეობების ნეიტრალური განსხვავებულობიდან მიღებული შედეგები (ბრეი‐კურტისი) ზვავის დისკრიმინაციული განსხვავებულობის საფუძველზე, რომელიც აერთიანებს სახეობათაშორის ფილოგენეტიკურ ვარიაციებს. გენეტიკური ცვალებადობის ჩართვამ განსხვავებულობის რაოდენობრივ განსაზღვრებაში გამოიწვია მერქნიანი სახეობების შეკრების უფრო ნიუანსური განსხვავება და გაზრდილი კლასტერული თანმიმდევრულობა. ხელსაყრელი სტატისტიკა მოიცავს მტევანთა საერთო რაოდენობას (23 v. 20), საშუალო მანძილს მტევნის შიგნით (0.773 vs. 0.343) და კვადრატების ჯამის ფარგლებში (344.13 vs. 112.92). განსხვავებებიდან მიღებული კლასტერებმა, რომლებიც ითვალისწინებენ გენეტიკურ ვარიაციებს, აჩვენეს უფრო მძლავრი გასწორება ბიოგეოგრაფიულ ერთეულებთან, როგორიცაა სიმაღლე და ცნობილი ჰაბიტატები. ჩვენ ვაჩვენებთ, რომ სახეობების შეკრების უკონტროლო კლასიფიკაციის გამოყენებადობა ფართომასშტაბიანი ტყის ინვენტარიზაციის მონაცემებზე მტკიცედ არის დამოკიდებული განსხვავებულობის ფუძემდებლური რაოდენობრივი განსაზღვრაზე. ჩვენი შედეგები მიუთითებს, რომ ფილოგენეტიკური ვარიაციით, უფრო ზუსტი კლასიფიკაციაა შესაძლებელი, რომელიც შეესაბამება ბიოგეოგრაფიულ ერთეულებს. ეს ამტიცებს კონცეფციას, რომ სახეობათა შეკრების გენეტიკური სიგნალი ასახავს ბიოგეოგრაფიულ ნიმუშებს და ხელს უწყობს ტყის მრავალფეროვნების აღწერას მონიტორინგისა და მართვის უფრო ზუსტ ანალიზს.

Identifiants

pubmed: 39045499
doi: 10.1002/ece3.11569
pii: ECE311569
pmc: PMC11264350
doi:

Banques de données

Dryad
['10.5061/dryad.wpzgmsbvv']

Types de publication

Journal Article Review

Langues

eng

Pagination

e11569

Informations de copyright

© 2024 The Author(s). Ecology and Evolution published by John Wiley & Sons Ltd.

Déclaration de conflit d'intérêts

The authors declare no competing interests.

Auteurs

Alexander Wellenbeck (A)

Systematic Zoology University of Bonn Bonn Germany.
Forest Inventory and Remote Sensing University of Göttingen Göttingen Germany.

Lutz Fehrmann (L)

Forest Inventory and Remote Sensing University of Göttingen Göttingen Germany.

Hannes Feilhauer (H)

Remote Sensing Centre for Earth System Research (RSC4Earth) Leipzig University Leipzig Germany.

Sebastian Schmidtlein (S)

Institute of Geography and Geoecology Karlsruhe Institute of Technology (KIT) Karlsruhe Germany.

Bernhard Misof (B)

Systematic Zoology University of Bonn Bonn Germany.
Leibniz Institute for the Analysis of Biodiversity Change (LIB) Museum Koenig Bonn Germany.

Nils Hein (N)

Leibniz Institute for the Analysis of Biodiversity Change (LIB) Museum Koenig Bonn Germany.

Classifications MeSH