Titre : Facteurs de transcription à motifs basiques hélice-boucle-hélice et à glissière à leucines

Facteurs de transcription à motifs basiques hélice-boucle-hélice et à glissière à leucines : Questions médicales fréquentes

Termes MeSH sélectionnés :

Single-Cell Gene Expression Analysis

Questions fréquentes et termes MeSH associés

Diagnostic 5

#1

Comment diagnostiquer une anomalie des facteurs de transcription ?

Des tests génétiques et des analyses d'expression génique peuvent être utilisés.
Facteurs de transcription Analyse génétique
#2

Quels tests sont utilisés pour évaluer ces facteurs ?

Les tests d'ADN et les techniques de PCR sont couramment utilisés.
PCR Analyse de l'ADN
#3

Les biopsies sont-elles nécessaires pour le diagnostic ?

Parfois, des biopsies peuvent être nécessaires pour évaluer l'expression des gènes.
Biopsie Expression génique
#4

Peut-on détecter ces facteurs dans le sang ?

Généralement, ils sont évalués dans des échantillons de tissus plutôt que dans le sang.
Sang Tissu
#5

Quels marqueurs sont associés à ces facteurs ?

Des marqueurs spécifiques de l'expression génique peuvent indiquer des anomalies.
Marqueurs biologiques Expression génique

Symptômes 5

#1

Quels symptômes sont liés aux dysfonctionnements de ces facteurs ?

Des troubles du développement, des anomalies métaboliques ou des cancers peuvent survenir.
Troubles du développement Cancer
#2

Les symptômes varient-ils selon le type de facteur ?

Oui, les symptômes dépendent du type de facteur de transcription impliqué.
Facteurs de transcription Symptômes
#3

Y a-t-il des symptômes spécifiques à surveiller ?

Des anomalies de croissance ou des troubles hormonaux peuvent être des indicateurs.
Croissance Troubles hormonaux
#4

Les symptômes apparaissent-ils à un âge spécifique ?

Certains symptômes peuvent apparaître à la naissance, d'autres plus tard dans l'enfance.
Âge Enfance
#5

Les symptômes sont-ils réversibles ?

Cela dépend de la nature de l'anomalie et du traitement appliqué.
Réversibilité Traitement

Prévention 5

#1

Comment prévenir les anomalies des facteurs de transcription ?

La prévention passe par le conseil génétique et la détection précoce.
Prévention Conseil génétique
#2

L'alimentation joue-t-elle un rôle dans la prévention ?

Une alimentation équilibrée peut soutenir la santé génétique, mais ne prévient pas toutes les anomalies.
Alimentation Santé génétique
#3

Les vaccinations peuvent-elles aider ?

Les vaccinations ne préviennent pas directement les anomalies génétiques.
Vaccination Anomalies génétiques
#4

Le dépistage prénatal est-il utile ?

Oui, le dépistage prénatal peut identifier certaines anomalies génétiques.
Dépistage prénatal Anomalies génétiques
#5

Y a-t-il des recommandations pour les femmes enceintes ?

Les femmes enceintes devraient suivre des soins prénatals réguliers et un bon mode de vie.
Soins prénatals Mode de vie

Traitements 5

#1

Quels traitements sont disponibles pour les anomalies ?

Les traitements peuvent inclure des thérapies géniques ou des médicaments ciblés.
Thérapie génique Médicaments
#2

La thérapie génique est-elle efficace ?

Elle peut être efficace pour certaines anomalies génétiques, mais pas pour toutes.
Thérapie génique Efficacité
#3

Des traitements préventifs existent-ils ?

Des conseils génétiques peuvent aider à prévenir certaines anomalies héréditaires.
Conseil génétique Prévention
#4

Les médicaments peuvent-ils corriger les anomalies ?

Certains médicaments peuvent cibler les voies de signalisation affectées.
Médicaments Voies de signalisation
#5

Y a-t-il des essais cliniques en cours ?

Oui, de nombreux essais cliniques explorent de nouvelles thérapies pour ces anomalies.
Essais cliniques Thérapies

Complications 5

#1

Quelles complications peuvent survenir avec ces anomalies ?

Des complications peuvent inclure des troubles métaboliques ou des cancers.
Complications Troubles métaboliques
#2

Les complications sont-elles toujours graves ?

Pas toujours, certaines anomalies peuvent être gérées avec succès.
Gravité Gestion
#3

Y a-t-il des risques de complications à long terme ?

Oui, certaines anomalies peuvent entraîner des complications chroniques.
Risques Complications chroniques
#4

Les complications peuvent-elles être évitées ?

Certaines complications peuvent être évitées par un traitement précoce.
Prévention Traitement précoce
#5

Les complications affectent-elles la qualité de vie ?

Oui, les complications peuvent avoir un impact significatif sur la qualité de vie.
Qualité de vie Impact

Facteurs de risque 5

#1

Quels sont les facteurs de risque pour ces anomalies ?

Les antécédents familiaux et certaines expositions environnementales sont des facteurs de risque.
Facteurs de risque Antécédents familiaux
#2

L'âge parental influence-t-il le risque ?

Oui, l'âge avancé des parents peut augmenter le risque d'anomalies génétiques.
Âge parental Anomalies génétiques
#3

Les habitudes de vie affectent-elles le risque ?

Oui, des habitudes de vie saines peuvent réduire certains risques d'anomalies.
Habitudes de vie Risques
#4

Y a-t-il des tests pour évaluer le risque ?

Des tests génétiques peuvent évaluer le risque d'anomalies héréditaires.
Tests génétiques Risque
#5

Les facteurs environnementaux jouent-ils un rôle ?

Oui, l'exposition à certaines substances chimiques peut augmenter le risque.
Facteurs environnementaux Substances chimiques
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Dr Olivier Menir

Contenu validé par Dr Olivier Menir

Expert en Médecine, Optimisation des Parcours de Soins et Révision Médicale


Validation scientifique effectuée le 03/04/2025

Contenu vérifié selon les dernières recommandations médicales

Auteurs principaux

Muhammad Waseem

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Affiliations :
  • Key Laboratory of Plant Hormones and Development Regulation of Chongqing, School of Life Sciences, Chongqing University, Chongqing, China.
Publications dans "Facteurs de transcription à motifs basiques hélice-boucle-hélice et à glissière à leucines" :

Zhengguo Li

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Affiliations :
  • Key Laboratory of Plant Hormones and Development Regulation of Chongqing, School of Life Sciences, Chongqing University, Chongqing, China.
Publications dans "Facteurs de transcription à motifs basiques hélice-boucle-hélice et à glissière à leucines" :

Bao-Teng Wang

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Affiliations :
  • College of Biology and the Environment, Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing, China.
Publications dans "Facteurs de transcription à motifs basiques hélice-boucle-hélice et à glissière à leucines" :

Miao Zhuang

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Affiliations :
  • College of Biology and the Environment, Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing, China.
Publications dans "Facteurs de transcription à motifs basiques hélice-boucle-hélice et à glissière à leucines" :

Zhi-Min Zhang

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Affiliations :
  • College of Biology and the Environment, Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing, China.
Publications dans "Facteurs de transcription à motifs basiques hélice-boucle-hélice et à glissière à leucines" :

Long Jin

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Affiliations :
  • College of Biology and the Environment, Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing, China.
Publications dans "Facteurs de transcription à motifs basiques hélice-boucle-hélice et à glissière à leucines" :

Feng-Jie Jin

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Affiliations :
  • College of Biology and the Environment, Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing, China. Electronic address: jinfj@njfu.edu.cn.
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Zhenchang Liang

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Affiliations :
  • Beijing Key Laboratory of Grape Science and Enology, and CAS Key Laboratory of Plant Resources, Institute of Botany, Chinese Academy of Science, Beijing 100093, China.
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Shahad Al Thamin

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Affiliations :
  • Department of Oral Health and Development Sciences, Division of Pediatric Dentistry, Tohoku University Graduate School of Dentistry, Sendai, Japan.
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Yuta Chiba

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Affiliations :
  • Department of Oral Health and Development Sciences, Division of Pediatric Dentistry, Tohoku University Graduate School of Dentistry, Sendai, Japan.
  • Section of Oral Medicine for Children, Division of Oral Health, Growth and Development, Faculty of Dental Science, Kyushu University, Fukuoka, Japan.
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Keigo Yoshizaki

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Affiliations :
  • Section of Orthodontics and Dentofacial Orthopedics, Division of Oral Health, Growth and Development, Faculty of Dental Science, Kyushu University, Fukuoka, Japan.
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Tian Tian

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Affiliations :
  • Section of Orthodontics and Dentofacial Orthopedics, Division of Oral Health, Growth and Development, Faculty of Dental Science, Kyushu University, Fukuoka, Japan.
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LingLing Jia

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Affiliations :
  • Department of Oral Health and Development Sciences, Division of Pediatric Dentistry, Tohoku University Graduate School of Dentistry, Sendai, Japan.
  • State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical Research Center for Oral Diseases, Department of Cariology and Endodontics, West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu, China.
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Xin Wang

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Affiliations :
  • Department of Oral Health and Development Sciences, Division of Pediatric Dentistry, Tohoku University Graduate School of Dentistry, Sendai, Japan.
  • Department of Pediatric Dentistry, Peking University School and Hospital of Stomatology, Beijing, China.
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Kan Saito

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Affiliations :
  • Department of Oral Health and Development Sciences, Division of Pediatric Dentistry, Tohoku University Graduate School of Dentistry, Sendai, Japan.
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Aya Yamada

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Affiliations :
  • Department of Oral Health and Development Sciences, Division of Pediatric Dentistry, Tohoku University Graduate School of Dentistry, Sendai, Japan.
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Satoshi Fukumoto

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Affiliations :
  • Department of Oral Health and Development Sciences, Division of Pediatric Dentistry, Tohoku University Graduate School of Dentistry, Sendai, Japan.
  • Section of Oral Medicine for Children, Division of Oral Health, Growth and Development, Faculty of Dental Science, Kyushu University, Fukuoka, Japan.
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Shiyu Tian

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Affiliations :
  • State Key Laboratory of Crop Biology, College of Horticulture Science and Engineering, Shandong Agricultural University, Shandong, China.
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Min Wei

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Affiliations :
  • State Key Laboratory of Crop Biology, College of Horticulture Science and Engineering, Shandong Agricultural University, Shandong, China.
  • Scientific Observing and Experimental Station of Facility Agricultural Engineering (Huang-Huai-Hai Region), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Shandong, China.
  • Shandong Collaborative Innovation Center for Fruit and Vegetable Production With High Quality and Efficiency, Tai'an, China.
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Fengjuan Yang

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Affiliations :
  • State Key Laboratory of Crop Biology, College of Horticulture Science and Engineering, Shandong Agricultural University, Shandong, China.
  • Shandong Collaborative Innovation Center for Fruit and Vegetable Production With High Quality and Efficiency, Tai'an, China.
  • Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops in Huanghuai Region, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Shandong, China.
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scMuffin: an R package to disentangle solid tumor heterogeneity by single-cell gene expression analysis.

Single-cell (SC) gene expression analysis is crucial to dissect the complex cellular heterogeneity of solid tumors, which is one of the main obstacles for the development of effective cancer treatment... scMuffin provides a series of functions to calculate qualitative and quantitative scores, such as: expression of marker sets for normal and tumor conditions, pathway activity, cell state trajectories,... The analyses offered by scMuffin and the results achieved in the case study show that our tool helps addressing the main challenges in the bioinformatics analysis of SC expression data from solid tumo...

Robustness of single-cell RNA-seq for identifying differentially expressed genes.

A common feature of single-cell RNA-seq (scRNA-seq) data is that the number of cells in a cell cluster may vary widely, ranging from a few dozen to several thousand. It is not clear whether scRNA-seq ... We addressed this question by performing scRNA-seq and poly(A)-dependent bulk RNA-seq in comparable aliquots of human induced pluripotent stem cells-derived, purified vascular endothelial and smooth m... Findings of the current study provide a quantitative reference for designing studies that aim for identifying DEGs for specific cell clusters using scRNA-seq data and for interpreting results of such ...

Feature selection followed by a novel residuals-based normalization that includes variance stabilization simplifies and improves single-cell gene expression analysis.

Normalization is a crucial step in the analysis of single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) counts data. Its principal objectives are reduction of systematic biases primarily introduced through technica...

Deconvolution from bulk gene expression by leveraging sample-wise and gene-wise similarities and single-cell RNA-Seq data.

The widely adopted bulk RNA-seq measures the gene expression average of cells, masking cell type heterogeneity, which confounds downstream analyses. Therefore, identifying the cellular composition and... We propose a new deconvolution algorithm, DSSC, which infers cell type-specific gene expression and cell type proportions of heterogeneous samples simultaneously by leveraging gene-gene and sample-sam... DSSC provides a practical and promising alternative to the experimental techniques to characterize cellular composition and heterogeneity in the gene expression of heterogeneous samples....

scMEB: a fast and clustering-independent method for detecting differentially expressed genes in single-cell RNA-seq data.

Cell clustering is a prerequisite for identifying differentially expressed genes (DEGs) in single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data. Obtaining a perfect clustering result is of central importance f... Here, we propose single-cell minimum enclosing ball (scMEB), a novel and fast method for detecting single-cell DEGs without prior cell clustering results. The proposed method utilizes a small part of ... We compared scMEB to two different approaches that could be used to identify DEGs without cell clustering. The investigation of 11 real datasets revealed that scMEB outperformed rival methods in terms...

Single-cell transcriptome analysis reveals the key genes associated with macrophage polarization in liver cancer.

The aim of this study was to reveal the key genes associated with macrophage polarization in liver cancer.... Data were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) and the Cancer Genome Atlas databases (TCGA). R package Seurat 4.0 was used to preprocess the downloaded single-cell sequencing data, princi... Two thousand highly variable genes were obtained after the normalization of single-cell profiles. In all, 16 principal components and 15 cell clusters were obtained. Monocytes and macrophages were the... The key genes associated with macrophage polarization, namely CD53, TGFBI, S100A4, pyruvate kinase M, LSP1, and SPP1, may be potential therapeutic targets for liver cancer....

Single-cell transcriptome analysis profiles the expression features of TMEM173 in BM cells of high-risk B-cell acute lymphoblastic leukemia.

As an essential regulator of type I interferon (IFN) response, TMEM173 participates in immune regulation and cell death induction. In recent studies, activation of TMEM173 has been regarded as a promi... Quantitative real-time PCR (qRT-PCR) and western blotting (WB) were applied to determine the mRNA and protein levels of TMEM173 in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs). TMEM173 mutation status w... The mRNA and protein levels of TMEM173 were increased in PBMCs from B-ALL patients. Besides, frameshift mutation was presented in TMEM173 sequences of 2 B-ALL patients. ScRNA-seq analysis identified t... Our findings provide insights into the transcriptomic features of TMEM173 in the BM of high-risk B-ALL patients. Targeted activation of TMEM173 in specific cells might provide new therapeutic strategi...

Integrated analysis of single-cell RNA-seq and chipset data unravels PANoptosis-related genes in sepsis.

The poor prognosis of sepsis warrants the investigation of biomarkers for predicting the outcome. Several studies have indicated that PANoptosis exerts a critical role in tumor initiation and developm... We obtained Sepsis samples and scRNA-seq data from the GEO database. PANoptosis-related genes were subjected to consensus clustering and functional enrichment analysis, followed by identification of d... Unsupervised clustering analysis using 16 PANoptosis-related genes identified three subtypes of sepsis. Kaplan-Meier analysis showed significant differences in patient survival among the subtypes, wit... We developed a machine learning based Boruta algorithm for profiling PANoptosis related subgroups with in predicting survival and clinical features in the sepsis....

Integrating the characteristic genes of macrophage pseudotime analysis in single-cell RNA-seq to construct a prediction model of atherosclerosis.

Macrophages play an important role in the occurrence and development of atherosclerosis. However, few existing studies have deliberately analyzed the changes in characteristic genes in the process of ... Carotid atherosclerotic plaque single-cell RNA (scRNA) sequencing data were analyzed to define the cells involved and determine their transcriptomic characteristics. KEGG enrichment analysis, CIBERSOR... Nine cell clusters were identified. M1 macrophages, M2 macrophages, and M2/M1 macrophages were identified as three clusters within the macrophages. According to pseudotime analysis, M2/M1 macrophages ... IL1RN...