Implementation of a Gene Panel for Genetic Diagnosis of Primary Ciliary Dyskinesia.

Implementación de un panel de genes para el diagnóstico genético de la discinesia ciliar primaria.
Discinesia ciliar primaria Electron microscopy Gene panel High-speed optical video microscopy Massive sequencing Microscopia electrónica Panel de genes Primary ciliary dyskinesia Secuenciación masiva Videomicroscopia óptica de alta velocidad

Journal

Archivos de bronconeumologia
ISSN: 2173-5751
Titre abrégé: Arch Bronconeumol (Engl Ed)
Pays: Spain
ID NLM: 101777538

Informations de publication

Date de publication:
Mar 2021
Historique:
received: 12 01 2020
revised: 16 02 2020
accepted: 18 02 2020
pubmed: 8 4 2020
medline: 25 6 2021
entrez: 8 4 2020
Statut: ppublish

Résumé

Primary ciliary dyskinesia (PCD) is characterized by an alteration in the ciliary structure causing difficulty in the clearance of respiratory secretions. Diagnosis is complex and based on a combination of techniques. The objective of this study was to design a gene panel including all known causative genes, and to corroborate their diagnostic utility in a cohort of Spanish patients. This was a multicenter cross-sectional study of patients with a high suspicion of PCD, according to European Respiratory Society criteria, designed around a gene panel for massive sequencing using SeqCap EZ capture technology that included 44 genes associated with PCD. We included 79 patients, 53 of whom had a diagnosis of confirmed or highly probable PCD. The sensitivity of the gene panel was 81.1%, with a specificity of 100%. Candidate variants were found in some of the genes of the panel in 43 patients with PCD, 51.2% (22/43) of whom were homozygotes and 48.8% (21/43) compound heterozygotes. The most common causative genes were DNAH5 and CCDC39. We found 52 different variants, 36 of which were not previously described in the literature. The design and implementation of a tailored gene panel produces a high yield in the genetic diagnosis of PCD. This panel provides a better understanding of the causative factors involved in these patients and lays down the groundwork for future therapeutic approaches.

Identifiants

pubmed: 32253119
pii: S0300-2896(20)30073-9
doi: 10.1016/j.arbres.2020.02.010
pii:
doi:

Types de publication

Journal Article Multicenter Study

Langues

eng spa

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IM

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186-194

Informations de copyright

Copyright © 2020 SEPAR. Publicado por Elsevier España, S.L.U. All rights reserved.

Auteurs

Noelia Baz-Redón (N)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Departamento de Pediatría, Obstetricia, Ginecología, Medicina Preventiva y Salud Pública, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, España.

Sandra Rovira-Amigo (S)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Departamento de Pediatría, Obstetricia, Ginecología, Medicina Preventiva y Salud Pública, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, España; Sección de Alergología Pediátrica, Neumología Pediátrica y Fibrosis Quística, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España.

Ida Paramonov (I)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Área de Genética Clínica y Molecular, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España.

Silvia Castillo-Corullón (S)

Unidad de Neumología Pediátrica, Hospital Clínico Universitario de Valencia, Universidad de Valencia, Valencia, España.

Maria Cols Roig (M)

Sección de Neumología Infantil y Unidad de Fibrosis Quística, Hospital Sant Joan de Déu, Barcelona, España.

María Antolín (M)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Área de Genética Clínica y Molecular, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España.

Elena García Arumí (E)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Área de Genética Clínica y Molecular, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; CIBER de Enfermedades raras, CIBERER, Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Madrid, España.

Alba Torrent-Vernetta (A)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Departamento de Pediatría, Obstetricia, Ginecología, Medicina Preventiva y Salud Pública, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, España; Sección de Alergología Pediátrica, Neumología Pediátrica y Fibrosis Quística, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España.

Inés de Mir Messa (I)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Sección de Alergología Pediátrica, Neumología Pediátrica y Fibrosis Quística, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España.

Silvia Gartner (S)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Sección de Alergología Pediátrica, Neumología Pediátrica y Fibrosis Quística, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España.

Ignacio Iglesias Serrano (I)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Sección de Alergología Pediátrica, Neumología Pediátrica y Fibrosis Quística, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España.

M Araceli Caballero-Rabasco (MA)

Unidad de Neumología Pediátrica, Hospital del Mar, Barcelona, España.

Óscar Asensio de la Cruz (Ó)

Unidad de Neumología Pediátrica, Hospital Parc Taulí, Sabadell, Barcelona, España.

Gerardo Vizmanos-Lamotte (G)

Servicio de Pediatría, Pôle Pédiatrique de Cerdagne - ALEFPA, Osséja, Francia.

Carlos Martín de Vicente (C)

Unidad de Neumología Pediátrica, Hospital Miguel Servet, Zaragoza, España.

María Del Mar Martínez-Colls (MDM)

Unidad de Neumología Pediátrica, Hospital Germans Trias i Pujol, Badalona, Barcelona, España.

Ana Reula (A)

Grupo de Biomedicina Molecular, Celular y Genómica, IIS La Fe, Universidad de Valencia, Valencia, España.

Amparo Escribano (A)

Unidad de Neumología Pediátrica, Hospital Clínico Universitario de Valencia, Universidad de Valencia, Valencia, España; Departamento de Fisiología, Universidad de Valencia, Valencia, España.

Francisco Dasí (F)

Departamento de Fisiología, Universidad de Valencia, Valencia, España; UCIM, Instituto de Investigación Sanitaria INCLIVA, Valencia, España.

Miguel Armengot-Carceller (M)

Grupo de Biomedicina Molecular, Celular y Genómica, IIS La Fe, Universidad de Valencia, Valencia, España; Servicio de Otorrinolaringología, Hospital Universitario y Politécnico La Fe, Valencia, España; CIBER de Enfermedades Respiratorias, CIBERES, Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Madrid, España.

Eva Polverino (E)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Servicio de Neumología, Hospital Universitario Vall d'Hebron, Barcelona, España.

Esther Amengual Pieras (E)

Hospital de Son Llàtzer, Palma de Mallorca, Baleares, España.

Rosanel Amaro-Rodríguez (R)

Servicio de Neumología, Hospital Clínic, Barcelona, España.

Marta Garrido-Pontnou (M)

Servicio de Anatomía Patológica, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España.

Eduardo Tizzano (E)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Área de Genética Clínica y Molecular, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España.

Núria Camats-Tarruella (N)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; CIBER de Enfermedades raras, CIBERER, Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Madrid, España.

Mónica Fernández-Cancio (M)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; CIBER de Enfermedades raras, CIBERER, Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Madrid, España.

Antonio Moreno-Galdó (A)

Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; Departamento de Pediatría, Obstetricia, Ginecología, Medicina Preventiva y Salud Pública, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, España; Sección de Alergología Pediátrica, Neumología Pediátrica y Fibrosis Quística, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, España; CIBER de Enfermedades raras, CIBERER, Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), Madrid, España. Electronic address: amoreno@vhebron.net.

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