SARS-CoV-2 and RT-PCR in asymptomatic patients: Results of a cohort of workers at El Dorado International Airport in Bogotá, 2020

[SARS-CoV-2 y RT-PCR en pacientes asintomáticos: resultados de una cohorte de trabajadores del Aeropuerto Internacional El Dorado de Bogotá, 2020].

Journal

Biomedica : revista del Instituto Nacional de Salud
ISSN: 2590-7379
Titre abrégé: Biomedica
Pays: Colombia
ID NLM: 8205605

Informations de publication

Date de publication:
30 10 2020
Historique:
received: 11 09 2020
entrez: 5 11 2020
pubmed: 6 11 2020
medline: 20 11 2020
Statut: epublish

Résumé

Introduction: The 2019 coronavirus pandemic (COVID-19) has caused around 25 million cases worldwide. Asymptomatic patients have been described as potential sources of transmission. However, there are difficulties to detect them and to establish their role in the dynamics of virus transmission, which hinders the implementation of prevention strategies. Objective: To describe the behavior of asymptomatic SARS-CoV-2 virus infection in a cohort of workers at the El Dorado “Luis Carlos Galán Sarmiento” International Airport in Bogotá, Colombia. Materials and methods: A prospective cohort of 212 workers from the El Dorado airport was designed. The follow-up began in June, 2020. A survey was used to characterize health and work conditions. Every 21 day, a nasopharyngeal swab was taken to identify the presence of SARS-CoV-2 using RT-PCR. We analyzed the behavior of the cycle threshold (ORF1ab and N genes) according to the day of follow-up. Results: In the first three follow-ups of the cohort, we found an incidence of SARS-CoV-2 infection of 16.51%. The proportion of positive contacts was 14.08%. The median threshold for cycle threshold was 33.53. Conclusion: We characterized the asymptomatic SARS-CoV-2 infection in a cohort of workers. The identification of asymptomatic infected persons continues to be a challenge for epidemiological surveillance systems. Introducción. La pandemia de COVID-19 ha ocasionado cerca de 25 millones de casos en el mundo. Se ha descrito que los pacientes asintomáticos pueden ser fuentes de transmisión. Sin embargo, es difícil detectarlos y no es claro su papel en la dinámica de transmisión del virus, lo que obstaculiza la implementación de estrategias para la prevención. Objetivo. Describir el comportamiento de la infección asintomática por SARS-CoV-2 en una cohorte de trabajadores del Aeropuerto Internacional El Dorado "Luis Carlos Galán Sarmiento" de Bogotá, Colombia. Materiales y métodos. Se diseñó una cohorte prospectiva de trabajadores del Aeropuerto El Dorado. El seguimiento se inició en junio de 2020 con una encuesta a cada trabajador para caracterizar sus condiciones de salud y trabajo. Cada 21 días se tomó una muestra de hisopado nasofaríngeo para detectar la presencia del SARS-CoV-2 mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR). Se analizó el comportamiento del umbral del ciclo (cycle threshold) de los genes ORF1ab y N según el día de seguimiento. Resultados. En los primeros tres seguimientos de la cohorte se encontró una incidencia de la infección por SARS-CoV-2 del 16,51 %. La proporción de contactos positivos fue del 14,08 %. La mediana del umbral del ciclo fue de 33,53. Conclusión. Se determinaron las características de la infección asintomática por el SARSCoV-2 en una cohorte de trabajadores. La detección de infectados asintomáticos sigue siendo un reto para los sistemas de vigilancia epidemiológica.

Autres résumés

Type: Publisher (spa)
Introducción. La pandemia de COVID-19 ha ocasionado cerca de 25 millones de casos en el mundo. Se ha descrito que los pacientes asintomáticos pueden ser fuentes de transmisión. Sin embargo, es difícil detectarlos y no es claro su papel en la dinámica de transmisión del virus, lo que obstaculiza la implementación de estrategias para la prevención. Objetivo. Describir el comportamiento de la infección asintomática por SARS-CoV-2 en una cohorte de trabajadores del Aeropuerto Internacional El Dorado "Luis Carlos Galán Sarmiento" de Bogotá, Colombia. Materiales y métodos. Se diseñó una cohorte prospectiva de trabajadores del Aeropuerto El Dorado. El seguimiento se inició en junio de 2020 con una encuesta a cada trabajador para caracterizar sus condiciones de salud y trabajo. Cada 21 días se tomó una muestra de hisopado nasofaríngeo para detectar la presencia del SARS-CoV-2 mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR). Se analizó el comportamiento del umbral del ciclo (cycle threshold) de los genes ORF1ab y N según el día de seguimiento. Resultados. En los primeros tres seguimientos de la cohorte se encontró una incidencia de la infección por SARS-CoV-2 del 16,51 %. La proporción de contactos positivos fue del 14,08 %. La mediana del umbral del ciclo fue de 33,53. Conclusión. Se determinaron las características de la infección asintomática por el SARSCoV-2 en una cohorte de trabajadores. La detección de infectados asintomáticos sigue siendo un reto para los sistemas de vigilancia epidemiológica.

Identifiants

pubmed: 33152200
doi: 10.7705/biomedica.5802
pmc: PMC7676845
doi:

Substances chimiques

Coronavirus Nucleocapsid Proteins 0
Nucleocapsid Proteins 0
ORF1ab polyprotein, SARS-CoV-2 0
Phosphoproteins 0
Polyproteins 0
RNA, Viral 0
Viral Proteins 0
nucleocapsid phosphoprotein, SARS-CoV-2 0

Types de publication

Journal Article

Langues

eng spa

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

166-172

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Auteurs

Jeadran Malagón-Rojas (J)

Doctorado en Salud Pública, Universidad El Bosque, Bogotá, D.C., Colombia; Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. jnmalagon@unbosque.edu.co.

Claudia Gómez-Rendón (C)

Doctorado en Salud Pública, Universidad El Bosque, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Eliana L Parra (EL)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Julia Almentero (J)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Ruth Palma (R)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Ronald López (R)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Yesith Guillermo Toloza-Pérez (YG)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Vivian Rubio (V)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Juan Felipe Bedoya (JF)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Fernando López-Díaz (F)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Carlos Franco-Muñoz (C)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Jhonnatan Reales-González (J)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

Marcela Mercado-Reyes (M)

Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia. biomedica@ins.gov.co.

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