SARS-CoV-2 and RT-PCR in asymptomatic patients: Results of a cohort of workers at El Dorado International Airport in Bogotá, 2020
[SARS-CoV-2 y RT-PCR en pacientes asintomáticos: resultados de una cohorte de trabajadores del Aeropuerto Internacional El Dorado de Bogotá, 2020].
Adult
Airports
Asymptomatic Infections
/ epidemiology
Betacoronavirus
/ genetics
COVID-19
COVID-19 Testing
Clinical Laboratory Techniques
Colombia
Contact Tracing
Coronavirus Infections
/ diagnosis
Coronavirus Nucleocapsid Proteins
Female
Follow-Up Studies
Humans
Male
Middle Aged
Nasopharynx
/ virology
Nucleocapsid Proteins
/ genetics
Pandemics
Phosphoproteins
Pneumonia, Viral
/ diagnosis
Polyproteins
Prospective Studies
RNA, Viral
/ genetics
Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction
SARS-CoV-2
Surveys and Questionnaires
Viral Proteins
/ genetics
Virus Replication
/ genetics
Workplace
Coronavirus infections
asymptomatic infections
respiratory distress syndrome
adult
occupational health
reverse transcriptase polymerase chain reaction
Journal
Biomedica : revista del Instituto Nacional de Salud
ISSN: 2590-7379
Titre abrégé: Biomedica
Pays: Colombia
ID NLM: 8205605
Informations de publication
Date de publication:
30 10 2020
30 10 2020
Historique:
received:
11
09
2020
entrez:
5
11
2020
pubmed:
6
11
2020
medline:
20
11
2020
Statut:
epublish
Résumé
Introduction: The 2019 coronavirus pandemic (COVID-19) has caused around 25 million cases worldwide. Asymptomatic patients have been described as potential sources of transmission. However, there are difficulties to detect them and to establish their role in the dynamics of virus transmission, which hinders the implementation of prevention strategies.
Objective: To describe the behavior of asymptomatic SARS-CoV-2 virus infection in a cohort of workers at the El Dorado “Luis Carlos Galán Sarmiento” International Airport in Bogotá, Colombia.
Materials and methods: A prospective cohort of 212 workers from the El Dorado airport was designed. The follow-up began in June, 2020. A survey was used to characterize health and work conditions. Every 21 day, a nasopharyngeal swab was taken to identify the presence of SARS-CoV-2 using RT-PCR. We analyzed the behavior of the cycle threshold (ORF1ab and N genes) according to the day of follow-up.
Results: In the first three follow-ups of the cohort, we found an incidence of SARS-CoV-2 infection of 16.51%. The proportion of positive contacts was 14.08%. The median threshold for cycle threshold was 33.53.
Conclusion: We characterized the asymptomatic SARS-CoV-2 infection in a cohort of workers. The identification of asymptomatic infected persons continues to be a challenge for epidemiological surveillance systems. Introducción. La pandemia de COVID-19 ha ocasionado cerca de 25 millones de casos en el mundo. Se ha descrito que los pacientes asintomáticos pueden ser fuentes de transmisión. Sin embargo, es difícil detectarlos y no es claro su papel en la dinámica de transmisión del virus, lo que obstaculiza la implementación de estrategias para la prevención. Objetivo. Describir el comportamiento de la infección asintomática por SARS-CoV-2 en una cohorte de trabajadores del Aeropuerto Internacional El Dorado "Luis Carlos Galán Sarmiento" de Bogotá, Colombia. Materiales y métodos. Se diseñó una cohorte prospectiva de trabajadores del Aeropuerto El Dorado. El seguimiento se inició en junio de 2020 con una encuesta a cada trabajador para caracterizar sus condiciones de salud y trabajo. Cada 21 días se tomó una muestra de hisopado nasofaríngeo para detectar la presencia del SARS-CoV-2 mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR). Se analizó el comportamiento del umbral del ciclo (cycle threshold) de los genes ORF1ab y N según el día de seguimiento. Resultados. En los primeros tres seguimientos de la cohorte se encontró una incidencia de la infección por SARS-CoV-2 del 16,51 %. La proporción de contactos positivos fue del 14,08 %. La mediana del umbral del ciclo fue de 33,53. Conclusión. Se determinaron las características de la infección asintomática por el SARSCoV-2 en una cohorte de trabajadores. La detección de infectados asintomáticos sigue siendo un reto para los sistemas de vigilancia epidemiológica.
Autres résumés
Type: Publisher
(spa)
Introducción. La pandemia de COVID-19 ha ocasionado cerca de 25 millones de casos en el mundo. Se ha descrito que los pacientes asintomáticos pueden ser fuentes de transmisión. Sin embargo, es difícil detectarlos y no es claro su papel en la dinámica de transmisión del virus, lo que obstaculiza la implementación de estrategias para la prevención. Objetivo. Describir el comportamiento de la infección asintomática por SARS-CoV-2 en una cohorte de trabajadores del Aeropuerto Internacional El Dorado "Luis Carlos Galán Sarmiento" de Bogotá, Colombia. Materiales y métodos. Se diseñó una cohorte prospectiva de trabajadores del Aeropuerto El Dorado. El seguimiento se inició en junio de 2020 con una encuesta a cada trabajador para caracterizar sus condiciones de salud y trabajo. Cada 21 días se tomó una muestra de hisopado nasofaríngeo para detectar la presencia del SARS-CoV-2 mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR). Se analizó el comportamiento del umbral del ciclo (cycle threshold) de los genes ORF1ab y N según el día de seguimiento. Resultados. En los primeros tres seguimientos de la cohorte se encontró una incidencia de la infección por SARS-CoV-2 del 16,51 %. La proporción de contactos positivos fue del 14,08 %. La mediana del umbral del ciclo fue de 33,53. Conclusión. Se determinaron las características de la infección asintomática por el SARSCoV-2 en una cohorte de trabajadores. La detección de infectados asintomáticos sigue siendo un reto para los sistemas de vigilancia epidemiológica.
Identifiants
pubmed: 33152200
doi: 10.7705/biomedica.5802
pmc: PMC7676845
doi:
Substances chimiques
Coronavirus Nucleocapsid Proteins
0
Nucleocapsid Proteins
0
ORF1ab polyprotein, SARS-CoV-2
0
Phosphoproteins
0
Polyproteins
0
RNA, Viral
0
Viral Proteins
0
nucleocapsid phosphoprotein, SARS-CoV-2
0
Types de publication
Journal Article
Langues
eng
spa
Sous-ensembles de citation
IM
Pagination
166-172Références
J Microbiol Immunol Infect. 2020 May 15;:
pubmed: 32425996
Epidemiol Health. 2020;42:e2020007
pubmed: 32035431
Clin Imaging. 2020 Nov;67:219-225
pubmed: 32871426
Scand J Work Environ Health. 2020 May 1;46(3):229-230
pubmed: 32356896
J Autoimmun. 2020 Aug;112:102473
pubmed: 32439209
Int J Infect Dis. 2020 May;94:133-138
pubmed: 32247826
Int J Environ Res Public Health. 2020 Jun 13;17(12):
pubmed: 32545827
N Engl J Med. 2020 May 28;382(22):2081-2090
pubmed: 32329971
Tohoku J Exp Med. 2020;250(4):271-278
pubmed: 32321874
mSphere. 2020 Jun 24;5(3):
pubmed: 32581071
Euro Surveill. 2020 Aug;25(32):
pubmed: 32794447
Epidemiol Infect. 2020 Jun 11;148:e116
pubmed: 32525469
J Clin Med. 2020 Mar 30;9(4):
pubmed: 32235486
Euro Surveill. 2020 Jan;25(3):
pubmed: 31992387
Clin Infect Dis. 2020 Jun 06;:
pubmed: 32504529
Lancet Digit Health. 2020 Nov;2(11):e607-e621
pubmed: 32839755
JAMA. 2020 Apr 14;323(14):1406-1407
pubmed: 32083643
Int J Infect Dis. 2020 Nov;100:112-116
pubmed: 32891737
Rev Peru Med Exp Salud Publica. 2020 Apr-Jun;37(2):203-209
pubmed: 32876207
Elife. 2020 Feb 24;9:
pubmed: 32091395
Lancet. 2020 Jun 27;395(10242):1973-1987
pubmed: 32497510
Asia Pac J Public Health. 2020 Aug 30;:1010539520956447
pubmed: 32864996