Emergence and spread of the potential variant of interest (VOI) B.1.1.519 of SARS-CoV-2 predominantly present in Mexico.


Journal

Archives of virology
ISSN: 1432-8798
Titre abrégé: Arch Virol
Pays: Austria
ID NLM: 7506870

Informations de publication

Date de publication:
Nov 2021
Historique:
received: 13 04 2021
accepted: 27 06 2021
pubmed: 28 8 2021
medline: 16 10 2021
entrez: 27 8 2021
Statut: ppublish

Résumé

SARS-CoV-2 variants emerged in late 2020, and at least three variants of concern (B.1.1.7, B.1.351, and P1) have been reported by WHO. These variants have several substitutions in the spike protein that affect receptor binding; they exhibit increased transmissibility and may be associated with reduced vaccine effectiveness. In the present work, we report the identification of a potential variant of interest, harboring the mutations T478K, P681H, and T732A in the spike protein, within the newly named lineage B.1.1.519, that rapidly outcompeted the preexisting variants in Mexico and has been the dominant virus in the country during the first trimester of 2021.

Identifiants

pubmed: 34448936
doi: 10.1007/s00705-021-05208-6
pii: 10.1007/s00705-021-05208-6
pmc: PMC8390838
doi:

Substances chimiques

Spike Glycoprotein, Coronavirus 0
spike protein, SARS-CoV-2 0

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

3173-3177

Subventions

Organisme : SECTEI
ID : 057
Organisme : SECTEI
ID : 047
Organisme : SECTEI
ID : 072

Informations de copyright

© 2021. The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Austria, part of Springer Nature.

Références

Nature. 2021 Apr;592(7852):116-121
pubmed: 33106671
Cell. 2021 Apr 29;184(9):2362-2371.e9
pubmed: 33735608
Cell. 2020 Aug 20;182(4):812-827.e19
pubmed: 32697968
Viruses. 2021 Apr 21;13(5):
pubmed: 33919314
Cell Host Microbe. 2021 May 12;29(5):747-751.e4
pubmed: 33887205
Cell. 2020 Sep 3;182(5):1295-1310.e20
pubmed: 32841599
Cell Host Microbe. 2021 Mar 10;29(3):477-488.e4
pubmed: 33535027
Science. 2021 Apr 9;372(6538):
pubmed: 33658326

Auteurs

Abril Paulina Rodríguez-Maldonado (AP)

Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico.

Joel Armando Vázquez-Pérez (JA)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

Alberto Cedro-Tanda (A)

Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico.

Blanca Taboada (B)

Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico.

Celia Boukadida (C)

Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias "Ismael Cosío Villegas", Mexico City, Mexico.

Claudia Wong-Arámbula (C)

Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico.

Tatiana Ernestina Nuñez-García (TE)

Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico.

Natividad Cruz-Ortiz (N)

Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico.

Gisela Barrera-Badillo (G)

Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico.

Lucía Hernández-Rivas (L)

Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico.

Irma López-Martínez (I)

Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico.

Alfredo Mendoza-Vargas (A)

Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico.

Juan Pablo Reyes-Grajeda (JP)

Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico.

Nicolas Alcaraz (N)

Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico.

Fernando Peñaloza-Figueroa (F)

Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico.

Dulibeth Gonzalez-Barrera (D)

Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico.

Daniel Rangel-DeLeon (D)

Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico.

Luis Alonso Herrera-Montalvo (LA)

Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico.

Fidencio Mejía-Nepomuceno (F)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

Alejandra Hernández-Terán (A)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

Mario Mújica-Sánchez (M)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

Eduardo Becerril-Vargas (E)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

José Arturo Martínez-Orozco (JA)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

Rogelio Pérez-Padilla (R)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

Jorge Salas-Hernández (J)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

Alejandro Sanchez-Flores (A)

Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico.

Pavel Isa (P)

Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico.

Margarita Matías-Florentino (M)

Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias "Ismael Cosío Villegas", Mexico City, Mexico.

Santiago Ávila-Ríos (S)

Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias "Ismael Cosío Villegas", Mexico City, Mexico.

José Esteban Muñoz-Medina (JE)

Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City, Mexico.

Concepción Grajales-Muñiz (C)

Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City, Mexico.

Angel Gustavo Salas-Lais (AG)

Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City, Mexico.

Andrea Santos Coy-Arechavaleta (A)

Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City, Mexico.

Alfredo Hidalgo-Miranda (A)

Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico. ahidalgo@inmegen.gob.mx.

Carlos F Arias (CF)

Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias "Ismael Cosío Villegas", Mexico City, Mexico. arias@ibt.unam.mx.

José Ernesto Ramírez-González (JE)

Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico. ernesto.ramirez@salud.gob.mx.

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