Beyond the Brain: MIDS Extends BIDS to Multiple Modalities and Anatomical Regions.


Journal

Studies in health technology and informatics
ISSN: 1879-8365
Titre abrégé: Stud Health Technol Inform
Pays: Netherlands
ID NLM: 9214582

Informations de publication

Date de publication:
25 May 2022
Historique:
entrez: 25 5 2022
pubmed: 26 5 2022
medline: 27 5 2022
Statut: ppublish

Résumé

Brain Imaging Data Structure (BIDS) provides a valuable tool to organise brain imaging data into a clear and easy standard directory structure. Moreover, BIDS is widely supported by the scientific community and has been established as a powerful standard for medical imaging management. Nonetheless, the original BIDS is restricted to magnetic resonance imaging (MRI) of the brain, limiting its implantation to other techniques and anatomical regions. We developed Medical Imaging Data Structure (MIDS), conceived to extend BIDS methodology to other anatomical regions and multiple imaging systems in these areas. The MIDS standard was developed to store and manage medical images as an extension of BIDS. It allows the user to handily save studies of multiple anatomical regions and imaging techniques. Besides, MIDS improves the classification of multiple images within the structure, allowing the possibility to unify them in a single study to apply on them preprocessing or artificial intelligence algorithms. Finally, the results generated are saved in the derivatives folder.

Identifiants

pubmed: 35612110
pii: SHTI220488
doi: 10.3233/SHTI220488
doi:

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Pagination

413-414

Auteurs

Jose Manuel Saborit-Torres (JM)

Unidad Mixta de Imagen Biomédica FISABIO-CIPF. Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana - València, Spain.

Silvia Nadal-Almela (S)

Unidad Mixta de Imagen Biomédica FISABIO-CIPF. Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana - València, Spain.

Joaquim Angel Montell-Serrano (JA)

Unidad Mixta de Imagen Biomédica FISABIO-CIPF. Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana - València, Spain.

Elena Oliver-Garcia (E)

Unidad Mixta de Imagen Biomédica FISABIO-CIPF. Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana - València, Spain.

Hector Carceller (H)

Unidad Mixta de Imagen Biomédica FISABIO-CIPF. Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana - València, Spain.
CIBERSAM, ISC III. Av. Blasco Ibáñez 15, 46010 - València, Spain.
Institute for Biotechnology and Biomedicine (BIOTECMED), Universitat de Valencia, Burjassot, 46100, Spain.

Jon Ander Gómez-Ádrian (JA)

Department of Computer Systems and Computation, Universitat Politècnica de València - València, Spain.

Marisa Caparrós-Redondo (M)

Unidad Mixta de Imagen Biomédica FISABIO-CIPF. Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana - València, Spain.

Francisco García-García (F)

Unidad Mixta de Imagen Biomédica FISABIO-CIPF. Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana - València, Spain.
Bioinformatics & Biostatistics Unit, Principe Felipe Research Center - Valencia, Spain.

Julio Domenech-Fernández (J)

Hospital Arnau de Vilanova - Valencia, Spain.

Maria De La Iglesia-Vayá (M)

Unidad Mixta de Imagen Biomédica FISABIO-CIPF. Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana - València, Spain.
CIBERSAM, ISC III. Av. Blasco Ibáñez 15, 46010 - València, Spain.
General Directorate of Research, Innovation, Technology and Quality. Subdirectorate General of Information Systems for Health - Valencia, Spain.

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