Could self-reported symptoms be predictors of RT-PCR positivity in suspected COVID-19 cases? The Libya experience.
COVID-19
PCR
predictors
respiratory disease
self-reported symptoms
sensitivity
specificity
Journal
Eastern Mediterranean health journal = La revue de sante de la Mediterranee orientale = al-Majallah al-sihhiyah li-sharq al-mutawassit
ISSN: 1687-1634
Titre abrégé: East Mediterr Health J
Pays: Egypt
ID NLM: 9608387
Informations de publication
Date de publication:
29 Sep 2022
29 Sep 2022
Historique:
received:
17
09
2021
accepted:
05
06
2022
entrez:
7
10
2022
pubmed:
8
10
2022
medline:
12
10
2022
Statut:
epublish
Résumé
COVID-19 has symptoms similar to several other respiratory and non-respiratory diseases, which makes differentiating them a challenging task and could lead to unnecessary use of realtime reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) resources. The study aimed to assess self-reported symptoms as predictors for RT-PCR positivity in suspected COVID-19 cases. This was a cross-sectional study. We retrospectively reviewed the database of COVID-19 care centres in the eastern district of Tripoli, Libya, from May to December 2020. Presenting symptoms and RT-PCR test data were extracted. Of the 4593 subjects, 923 (20.1%) had positive RT-PCR result. Sensitivity for COVID-19 disease diagnosis was very low (≤ 18.2%) for all symptoms, except for myalgia (82.1%). Specificity was high for all symptoms (90.7-99.8%), except for myalgia (11.0%). Loss of taste and smell had the highest positive likelihood ratio (LR) for RT-PCR positivity (LR+ = 3.59, 95% CI: 2.95-4.37). In the multiple logistic regression, three symptoms maintained significant contribution to RT-PCR positivity; these were loss of taste and smell (odds ratio (OR) = 3.90, 95% CI: 3.04-4.99), sore throat (OR = 1.50, 95% CI: 1.02-2.19), and myalgia (OR = 0.65, 95% CI: 0.49-0.85). Other significant predictors were history of contact with a COVID-19 case (OR = 0.50, 95% CI: 0.39-0.62), and being female (OR = 1.33, 95% CI: 1.15-1.55). The findings of this study do not support the use of self-reported symptoms for the confirmation of COVID-19 disease in suspected cases because of their poor diagnostic properties. الأعراض التي يبلغ عنها المريض بنفسه: هل يمكن أن تستخدم للتنبؤ بالنتيجة الإيجابية لتحليل التنسخ العكسي لتفاعل البوليميراز المتسلسل في حالات كوقيذ-19 المشتبه فيها؟ التجربة الليبية. أميرة القيادي، أمنية الدالي، سناء عاشور، ليلى سبعي. لمرض فيروس كورونا-2019 (كوفيد-19) أعراضٌ تتشابه مع العديد من الأمراض الأخرى التنفسية وغير التنفسية، وهو ما يمثل تحديًا في التمييز بينه وبين تلك الأمراض، وقد يؤدي ذلك إلى استنفاد الموارد المخصصة لاختبارات التنسخ العكسي لتفاعل البوليميراز المتسلسل الآني بدون ضرورة. هدفت هذه الدراسة الى تقييمَ الأعراض التي يُبلِغ عنها المريض بنفسه، من حيث إمكانية استخدامها للتنبؤ بالنتيجة الإيجابية لتحليل التنسخ العكسي لتفاعل البوليميراز المتسلسل في حالات كوفيد-19 المشتبه فيها. كانت هذه الدراسة مقطعية ، وقد استعرضنا فيها بأثر رجعي قاعدة بيانات مراكز الرعاية المخصصة لمرضى كوفيد-19 في المنطقة الشرقية في طرابلس بليبيا، في الفترة من مايو/ أيار إلى ديسمبر/ كانون الأول 2020. واستخلص الباحثون الأعراض وبيانات اختبارات التنسخ العكسي لتفاعل البوليميراز المتسلسل. مِن بين مَن شملت الدراسة بياناتهم، الذين بلغ عددهم 4593 شخصًا، كانت نتيجة اختبار "تفاعل البوليميراز التنسخي العكسي المتسلسل" إيجابية لدى 923 شخصًا (20.1٪). وكانت حساسية جميع الأعراض لتشخيص مرض كوفيد-19 منخفضة جدًّا (18.2٪ أو أقل)، ما عدا الألم العضلي (82.1٪). وكانت الدقة النوعية عالية لجميع الأعراض (90.7 – 99.8٪)، ما عدا الألم العضلي (11.0٪). وكان لفقدان التذوق والشم أعلى نسبة ترجيح إيجابي لإيجابية اختبار "تفاعل البوليميراز التنسخي العكسي المتسلسل" (نسبة الترجيح الإيجابي = 3.59، عند فترة الثقة 95٪: 2.95−4.37). وفي الانحدار اللوجستي المتعدد، حافظت ثلاثة أعراض على مساهمة مهمة في إيجابية اختبار "تفاعل البوليميراز التنسخي العكسي المتسلسل" . وهذه الأعراض هي فقدان التذوق والشم (نسبة الأرجحية = 3.90، عند فترة الثقة 95٪: 3.04 – 4.99)، والتهاب الحلق (نسبة الأرجحية = 1.50، عند فترة الثقة 95٪: 1.02–2.19)، والألم العضلي (نسبة الأرجحية = 0.65، عند فترة الثقة 95٪: 0.49–0.85). ومن العوامل المهمة الأخرى التي يمكن استخدامها للتنبؤ بالنتيجة الإيجابية مخالطة حالة مصابة بمرض كوفيد-19 (نسبة الأرجحية = 0.50، عند فترة الثقة 95٪: 0.39–0.62)، وكون المريضة أنثى (نسبة الأرجحية = 1.33، عند فترة الثقة 95٪: 1.15–1.55). نتائج هذه الدراسة لا تؤيد استخدام الأعراض التي يبلغ عنها المريض لتأكيد الإصابة بمرض كوفيد-19 بين الحالات المشتبه فيها، وذلك بسبب ضعف ارتباطها بالتشخيص. Les symptômes auto-déclarés pourraient-ils constituer des facteurs prédictifs d'une positivité au test RT-PCR chez les cas suspects de COVID-19 ? L'expérience de la Libye. La COVID-19 présente des symptômes similaires à ceux de plusieurs autres maladies respiratoires et non respiratoires, ce qui rend leur différenciation difficile et pourrait entraîner un recours inutile aux ressources de l'amplification en chaîne par polymérase en temps réel (RT-PCR). L'étude visait à évaluer les symptômes auto-déclarés en tant que facteurs prédictifs de la positivité au test RT-PCR chez les cas suspects de COVID-19. Il s'agissait d'une étude transversale. Nous avons examiné rétrospectivement la base de données des centres de soins COVID-19 dans le district oriental de Tripoli en Libye, de mai à décembre 2020. Les symptômes qui se sont présentés et les données du test RT-PCR ont été extraits. Neuf cent vingt-trois sujets (20,1 %) sur 4593 présentaient un résultat positif à la RT-PCR. La sensibilité du diagnostic de la COVID-19 était très faible (≤ 18,2 %) pour tous les symptômes, à l'exception de la myalgie (82,1 %). La spécificité était élevée pour tous les symptômes (90,7-99,8 %), sauf pour la myalgie (11,0 %). La perte du goût et de l'odorat présentait le rapport de vraisemblance (RV) positif le plus élevé pour la positivité à la RT-PCR (RV+ = 3,59, IC à 95 % : 2,95-4,37). À la régression logistique multiple, trois symptômes ont maintenu une contribution significative à la positivité de la RT-PCR ; il s'agissait de la perte du goût et de l'odorat (OR = 3,90, IC à 95 % : 3,04-4,99), des maux de gorge (OR = 1,50, IC à 95 % : 1,02-2,19), et de la myalgie (OR = 0,65, IC à 95 % : 0,49-0,85). Les autres facteurs prédictifs significatifs étaient les contacts précédents avec un cas de COVID-19 (OR = 0,50, IC à 95 % : 0,39-0,62), et l'appartenance au sexe féminin (OR = 1,33, IC à 95 % : 1,15-1,55). Les résultats de la présente étude ne soutiennent pas l'utilisation des symptômes auto-déclarés pour la confirmation de la présence de COVID-19 chez les cas suspects, en raison de leurs mauvaises propriétés diagnostiques.
Sections du résumé
Background
UNASSIGNED
COVID-19 has symptoms similar to several other respiratory and non-respiratory diseases, which makes differentiating them a challenging task and could lead to unnecessary use of realtime reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) resources.
Aims
UNASSIGNED
The study aimed to assess self-reported symptoms as predictors for RT-PCR positivity in suspected COVID-19 cases.
Methods
UNASSIGNED
This was a cross-sectional study. We retrospectively reviewed the database of COVID-19 care centres in the eastern district of Tripoli, Libya, from May to December 2020. Presenting symptoms and RT-PCR test data were extracted.
Results
UNASSIGNED
Of the 4593 subjects, 923 (20.1%) had positive RT-PCR result. Sensitivity for COVID-19 disease diagnosis was very low (≤ 18.2%) for all symptoms, except for myalgia (82.1%). Specificity was high for all symptoms (90.7-99.8%), except for myalgia (11.0%). Loss of taste and smell had the highest positive likelihood ratio (LR) for RT-PCR positivity (LR+ = 3.59, 95% CI: 2.95-4.37). In the multiple logistic regression, three symptoms maintained significant contribution to RT-PCR positivity; these were loss of taste and smell (odds ratio (OR) = 3.90, 95% CI: 3.04-4.99), sore throat (OR = 1.50, 95% CI: 1.02-2.19), and myalgia (OR = 0.65, 95% CI: 0.49-0.85). Other significant predictors were history of contact with a COVID-19 case (OR = 0.50, 95% CI: 0.39-0.62), and being female (OR = 1.33, 95% CI: 1.15-1.55).
Conclusion
UNASSIGNED
The findings of this study do not support the use of self-reported symptoms for the confirmation of COVID-19 disease in suspected cases because of their poor diagnostic properties.
الأعراض التي يبلغ عنها المريض بنفسه: هل يمكن أن تستخدم للتنبؤ بالنتيجة الإيجابية لتحليل التنسخ العكسي لتفاعل البوليميراز المتسلسل في حالات كوقيذ-19 المشتبه فيها؟ التجربة الليبية.
أميرة القيادي، أمنية الدالي، سناء عاشور، ليلى سبعي.
الخلفية
UNASSIGNED
لمرض فيروس كورونا-2019 (كوفيد-19) أعراضٌ تتشابه مع العديد من الأمراض الأخرى التنفسية وغير التنفسية، وهو ما يمثل تحديًا في التمييز بينه وبين تلك الأمراض، وقد يؤدي ذلك إلى استنفاد الموارد المخصصة لاختبارات التنسخ العكسي لتفاعل البوليميراز المتسلسل الآني بدون ضرورة.
الأهداف
UNASSIGNED
هدفت هذه الدراسة الى تقييمَ الأعراض التي يُبلِغ عنها المريض بنفسه، من حيث إمكانية استخدامها للتنبؤ بالنتيجة الإيجابية لتحليل التنسخ العكسي لتفاعل البوليميراز المتسلسل في حالات كوفيد-19 المشتبه فيها.
طرق البحث
UNASSIGNED
كانت هذه الدراسة مقطعية ، وقد استعرضنا فيها بأثر رجعي قاعدة بيانات مراكز الرعاية المخصصة لمرضى كوفيد-19 في المنطقة الشرقية في طرابلس بليبيا، في الفترة من مايو/ أيار إلى ديسمبر/ كانون الأول 2020. واستخلص الباحثون الأعراض وبيانات اختبارات التنسخ العكسي لتفاعل البوليميراز المتسلسل.
النتائج
UNASSIGNED
مِن بين مَن شملت الدراسة بياناتهم، الذين بلغ عددهم 4593 شخصًا، كانت نتيجة اختبار "تفاعل البوليميراز التنسخي العكسي المتسلسل" إيجابية لدى 923 شخصًا (20.1٪). وكانت حساسية جميع الأعراض لتشخيص مرض كوفيد-19 منخفضة جدًّا (18.2٪ أو أقل)، ما عدا الألم العضلي (82.1٪). وكانت الدقة النوعية عالية لجميع الأعراض (90.7 – 99.8٪)، ما عدا الألم العضلي (11.0٪). وكان لفقدان التذوق والشم أعلى نسبة ترجيح إيجابي لإيجابية اختبار "تفاعل البوليميراز التنسخي العكسي المتسلسل" (نسبة الترجيح الإيجابي = 3.59، عند فترة الثقة 95٪: 2.95−4.37). وفي الانحدار اللوجستي المتعدد، حافظت ثلاثة أعراض على مساهمة مهمة في إيجابية اختبار "تفاعل البوليميراز التنسخي العكسي المتسلسل" . وهذه الأعراض هي فقدان التذوق والشم (نسبة الأرجحية = 3.90، عند فترة الثقة 95٪: 3.04 – 4.99)، والتهاب الحلق (نسبة الأرجحية = 1.50، عند فترة الثقة 95٪: 1.02–2.19)، والألم العضلي (نسبة الأرجحية = 0.65، عند فترة الثقة 95٪: 0.49–0.85). ومن العوامل المهمة الأخرى التي يمكن استخدامها للتنبؤ بالنتيجة الإيجابية مخالطة حالة مصابة بمرض كوفيد-19 (نسبة الأرجحية = 0.50، عند فترة الثقة 95٪: 0.39–0.62)، وكون المريضة أنثى (نسبة الأرجحية = 1.33، عند فترة الثقة 95٪: 1.15–1.55).
الاستنتاجات
UNASSIGNED
نتائج هذه الدراسة لا تؤيد استخدام الأعراض التي يبلغ عنها المريض لتأكيد الإصابة بمرض كوفيد-19 بين الحالات المشتبه فيها، وذلك بسبب ضعف ارتباطها بالتشخيص.
Les symptômes auto-déclarés pourraient-ils constituer des facteurs prédictifs d'une positivité au test RT-PCR chez les cas suspects de COVID-19 ? L'expérience de la Libye.
Contexte
UNASSIGNED
La COVID-19 présente des symptômes similaires à ceux de plusieurs autres maladies respiratoires et non respiratoires, ce qui rend leur différenciation difficile et pourrait entraîner un recours inutile aux ressources de l'amplification en chaîne par polymérase en temps réel (RT-PCR).
Objectifs
UNASSIGNED
L'étude visait à évaluer les symptômes auto-déclarés en tant que facteurs prédictifs de la positivité au test RT-PCR chez les cas suspects de COVID-19.
Méthodes
UNASSIGNED
Il s'agissait d'une étude transversale. Nous avons examiné rétrospectivement la base de données des centres de soins COVID-19 dans le district oriental de Tripoli en Libye, de mai à décembre 2020. Les symptômes qui se sont présentés et les données du test RT-PCR ont été extraits.
Résultats
UNASSIGNED
Neuf cent vingt-trois sujets (20,1 %) sur 4593 présentaient un résultat positif à la RT-PCR. La sensibilité du diagnostic de la COVID-19 était très faible (≤ 18,2 %) pour tous les symptômes, à l'exception de la myalgie (82,1 %). La spécificité était élevée pour tous les symptômes (90,7-99,8 %), sauf pour la myalgie (11,0 %). La perte du goût et de l'odorat présentait le rapport de vraisemblance (RV) positif le plus élevé pour la positivité à la RT-PCR (RV+ = 3,59, IC à 95 % : 2,95-4,37). À la régression logistique multiple, trois symptômes ont maintenu une contribution significative à la positivité de la RT-PCR ; il s'agissait de la perte du goût et de l'odorat (OR = 3,90, IC à 95 % : 3,04-4,99), des maux de gorge (OR = 1,50, IC à 95 % : 1,02-2,19), et de la myalgie (OR = 0,65, IC à 95 % : 0,49-0,85). Les autres facteurs prédictifs significatifs étaient les contacts précédents avec un cas de COVID-19 (OR = 0,50, IC à 95 % : 0,39-0,62), et l'appartenance au sexe féminin (OR = 1,33, IC à 95 % : 1,15-1,55).
Conclusion
UNASSIGNED
Les résultats de la présente étude ne soutiennent pas l'utilisation des symptômes auto-déclarés pour la confirmation de la présence de COVID-19 chez les cas suspects, en raison de leurs mauvaises propriétés diagnostiques.
Autres résumés
Type: Publisher
(ara)
الأعراض التي يبلغ عنها المريض بنفسه: هل يمكن أن تستخدم للتنبؤ بالنتيجة الإيجابية لتحليل التنسخ العكسي لتفاعل البوليميراز المتسلسل في حالات كوقيذ-19 المشتبه فيها؟ التجربة الليبية.
Type: Publisher
(fre)
Les symptômes auto-déclarés pourraient-ils constituer des facteurs prédictifs d'une positivité au test RT-PCR chez les cas suspects de COVID-19 ? L'expérience de la Libye.
Identifiants
pubmed: 36205205
doi: 10.26719/emhj.22.061
doi:
Types de publication
Journal Article
Langues
eng
Sous-ensembles de citation
IM
Pagination
664-672Informations de copyright
Copyright © World Health Organization (WHO) 2022. Open Access. Some rights reserved. This work is available under the CC BY-NC-SA 3.0 IGO license (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/igo).