A Toolbox for Glutamine Use in Dissolution Dynamic Nuclear Polarization: from Enzymatic Reaction Monitoring to the Study of Cellular Metabolic Pathways and Imaging.


Journal

Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry
ISSN: 1439-7641
Titre abrégé: Chemphyschem
Pays: Germany
ID NLM: 100954211

Informations de publication

Date de publication:
15 06 2023
Historique:
revised: 25 03 2023
received: 27 02 2023
medline: 19 6 2023
pubmed: 28 3 2023
entrez: 27 3 2023
Statut: ppublish

Résumé

Glutamine is under scrutiny regarding its metabolic deregulation linked to energetic reprogramming in cancer cells. Many analytical techniques have been used to better understand the impact of the metabolism of amino acids on biological processes, however only a few are suited to work with complex samples. Here, we report the use of a general dissolution dynamic nuclear polarization (D-DNP) formulation using an unexpensive radical as a multipurpose tool to study glutamine, with insights from enzymatic modelling to complex metabolic networks and fast imaging. First, hyperpolarized [5-

Identifiants

pubmed: 36973178
doi: 10.1002/cphc.202300151
doi:

Substances chimiques

Glutamine 0RH81L854J
Amino Acids 0
Carbon Isotopes 0

Types de publication

Journal Article Research Support, Non-U.S. Gov't

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

e202300151

Subventions

Organisme : École Doctorale Médicament, Toxicologie, Chimie, Imageries
ID : MTCI ED563

Informations de copyright

© 2023 The Authors. ChemPhysChem published by Wiley-VCH GmbH.

Références

M. R. Siddiqui, Z. A. AlOthman, N. Rahman, Arab. J. Chem. 2017, 10, S1409-S1421.
G. A. Nagana Gowda, D. Raftery, J. Magn. Reson. 2015, 260, 144-160.
T. W.-M. Fan, A. N. Lane, Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2016, 92 (93), 18-53.
J. H. Ardenkjaer-Larsen, B. Fridlund, A. Gram, G. Hansson, L. Hansson, M. H. Lerche, R. Servin, M. Thaning, K. Golman, Proc. Nat. Acad. Sci. 2003, 100, 10158-10163.
R. Gupta, M. Lu, G. Hou, M. A. Caporini, M. Rosay, W. Maas, J. Struppe, C. Suiter, J. Ahn, I.-J. L. Byeon, W. T. Franks, M. Orwick-Rydmark, A. Bertarello, H. Oschkinat, A. Lesage, G. Pintacuda, A. M. Gronenborn, T. Polenova, J. Phys. Chem. B 2016, 120, 329-339.
K. K. Frederick, V. K. Michaelis, B. Corzilius, T.-C. Ong, A. C. Jacavone, R. G. Griffin, S. Lindquist, Cell 2015, 163, 620-628.
A. Sadet, E. M. M. Weber, A. Jhajharia, D. Kurzbach, G. Bodenhausen, E. Miclet, D. Abergel, Chem. Eur. J. 2018, 24, 5456-5461.
S. J. Nelson, J. Kurhanewicz, D. B. Vigneron, P. E. Z. Larson, A. L. Harzstark, M. Ferrone, M. van Criekinge, J. W. Chang, R. Bok, I. Park, G. Reed, L. Carvajal, E. J. Small, P. Munster, V. K. Weinberg, J. H. Ardenkjaer-Larsen, A. P. Chen, R. E. Hurd, L.-I. Odegardstuen, F. J. Robb, J. Tropp, J. A. Murray, Sci. Transl. Med. 2013, 5, 198ra108-198ra108.
E. Miclet, V. Stoven, P. A. M. Michels, F. R. Opperdoes, J.-Y. Lallemand, F. Duffieux, J. Biol. Chem. 2001, 276, 34840-34846.
E. Miclet, D. Abergel, A. Bornet, J. Milani, S. Jannin, G. Bodenhausen, J. Phys. Chem. Lett. 2014, 5, 3290-3295.
H. Gutte, A. E. Hansen, H. H. Johannesen, A. E. Clemmensen, J. H. Ardenkjaer-Larsen, C. H. Nielsen, A. Kjaer, Am. J. Nucl. Med. Mol. Imaging 2015, 5, 548-560.
J. E. AbuSalim, K. Yamamoto, N. Miura, B. Blackman, J. R. Brender, C. Mushti, T. Seki, K. A. Camphausen, R. E. Swenson, M. C. Krishna, A. H. Kesarwala, ACS Chem. Biol. 2021, 16, 2144-2150.
A. P. Gaunt, J. S. Lewis, F. Hesse, T. Cheng, I. Marco-Rius, K. M. Brindle, A. Comment, Angew. Chem. 2021, DOI 10.1002/ange.202112982.
G. Sharma, X. Wen, N. R. Maptue, T. Hever, C. R. Malloy, A. D. Sherry, C. Khemtong, ACS Sens. 2021, acssensors.1c01225.
L. Salamanca-Cardona, H. Shah, A. J. Poot, F. M. Correa, V. Di Gialleonardo, H. Lui, V. Z. Miloushev, K. L. Granlund, S. S. Tee, J. R. Cross, C. B. Thompson, K. R. Keshari, Cell Metab. 2017, 26, 830-841.e3.
F. A. Gallagher, M. I. Kettunen, S. E. Day, M. Lerche, K. M. Brindle, Magn. Reson. Med. 2008, 60, 253-257.
C. Cabella, M. Karlsson, C. Canapè, G. Catanzaro, S. Colombo Serra, L. Miragoli, L. Poggi, F. Uggeri, L. Venturi, P. R. Jensen, M. H. Lerche, F. Tedoldi, J. Magn. Reson. 2013, 232, 45-52.
L. Mazuel, R. F. Schulte, A. Cladière, C. Spéziale, M. Lagrée, M. Leremboure, B. Jean, F. Durif, C. Chassain, Magn. Reson. Med. 2017, 78, 1296-1305.
C. Canapè, G. Catanzaro, E. Terreno, M. Karlsson, M. H. Lerche, P. R. Jensen, Magn. Reson. Med. 2015, 73, 2296-2305.
P. R. Jensen, M. Karlsson, S. Meier, J. Ø. Duus, M. H. Lerche, Chem. Eur. J. 2009, 15, 10010-10012.
M. Karlsson, P. R. Jensen, J. Ø. Duus, S. Meier, M. H. Lerche, Appl. Magn. Reson. 2012, 43, 223-236.
G. Bertho, L. Lordello, X. Chen, C. Lucas-Torres, I. E. Oumezziane, C. Caradeuc, M. Baudin, S. Nuan-Aliman, C. Thieblemont, V. Baud, N. Giraud, J. Proteome Res. 2022, 21, 1041-1051.
X. Chen, C. Caradeuc, A. Montagne, V. Baud, G. Bertho, C. Lucas-Torres, N. Giraud, Anal. Chem. 2022, 94, 14974-14984.
M. Stumvoll, G. Perriello, C. Meyer, J. Gerich, Kidney Int. 1999, 55, 778-792.
R. J. DeBerardinis, T. Cheng, Oncogene 2010, 29, 313-324.
C. T. Hensley, A. T. Wasti, R. J. DeBerardinis, J. Clin. Invest. 2013, 123, 3678-3684.
F. Parlati, S. Bromley-Dulfano, S. Demo, J. Janes, M. Gross, E. Lewis, A. MacKinnon, M. Rodriguez, J. Yang, F. Zhao, M. Bennett, Blood 2013, 122, 4226-4226.
A. Beckett, D. Gervais, World J. Microbiol. Biotechnol. 2019, 35, 152.
J. Zhang, J. Fan, S. Venneti, J. R. Cross, T. Takagi, B. Bhinder, H. Djaballah, M. Kanai, E. H. Cheng, A. R. Judkins, B. Pawel, J. Baggs, S. Cherry, J. D. Rabinowitz, C. B. Thompson, Mol. Cell 2014, 56, 205-218.
H. van den Berg, Leuk. Lymphoma 2011, 52, 168-178.
G. Ollenschläger, E. Roth, W. Linkesch, S. Jansen, A. Simmel, B. Mödder, Eur. J. Clin. Invest. 1988, 18, 512-516.
R. Pieters, S. P. Hunger, J. Boos, C. Rizzari, L. Silverman, A. Baruchel, N. Goekbuget, M. Schrappe, C.-H. Pui, Cancer 2011, 117, 238-249.
D. Shimon, Y. Hovav, A. Feintuch, D. Goldfarb, S. Vega, Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 5729.
R. A. Wind, M. J. Duijvestijn, C. van der Lugt, A. Manenschijn, J. Vriend, Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 1985, 17, 33-67.
S. J. Elliott, Q. Stern, M. Ceillier, T. El Daraï, S. F. Cousin, O. Cala, S. Jannin, Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2021, 126 (127), 59-100.
M. Rosay, L. Tometich, S. Pawsey, R. Bader, R. Schauwecker, M. Blank, P. M. Borchard, S. R. Cauffman, K. L. Felch, R. T. Weber, R. J. Temkin, R. G. Griffin, W. E. Maas, Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 5850.
A. Bornet, R. Melzi, S. Jannin, G. Bodenhausen, Appl. Magn. Reson. 2012, 43, 107-117.
A. Bornet, J. Milani, B. Vuichoud, A. J. Perez Linde, G. Bodenhausen, S. Jannin, Chem. Phys. Lett. 2014, 602, 63-67.
A. Bornet, A. Pinon, A. Jhajharia, M. Baudin, X. Ji, L. Emsley, G. Bodenhausen, J. H. Ardenkjaer-Larsen, S. Jannin, Phys. Chem. Chem. Phys. 2016, 18, 30530-30535.
M. Baudin, B. Vuichoud, A. Bornet, G. Bodenhausen, S. Jannin, J. Magn. Reson. 2018, 294, 115-121.
S. Budavari, M. J. O'Neal, A. Smith, P. E. Heckelman, J. F. Kinneary (Eds.), The Merck Index: An Encyclopedia of Chemicals, Drugs, and Biologicals, Merck&Co, n. d.
M. M. Chaumeil, P. E. Z. Larson, H. A. I. Yoshihara, O. M. Danforth, D. B. Vigneron, S. J. Nelson, R. O. Pieper, J. J. Phillips, S. M. Ronen, Nat. Commun. 2013, 4, 2429.
M. M. Chaumeil, P. E. Z. Larson, S. M. Woods, L. Cai, P. Eriksson, A. E. Robinson, J. M. Lupo, D. B. Vigneron, S. J. Nelson, R. O. Pieper, J. J. Phillips, S. M. Ronen, Cancer Res. 2014, 74, 4247-4257.
L. Dang, D. W. White, S. Gross, B. D. Bennett, M. A. Bittinger, E. M. Driggers, V. R. Fantin, H. G. Jang, S. Jin, M. C. Keenan, K. M. Marks, R. M. Prins, P. S. Ward, K. E. Yen, L. M. Liau, J. D. Rabinowitz, L. C. Cantley, C. B. Thompson, M. G. Vander Heiden, S. M. Su, Nature 2009, 462, 739-744.
A. B. Frahm, D. Hill, S. Katsikis, T. Andreassen, J. H. Ardenkjaer-Larsen, T. F. Bathen, S. A. Moestue, P. R. Jensen, M. H. Lerche, Talanta 2021, 235, 122812.
L. Guduff, D. Kurzbach, C. van Heijenoort, D. Abergel, J.-N. Dumez, Chem. Eur. J. 2017, 23, 16722-16727.
J. Hennig, A. Nauerth, H. Friedburg, Magn. Reson. Med. 1986, 3, 823-833.
J. H. Weiner, L. A. Heppel, J. Biol. Chem. 1971, 246, 6933-6941.
P. S. Masters, J. S. Hong, J. Bacteriol. 1981, 147, 805-819.
M. Zampieri, M. Hörl, F. Hotz, N. F. Müller, U. Sauer, Nat. Commun. 2019, 10, 3354.
M. Scalise, L. Console, F. Rovella, M. Galluccio, L. Pochini, C. Indiveri, Cells 2020, 9, 2028.
J. H. Ardenkjaer-Larsen, S. Macholl, H. Jóhannesson, Appl. Magn. Reson. 2008, 34, 509-522.
J. Wolber, F. Ellner, B. Fridlund, A. Gram, H. Jóhannesson, G. Hansson, L. H. Hansson, M. H. Lerche, S. Månsson, R. Servin, M. Thaning, K. Golman, J. H. Ardenkjaer-Larsen, Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. Sect. Accel. Spectrometers Detect. Assoc. Equip. 2004, 526, 173-181.
S. Jannin, A. Bornet, S. Colombo, G. Bodenhausen, Chem. Phys. Lett. 2011, 517, 234-236.
D. Baudouin, H. A. van Kalkeren, A. Bornet, B. Vuichoud, L. Veyre, M. Cavaillès, M. Schwarzwälder, W.-C. Liao, D. Gajan, G. Bodenhausen, L. Emsley, A. Lesage, S. Jannin, C. Copéret, C. Thieuleux, Chem. Sci. 2016, 7, 6846-6850.
T. El Daraï, S. F. Cousin, Q. Stern, M. Ceillier, J. Kempf, D. Eshchenko, R. Melzi, M. Schnell, L. Gremillard, A. Bornet, J. Milani, B. Vuichoud, O. Cala, D. Montarnal, S. Jannin, Nat. Commun. 2021, 12, 4695.
J. J. Helmus, C. P. Jaroniec, J. Biomol. NMR 2013, 55, 355-367.
M. Roelfs, P. C. Kroon, 2022, DOI 10.5281/ZENODO.1133336.
C. Harrison, C. Yang, A. Jindal, R. J. DeBerardinis, M. A. Hooshyar, M. Merritt, A. Dean Sherry, C. R. Malloy, NMR Biomed. 2012, 25, 1286-1294.

Auteurs

Karen Dos Santos (K)

Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, Université Paris Cité, 45, Rue des Saints Pères, 75006, Paris, France.

Gildas Bertho (G)

Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, Université Paris Cité, 45, Rue des Saints Pères, 75006, Paris, France.

Cédric Caradeuc (C)

Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, Université Paris Cité, 45, Rue des Saints Pères, 75006, Paris, France.

Véronique Baud (V)

Laboratoire NF-κB, Différenciation et Cancer, Université Paris Cité, 24, Rue du faubourg Saint Jacques, 75014, Paris, France.

Aurélie Montagne (A)

Laboratoire NF-κB, Différenciation et Cancer, Université Paris Cité, 24, Rue du faubourg Saint Jacques, 75014, Paris, France.

Daniel Abergel (D)

Laboratoire des Biomolécules, LBM, Département de chimie, École Normale Supérieure, PSL Université, Sorbonne Université, 45 Rue d'Ulm, 75005, Paris, France.

Nicolas Giraud (N)

Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, Université Paris Cité, 45, Rue des Saints Pères, 75006, Paris, France.

Mathieu Baudin (M)

Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, Université Paris Cité, 45, Rue des Saints Pères, 75006, Paris, France.
Laboratoire des Biomolécules, LBM, Département de chimie, École Normale Supérieure, PSL Université, Sorbonne Université, 45 Rue d'Ulm, 75005, Paris, France.

Articles similaires

Female Biofilms Animals Lactobacillus Mice
Metabolic Networks and Pathways Saccharomyces cerevisiae Computational Biology Synthetic Biology Computer Simulation
Host Specificity Bacteriophages Genomics Algorithms Escherichia coli
Biofilms Horses Animals Escherichia coli Mesenchymal Stem Cells

Classifications MeSH