Quantum Computing for Molecular Biology.
Molecular Biology
Molecular Simulations
Quantum Biology
Quantum Chemistry
Quantum Computing
Journal
Chembiochem : a European journal of chemical biology
ISSN: 1439-7633
Titre abrégé: Chembiochem
Pays: Germany
ID NLM: 100937360
Informations de publication
Date de publication:
03 07 2023
03 07 2023
Historique:
revised:
27
04
2023
received:
16
02
2023
medline:
5
7
2023
pubmed:
8
5
2023
entrez:
8
5
2023
Statut:
ppublish
Résumé
Molecular biology and biochemistry interpret microscopic processes in the living world in terms of molecular structures and their interactions, which are quantum mechanical by their very nature. Whereas the theoretical foundations of these interactions are well established, the computational solution of the relevant quantum mechanical equations is very hard. However, much of molecular function in biology can be understood in terms of classical mechanics, where the interactions of electrons and nuclei have been mapped onto effective classical surrogate potentials that model the interaction of atoms or even larger entities. The simple mathematical structure of these potentials offers huge computational advantages; however, this comes at the cost that all quantum correlations and the rigorous many-particle nature of the interactions are omitted. In this work, we discuss how quantum computation may advance the practical usefulness of the quantum foundations of molecular biology by offering computational advantages for simulations of biomolecules. We not only discuss typical quantum mechanical problems of the electronic structure of biomolecules in this context, but also consider the dominating classical problems (such as protein folding and drug design) as well as data-driven approaches of bioinformatics and the degree to which they might become amenable to quantum simulation and quantum computation.
Identifiants
pubmed: 37151197
doi: 10.1002/cbic.202300120
doi:
Types de publication
Journal Article
Review
Research Support, Non-U.S. Gov't
Langues
eng
Sous-ensembles de citation
IM
Pagination
e202300120Informations de copyright
© 2023 The Authors. ChemBioChem published by Wiley-VCH GmbH.
Références
J. Drenth, Principles of Protein X-Ray Christallography, Springer New York, NY 2007.
M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, i. Seltzer, J.-M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, Nature 2011, 470, 78.
H. N. Chapman, P. Fromme, A. Barty, T. A. White, R. A. Kirian, A. Aquila, M. S. Hunter, J. Schulz, D. P. DePonte, U. Weierstall, R. B. Doak, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, I. Schlichting, L. Lomb, N. Coppola, R. L. Shoeman, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, L. Foucar, N. Kimmel, G. Weidenspointner, P. Holl, M. Liang, M. Barthelmess, C. Caleman, S. Boutet, M. J. Bogan, J. Krzywinski, C. Bostedt, S. Bajt, L. Gumprecht, B. Rudek, B. Erk, C. Schmidt, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. Kühnel, M. Messerschmidt, J. D. Bozek, S. P. Hau-Riege, M. Frank, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, G. J. Williams, J. Hajdu, N. Timneanu, M. M. Seibert, J. Andreasson, A. Rocker, O. Jönsson, M. Svenda, S. Stern, K. Nass, R. Andritschke, C.-D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, K. E. Schmidt, X. Wang, I. Grotjohann, J. M. Holton, T. R. M. Barends, R. Neutze, S. Marchesini, R. Fromme, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, I. Andersson, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, J. C. H. Spence, Nature 2011, 470, 73.
J. C. H. Spence, U. Weierstall, H. N. Chapman, Rep. Prog. Phys. 2012, 75, 102601.
A. T. Chinwalla, L. L. Cook, K. D. Delehaunty, G. A. Fewell, L. A. Fulton, R. S. Fulton, T. A. Graves, L. W. Hillier, E. R. Mardis, J. D. McPherson, T. L. Miner, W. E. Nash, J. O. Nelson, M. N. Nhan, K. H. Pepin, C. S. Pohl, T. C. Ponce, B. Schultz, J. Thompson, E. Trevaskis, R. H. Waterston, M. C. Wendl, R. K. Wilson, S.-P. Yang, P. An, E. Berry, B. Birren, T. Bloom, D. G. Brown, J. Butler, M. Daly, R. David, J. Deri, S. Dodge, K. Foley, D. Gage, S. Gnerre, T. Holzer, D. B. Jaffe, M. Kamal, E. K. Karlsson, C. Kells, A. Kirby, E. J. Kulbokas, E. S. Lander, T. Landers, J. P. Leger, R. Levine, K. Lindblad-Toh, E. Mauceli, J. H. Mayer, M. McCarthy, J. Meldrim, J. P. Mesirov, R. Nicol, C. Nusbaum, S. Seaman, T. Sharpe, A. Sheridan, J. B. Singer, R. Santos, B. Spencer, N. Stange-Thomann, J. P. Vinson, C. M. Wade, J. Wierzbowski, D. Wyman, M. C. Zody, E. Birney, N. Goldman, A. Kasprzyk, E. Mongin, A. G. Rust, G. Slater, A. Stabenau, A. Ureta-Vidal, S. Whelan, R. Ainscough, J. Attwood, J. Bailey, K. Barlow, S. Beck, J. Burton, M. Clamp, C. Clee, A. Coulson, J. Cuff, V. Curwen, T. Cutts, J. Davies, E. Eyras, D. Grafham, S. Gregory, T. Hubbard, A. Hunt, M. Jones, A. Joy, S. Leonard, C. Lloyd, L. Matthews, S. McLaren, K. McLay, B. Meredith, J. C. Mullikin, Z. Ning, K. Oliver, E. Overton-Larty, R. Plumb, S. Potter, M. Quail, J. Rogers, C. Scott, S. Searle, R. Shownkeen, S. Sims, M. Wall, A. P. West, D. Willey, S. Williams, J. F. Abril, R. Guigó, G. Parra, P. Agarwal, R. Agarwala, D. M. Church, W. Hlavina, D. R. Maglott, V. Sapojnikov, M. Alexandersson, L. Pachter, S. E. Antonarakis, E. T. Dermitzakis, A. Reymond, C. Ucla, R. Baertsch, M. Diekhans, T. S. Furey, A. Hinrichs, F. Hsu, D. Karolchik, W. J. Kent, K. M. Roskin, M. S. Schwartz, C. Sugnet, R. J. Weber, P. Bork, I. Letunic, M. Suyama, D. Torrents, E. M. Zdobnov, M. Botcherby, S. D. Brown, R. D. Campbell, I. Jackson, N. Bray, O. Couronne, I. Dubchak, A. Poliakov, E. M. Rubin, M. R. Brent, P. Flicek, E. Keibler, I. Korf, S. Batalov, C. Bult, W. N. Frankel, P. Carninci, Y. Hayashizaki, J. Kawai, Y. Okazaki, S. Cawley, D. Kulp, R. Wheeler, F. Chiaromonte, F. S. Collins, A. Felsenfeld, M. Guyer, J. Peterson, K. Wetterstrand, R. R. Copley, R. Mott, C. Dewey, N. J. Dickens, R. D. Emes, L. Goodstadt, C. P. Ponting, E. Winter, D. M. Dunn, A. C. von Niederhausern, R. B. Weiss, S. R. Eddy, L. S. Johnson, T. A. Jones, L. Elnitski, D. L. Kolbe, P. Eswara, W. Miller, M. J. O'Connor, S. Schwartz, R. A. Gibbs, D. M. Muzny, G. Glusman, A. Smit, E. D. Green, R. C. Hardison, S. Yang, D. Haussler, A. Hua, B. A. Roe, R. S. Kucherlapati, K. T. Montgomery, J. Li, M. Li, S. Lucas, B. Ma, W. R. McCombie, M. Morgan, P. Pevzner, G. Tesler, J. Schultz, D. R. Smith, J. Tromp, K. C. Worley, Nature 2002, 420, 520.
R. H. Waterson, E. S. Lander, R. K. Wilson, Nature 2005, 437, 69.
C. G. Elsik, R. L. Tellam, K. C. Worley, R. A. Gibbs, D. M. Muzny, G. M. Weinstock, D. L. Adelson, E. E. Eichler, L. Elnitski, R. Guigó, D. L. Hamernik, S. M. Kappes, H. A. Lewin, D. J. Lynn, F. W. Nicholas, A. Reymond, M. Rijnkels, L. C. Skow, E. M. Zdobnov, L. Schook, J. Womack, T. Alioto, S. E. Antonarakis, A. Astashyn, C. E. Chapple, H.-C. Chen, J. Chrast, F. Câmara, O. Ermolaeva, C. N. Henrichsen, W. Hlavina, Y. Kapustin, B. Kiryutin, P. Kitts, F. Kokocinski, M. Landrum, D. Maglott, K. Pruitt, V. Sapojnikov, S. M. Searle, V. Solovyev, A. Souvorov, C. Ucla, C. Wyss, J. M. Anzola, D. Gerlach, E. Elhaik, D. Graur, J. T. Reese, R. C. Edgar, J. C. McEwan, G. M. Payne, J. M. Raison, T. Junier, E. V. Kriventseva, E. Eyras, M. Plass, R. Donthu, D. M. Larkin, J. Reecy, M. Q. Yang, L. Chen, Z. Cheng, C. G. Chitko-McKown, G. E. Liu, L. K. Matukumalli, J. Song, B. Zhu, D. G. Bradley, F. S. Brinkman, L. P. Lau, M. D. Whiteside, A. Walker, T. T. Wheeler, T. Casey, J. B. German, D. G. Lemay, N. J. Maqbool, A. J. Molenaar, S. Seo, P. Stothard, C. L. Baldwin, R. Baxter, C. L. Brinkmeyer-Langford, W. C. Brown, C. P. Childers, T. Connelley, S. A. Ellis, K. Fritz, E. J. Glass, C. T. Herzig, A. Iivanainen, K. K. Lahmers, A. K. Bennett, C. M. Dickens, J. G. Gilbert, D. E. Hagen, H. Salih, J. Aerts, A. R. Caetano, B. Dalrymple, J. F. Garcia, C. A. Gill, S. G. Hiendleder, E. Memili, D. Spurlock, J. L. Williams, L. Alexander, M. J. Brownstein, L. Guan, R. A. Holt, S. J. Jones, M. A. Marra, R. Moore, S. S. Moore, A. Roberts, M. Taniguchi, R. C. Waterman, J. Chacko, M. M. Chandrabose, A. Cree, M. D. Dao, H. H. Dinh, R. A. Gabisi, S. Hines, J. Hume, S. N. Jhangiani, V. Joshi, C. L. Kovar, L. R. Lewis, Y. shin Liu, J. Lopez, M. B. Morgan, N. B. Nguyen, G. O. Okwuonu, S. J. Ruiz, J. Santibanez, R. A. Wright, C. Buhay, Y. Ding, S. Dugan-Rocha, J. Herdandez, M. Holder, A. Sabo, A. Egan, J. Goodell, K. Wilczek-Boney, G. R. Fowler, M. E. Hitchens, R. J. Lozado, C. Moen, D. Steffen, J. T. Warren, J. Zhang, R. Chiu, J. E. Schein, K. J. Durbin, P. Havlak, H. Jiang, Y. Liu, X. Qin, Y. Ren, Y. Shen, H. Song, S. N. Bell, C. Davis, A. J. Johnson, S. Lee, L. V. Nazareth, B. M. Patel, L.-L. Pu, S. Vattathil, R. L. Williams, S. Curry, C. Hamilton, E. Sodergren, D. A. Wheeler, W. Barris, G. L. Bennett, A. Eggen, R. D. Green, G. P. Harhay, M. Hobbs, O. Jann, J. W. Keele, M. P. Kent, S. Lien, S. D. McKay, S. McWilliam, A. Ratnakumar, R. D. Schnabel, T. Smith, W. M. Snelling, T. S. Sonstegard, R. T. Stone, Y. Sugimoto, A. Takasuga, J. F. Taylor, C. P. V. Tassell, M. D. MacNeil, A. R. Abatepaulo, C. A. Abbey, V. Ahola, I. G. Almeida, A. F. Amadio, E. Anatriello, S. M. Bahadue, F. H. Biase, C. R. Boldt, J. A. Carroll, W. A. Carvalho, E. P. Cervelatti, E. Chacko, J. E. Chapin, Y. Cheng, J. Choi, A. J. Colley, T. A. de Campos, M. D. Donato, I. K. de Miranda Santos, C. J. de Oliveira, H. Deobald, E. Devinoy, K. E. Donohue, P. Dovc, A. Eberlein, C. J. Fitzsimmons, A. M. Franzin, G. R. Garcia, S. Genini, C. J. Gladney, J. R. Grant, M. L. Greaser, J. A. Green, D. L. Hadsell, H. A. Hakimov, R. Halgren, J. L. Harrow, E. A. Hart, N. Hastings, M. Hernandez, Z.-L. Hu, A. Ingham, T. Iso-Touru, C. Jamis, K. Jensen, D. Kapetis, T. Kerr, S. S. Khalil, H. Khatib, D. Kolbehdari, C. G. Kumar, D. Kumar, R. Leach, J. C.-M. Lee, C. Li, K. M. Logan, R. Malinverni, E. Marques, W. F. Martin, N. F. Martins, S. R. Maruyama, R. Mazza, K. L. McLean, J. F. Medrano, B. T. Moreno, D. D. Moré, C. T. Muntean, H. P. Nandakumar, M. F. Nogueira, I. Olsaker, S. D. Pant, F. Panzitta, R. C. Pastor, M. A. Poli, N. Poslusny, S. Rachagani, S. Ranganathan, A. Razpet, P. K. Riggs, G. Rincon, N. Rodriguez-Osorio, S. L. Rodriguez-Zas, N. E. Romero, A. Rosenwald, L. Sando, S. M. Schmutz, L. Shen, L. Sherman, B. R. Southey, Y. S. Lutzow, J. V. Sweedler, I. Tammen, B. P. V. Telugu, J. M. Urbanski, Y. T. Utsunomiya, C. P. Verschoor, A. J. Waardenberg, Z. Wang, R. Ward, R. Weikard, T. H. Welsh, S. N. White, L. G. Wilming, K. R. Wunderlich, J. Yang, F.-Q. Zhao, Science 2009, 324, 522.
E. R. Mardis, Nature 2011, 470, 198.
I. Kassal, J. D. Whitfield, A. Perdomo-Ortiz, M.-H. Yung, A. Aspuru-Guzik, Ann. Rev. Phys. Chem. 2011, 62, 185.
Y. Cao, J. Romero, J. P. Olson, M. Degroote, P. D. Johnson, M. Kieferová, I. D. Kivlichan, T. Menke, B. Peropadre, N. P. D. Sawaya, S. Sim, L. Veis, A. Aspuru-Guzik, Chem. Rev. 2019, 119, 10856.
B. Bauer, S. Bravyi, M. Motta, G. K.-L. Chan, Chem. Rev. 2020, 120, 12685.
S. McArdle, S. Endo, A. Aspuru-Guzik, S. C. Benjamin, X. Yuan, Rev. Mod. Phys. 2020, 92, 015003.
H. Liu, G. H. Low, D. S. Steiger, T. Häner, M. Reiher, M. Troyer, Matherials Theory 2022, 6, 11.
M. Reiher (Editor), Atomistic approaches in modern biology, Topics in Current Chemistry, Springer, Berlin, Germany, Volume 268 2007.
C. Outeiral, M. Strahm, J. Shi, G. M. Morris, S. C. Benjamin, C. M. Deane, WIREs Comput. Mol. Sci. 2021, 11, e1481.
P. S. Emani, J. Warrell, A. Anticevic, S. Bekiranov, M. Gandal, M. J. McConnell, G. Sapiro, A. Aspuru-Guzik, J. T. Baker, M. Bastiani, J. D. Murray, S. N. Sotiropoulos, J. Taylor, G. Senthil, T. Lehner, M. B. Gerstein, A. W. Harrow, Nat. Methods 2021, 18, 701.
A. K. Fedorov, M. S. Gelfand, Nat. Comput. Sci. 2021, 1, 114.
V. Marx, Nat. Methods 2021, 18, 715.
N. Lambert, Y.-N. Chen, Y.-C. Cheng, G.-Y. Li, Che-Mingand Chen, F. Nori, Nat. Phys. 2013, 9, 10.
M. Mosheni, Y. Omar, G. S. Engel, M. B. Plenio, Quantum Effects in Biology, Cambridge University Press 2014.
A. Marais, B. Adams, A. K. Ringsmuth, M. Ferretti, J. M. Gruber, R. Hendrikx, M. Schuld, S. L. Smith, I. Sinayskiy, T. P. J. Krüger, F. Petruccione, R. van Grondelle, J. R. Soc. Interface 2018, 15, 20180640.
J. Cao, R. J. Cogdell, D. F. Coker, H.-G. Duan, J. Hauer, U. Kleinekathöfer, T. L. C. Jansen, T. Mančal, R. J. D. Miller, J. P. Ogilvie, V. I. Prokhorenko, T. Renger, H.-S. Tan, R. Tempelaar, M. Thorwart, E. Thyrhaug, S. Westenhoff, D. Zigmantas, Sci. Adv. 2020, 6, eaaz4888.
T. Vreven, K. Morokuma, Chapter 3 Hybrid Methods: ONIOM (QM:MM) and QM/MM, Annu. Rep. Comput. Chem. 2006, 2, 35.
H. M. Senn, W. Thiel, Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 1198.
U. Ryde, Chapter Six - QM/MM Calculations on Proteins, in G. A. Voth (Editor), Computational Approaches for Studying Enzyme Mechanism Part A, volume 577 of Methods Enzymol., pages 119-158, Academic Press 2016.
S. Izrailev, S. Stepaniants, B. Isralewitz, D. Kosztin, H. Lu, F. Molnar, W. Wriggers, K. Schulten, Steered Molecular Dynamics, in P. Deuflhard, J. Hermans, B. Leimkuhler, A. E. Mark, S. Reich, R. D. Skeel (Editors), Computational Molecular Dynamics: Challenges, Methods, Ideas, Springer Berlin Heidelberg, Berlin, Heidelberg 1999 pages 39-65.
B. Isralewitz, M. Gao, K. Schulten, Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 224.
T. Hansson, C. Oostenbrink, W. F. van Gunsteren, Curr. Opin. Struct. Biol. 2002, 12, 190.
J. E. Stone, D. J. Hardy, I. S. Ufimtsev, K. Schulten, J. Mol. Graphics Modell. 2010, 29, 116.
K. Meier, A. Choutko, J. Dolenc, A. P. Eichenberger, S. Riniker, W. F. van Gunsteren, Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 2820.
D. J. Tannor, Introduction to Quantum Mechanics - A Time-Dependent Perspective, University Science Books, Sausalito, California 2007.
D. Sholl, J. A. Steckel, Density functional theory, Wiley-Blackwell, Hoboken, NJ 2009.
T. Helgaker, P. Jorgensen, J. Olsen, Molecular electronic-structure theory, John Wiley & Sons, Nashville, TN 2013.
M. Reiher, A. Wolf, Relativistic Quantum Chemistry - The Fundamental Theory of Molecular Science, John Wiley & Sons, New York 2015.
C. David Sherrill, H. F. Schaefer, The Configuration Interaction Method: Advances in Highly Correlated Approaches, in P.-O. Löwdin, J. R. Sabin, M. C. Zerner, E. Brändas (Editors), Advances in Quantum Chemistry, volume 34, pages 143-269, Academic Press 1999.
R. J. Bartlett, M. Musiał, Rev. Mod. Phys. 2007, 79, 291.
D. Cremer, WIREs Comput. Mol. Sci. 2011, 1, 509.
A. J. Cohen, P. Mori-Sánchez, W. Yang, Science 2008, 321, 792.
X. Ren, P. Rinke, C. Joas, M. Scheffler, J. Mater. Sci. 2012, 47, 7447.
M. Reiher, Isr. J. Chem. 2022, 62, e202100101.
C. Brunken, M. Reiher, J. Chem. Theory Comput. 2021, 17, 3797.
K.-S. Csizi, M. Reiher, WIREs Comput. Mol. Sci. 2023, page e1656.
J. Tomasi, B. Mennucci, R. Cammi, Chem. Rev. 2005, 105, 2999.
A. Klamt, WIREs Comput. Mol. Sci. 2011, 1, 699.
F. R. Manby, M. Stella, J. D. Goodpaster, T. F. Miller, J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 2564.
B. Mennucci, WIREs Comput. Mol. Sci. 2012, 2, 386.
C. R. Jacob, J. Neugebauer, WIREs Comput. Mol. Sci. 2014, 4, 325.
A. Warshel, Angew. Chem. Int. Ed. 2014, 53, 10020.
T. A. Wesolowski, S. Shedge, X. Zhou, Chem. Rev. 2015, 115, 5891.
C. Curutchet, B. Mennucci, Chem. Rev. 2017, 117, 294.
A. H. Mühlbach, M. Reiher, J. Chem. Phys. 2018, 149, 184104.
L. O. Jones, M. A. Mosquera, G. C. Schatz, M. A. Ratner, J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 3281.
D. Loco, L. Lagardère, O. Adjoua, J.-P. Piquemal, Acc. Chem. Res. 2021, 54, 2812.
T. P. Senftle, S. Hong, M. M. Islam, S. B. Kylasa, Y. Zheng, Y. K. Shin, C. Junkermeier, R. Engel-Herbert, M. J. Janik, H. M. Aktulga, T. Verstraelen, A. Grama, A. C. T. van Duin, npj Comput. Mater. 2016, 2, 15011.
L. Bertini, M. Bruschi, L. de Gioia, P. Fantucci, C. Greco, G. Zampella, Quantum Chemical Investigations of Reaction Paths of Metalloenzymes and BiomimeticModels - The Hydrogenase Example, pages 1-46, Springer Berlin Heidelberg, Berlin, Heidelberg 2007.
M. R. A. Blomberg, T. Borowski, F. Himo, R.-Z. Liao, P. E. M. Siegbahn, Chem. Rev. 2014, 114, 3601.
M. Orio, D. A. Pantazis, Chem. Commun. 2021, 57, 3952.
M. Born, V. Fock, Z. Phys. 1928, 51, 165.
J. Schliemann, J. I. Cirac, M. Kuś, M. Lewenstein, D. Loss, Phys. Rev. A 2001, 64, 022303.
M. A. Nielsen, I. L. Chuang, Quantum Computation and Quantum Information, Cambridge University Press, Cambridge, England 2010.
M. Altunbulak, A. Klyachko, Commun. Math. Phys. 2008, 282.
K. Boguslawski, P. Tecmer, O. Legeza, M. Reiher, J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 3129.
C. J. Stein, M. Reiher, J. Chem. Theory Comput. 2016, 12, 1760.
C. Schilling, M. Altunbulak, S. Knecht, A. Lopes, J. D. Whitfield, M. Christandl, D. Gross, M. Reiher, Phys. Rev. A 2018, 97, 052503.
A. Baiardi, M. Reiher, J. Chem. Phys. 2020, 152, 040903.
J. W. Park, R. Al-Saadon, M. K. MacLeod, T. Shiozaki, B. Vlaisavljevich, Chem. Rev. 2020, 120, 5878.
A. Khedkar, M. Roemelt, Phys. Chem. Chem. Phys. 2021, 23, 17097.
S. Grimme, WIREs Comput. Mol. Sci. 2011, 1, 211.
L. Kong, F. A. Bischoff, E. F. Valeev, Chem. Rev. 2012, 112, 75.
K. D. Vogiatzis, D. Ma, J. Olsen, L. Gagliardi, W. A. de Jong, J. Chem. Phys. 2017, 147, 184111.
I. Shavitt, Mol. Phys. 1998, 94, 3.
R. J. Bartlett, M. Musiał, Rev. Mod. Phys. 2007, 79, 291.
J. J. Eriksen, J. Phys. Chem. Lett. 2021, 12, 418.
G. H. Booth, A. J. W. Thom, A. Alavi, J. Chem. Phys. 2009, 131, 054106.
F. Neese, J. Chem. Phys. 2003, 119, 9428.
A. A. Holmes, N. M. Tubman, C. J. Umrigar, J. Chem. Theory Comput. 2016, 12, 3674.
P. M. Zimmerman, J. Chem. Phys. 2017, 146, 104102.
J. B. Schriber, F. A. Evangelista, J. Chem. Theory Comput. 2017, 13, 5354.
V. Abraham, N. J. Mayhall, J. Chem. Theory Comput. 2020, 16, 6098.
B. Huron, J. P. Malrieu, P. Rancurel, J. Chem. Phys. 1973, 58, 5745.
S. Szalay, M. Pfeffer, V. Murg, G. Barcza, F. Verstraete, R. Schneider, Ö. Legeza, Int. J. Quantum Chem. 2015, 115, 1342.
G. K.-L. Chan, J. J. Dorando, D. Ghosh, J. Hachmann, E. Neuscamman, H. Wang, T. Yanai, An Introduction to the Density Matrix Renormalization Group Ansatz in Quantum Chemistry, in Frontiers in Quantum Systems in Chemistry and Physics, pages 49-65, Springer-Verlag 2008.
G. K. L. Chan, D. Zgid, Annu. Rep. Comput. Chem. 2009, 5, 149.
K. H. Marti, M. Reiher, Z. Phys. Chem. 2010, 224, 583.
U. Schollwöck, Ann. Phys. 2011, 326, 96.
G. K.-L. Chan, S. Sharma, Annu. Rev. Phys. Chem. 2011, 62, 465.
S. Wouters, D. Van Neck, Eur. Phys. J. D 2013, 31, 272.
Y. Kurashige, Mol. Phys. 2014, 112, 1485.
R. Olivares-Amaya, W. Hu, N. Nakatani, S. Sharma, J. Yang, G. K.-L. Chan, J. Chem. Phys. 2015, 142, 34102.
T. Yanai, Y. Kurashige, W. Mizukami, J. Chalupský, T. N. Lan, M. Saitow, Int. J. Quantum Chem. 2015, 115, 283.
S. R. White, Phys. Rev. Lett. 1992, 69, 2863.
S. R. White, Phys. Rev. B 1993, 48, 10345.
A. Baiardi, C. J. Stein, V. Barone, M. Reiher, J. Chem. Theory Comput. 2017, 13, 3764.
S. Paeckel, T. Köhler, A. Swoboda, S. R. Manmana, U. Schollwöck, C. Hubig, Ann. Phys. 2019, 411, 167998.
A. Baiardi, M. Reiher, J. Chem. Theory Comput. 2019, 15, 3481.
P. Pulay, T. P. Hamilton, J. Chem. Phys. 1988, 88, 4926.
V. Veryazov, P. Å. Malmqvist, B. O. Roos, Int. J. Quantum Chem. 2011, 111, 3329.
E. R. Sayfutyarova, Q. Sun, G. K.-L. Chan, G. Knizia, J. Chem. Theory Comput. 2017, 13, 4063.
C. J. Stein, M. Reiher, J. Comput. Chem. 2019, 40, 2216.
C. A. Coulson, Rev. Mod. Phys. 1960, 32, 170.
R. H. Tredgold, Phys. Rev. 1957, 105, 1421.
A. J. Coleman, Rev. Mod. Phys. 1963, 35, 668.
Y.-K. Liu, M. Christandl, F. Verstraete, Phys. Rev. Lett. 2007, 98, 110503.
A. Coleman, V. Yukalov, Reduced Density Matrices: Coulson's Challenge, Lecture Notes in Chemistry, Springer 2000.
J. Cioslowski, Many-Electron Densities and Reduced Density Matrices, Mathematical and Computational Chemistry (MACC), Springer 2000.
D. A. Mazziotti, Acc. Chem. Res. 2006, 39, 207.
T. Helgaker, S. Coriani, P. Jørgensen, K. Kristensen, J. Olsen, K. Ruud, Chem. Rev. 2012, 112, 543.
R. P. Feynman, Int. J. Theor. Phys. 1982, 21, 467.
M. Fingerhuth, T. Babej, C. Ing, arXiv 2018, article no. 1810.13411.
A. Robert, P. K. Barkoutsos, S. Woerner, I. Tavernelli, npj Quantum Inf. 2021, 7, 38.
S. Lloyd, Science 1996, 273, 1073.
T. S. Cubitt, A. Montanaro, S. Piddock, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2018, 115, 9497.
I. Cirac, P. Zoller, Nat. Phys. 2012, 8, 264.
A. Daley, I. Bloch, C. Kokail, N. Pearson, M. Troyer, P. Zoller, Nature 2022, 607, 667.
P. W. Shor, Phys. Rev. A 1995, 52, R2493.
D. Aharonov, M. Ben-Or, arXiv 1999, article no. 10.48550.
O. Fawzi, A. Grospellier, A. Leverrier, Commun. ACM 2020, 64, 106-114.
A. Y. Kitaev, Russ. Math. Surv. 1997, 52, 1191.
A. Kitaev, Ann. Phys. 2003, 303, 2.
J. Preskill, Quantum 2018, page 79.
P. Jordan, E. Wigner, Zeitschrift für Physik 1928, 47, 631.
S. B. Bravyi, A. Y. Kitaev, Ann. Phys. 2002, 298, 210.
J. T. Seeley, M. J. Richard, P. J. Love, J. Chem. Phys. 2012, 137, 224109.
J. R. McClean, J. Romero, R. Babbush, A. Aspuru-Guzik, New J. Phys. 2016, 18, 023023.
M. Cerezo, A. Arrasmith, R. Babbush, S. C. Benjamin, S. Endo, K. Fujii, J. R. McClean, K. Mitarai, X. Yuan, L. Cincio, P. J. Coles, Nat. Rev. Phys. 2021, 3, 625.
A. Peruzzo, J. McClean, P. Shadbolt, M.-H. Yung, X.-Q. Zhou, P. J. Love, A. Aspuru-Guzik, J. L. O'Brien, Nat. Commun. 2014, 5, 4213.
A. Kandala, A. Mezzacapo, K. Temme, M. Takita, M. Brink, J. M. Chow, J. M. Gambetta, Nature 2017, 549, 242.
J. Tilly, H. Chen, S. Cao, D. Picozzi, K. Setia, Y. Li, E. Grant, L. Wossnig, I. Rungger, G. H. Booth, J. Tennyson, Phys. Rep. 2022, 986, 1.
M. Benedetti, M. Fiorentini, M. Lubasch, Phys. Rev. Research 2021, 3, 033083.
S. Barison, F. Vicentini, G. Carleo, Quantum 2021, 5, 512.
S. McArdle, T. Jones, S. Endo, Y. Li, S. C. Benjamin, X. Yuan, npj Quantum Information 2019, 5, 75.
A. Aspuru-Guzik, A. D. Dutoi, P. J. Love, M. Head-Gordon, Science 2005, 309, 1704.
H. Wang, S. Kais, A. Aspuru-Guzik, M. R. Hoffmann, Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 5388.
L. Veis, J. Pittner, J. Chem. Phys. 2010, 133, 194106.
L. Veis, J. Višňák, T. Fleig, S. Knecht, T. Saue, L. Visscher, J. Pittner, Phys. Rev. A 2012, 85, 030304.
L. Veis, J. Višňák, H. Nishizawa, H. Nakai, J. Pittner, Int. J. Quantum Chem. 2016, 116, 1328.
S. Lee, J. Lee, H. Zhai, Y. Tong, A. M. Dalzell, A. Kumar, P. Helms, J. Gray, Z.-H. Cui, W. Liu, M. Kastoryano, R. Babbush, J. Preskill, D. R. Reichman, E. T. Campbell, E. F. Valeev, L. Lin, G. K.-L. Chan, arXiv 2022, article no. 2208.02199.
G. H. Low, I. L. Chuang, Phys. Rev. Lett. 2017, 118, 010501.
A. M. Childs, Y. Su, Phys. Rev. Lett. 2019, 123, 050503.
M. Reiher, N. Wiebe, K. M. Svore, D. Wecker, M. Troyer, Proc. Nat. Acad. Sci. 2017, 114, 7555.
K. Bourzac, Chem. Eng. News 2017, 95, 43.
V. von Burg, G. H. Low, T. Häner, D. S. Steiger, M. Reiher, M. Roetteler, M. Troyer, Phys. Rev. Research 2021, 3, 033055.
D. Rappoport, C. J. Galvin, D. Y. Zubarev, A. Aspuru-Guzik, J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 897.
G. N. Simm, M. Reiher, J. Chem. Theory Comput. 2017, 13, 6108.
G. Wächtershäuser, Microbiol. Rev. 1988, 52, 452.
G. Wächtershäuser, Prog. Biophys. Mol. Biol. 1992, 58, 85.
V. Barone, M. Biczysko, C. Puzzarini, Acc. Chem. Res. 2015, 48, 1413.
K. I. Öberg, Chem. Rev. 2016, 116, 9631.
S. A. Sandford, M. Nuevo, P. P. Bera, T. J. Lee, Chem. Rev. 2020, 120, 4616.
C. F. Chyba, K. P. Hand, Ann. Rev. Astron. Astrophys. 2005, 43, 31.
J. A. Pople, Rev. Mod. Phys. 1999, 71, 1267.
W. Kohn, Rev. Mod. Phys. 1999, 71, 1253.
C. E. Dykstra, G. Frenking, K. Kim, G. Scuseria (Editors), Theory and applications of computational chemistry, Elsevier Science, London, England 2005.
P. Horton, A. V. Ruban, R. G. Walters, Annu. Rev. Plant Physiol. 1996, 47, 655.
Y.-C. Cheng, G. R. Fleming, Ann. Rev. Phys. Chem. 2009, 60, 241.
G. D. Scholes, G. R. Fleming, A. Olaya-Castro, R. van Grondelle, Nat. Chem. 2011, 3, 763.
T. Ritz, S. Adem, K. Schulten, Biophys. J. 2000, 78, 707.
S. Huelga, M. Plenio, Contemp. Phys. 2013, 54, 181.
C. Curutchet, B. Mennucci, Chem. Rev. 2017, 117, 294.
T. Mirkovic, E. E. Ostroumov, J. M. Anna, R. van Grondelle, Govindjee, G. D. Scholes, Chem. Rev. 2017, 117, 249.
G. S. Engel, T. R. Calhoun, E. L. Read, T.-K. Ahn, T. Mančal, Y.-C. Cheng, R. E. Blankenship, G. R. Fleming, Nature 2007, 446, 782.
G. Panitchayangkoon, D. Hayes, K. A. Fransted, J. R. Caram, E. Harel, J. Wen, R. E. Blankenship, G. S. Engel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 12766.
E. Collini, C. Y. Wong, K. E. Wilk, P. M. G. Curmi, P. Brumer, G. D. Scholes, Nature 2010, 463, 644.
H.-G. Duan, V. I. Prokhorenko, R. J. Cogdell, K. Ashraf, A. L. Stevens, M. Thorwart, R. J. D. Miller, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2017, 114, 8493.
E. Thyrhaug, R. Tempelaar, M. J. P. Alcocer, K. Žídek, D. Bína, J. Knoester, T. L. C. Jansen, D. Zigmantas, Nat. Chem. 2018, 10, 780.
A. W. Chin, J. Prior, R. Rosenbach, F. Caycedo-Soler, S. F. Huelga, M. B. Plenio, Nat. Phys. 2013, 9, 113.
E. J. O'Reilly, A. Olaya-Castro, Nat. Commun. 2014, 5, 3012.
J. C. Dean, T. Mirkovic, Z. S. Toa, D. G. Oblinsky, G. D. Scholes, Chem 2016, 1, 858.
C. T. Rodgers, P. J. Hore, Proc. Nat. Acad. Sci. 2009, 106, 353.
P. J. Hore, H. Mouritsen, Ann. Rev. Biophys. 2016, 45, 299.
T. P. Fay, L. P. Lindoy, D. E. Manolopoulos, P. J. Hore, Faraday Discuss. 2020, 221, 77.
J. Cai, M. B. Plenio, Phys. Rev. Lett. 2013, 111, 230503.
A. M. Lewis, T. P. Fay, D. E. Manolopoulos, J. Chem. Phys. 2016, 145, 244101.
L. P. Lindoy, T. P. Fay, D. E. Manolopoulos, J. Chem. Phys. 2020, 152, 164107.
B.-X. Wang, M.-J. Tao, Q. Ai, T. Xin, N. Lambert, D. Ruan, Y.-C. Cheng, F. Nori, F.-G. Deng, G.-L. Long, npj Quantum Inf. 2018, 4, 52.
A. Potočnik, A. Bargerbos, F. A. Y. N. Schröder, S. A. Khan, M. C. Collodo, S. Gasparinetti, Y. Salathé, C. Creatore, C. Eichler, H. E. Türeci, A. W. Chin, A. Wallraff, Nat. Commun. 2018, 9, 904.
W. R. P. Scott, P. H. Hünenberger, I. G. Tironi, A. E. Mark, S. R. Billeter, J. Fennen, A. E. Torda, T. Huber, P. Krüger, W. F. van Gunsteren, J. Phys. Chem. A 1999, 103, 3596.
J. Wang, P. Cieplak, P. A. Kollman, J. Comput. Chem. 2000, 21, 1049.
J. W. Ponder, D. A. Case, Force Fields for Protein Simulations, in Protein Simulations, volume 66 of Adv. Protein Chem., pages 27-85, Academic Press 2003.
P. S. Nerenberg, T. Head-Gordon, Curr. Opin. Struct. Biol. 2018, 49, 129.
J. G. Kirkwood, J. Chem. Phys. 1935, 3, 300.
M. Motta, C. Sun, A. T. K. Tan, M. J. O'Rourke, E. Ye, A. J. Minnich, F. G. S. L. Brandão, G. K.-L. Chan, Nat. Phys. 2020, 16, 205.
K. Temme, T. J. Osborne, K. G. Vollbrecht, D. Poulin, F. Verstraete, Nature 2011, 471, 87.
D. Frenkel, B. Smit, Statistical Mechanics, in Understanding Molecular Simulation, pages 9-22, Elsevier 2002.
C. Micheletti, P. Hauke, P. Faccioli, Phys. Rev. Lett. 2021, 127, 080501.
D. Ghamari, P. Hauke, R. Covino, P. Faccioli, Sci. Rep. 2022, 12, 16336.
Y. Duan, P. A. Kollman, Science 1998, 282, 740.
C. D. Snow, H. Nguyen, V. S. Pande, M. Gruebele, Nature 2002, 420, 102.
K. Lindorff-Larsen, S. Piana, R. O. Dror, D. E. Shaw, Science 2011, 334, 517.
F. D. Malone, R. M. Parrish, A. R. Welden, T. Fox, M. Degroote, E. Kyoseva, N. Moll, R. Santagati, M. Streif, arXiv 2021, article no. 2110.01589.
J. J. M. Kirsopp, C. Di Paola, D. Z. Manrique, M. Krompiec, G. Greene-Diniz, W. Guba, A. Meyder, D. Wolf, M. Strahm, D. Muñoz Ramo, Int. J. Quantum Chem. 2022, 122, e26975.
A. S. Fraenkel, Bull. Math. Biol. 1993, 55, 1199.
D. A. Hinds, M. Levitt, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 2536.
I. Halperin, B. Ma, H. Wolfson, R. Nussinov, Proteins Struct. Funct. Genet. 2002, 47, 409.
R. Dias, W. F. de Azevedo Jr, Curr. Drug Targets 2008, 9, 1040.
C. H. Bennett, E. Bernstein, G. Brassard, U. Vazirani, SIAM J. Comput. 1997, 26, 1510.
L. K. Grover, Phys. Rev. Lett. 1997, 79, 325.
E. Farhi, J. Goldstone, S. Gutmann, arXiv 2014, article no. 1411.4028.
S. Lloyd, arXiv 2018, article no. 1812.11075.
E. Farhi, A. W. Harrow, arXiv 2016, article no. 1602.07674.
L. Zhou, S.-T. Wang, S. Choi, H. Pichler, M. D. Lukin, Phys. Rev. X 2020, 10, 021067.
M. P. Harrigan, K. J. Sung, M. Neeley, K. J. Satzinger, F. Arute, K. Arya, J. Atalaya, J. C. Bardin, R. Barends, S. Boixo, M. Broughton, B. B. Buckley, D. A. Buell, B. Burkett, N. Bushnell, Y. Chen, Z. Chen, B. Chiaro, R. Collins, W. Courtney, S. Demura, A. Dunsworth, D. Eppens, A. Fowler, B. Foxen, C. Gidney, M. Giustina, R. Graff, S. Habegger, A. Ho, S. Hong, T. Huang, L. B. Ioffe, S. V. Isakov, E. Jeffrey, Z. Jiang, C. Jones, D. Kafri, K. Kechedzhi, J. Kelly, S. Kim, P. V. Klimov, A. N. Korotkov, F. Kostritsa, D. Landhuis, P. Laptev, M. Lindmark, M. Leib, O. Martin, J. M. Martinis, J. R. McClean, M. McEwen, A. Megrant, M. Mi, Xiaoand Mohseni, W. Mruczkiewicz, J. Mutus, O. Naaman, C. Neill, F. Neukart, M. Y. Niu, T. E. O'Brien, B. O'Gorman, E. Ostby, A. Petukhov, H. Putterman, C. Quintana, P. Roushan, N. C. Rubin, D. Sank, A. Skolik, V. Smelyanskiy, D. Strain, M. Streif, M. Szalay, A. Vainsencher, T. White, Z. J. Yao, P. Yeh, A. Zalcman, L. Zhou, H. Neven, D. Bacon, E. Lucero, E. Farhi, R. Babbush, Nat. Phys. 2021, 17, 332.
P. Hauke, H. G. Katzgraber, W. Lechner, H. Nishimori, W. D. Oliver, Rep. Prog. Phys. 2020, 83, 054401.
P. Hauke, G. Mattiotti, P. Faccioli, Phys. Rev. Lett. 2021, 126, 028104.
A. Perdomo-Ortiz, N. Dickson, M. Drew-Brook, G. Rose, A. Aspuru-Guzik, Sci. Rep. 2012, 2, 571.
R. Babbush, A. Perdomo-Ortiz, B. O'Gorman, W. Macready, A. Aspuru-Guzik, Construction of Energy Functions for Lattice Heteropolymer Models: Efficient Encodings for Constraint Satisfaction Programming and Quantum Annealing, volume 155, chapter 5, pages 201-244, John Wiley & Sons, Ltd 2014.
P. A. M. Casares, R. Campos, M. A. Martin-Delgado, Quantum Sci. Technol. 2022, 7, 025013.
R. Zwanzig, A. Szabo, B. Bagchi, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 20.
M. Rossmannek, P. K. Barkoutsos, P. J. Ollitrault, I. Tavernelli, J. Chem. Phys. 2021, 154, 114105.
C. Vorwerk, N. Sheng, M. Govoni, B. Huang, G. Galli, Nat. Comput. Sci. 2022, 2, 424.
M. Rossmannek, F. Pavošević, A. Rubio, I. Tavernelli, J. Phys. Chem. Lett. 2023, 14, 3491.
Y. Liu, O. R. Meitei, Z. E. Chin, A. Dutt, M. Tao, T. V. Voorhis, I. L. Chuang, arXiv 2023, article no. 2301.01457.
J. Jumper, R. Evans, A. Pritzel, T. Green, M. Figurnov, O. Ronneberger, K. Tunyasuvunakool, R. Bates, A. Žídek, A. Potapenko, A. Bridgland, C. Meyer, S. A. A. Kohl, A. J. Ballard, A. Cowie, B. Romera-Paredes, S. Nikolov, R. Jain, J. Adler, T. Back, S. Petersen, D. Reiman, E. Clancy, M. Zielinski, M. Steinegger, M. Pacholska, T. Berghammer, S. Bodenstein, D. Silver, O. Vinyals, A. W. Senior, K. Kavukcuoglu, P. Kohli, D. Hassabis, Nature 2021, 596, 583.
K. M. Ruff, R. V. Pappu, J. Mol. Biol. 2021, 433, 167208.
C. J. Oldfield, A. K. Dunker, Annu. Rev. Biochem. 2014, 83, 553.
R. B. Best, K. Lindorff-Larsen, M. A. DePristo, M. Vendruscolo, Proc. Nat. Acad. Sci. 2006, 103, 10901.
T. Ching, D. S. Himmelstein, B. K. Beaulieu-Jones, A. A. Kalinin, B. T. Do, G. P. Way, E. Ferrero, P.-M. Agapow, M. Zietz, M. M. Hoffman, W. Xie, G. L. Rosen, B. J. Lengerich, J. Israeli, J. Lanchantin, S. Woloszynek, A. E. Carpenter, A. Shrikumar, J. Xu, E. M. Cofer, C. A. Lavender, S. C. Turaga, A. M. Alexandari, Z. Lu, D. J. Harris, D. DeCaprio, Y. Qi, A. Kundaje, Y. Peng, L. K. Wiley, M. H. S. Segler, S. M. Boca, S. J. Swamidass, A. Huang, A. Gitter, C. S. Greene, J. R. Soc. Interface 2018, 15, 20170387.
J. G. Greener, S. M. Kandathil, L. Moffat, D. T. Jones, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2022, 23, 40.
J. Biamonte, P. Wittek, N. Pancotti, P. Rebentrost, N. Wiebe, S. Lloyd, Nature 2017, 549, 195.
M. Cerezo, G. Verdon, H.-Y. Huang, L. Cincio, P. J. Coles, Nat. Comput. Sci. 2022, 2, 567.
S. Lloyd, M. Mohseni, P. Rebentrost, Nat. Phys. 2014, 10, 631.
P. Rebentrost, M. Mohseni, S. Lloyd, Phys. Rev. Lett. 2014, 113, 130503.
V. Giovannetti, S. Lloyd, L. Maccone, Phys. Rev. Lett. 2008, 100, 160501.
S. Aaronson, Nat. Phys. 2015, 11, 291.
I. Cong, S. Choi, M. D. Lukin, Nat. Phys. 2019, 15, 1273.
N. Killoran, T. R. Bromley, J. M. Arrazola, M. Schuld, N. Quesada, S. Lloyd, Phys. Rev. Research 2019, 1, 033063.
A. Abbas, D. Sutter, C. Zoufal, A. Lucchi, A. Figalli, S. Woerner, Nat. Comput. Sci. 2021, 1, 403.
V. Havlíček, A. D. Córcoles, K. Temme, A. W. Harrow, A. Kandala, J. M. Chow, J. M. Gambetta, Nature 2019, 567, 209.
Y. Liu, S. Arunachalam, K. Temme, Nat. Phys. 2021, 17, 1013.
J. R. McClean, S. Boixo, V. N. Smelyanskiy, R. Babbush, H. Neven, Nat. Commun. 2018, 9, 4812.
C. Ortiz Marrero, M. Kieferová, N. Wiebe, PRX Quantum 2021, 2, 040316.
James M. Heather, Benjamin Chain, Genomics 2016, 107, 1.
E. W. Myers, Bioinformatics 2005, 21, ii79.
P. E. C. Compeau, P. A. Pevzner, G. Tesler, Nat. Biotechnol. 2011, 29, 987.
N. Nagarajan, M. Pop, Nat. Rev. Genet. 2013, 14, 157.
D. MacLean, J. D. G. Jones, D. J. Studholme, Nat. Rev. Microbiol. 2009, 7.
K. Prousalis, N. Konofaos, Sci. Rep. 2019, 9, 7226.
A. Sarkar, Z. Al-Ars, C. G. Almudever, K. Bertels, arXiv 2019, article no. 1909.05563.
R. Babbush, J. R. McClean, M. Newman, C. Gidney, S. Boixo, H. Neven, PRX Quantum 2021, 2, 010103.
A. Sarkar, Z. Al-Ars, K. Bertels, PLoS One 2021, 16, 1.
A. S. Boev, A. S. Rakitko, S. R. Usmanov, A. N. Kobzeva, I. V. Popov, V. V. Ilinsky, E. O. Kiktenko, A. K. Fedorov, Sci. Rep. 2021, 11, 13183.
R. Y. Li, R. Di Felice, R. Rohs, D. A. Lidar, npj Quantum Inf. 2018, 4, 14.
C. L. Degen, F. Reinhard, P. Cappellaro, Rev. Mod. Phys. 2017, 89, 035002.
K. Jensen, R. Budvytyte, R. A. Thomas, T. Wang, A. M. Fuchs, M. V. Balabas, G. Vasilakis, L. D. Mosgaard, H. C. Staerkind, J. H. Müller, T. Heimburg, S.-P. Olesen, E. S. Polzik, Sci. Rep. 2016, 6, 29638.
D. Gottesman, T. Jennewein, S. Croke, Phys. Rev. Lett. 2012, 109, 070503.