Towards a Precise NMR Quantification of Acute Phase Inflammation Proteins from Human Serum.
Acute Phase Proteins
Diagnostic Tool
GlycA/B
Glycoproteins
NMR
NMR Blood Analyses
NMR Metabolomics
Journal
Angewandte Chemie (International ed. in English)
ISSN: 1521-3773
Titre abrégé: Angew Chem Int Ed Engl
Pays: Germany
ID NLM: 0370543
Informations de publication
Date de publication:
28 08 2023
28 08 2023
Historique:
received:
03
05
2023
medline:
24
8
2023
pubmed:
21
6
2023
entrez:
21
6
2023
Statut:
ppublish
Résumé
Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectra of human serum and plasma show, besides metabolites and lipoproteins, two characteristic signals termed GlycA and B arising from the acetyl groups of glycoprotein glycans from acute phase proteins, which constitute good markers for inflammatory processes. Here, we report a comprehensive assignment of glycoprotein glycan NMR signals observed in human serum, showing that GlycA and GlycB signals originate from Neu5Ac and GlcNAc moieties from N-glycans, respectively. Diffusion-edited NMR experiments demonstrate that signal components can be associated with specific acute phase proteins. Conventionally determined concentrations of acute phase glycoproteins correlate well with distinct features in NMR spectra (R
Identifiants
pubmed: 37341676
doi: 10.1002/anie.202306154
doi:
Substances chimiques
Acute-Phase Proteins
0
Biomarkers
0
Glycoproteins
0
Polysaccharides
0
Types de publication
Journal Article
Research Support, Non-U.S. Gov't
Langues
eng
Sous-ensembles de citation
IM
Pagination
e202306154Informations de copyright
© 2023 The Authors. Angewandte Chemie International Edition published by Wiley-VCH GmbH.
Références
A. Vignoli, V. Ghini, G. Meoni, C. Licari, P. G. Takis, L. Tenori, P. Turano, C. Luchinat, Angew. Chem. Int. Ed. 2019, 58, 968-994.
S. Lodge, P. Nitschke, T. Kimhofer, J. Wist, S.-H. Bong, R. L. Loo, R. Masuda, S. Begum, T. Richards, J. C. Lindon, W. Bermel, T. Reinsperger, H. Schaefer, M. Spraul, E. Holmes, J. K. Nicholson, Anal. Chem. 2021, 93, 3976-3986.
J. D. Bell, J. C. C. Brown, J. K. Nicholson, P. J. Sadler, FEBS Lett. 1987, 215, 311-315.
J. D. Otvos, I. Shalaurova, J. Wolak-Dinsmore, M. A. Connelly, R. H. Mackey, J. H. Stein, R. P. Tracy, Clin. Chem. 2015, 61, 714-723.
J. B. Muhlestein, H. May, O. Galenko, K. Knowlton, J. Otvos, M. Connelly, D. Lappe, J. Anderson, J. Am. Coll. Cardiol. 2017, 69, 1069.
C. Lorenzo, A. Festa, A. J. Hanley, M. J. Rewers, A. Escalante, S. M. Haffner, Diabetes Care 2017, 40, 375-382.
J. A. Levine, J. M. Han, A. Wolska, S. R. Wilson, T. P. Patel, A. T. Remaley, V. Periwal, J. A. Yanovski, A. P. Demidowich, J. Clin. Lipidol. 2020, 14, 667-674.
M. A. Connelly, J. D. Otvos, I. Shalaurova, M. P. Playford, N. N. Mehta, J. Transl. Med. 2017, 15, 219-224.
R. Fuertes-Martín, D. Taverner, J.-C. Vallvé, S. Paredes, L. Masana, X. Correig Blanchar, N. Amigó Grau, J. Proteome Res. 2018, 17, 3730-3739.
E. G. Gruppen, I. J. Riphagen, M. A. Connelly, J. D. Otvos, S. J. L. Bakker, R. P. F. Dullaart, PLoS One 2015, 10, e0139057.
C. Gabay, I. Kushner, N. Engl. J. Med. 1999, 340, 448-454.
O. Gornik, G. Lauc, Dis. Markers 2008, 25, 267-278.
S. Lodge, P. Nitschke, T. Kimhofer, J. Wist, S.-H. Bong, R. L. Loo, R. Masuda, S. Begum, T. Richards, J. C. Lindon, W. Bermel, T. Reinsperger, H. Schaefer, M. Spraul, E. Holmes, J. K. Nicholson, Anal. Chem. 2021, 93, 3976-3986.
V. N. Schumaker, D. L. Puppione, in Methods Enzymol., Elsevier, Amsterdam, 1986, pp. 155-170.
P. Nitschke, S. Lodge, T. Kimhofer, R. Masuda, S.-H. Bong, D. Hall, H. Schäfer, M. Spraul, N. Pompe, T. Diercks, G. Bernardo-Seisdedos, J. M. Mato, O. Millet, D. Susic, A. Henry, E. M. El-Omar, E. Holmes, J. C. Lindon, J. K. Nicholson, J. Wist, Anal. Chem. 2022, 94, 1333-1341.
M. Schubert, M. J. Walczak, M. Aebi, G. Wider, Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 7096-7100.
S. Yanaka, Y. Yamaguchi, T. Takizawa, Y. Miyanoiri, R. Yogo, I. Shimada, K. Kato, Biomol. NMR Assignments 2021, 15, 187-192.
L. Unione, M. P. Lenza, A. Ardá, P. Urquiza, A. Laín, J. M. Falcón-Pérez, J. Jiménez-Barbero, O. Millet, ACS Cent. Sci. 2019, 5, 1554-1561.
Y. Zhuo, D. A. Keire, K. Chen, Mol. Pharmaceutics 2021, 18, 441-450.
A. A. Hargett, A. M. Marcella, H. Yu, C. Li, J. Orwenyo, M. D. Battistel, L.-X. Wang, D. I. Freedberg, Molecules 2021, 26, 4308.
M. P. Lenza, I. Oyenarte, T. Diercks, J. I. Quintana, A. Gimeno, H. Coelho, A. Diniz, F. Peccati, S. Delgado, A. Bosch, M. Valle, O. Millet, N. G. A. Abrescia, A. Palazón, F. Marcelo, G. Jiménez-Osés, J. Jiménez-Barbero, A. Ardá, J. Ereño-Orbea, Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59, 23763-23771.
K. R. Reiding, D. Blank, D. M. Kuijper, A. M. Deelder, M. Wuhrer, Anal. Chem. 2014, 86, 5784-5793.
F. Clerc, K. R. Reiding, B. C. Jansen, G. S. M. Kammeijer, A. Bondt, M. Wuhrer, Glycoconjugate J. 2016, 33, 309-343.
G. E. Ritchie, B. E. Moffatt, R. B. Sim, B. P. Morgan, R. A. Dwek, P. M. Rudd, Chem. Rev. 2002, 102, 305-320.
Y. Yoshida, J. Furukawa, S. Naito, K. Higashino, Y. Numata, Y. Shinohara, Proteomics 2016, 16, 2747-2758.
S. Sun, Y. Hu, L. Jia, S. T. Eshghi, Y. Liu, P. Shah, H. Zhang, Anal. Chem. 2018, 90, 6292-6299.
F. Fenaille, M. Le Mignon, C. Groseil, C. Ramon, S. Riande, L. Siret, N. Bihoreau, Glycobiology 2007, 17, 932-944.
D. Madariaga, N. Martínez-Sáez, V. J. Somovilla, H. Coelho, J. Valero-González, J. Castro-López, J. L. Asensio, J. Jiménez-Barbero, J. H. Busto, A. Avenoza, F. Marcelo, R. Hurtado-Guerrero, F. Corzana, J. M. Peregrina, ACS Chem. Biol. 2015, 10, 747-756.
H. Coelho, M. de las Rivas, A. S. Grosso, A. Diniz, C. O. Soares, R. A. Francisco, J. S. Dias, I. Compañon, L. Sun, Y. Narimatsu, S. Y. Vakhrushev, H. Clausen, E. J. Cabrita, J. Jiménez-Barbero, F. Corzana, R. Hurtado-Guerrero, F. Marcelo, JACS Au 2022, 2, 631-645.
J. Macías-León, I. A. Bermejo, A. Asín, A. García-García, I. Compañón, E. Jiménez-Moreno, H. Coelho, V. Mangini, I. S. Albuquerque, F. Marcelo, J. L. Asensio, G. J. L. Bernardes, H. J. Joshi, R. Fiammengo, O. Blixt, R. Hurtado-Guerrero, F. Corzana, Chem. Commun. 2020, 56, 15137-15140.
J. Uzawa, M. Urai, T. Baba, H. Seki, K. Taniguchi, K. Ushida, J. Nat. Prod. 2009, 72, 818-823.
J. P. Kamerling, J. F. G. Vliegenthart, in Carbohydr. Nucleic Acids (Eds.: L. J. Berliner, J. Reuben), Springer US, Boston, MA, 1992, pp. 1-194.
R. Fuertes-Martín, X. Correig, J.-C. Vallvé, N. Amigó, J. Clin. Med. 2020, 9, 354.
J. D. Otvos, I. Y. Shalaurova, D. W. Bennett, J. E. Wolak-Dinsmore, NMR Measurements of NMR Biomarker GlycA, 2016, US Patent 9470771 B2.
J. Haverkamp, H. Van Halbeek, L. Dorland, J. F. G. Vliegenthart, R. Pfeil, R. Schauer, Eur. J. Biochem. 1982, 122, 305-311.
J. F. G. Vliegenthart, L. Dorland, H. van Halbeek, in Adv. Carbohydr. Chem. Biochem. (Eds.: R. S. Tipson, D. Horton), Academic Press, San Diego, 1983, pp. 209-374.
H. van Halbeek, L. Dorland, J. F. G. Vliegenthart, K. Schmid, J. Montreuil, B. Fournet, W. E. Hull, FEBS Lett. 1980, 114, 11-16.
F. Schmelter, B. Föh, A. Mallagaray, J. Rahmöller, M. Ehlers, S. Lehrian, V. von Kopylow, I. Künsting, A. S. Lixenfeld, E. Martin, M. Ragab, R. Meyer-Saraei, F. Kreutzmann, I. Eitel, S. Taube, N. Käding, E. Jantzen, T. Graf, C. Sina, U. L. Günther, Front. Mol. Biosci. 2021, 8, 737039.
J. D. Otvos, E. J. Jeyarajah, D. W. Bennett, J. Clin. Ligand Assay 1996, 19, 184-189.
J. D. Otvos, E. J. Jeyarajah, M. J. Bennett, Clin. Chem. 1991, 377-386.
P. Bruins, H. Velthuis, A. Eerenberg-Belmer, A. Yazdanbakhsh, E. de Beaumont, L. Eijsman, A. Trouwborst, E. Hack, Thromb. Haemostasis 2000, 84, 237-243.
T. Jäntti, T. Tarvasmäki, V.-P. Harjola, J. Parissis, K. Pulkki, T. Javanainen, H. Tolppanen, R. Jurkko, M. Hongisto, A. Kataja, A. Sionis, J. Silva-Cardoso, M. Banaszewski, J. Spinar, A. Mebazaa, J. Lassus, for the CardShock investigators, PLoS One 2019, 14, e0217006.