Titre : Traitement automatique des données

Traitement automatique des données : Questions médicales fréquentes

Termes MeSH sélectionnés :

Codon
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Sources (588 au total)

ICOR: improving codon optimization with recurrent neural networks.

In protein sequences-as there are 61 sense codons but only 20 standard amino acids-most amino acids are encoded by more than one codon. Although such synonymous codons do not alter the encoded amino a... We demonstrate that sequential context achieved via RNN may yield codon selection that is more similar to the host genome. Based on computational metrics that predict protein expression, ICOR theoreti... The results, based on in silico metrics, indicate that ICOR codon optimization is theoretically more effective in enhancing recombinant expression of proteins over other established codon optimization...

Analysis of codon usage patterns in 48 Aconitum species.

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An investigation of codon usage pattern analysis in pancreatitis associated genes.

Pancreatitis is an inflammatory disorder resulting from the autoactivation of trypsinogen in the pancreas. The genetic basis of the disease is an old phenomenon, and evidence is accumulating for the i... The present study envisaged a panel of 26 genes involved in pancreatitis for their codon choices, compositional analysis, relative dinucleotide frequency, nucleotide disproportion, protein physical pr... This study will enable us to gain insight into the molecular signatures associated with the disease that might help identify more potential genes contributing to enhanced risk for pancreatitis. All th...