Full genome sequence of the first SARS-CoV-2 detected in Mexico.


Journal

Archives of virology
ISSN: 1432-8798
Titre abrégé: Arch Virol
Pays: Austria
ID NLM: 7506870

Informations de publication

Date de publication:
Sep 2020
Historique:
received: 16 03 2020
accepted: 11 05 2020
pubmed: 20 6 2020
medline: 14 8 2020
entrez: 20 6 2020
Statut: ppublish

Résumé

SARS-CoV-2 was first detected in the city of Wuhan, Hubei Province, China. In this report, we describe the complete genome sequence of the first imported SARS-CoV-2, detected in a Mexican patient who had traveled to Bergamo, Italy. Phylogenetic analysis showed that this isolate belongs to subclade A2a (lineage G) and is closely related to isolates from Finland, Germany and Brazil, all of which were from patients with a history of travel to Italy. This is the first report of the complete genome sequence of this virus in Mexico.

Identifiants

pubmed: 32556599
doi: 10.1007/s00705-020-04695-3
pii: 10.1007/s00705-020-04695-3
pmc: PMC7300367
doi:

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

2095-2098

Références

Mol Biol Evol. 2013 Dec;30(12):2725-9
pubmed: 24132122
J Comput Biol. 2012 May;19(5):455-77
pubmed: 22506599
Lancet. 2020 Feb 15;395(10223):497-506
pubmed: 31986264
Euro Surveill. 2020 Jan;25(3):
pubmed: 31992387
N Engl J Med. 2020 Feb 20;382(8):727-733
pubmed: 31978945

Auteurs

Fabiola Garcés-Ayala (F)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Adnan Araiza-Rodríguez (A)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Edgar Mendieta-Condado (E)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Abril Paulina Rodríguez-Maldonado (AP)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Claudia Wong-Arámbula (C)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Magaly Landa-Flores (M)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Juan Carlos Del Mazo-López (JC)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Maribel González-Villa (M)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Noé Escobar-Escamilla (N)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

David Esaú Fragoso-Fonseca (DE)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

María Del Carmen Esteban-Valencia (MDC)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Lourdes Lloret-Sánchez (L)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Dayanira Sarith Arellano-Suarez (DS)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Tatiana Ernestina Nuñez-García (TE)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Nervain Benjamin Contreras-González (NB)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Natividad Cruz-Ortiz (N)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Adriana Ruiz-López (A)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Miguel Ángel Fierro-Valdez (MÁ)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Daniel Regalado-Santiago (D)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Nancy Martínez-Velázquez (N)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Mireya Mederos-Michel (M)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Joel Vázquez-Pérez (J)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

José Arturo Martínez-Orozco (JA)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

Eduardo Becerril-Vargas (E)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

Jorge Salas (J)

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico.

Lucía Hernández-Rivas (L)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

Irma López-Martínez (I)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico.

José Luis Alomía-Zegarra (JL)

Dirección General de Epidemiología, Mexico City, Mexico.

Hugo López-Gatell (H)

Subsecretaría de Prevención y Promoción de la Salud, Mexico City, Mexico.

Gisela Barrera-Badillo (G)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico. gisela.barrera20@yahoo.com.mx.

José Ernesto Ramírez-González (JE)

Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos "Dr. Manuel Martínez Báez", Mexico City, Mexico. ernesto.ramirez@salud.gob.mx.

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