Titre : Analyse de séquence

Analyse de séquence : Questions médicales fréquentes

Nom anglais: Sequence Analysis

Descriptor UI: D017421

Tree Number: E05.393.760

Questions fréquentes et termes MeSH associés

Diagnostic 5

#1

Comment l'analyse de séquence aide-t-elle au diagnostic ?

Elle permet d'identifier des mutations génétiques associées à des maladies.
Analyse de séquence Diagnostic génétique
#2

Quels tests utilisent l'analyse de séquence ?

Les tests de séquençage de nouvelle génération (NGS) sont couramment utilisés.
Séquençage Tests génétiques
#3

L'analyse de séquence peut-elle détecter des infections ?

Oui, elle peut identifier des agents pathogènes par séquençage de leur génome.
Infections Séquençage
#4

Quels types de maladies sont diagnostiqués par analyse de séquence ?

Elle est utilisée pour des maladies héréditaires, cancers et infections virales.
Maladies héréditaires Cancers
#5

L'analyse de séquence est-elle utilisée en oncologie ?

Oui, elle aide à identifier des mutations spécifiques dans les tumeurs.
Oncologie Mutations génétiques

Symptômes 5

#1

Quels symptômes peuvent indiquer un besoin d'analyse de séquence ?

Des symptômes inexpliqués ou des antécédents familiaux de maladies génétiques.
Symptômes Antécédents familiaux
#2

L'analyse de séquence peut-elle expliquer des symptômes neurologiques ?

Oui, elle peut révéler des mutations liées à des troubles neurologiques.
Troubles neurologiques Mutations
#3

Peut-on détecter des symptômes de maladies infectieuses par analyse de séquence ?

Oui, elle permet d'identifier des agents pathogènes responsables des symptômes.
Maladies infectieuses Agents pathogènes
#4

Quels symptômes sont associés aux maladies génétiques ?

Des anomalies de développement, des troubles métaboliques ou des cancers.
Maladies génétiques Troubles métaboliques
#5

L'analyse de séquence peut-elle aider à comprendre des symptômes rares ?

Oui, elle est utile pour diagnostiquer des syndromes rares non identifiés.
Syndromes rares Diagnostic

Prévention 5

#1

L'analyse de séquence peut-elle aider à la prévention des maladies ?

Oui, elle permet d'identifier les individus à risque de maladies héréditaires.
Prévention Maladies héréditaires
#2

Comment l'analyse de séquence est-elle utilisée en prévention ?

Par le dépistage génétique pour détecter des mutations avant l'apparition des symptômes.
Dépistage génétique Mutations
#3

Peut-on prévenir des maladies infectieuses grâce à l'analyse de séquence ?

Oui, elle aide à surveiller les souches virales et à adapter les vaccins.
Maladies infectieuses Vaccins
#4

Quels conseils de prévention peuvent découler de l'analyse de séquence ?

Des recommandations sur le mode de vie et le dépistage précoce des maladies.
Conseils de prévention Dépistage précoce
#5

L'analyse de séquence peut-elle influencer les choix de mode de vie ?

Oui, elle peut recommander des changements pour réduire les risques génétiques.
Mode de vie Risques génétiques

Traitements 5

#1

Comment l'analyse de séquence influence-t-elle les traitements ?

Elle permet de personnaliser les traitements en fonction des mutations identifiées.
Traitements personnalisés Mutations
#2

L'analyse de séquence est-elle utilisée pour le suivi des traitements ?

Oui, elle aide à surveiller l'évolution des mutations pendant le traitement.
Suivi thérapeutique Mutations
#3

Quels traitements peuvent être adaptés grâce à l'analyse de séquence ?

Les thérapies ciblées en oncologie et les traitements pour maladies rares.
Thérapies ciblées Maladies rares
#4

L'analyse de séquence peut-elle guider les choix de médicaments ?

Oui, elle aide à choisir des médicaments efficaces selon le profil génétique.
Pharmacogénétique Médicaments
#5

Quels types de traitements sont influencés par l'analyse de séquence ?

Les traitements anticancéreux, les thérapies géniques et les médicaments antiviraux.
Traitements anticancéreux Thérapies géniques

Complications 5

#1

Quelles complications peuvent survenir sans analyse de séquence ?

Des diagnostics tardifs et des traitements inappropriés peuvent survenir.
Complications Diagnostics tardifs
#2

L'absence d'analyse de séquence peut-elle aggraver des maladies ?

Oui, cela peut mener à une progression non contrôlée de certaines maladies.
Progression des maladies Complications
#3

Quelles complications sont liées à des mutations non détectées ?

Des effets secondaires graves aux traitements et des rechutes de maladies.
Mutations Effets secondaires
#4

L'analyse de séquence peut-elle prévenir des complications ?

Oui, elle permet d'anticiper et de gérer les risques de complications.
Prévention des complications Gestion des risques
#5

Quels types de complications peuvent être identifiés par analyse de séquence ?

Des complications métaboliques, immunologiques ou liées à des cancers.
Complications métaboliques Cancers

Facteurs de risque 5

#1

Quels facteurs de risque sont identifiés par analyse de séquence ?

Des mutations génétiques, des antécédents familiaux et des expositions environnementales.
Facteurs de risque Mutations génétiques
#2

L'analyse de séquence peut-elle révéler des risques pour la santé ?

Oui, elle identifie des prédispositions génétiques à diverses maladies.
Prédispositions génétiques Santé
#3

Comment les facteurs de risque influencent-ils les traitements ?

Ils aident à personnaliser les traitements en fonction du profil génétique.
Personnalisation des traitements Facteurs de risque
#4

Peut-on évaluer les risques de maladies par analyse de séquence ?

Oui, elle permet d'évaluer les risques de maladies héréditaires et acquises.
Évaluation des risques Maladies héréditaires
#5

Quels facteurs environnementaux peuvent être analysés ?

Des expositions à des toxines ou des agents pathogènes peuvent être évaluées.
Facteurs environnementaux Toxines
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"Les traitements anticancéreux, les thérapies géniques et les médicaments antiviraux." } }, { "@type": "Question", "name": "Quelles complications peuvent survenir sans analyse de séquence ?", "position": 21, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des diagnostics tardifs et des traitements inappropriés peuvent survenir." } }, { "@type": "Question", "name": "L'absence d'analyse de séquence peut-elle aggraver des maladies ?", "position": 22, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, cela peut mener à une progression non contrôlée de certaines maladies." } }, { "@type": "Question", "name": "Quelles complications sont liées à des mutations non détectées ?", "position": 23, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des effets secondaires graves aux traitements et des rechutes de maladies." } }, { "@type": "Question", "name": "L'analyse de séquence peut-elle prévenir des complications ?", "position": 24, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, elle permet d'anticiper et de gérer les risques de complications." } }, { "@type": "Question", "name": "Quels types de complications peuvent être identifiés par analyse de séquence ?", "position": 25, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des complications métaboliques, immunologiques ou liées à des cancers." } }, { "@type": "Question", "name": "Quels facteurs de risque sont identifiés par analyse de séquence ?", "position": 26, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des mutations génétiques, des antécédents familiaux et des expositions environnementales." } }, { "@type": "Question", "name": "L'analyse de séquence peut-elle révéler des risques pour la santé ?", "position": 27, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, elle identifie des prédispositions génétiques à diverses maladies." } }, { "@type": "Question", "name": "Comment les facteurs de risque influencent-ils les traitements ?", "position": 28, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Ils aident à personnaliser les traitements en fonction du profil génétique." } }, { "@type": "Question", "name": "Peut-on évaluer les risques de maladies par analyse de séquence ?", "position": 29, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, elle permet d'évaluer les risques de maladies héréditaires et acquises." } }, { "@type": "Question", "name": "Quels facteurs environnementaux peuvent être analysés ?", "position": 30, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des expositions à des toxines ou des agents pathogènes peuvent être évaluées." } } ] } ] }
Dr Olivier Menir

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Sous-catégories

14 au total
└─

Séquençage nucléotidique à haut débit

High-Throughput Nucleotide Sequencing D059014 - E05.393.760.319
└─

Séquençage par nanopores

Nanopore Sequencing D000081414 - E05.393.760.560
└─

Analyse de séquence d'ADN

Sequence Analysis, DNA D017422 - E05.393.760.700
└─

Analyse de séquence de protéine

Sequence Analysis, Protein D020539 - E05.393.760.705
└─

Analyse de séquence d'ARN

Sequence Analysis, RNA D017423 - E05.393.760.710
└─└─

Codage à barres de l'ADN pour la taxonomie

DNA Barcoding, Taxonomic D058893 - E05.393.760.700.149
└─└─

Analyse de mutations d'ADN

DNA Mutational Analysis D004252 - E05.393.760.700.300
└─└─

Typage par séquençage multilocus

Multilocus Sequence Typing D058885 - E05.393.760.700.650
└─└─

Séquençage du génome entier

Whole Genome Sequencing D000073336 - E05.393.760.700.825
└─└─

Cartographie peptidique

Peptide Mapping D010449 - E05.393.760.705.685
└─└─

Profilage de ribosome

Ribosome Profiling D000094506 - E05.393.760.710.250
└─└─

RNA-Seq

RNA-Seq D000081246 - E05.393.760.710.500
└─└─└─

Séquençage de l'exome

Exome Sequencing D000073359 - E05.393.760.700.825.500
└─└─└─

Prise d'empreintes protéiques

Protein Footprinting D023302 - E05.393.760.705.685.690

Auteurs principaux

Jie Dong

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Affiliations :
  • National Health Commission Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens, Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing, P. R. China.
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Yanyan Li

2 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Postdoctoral Research Base, Henan Collaborative Innovation Center of Modern Biological Breeding, Henan Institute of Science and Technology, Xinxiang 453003, China.
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Xu Wang

2 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Anhui Provincial Key Laboratory of the Conservation and Exploitation of Biological Resources, Key Laboratory of Biotic Environment and Ecological Safety in Anhui Province, College of Life Sciences, Anhui Normal University, Wuhu, Anhui, China.
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Mengmeng Zhao

1 publication dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Veterinary Medicine, School of Life Science and Engineering, Foshan University, Foshan, China.
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Huawei Li

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Affiliations :
  • Henan University of Animal Husbandry and Economy, Zhengzhou, China.
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Hang Zhang

1 publication dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Veterinary Medicine, School of Life Science and Engineering, Foshan University, Foshan, China.
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Huiyang Sha

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Affiliations :
  • Department of Veterinary Medicine, School of Life Science and Engineering, Foshan University, Foshan, China.
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Liangzong Huang

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Affiliations :
  • Department of Veterinary Medicine, School of Life Science and Engineering, Foshan University, Foshan, China.
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Ruining Wang

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Affiliations :
  • Henan University of Animal Husbandry and Economy, Zhengzhou, China.
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Ramakanta Rana

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Affiliations :
  • Division of Molecular Epidemiology and Public Health, ICMR-Regional Medical Research Centre, Bhubaneswar, Odisha, India.
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Manoranjan Ranjit

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Affiliations :
  • Division of Molecular Epidemiology and Public Health, ICMR-Regional Medical Research Centre, Bhubaneswar, Odisha, India.
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Madhusmita Bal

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Affiliations :
  • Division of Molecular Epidemiology and Public Health, ICMR-Regional Medical Research Centre, Bhubaneswar, Odisha, India.
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Hemant Kumar Khuntia

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Affiliations :
  • Division of Molecular Epidemiology and Public Health, ICMR-Regional Medical Research Centre, Bhubaneswar, Odisha, India.
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Sanghamitra Pati

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Affiliations :
  • Division of Molecular Epidemiology and Public Health, ICMR-Regional Medical Research Centre, Bhubaneswar, Odisha, India.
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Sri Krishna

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Affiliations :
  • Division of Vector Borne Diseases, ICMR-National Institute of Research in Tribal Health, Jabalpur, India.
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Aparup Das

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Affiliations :
  • Division of Vector Borne Diseases, ICMR-National Institute of Research in Tribal Health, Jabalpur, India.
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Jennifer F Hughes

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Affiliations :
  • Whitehead Institute, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
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Helen Skaletsky

1 publication dans cette catégorie

Affiliations :
  • Whitehead Institute, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
  • Howard Hughes Medical Institute, Whitehead Institute, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
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Tatyana Pyntikova

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Affiliations :
  • Whitehead Institute, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
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Natalia Koutseva

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Affiliations :
  • Whitehead Institute, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
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Sources (10000 au total)

SeqWiz: a modularized toolkit for next-generation protein sequence database management and analysis.

17 May 2023
DOI: 10.1186/s12859-023-05334-9 PMID: 37194023

Current proteomic technologies are fast-evolving to uncover the complex features of sequence processes, variations and modifications. Thus, protein sequence database and the corresponding softwares sh... We developed a state-of-the-art toolkit (SeqWiz) for constructing next-generation sequence databases and performing proteomic-centric sequence analyses. First, we proposed two derived data formats: SQ... SeqWiz is designed to be a collection of modularized tools, which is friendly to both end-users for preparing easy-to-use sequence databases as well as bioinformaticians for performing downstream sequ...

Databases, Protein Proteomics Software Sequence Analysis Databases, Nucleic Acid

Whole-genome sequence analysis of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae recovered from hospitalized patients.

09 2023
DOI: 10.1016/j.jgar.2023.07.004 PMID: 37437842

Carbapenems are among the few effective antibiotics against multidrug-resistant Enterobacteriaceae. This study aimed at characterizing the plasmid content and resistome of clinical carbapenem-resistan... Plasmid typing and whole-genome sequencing were used to study the genomic characteristics of 65 clinical CREs including 27 Escherichia coli, 24 Klebsiella pneumoniae, one Klebsiella quasipneumoniae, t... bla... We analysed the clonality and resistance determinants of 65 multidrug-resistant (MDR) Enterobacteriaceae recovered in the period from 2016 to 2019 from a large tertiary hospital in Lebanon. NDM varian...

Humans Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Enterobacteriaceae Escherichia coli Anti-Bacterial Agents +1 autres

Jail-based medication for opioid use disorder and patterns of reincarceration and acute care use after release: A sequence analysis.

Mar 2024
DOI: 10.1016/j.josat.2023.209254 PMID: 38072387

Treatment with methadone and buprenorphine medications for opioid use disorder (MOUD) during incarceration may lead to better community re-entry, but evidence on these relationships have been mixed. W... Data came from a retrospective, observational cohort study of 6066 adults with opioid use disorder who were incarcerated in New York City jails and released to the community during 2011-14. An outcome... This study identified five re-entry patterns: stability (64 %), hospitalization (23 %), delayed reincarceration (7 %), immediate reincarceration (4 %), and continuous incarceration (2 %). After addres... Sequence analysis helped define post-release stability based on health and criminal legal system involvement. Receipt of in-jail MOUD was associated with a marker of successful community re-entry....

Adult Humans Jails Retrospective Studies Opioid-Related Disorders +2 autres

Identifying labour market pathways after a 30-day-long sickness absence -a three-year sequence analysis study in Finland.

07 06 2023
DOI: 10.1186/s12889-023-15895-2 PMID: 37287018

Return-to-work (RTW) process often includes many phases. Still, multi-state analyses that follow relevant labour market states after a long-term sickness absence (LTSA), and include a comprehensive se... Register data covered full-time and partial sickness allowance, rehabilitation, employment, unemployment benefits, and permanent and temporary disability pension (DP), retrieved for a 30% representati... We identified five clusters with emphases on the different states: (1) rapid RTW cluster (62% of the sample); (2) rapid unemployment cluster (9%); (3) DP after a prolonged sickness absence cluster (11... Among long-term sickness absentees, clear groups can be identified with both differing labour market pathways after LTSA and differing backgrounds. Lower socioeconomic background, pre-LTSA chronic dis...

Humans Adolescent Young Adult Adult Middle Aged +7 autres