From Sanger to genome sequencing - an overview of DNA sequencing technologies

Od Sangera do sekwencjonowania genomów – przegląd technologii sekwencjonowania DNA.

Journal

Postepy biochemii
ISSN: 0032-5422
Titre abrégé: Postepy Biochem
Pays: Poland
ID NLM: 0023525

Informations de publication

Date de publication:
01 07 2024
Historique:
received: 06 03 2024
accepted: 14 05 2024
medline: 31 7 2024
pubmed: 31 7 2024
entrez: 31 7 2024
Statut: epublish

Résumé

There is no technique that would make a greater contribution to the development of genetics, molecular biology and medicine than DNA sequencing. For many years, the method based on enzymatic DNA synthesis developed by Frederic Sanger was the gold standard in this area. At the end of the 20th century, there was a dynamic development of next-generation sequencing (NGS) technologies, which ended the era of single gene analysis and initiated the era of genome sequencing. Despite fierce competition, one NGS technology has practically completely dominated the global market. In the article, we present our own review of DNA sequencing methods, starting from the Sanger method to high-throughput second- and third-generation sequencing technologies, with particular emphasis on those that have achieved commercial success. We present their short history, principles of operation, technical possibilities, applications and limitations. In the summary, we reveal how much human genome sequencing costs at the current stage of the genomic revolution and outline the prospects for further development of genomics. Nie ma techniki, która wniosłaby większy wkład w rozwój genetyki, biologii molekularnej i medycyny niż sekwencjonowanie DNA. Przez wiele lat złoty standard w tym zakresie stanowiła metoda oparta na enzymatycznej syntezie DNA opracowana przez Frederica Sangera. Pod koniec XX. wieku nastąpił dynamiczny rozwój technologii sekwencjonowania nowej generacji (NGS), które zakończyły erę analizy pojedynczych genów i zapoczątkowały erę sekwencjonowania genomów. Pomimo ostrej konkurencji, jedna z technologii NGS praktycznie całkowicie zdominowała światowy rynek. W artykule przedstawiamy autorski przegląd metod sekwencjonowania DNA, począwszy od metody Sangera po wysokoprzepustowe technologie sekwencjonowania drugiej i trzeciej generacji, ze szczególnym uwzględnieniem tych, które odniosły komercyjny sukces. Prezentujemy ich krótką historię, zasady działania, możliwości techniczne, zastosowania i ograniczenia. W podsumowaniu zdradzamy ile kosztuje sekwencjonowanie genomu człowieka na obecnym etapie genomicznej rewolucji i nakreślamy perspektywy dalszego rozwoju genomiki.

Autres résumés

Type: Publisher (pol)
Nie ma techniki, która wniosłaby większy wkład w rozwój genetyki, biologii molekularnej i medycyny niż sekwencjonowanie DNA. Przez wiele lat złoty standard w tym zakresie stanowiła metoda oparta na enzymatycznej syntezie DNA opracowana przez Frederica Sangera. Pod koniec XX. wieku nastąpił dynamiczny rozwój technologii sekwencjonowania nowej generacji (NGS), które zakończyły erę analizy pojedynczych genów i zapoczątkowały erę sekwencjonowania genomów. Pomimo ostrej konkurencji, jedna z technologii NGS praktycznie całkowicie zdominowała światowy rynek. W artykule przedstawiamy autorski przegląd metod sekwencjonowania DNA, począwszy od metody Sangera po wysokoprzepustowe technologie sekwencjonowania drugiej i trzeciej generacji, ze szczególnym uwzględnieniem tych, które odniosły komercyjny sukces. Prezentujemy ich krótką historię, zasady działania, możliwości techniczne, zastosowania i ograniczenia. W podsumowaniu zdradzamy ile kosztuje sekwencjonowanie genomu człowieka na obecnym etapie genomicznej rewolucji i nakreślamy perspektywy dalszego rozwoju genomiki.

Identifiants

pubmed: 39083466
doi: 10.18388/pb.2021_534
doi:

Substances chimiques

DNA 9007-49-2

Types de publication

Journal Article Review Historical Article English Abstract

Langues

pol

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

173-189

Auteurs

Małgorzata Marcinkowska-Swojak (M)

Pracownia Genomiki, Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Poznań.

Magdalena Rakoczy (M)

Pracownia Genomiki, Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Poznań.

Jan Podkowiński (J)

Pracownia Genomiki, Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Poznań.

Jurand Handschuh (J)

Politechnika Poznańska.

Paweł Wojciechowski (P)

Pracownia Genomiki, Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Poznań oraz Instytut Informatyki, Politechnika Poznańska.

Luiza Handschuh (L)

Pracownia Genomiki, Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Poznań.

Articles similaires

Genome, Chloroplast Phylogeny Genetic Markers Base Composition High-Throughput Nucleotide Sequencing

[Redispensing of expensive oral anticancer medicines: a practical application].

Lisanne N van Merendonk, Kübra Akgöl, Bastiaan Nuijen
1.00
Humans Antineoplastic Agents Administration, Oral Drug Costs Counterfeit Drugs

Smoking Cessation and Incident Cardiovascular Disease.

Jun Hwan Cho, Seung Yong Shin, Hoseob Kim et al.
1.00
Humans Male Smoking Cessation Cardiovascular Diseases Female
Humans United States Aged Cross-Sectional Studies Medicare Part C

Classifications MeSH