Comment la protéogénomique aide-t-elle au diagnostic des maladies ?
Elle permet d'identifier des biomarqueurs protéiques spécifiques pour un diagnostic plus précis.
BiomarqueursProtéines
#2
Quels tests sont utilisés en protéogénomique ?
Des techniques comme la spectrométrie de masse et l'électrophorèse sont couramment utilisées.
Spectrométrie de masseÉlectrophorèse
#3
La protéogénomique peut-elle détecter des cancers ?
Oui, elle aide à identifier des protéines spécifiques associées à différents types de cancers.
CancerProtéines
#4
Quels échantillons sont analysés en protéogénomique ?
Des échantillons de tissus, de sang ou de fluides biologiques sont souvent analysés.
TissusSang
#5
La protéogénomique est-elle utilisée en médecine personnalisée ?
Oui, elle permet d'adapter les traitements en fonction du profil protéique du patient.
Médecine personnaliséeTraitement
Symptômes
5
#1
Quels symptômes peuvent être liés à des anomalies protéiques ?
Des symptômes variés comme la fatigue, la douleur ou des troubles neurologiques peuvent survenir.
SymptômesTroubles neurologiques
#2
Les maladies auto-immunes sont-elles étudiées en protéogénomique ?
Oui, la protéogénomique aide à comprendre les mécanismes sous-jacents des maladies auto-immunes.
Maladies auto-immunesMécanismes
#3
Comment les protéines affectent-elles les symptômes ?
Les protéines peuvent influencer des voies biologiques, entraînant divers symptômes cliniques.
ProtéinesVoies biologiques
#4
Les symptômes de maladies métaboliques sont-ils liés à la protéogénomique ?
Oui, des déséquilibres protéiques peuvent contribuer à des symptômes de maladies métaboliques.
Maladies métaboliquesDéséquilibres protéiques
#5
Peut-on prédire des symptômes grâce à la protéogénomique ?
Des modèles prédictifs basés sur des profils protéiques peuvent anticiper certains symptômes.
PrédictionProfils protéiques
Prévention
5
#1
La protéogénomique peut-elle aider à la prévention des maladies ?
Oui, elle permet d'identifier des facteurs de risque protéiques pour des interventions précoces.
PréventionFacteurs de risque
#2
Quels facteurs de risque sont identifiés par la protéogénomique ?
Des facteurs comme des niveaux anormaux de certaines protéines peuvent indiquer un risque accru.
Facteurs de risqueProtéines
#3
Comment la protéogénomique influence-t-elle les programmes de dépistage ?
Elle permet de cibler des populations à risque pour des dépistages plus efficaces.
DépistagePopulations à risque
#4
Peut-on prévenir des maladies grâce à des interventions protéogénomiques ?
Oui, des interventions basées sur des profils protéiques peuvent réduire le risque de maladies.
InterventionsProfils protéiques
#5
La nutrition peut-elle être influencée par la protéogénomique ?
Oui, elle aide à adapter les régimes alimentaires en fonction des besoins protéiques individuels.
NutritionRégimes alimentaires
Traitements
5
#1
La protéogénomique influence-t-elle les traitements ?
Oui, elle permet de développer des thérapies ciblées basées sur le profil protéique des patients.
Thérapies cibléesTraitements
#2
Quels types de traitements sont développés grâce à la protéogénomique ?
Des traitements biologiques, comme les anticorps monoclonaux, sont souvent développés.
Anticorps monoclonauxTraitements biologiques
#3
La protéogénomique aide-t-elle à la résistance aux médicaments ?
Oui, elle identifie des mécanismes de résistance, permettant d'ajuster les traitements.
Résistance aux médicamentsMécanismes
#4
Les traitements peuvent-ils être personnalisés grâce à la protéogénomique ?
Oui, les traitements peuvent être adaptés en fonction des profils protéiques individuels.
Traitements personnalisésProfils protéiques
#5
Quels médicaments sont influencés par la protéogénomique ?
Des médicaments anticancéreux et des immunothérapies sont souvent influencés par cette approche.
Médicaments anticancéreuxImmunothérapies
Complications
5
#1
Quelles complications peuvent survenir en cas d'anomalies protéiques ?
Des complications comme des troubles métaboliques ou des maladies dégénératives peuvent survenir.
ComplicationsTroubles métaboliques
#2
Les maladies cardiovasculaires sont-elles liées à la protéogénomique ?
Oui, des profils protéiques spécifiques peuvent être associés à un risque accru de maladies cardiovasculaires.
Maladies cardiovasculairesProfils protéiques
#3
Comment la protéogénomique aide-t-elle à comprendre les complications ?
Elle permet d'analyser les interactions entre gènes et protéines, révélant des mécanismes de complications.
MécanismesInteractions
#4
Les complications liées à la protéogénomique sont-elles évitables ?
Certaines complications peuvent être évitées par des interventions précoces basées sur des analyses protéiques.
InterventionsAnalyses protéiques
#5
Peut-on prédire des complications grâce à la protéogénomique ?
Oui, des modèles prédictifs basés sur des données protéomiques peuvent anticiper des complications.
PrédictionDonnées protéomiques
Facteurs de risque
5
#1
Quels sont les principaux facteurs de risque identifiés par la protéogénomique ?
Des facteurs comme l'âge, l'hérédité et des niveaux protéiques anormaux sont souvent identifiés.
Facteurs de risqueHérédité
#2
La protéogénomique peut-elle identifier des risques environnementaux ?
Oui, elle peut révéler comment des facteurs environnementaux influencent les profils protéiques.
Facteurs environnementauxProfils protéiques
#3
Les habitudes de vie influencent-elles les facteurs de risque protéogénomiques ?
Oui, des habitudes comme l'alimentation et l'exercice peuvent modifier les niveaux protéiques.
Habitudes de vieAlimentation
#4
Comment la génétique influence-t-elle les facteurs de risque ?
La génétique détermine la production de certaines protéines, influençant ainsi le risque de maladies.
GénétiqueProduction de protéines
#5
Peut-on modifier les facteurs de risque grâce à la protéogénomique ?
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Department of Medicine and Genetics, Siteman Cancer Center, Washington University in St. Louis, St. Louis, MO 63110, USA; McDonnell Genome Institute, Washington University in St. Louis, St. Louis, MO 63108, USA. Electronic address: lding@wustl.edu.
Lester and Sue Smith Breast Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA; Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA; Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA.
Lester and Sue Smith Breast Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA; Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA; Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA.
Department of Pathology, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA; Department of Computational Medicine and Bioinformatics, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA.
Institute for Systems Genetics, NYU School of Medicine, New York, NY 10016, USA; Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, NYU School of Medicine, New York, NY 10016, USA. Electronic address: david@fenyolab.org.
Lester and Sue Smith Breast Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA; Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA; Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA.
Lester and Sue Smith Breast Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA; Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA; Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA.
Department of Medicine and Genetics, Siteman Cancer Center, Washington University in St. Louis, St. Louis, MO 63110, USA; McDonnell Genome Institute, Washington University in St. Louis, St. Louis, MO 63108, USA.
Department of Medicine, Washington University in St. Louis, St. Louis, MO 63130, USA; McDonnell Genome Institute, Washington University in St. Louis, St. Louis, MO 63130, USA.
State Key Laboratory of Genetic Engineering and Collaborative Innovation Center for Genetics and Development , School of Life Sciences , Institute of Biomedical Sciences , Human Phenome Institute , Zhongshan Hospital , Fudan University , Shanghai , China.
Radiation resistance of lung cancer cells is a vital factor affecting the curative effect of lung cancer. Transcription factor GATA3 is involved in cell proliferation, invasion, and migration and is s...
Radiation-resistant cell models (A549-RR and H1299-RR) were made using fractionated high-dose irradiation. Use clone formation, CCK-8, F-actin staining, cell cycle detection, and other experiments to ...
We report that transcription factors GATA3 and H3K4me3 coactivate NRP1 gene transcription when A549 cells develop radiation resistance. However, the mechanism of radiation resistance in H1299 cells is...
GATA3, an upstream transcriptional regulator of NRP1 gene, regulates the radioresistance of A549 and H1299 cells by opposite mechanisms, which provides a new target for radiotherapy of lung cancer....
Th cells play an important role in pathogenesis of type 1 diabetes (T1D). Peripheral blood mononuclear cells were isolated from peripheral blood samples from newly diagnosed (ND), 1-year (1YD), and 5-...
Triple-negative breast cancer (TNBC) is a subtype of breast cancer with poor prognosis. Therefore, there is an urgent need to identify prognostic markers to improve current treatment and therapeutic s...
We performed a survival analysis of 989 breast cancer patients from The Cancer Genome Atlas (TCGA), and validated the findings in 202 breast cancer patients from tissue microarray (TMA)....
In TCGA database, the mRNA expression of...
The results indicated that the binding index of ZNF503 and GATA3 could be used as a prognostic biomarker in TNBC....
GATA binding protein 3 (GATA3) is a zinc-finger pioneer transcription factor involved in diverse processes. GATA3 regulates gene expression through binding nucleosomal DNA and facilitating chromatin r...
Sinonasal neuroendocrine neoplasms (SN-NENs) are rare and mostly include neuroendocrine carcinoma (NEC), whereas neuroendocrine tumor (NET) is exceptional in this site. Olfactory neuroblastoma (ONB) i...
Tamoxifen-mediated endocrine therapy has been standard treatment for ER+ breast cancers; however, majority of them acquire resistance leading to disease relapse. Although numerous substrates of E3 lig...
Luciferase reporter assay was performed after cloning full length and truncated FBW7 promoters followed by Chromatin immunoprecipitation assay to validate binding of SOX4 on FBW7 promoter. Transcripti...
SOX4 positively regulates FBW7 at transcriptional level by binding to three putative SOX4 biding sites within 3.1 kb long FBW7 promoter. Analysis of publicly available RNAseq datasets also showed a po...
Targeting SOX4-FBW7-GATA3 axis may overcome tamoxifen resistance in ER+ breast cancers....
Metastatic breast carcinoma (mBC) is frequently encountered and may be challenging to diagnose as the tumor cells can morphologically resemble carcinomas of other primary origins. An additional challe...
The authors identified the following cytology cases: 37 GATA3-positive mBC cases and 19 available cases that were deemed mBC but were GATA3-negative during the original case workup and five cases of e...
TRPS1 was positive in all 37 GATA3-positive mBC cases and in 18 of the 19 GATA3-negative mBC cases. TRPS1 was negative in all five of the seven frequently GATA3-positive epithelioid entities, with the...
TRPS1 is as sensitive as GATA3 in GATA3-positive mBC and is more sensitive than GATA3 in TNBC. TRPS1 is negative in most GATA3-positive nonbreast tumors. Thus, the combination of TRPS1 and GATA3 could...
This study aimed to evaluate the diagnostic and prognostic roles of GATA-binding protein 3 (GATA3) immunohistochemistry in urothelial carcinoma (UC) using a meta-analysis. We investigated GATA3 immuno...
Pioneer factors, which can directly bind to nucleosomes, have been considered to change chromatin conformations. However, the binding impact on the nucleosome is little known. Here, we show how the pi...
Long non-coding RNAs (lncRNAs) play various roles in gene regulation. GATA3 antisense RNA 1 (GATA3-AS1) is an lncRNA gene neighboring GATA binding protein 3 (GATA3). The current study aims to quantita...
In this case-control study, the GATA3-AS1, GATA3 and IL-4 expression profiles were assessed using real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR). Also, we assessed th...
Our results indicate a probably regulatory function for GATA3-AS1and the levels of GATA3-AS1 in blood could be important biomarkers for MS diagnosis. To confirm and be more certain of these results, i...