Secondary findings from whole-exome/genome sequencing evaluating stakeholder perspectives. A review of the literature.


Journal

European journal of medical genetics
ISSN: 1878-0849
Titre abrégé: Eur J Med Genet
Pays: Netherlands
ID NLM: 101247089

Informations de publication

Date de publication:
Jun 2019
Historique:
received: 20 02 2018
revised: 19 07 2018
accepted: 20 08 2018
pubmed: 31 8 2018
medline: 22 6 2019
entrez: 31 8 2018
Statut: ppublish

Résumé

With the development of next generation sequencing, beyond identifying the cause of manifestations that justified prescription of the test, other information with potential interest for patients and their families, defined as secondary findings (SF), can be provided once patients have given informed consent, in particular when therapeutic and preventive options are available. The disclosure of such findings has caused much debate. The aim of this work was to summarize all opinion-based studies focusing on SF, so as to shed light on the concerns that this question generate. A review of the literature was performed, focusing on all PubMed articles reporting qualitative, quantitative or mixed studies that interviewed healthcare providers, participants, or society regarding this subject. The methodology was carefully analysed, in particular whether or not studies made the distinction between actionable and non-actionable SF, in a clinical or research context. From 2010 to 2016, 39 articles were compiled. A total of 14,868 people were interviewed (1259 participants, 6104 healthcare providers, 7505 representatives of society). When actionable and non-actionable SF were distinguished (20 articles), 92% of respondents were keen to have results regarding actionable SF (participants: 88%, healthcare providers: 86%, society: 97%), against 70% (participants: 83%, healthcare providers: 62%, society: 73%) for non-actionable SF. These percentages were slightly lower in the specific situation of children probands. For respondents, the notion of the «patient's choice» is crucial. For healthcare providers, the importance of defining policies for SF among diagnostic lab, learning societies and/or countries is outlined, in particular regarding the content and extension of the list of actionable genes to propose, the modalities of information, and the access to information about adult-onset diseases in minors. However, the existing literature should be taken with caution, since most articles lack a clear definition of SF and actionability, and referred to hypothetical scenarios with limited information to respondents. Studies conducted by multidisciplinary teams involving patients with access to results are sadly lacking, in particular in the medium term after the results have been given. Such studies would feed the debate and make it possible to measure the impact of such findings and their benefit-risk ratio.

Identifiants

pubmed: 30165243
pii: S1769-7212(18)30122-8
doi: 10.1016/j.ejmg.2018.08.010
pii:
doi:

Types de publication

Journal Article Review

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

103529

Informations de copyright

Copyright © 2018. Published by Elsevier Masson SAS.

Auteurs

J Delanne (J)

Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares Anomalies du Développement de l'Interrégion Est, Hôpital d'Enfants, CHU, Dijon, France; FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; Equipe GAD « Génétique des Anomalies du Développement », UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France.

S Nambot (S)

Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares Anomalies du Développement de l'Interrégion Est, Hôpital d'Enfants, CHU, Dijon, France; FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; Equipe GAD « Génétique des Anomalies du Développement », UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France.

A Chassagne (A)

FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; CIC-IT Inserm 808, CHU de Besançon et Université de Bourgogne-Franche Comté, Besançon, France.

O Putois (O)

EA 3071 SuLiSoM, Université de Strasbourg, Strasbourg, France. Electronic address: putois@unistra.fr.

A Pelissier (A)

FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; EES-LEDI, Université de Bourgogne, France.

C Peyron (C)

FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; EES-LEDI, Université de Bourgogne, France.

E Gautier (E)

FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France.

J Thevenon (J)

Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares Anomalies du Développement de l'Interrégion Est, Hôpital d'Enfants, CHU, Dijon, France; FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; Equipe GAD « Génétique des Anomalies du Développement », UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France.

E Cretin (E)

FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; CIC-IT Inserm 808, CHU de Besançon et Université de Bourgogne-Franche Comté, Besançon, France.

A L Bruel (AL)

Equipe GAD « Génétique des Anomalies du Développement », UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France.

V Goussot (V)

GIMI (Genomic and Immunotherapy Medical Institute), Centre Georges François Leclerc, Dijon, France.

F Ghiringhelli (F)

GIMI (Genomic and Immunotherapy Medical Institute), Centre Georges François Leclerc, Dijon, France.

R Boidot (R)

GIMI (Genomic and Immunotherapy Medical Institute), Centre Georges François Leclerc, Dijon, France.

F Tran Mau-Them (F)

Equipe GAD « Génétique des Anomalies du Développement », UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France; Laboratoire de génétique moléculaire et de Cytogénétique, Plateau Technique de Biologie, CHU Dijon, France.

C Philippe (C)

Equipe GAD « Génétique des Anomalies du Développement », UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France; Laboratoire de génétique moléculaire et de Cytogénétique, Plateau Technique de Biologie, CHU Dijon, France.

A Vitobello (A)

Equipe GAD « Génétique des Anomalies du Développement », UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France; Laboratoire de génétique moléculaire et de Cytogénétique, Plateau Technique de Biologie, CHU Dijon, France.

L Demougeot (L)

Filière AnDDI-Rares, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France.

C Vernin (C)

Filière AnDDI-Rares, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France.

A S Lapointe (AS)

Filière AnDDI-Rares, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France.

M Bardou (M)

INSERM, CIC1432, module épidémiologie clinique, Dijon, France; Centre Hospitalier Universitaire Dijon-Bourgogne, Centre d'investigation clinique, module épidémiologie clinique/essais cliniques, Dijon, France.

M Luu (M)

INSERM, CIC1432, module épidémiologie clinique, Dijon, France; Centre Hospitalier Universitaire Dijon-Bourgogne, Centre d'investigation clinique, module épidémiologie clinique/essais cliniques, Dijon, France.

C Binquet (C)

INSERM, CIC1432, module épidémiologie clinique, Dijon, France; Centre Hospitalier Universitaire Dijon-Bourgogne, Centre d'investigation clinique, module épidémiologie clinique/essais cliniques, Dijon, France.

C Lejeune (C)

INSERM, CIC1432, module épidémiologie clinique, Dijon, France; Centre Hospitalier Universitaire Dijon-Bourgogne, Centre d'investigation clinique, module épidémiologie clinique/essais cliniques, Dijon, France.

L Joly (L)

Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares Anomalies du Développement de l'Interrégion Est, Hôpital d'Enfants, CHU, Dijon, France.

C Juif (C)

Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares Anomalies du Développement de l'Interrégion Est, Hôpital d'Enfants, CHU, Dijon, France.

A Baurand (A)

Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares Anomalies du Développement de l'Interrégion Est, Hôpital d'Enfants, CHU, Dijon, France.

C Sawka (C)

Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares Anomalies du Développement de l'Interrégion Est, Hôpital d'Enfants, CHU, Dijon, France.

G Bertolone (G)

Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares Anomalies du Développement de l'Interrégion Est, Hôpital d'Enfants, CHU, Dijon, France.

Y Duffourd (Y)

FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; Equipe GAD « Génétique des Anomalies du Développement », UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France.

D Sanlaville (D)

CLAD Sud-Est, Hôpital Femmes Mères Enfants, Hôpitaux Civils de Lyon, Lyon, France.

P Pujol (P)

Société Française de Médecine Prédictive et Personnalisée (SFMPP), CHU Montpellier, Montpellier, France.

D Geneviève (D)

Société Française de Médecine Prédictive et Personnalisée (SFMPP), CHU Montpellier, Montpellier, France.

F Houdayer (F)

CLAD Sud-Est, Hôpital Femmes Mères Enfants, Hôpitaux Civils de Lyon, Lyon, France.

C Thauvin-Robinet (C)

Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares Anomalies du Développement de l'Interrégion Est, Hôpital d'Enfants, CHU, Dijon, France; FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; Equipe GAD « Génétique des Anomalies du Développement », UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France; GIMI (Genomic and Immunotherapy Medical Institute), Centre Georges François Leclerc, Dijon, France; Filière AnDDI-Rares, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; Société Française de Médecine Prédictive et Personnalisée (SFMPP), CHU Montpellier, Montpellier, France. Electronic address: christel.thauvin@chu-dijon.fr.

L Faivre (L)

Centre de Génétique et Centre de Référence Maladies Rares Anomalies du Développement de l'Interrégion Est, Hôpital d'Enfants, CHU, Dijon, France; FHU TRANSLAD, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; Equipe GAD « Génétique des Anomalies du Développement », UMR INSERM 1231, Université de Bourgogne, Dijon, France; GIMI (Genomic and Immunotherapy Medical Institute), Centre Georges François Leclerc, Dijon, France; Filière AnDDI-Rares, Centre Hospitalier Universitaire et Université de Bourgogne-Franche Comté, Dijon, France; Société Française de Médecine Prédictive et Personnalisée (SFMPP), CHU Montpellier, Montpellier, France. Electronic address: laurence.faivre@chu-dijon.fr.

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