Cross-species utility of microsatellite loci for the genetic characterisation of Anisakis berlandi (Nematoda: Anisakidae).
Utilité des loci microsatellites pour la caractérisation génétique interspécifique d’Anisakis berlandi (Nematoda, Anisakidae).
Anisakis berlandi
Genetic diversity
Microsatellites
Nuclear markers
Sex-linkage loci
Journal
Parasite (Paris, France)
ISSN: 1776-1042
Titre abrégé: Parasite
Pays: France
ID NLM: 9437094
Informations de publication
Date de publication:
2020
2020
Historique:
received:
10
09
2019
accepted:
20
01
2020
entrez:
12
2
2020
pubmed:
12
2
2020
medline:
24
9
2020
Statut:
ppublish
Résumé
Eight microsatellite loci, recently developed in the species Anisakis pegreffii, were successfully amplified in Anisakis berlandi, sibling species of the A. simplex (s. l.) complex. They were validated on adult specimens (n = 46) of the parasite species, collected from two individuals of the definitive host, the long-finned pilot whale Globicephala melas from New Zealand waters. Among the eight loci scored, one, Anisl 07132, had null alleles in A. berlandi and was thus excluded from the subsequent genetic analysis. Two loci, Anisl 00314 and Anisl 10535, were monomorphic. In addition, as also previously detected in the other species of the A. simplex (s. l.) complex, the Anisl 7 locus was seen to be sex-linked, showing hemizygosity in male specimens. Differential allele frequency distributions of A. berlandi, with respect to those previously observed in A. pegreffii and A. simplex (s. s.), were found at some microsatellite loci. The Anisl 7 locus provided 100% diagnosis between A. berlandi and A. pegreffii, while others resulted in 99% diagnosis between A. berlandi and the other two species. Simple sequence repeat (SSR) loci also allowed us to estimate the genetic differentiation of A. berlandi from A. pegreffii (F Utilité des loci microsatellites pour la caractérisation génétique interspécifique d’Anisakis berlandi (Nematoda, Anisakidae). Huit loci microsatellites, récemment développés chez l’espèce Anisakis pegreffii, ont été amplifiés avec succès chez Anisakis berlandi, espèce sœur du complexe A. simplex (s. l.). Ils ont été validés sur des spécimens adultes (n = 46) de l’espèce, récoltés chez deux individus de l’hôte définitif, le globicéphale commun Globicephala melas, des eaux néo-zélandaises. Parmi les huit loci notés, l’un, Anisl 07132, avait des allèles nuls chez A. berlandi et a donc été exclu de l’analyse génétique ultérieure. Deux loci, Anisl 00314 et Anisl 10535, étaient monomorphes. De plus, comme cela a également été détecté précédemment dans les autres espèces du complexe A. simplex (s. l.), le locus Anisl 7 était lié au sexe, montrant une hémizygosité chez les spécimens mâles. Chez A. berlandi, des distributions de fréquences d’allèles, différentielles par rapport à celles précédemment observées chez A. pegreffii et A. simplex (s. s.), ont été trouvées pour certains loci microsatellites. Le locus Anisl 7 a fourni un diagnostic à 100 % entre A. berlandi et A. pegreffii, tandis que d’autres ont abouti à un diagnostic à 99 % entre A. berlandi et les deux autres espèces. Les loci des SSR ont également permis d’estimer la différenciation génétique d’A. berlandi par rapport à A. pegreffii (F
Autres résumés
Type: Publisher
(fre)
Utilité des loci microsatellites pour la caractérisation génétique interspécifique d’Anisakis berlandi (Nematoda, Anisakidae).
Identifiants
pubmed: 32043965
doi: 10.1051/parasite/2020004
pii: parasite190119
pmc: PMC7011781
doi:
Types de publication
Journal Article
Langues
eng
Sous-ensembles de citation
IM
Pagination
9Informations de copyright
© E. Bello et al., published by EDP Sciences, 2020.
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