A systematic study of the valence electronic structure of cyclo(Gly-Phe), cyclo(Trp-Tyr) and cyclo(Trp-Trp) dipeptides in the gas phase.


Journal

Physical chemistry chemical physics : PCCP
ISSN: 1463-9084
Titre abrégé: Phys Chem Chem Phys
Pays: England
ID NLM: 100888160

Informations de publication

Date de publication:
08 Dec 2021
Historique:
pubmed: 25 11 2021
medline: 11 1 2022
entrez: 24 11 2021
Statut: epublish

Résumé

The electronic energy levels of cyclo(glycine-phenylalanine), cyclo(tryptophan-tyrosine) and cyclo(tryptophan-tryptophan) dipeptides are investigated with a joint experimental and theoretical approach. Experimentally, valence photoelectron spectra in the gas phase are measured using VUV radiation. Theoretically, we first obtain low-energy conformers through an automated conformer-rotamer ensemble sampling scheme based on tight-binding simulations. Then, different first principles computational schemes are considered to simulate the spectra: Hartree-Fock (HF), density functional theory (DFT) within the B3LYP approximation, the quasi-particle GW correction, and the quantum-chemistry CCSD method. Theory allows assignment of the main features of the spectra. A discussion on the role of electronic correlation is provided, by comparing computationally cheaper DFT scheme (and GW) results with the accurate CCSD method.

Identifiants

pubmed: 34816853
doi: 10.1039/d1cp04050b
doi:

Substances chimiques

Dipeptides 0
Gases 0
Oligopeptides 0
Peptides, Cyclic 0
cyclo(tryptophyl-tryptophyl) 0
Phenylalanine 47E5O17Y3R
glycylphenylalanine 721-66-4
Tryptophan 8DUH1N11BX

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

26793-26805

Auteurs

Elena Molteni (E)

Istituto di Struttura della Materia-CNR (ISM-CNR), Area della Ricerca di Roma 1, Via Salaria km 29.300, CP 10, Monterotondo Scalo, Roma, Italy. elena.molteni@mlib.ism.cnr.it.
Dipartimento di Fisica, Universita' degli Studi di Milano, via Celoria 16, I-20133 Milano, Italy.

Giuseppe Mattioli (G)

Istituto di Struttura della Materia-CNR (ISM-CNR), Area della Ricerca di Roma 1, Via Salaria km 29.300, CP 10, Monterotondo Scalo, Roma, Italy. elena.molteni@mlib.ism.cnr.it.

Paola Alippi (P)

Istituto di Struttura della Materia-CNR (ISM-CNR), Area della Ricerca di Roma 1, Via Salaria km 29.300, CP 10, Monterotondo Scalo, Roma, Italy. elena.molteni@mlib.ism.cnr.it.

Lorenzo Avaldi (L)

Istituto di Struttura della Materia-CNR (ISM-CNR), Area della Ricerca di Roma 1, Via Salaria km 29.300, CP 10, Monterotondo Scalo, Roma, Italy. elena.molteni@mlib.ism.cnr.it.

Paola Bolognesi (P)

Istituto di Struttura della Materia-CNR (ISM-CNR), Area della Ricerca di Roma 1, Via Salaria km 29.300, CP 10, Monterotondo Scalo, Roma, Italy. elena.molteni@mlib.ism.cnr.it.

Laura Carlini (L)

Istituto di Struttura della Materia-CNR (ISM-CNR), Area della Ricerca di Roma 1, Via Salaria km 29.300, CP 10, Monterotondo Scalo, Roma, Italy. elena.molteni@mlib.ism.cnr.it.

Federico Vismarra (F)

Dipartimento di Fisica, Politecnico di Milano, Piazza Leonardo da Vinci, 32, Milano, Italy.
CNR-Istituto di Fotonica e Nanotecnologie, Piazza Leonardo da Vinci, 32, Milano, Italy.

Yingxuan Wu (Y)

Dipartimento di Fisica, Politecnico di Milano, Piazza Leonardo da Vinci, 32, Milano, Italy.
CNR-Istituto di Fotonica e Nanotecnologie, Piazza Leonardo da Vinci, 32, Milano, Italy.

Rocio Borrego Varillas (RB)

CNR-Istituto di Fotonica e Nanotecnologie, Piazza Leonardo da Vinci, 32, Milano, Italy.

Mauro Nisoli (M)

Dipartimento di Fisica, Politecnico di Milano, Piazza Leonardo da Vinci, 32, Milano, Italy.
CNR-Istituto di Fotonica e Nanotecnologie, Piazza Leonardo da Vinci, 32, Milano, Italy.

Manjot Singh (M)

Dipartimento di Scienze Biomediche Avanzate, Universita' degli Studi di Napoli Federico II, via Pansini 5, I-80131, Napoli, Italy.

Mohammadhassan Valadan (M)

Dipartimento di Scienze Biomediche Avanzate, Universita' degli Studi di Napoli Federico II, via Pansini 5, I-80131, Napoli, Italy.
Istituto Nazionale Fisica Nucleare (INFN), Sezione di Napoli, Napoli, Italy.

Carlo Altucci (C)

Dipartimento di Scienze Biomediche Avanzate, Universita' degli Studi di Napoli Federico II, via Pansini 5, I-80131, Napoli, Italy.
Istituto Nazionale Fisica Nucleare (INFN), Sezione di Napoli, Napoli, Italy.

Robert Richter (R)

Sincrotrone Trieste, Area Science Park, Basovizza, Trieste, Italy.

Davide Sangalli (D)

Istituto di Struttura della Materia-CNR (ISM-CNR), Area della Ricerca di Roma 1, Via Salaria km 29.300, CP 10, Monterotondo Scalo, Roma, Italy. elena.molteni@mlib.ism.cnr.it.
Dipartimento di Fisica, Universita' degli Studi di Milano, via Celoria 16, I-20133 Milano, Italy.

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