Exploring a unique class of flavoenzymes: Identification and biochemical characterization of ribosomal RNA dihydrouridine synthase.

Escherichia coli / genetics RNA, Ribosomal, 23S / metabolism Uridine / analogs & derivatives Escherichia coli Proteins / metabolism RNA, Bacterial / metabolism
RNA modification dihydrouridine dihydrouridine synthase flavoenzyme rRNA

Journal

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
ISSN: 1091-6490
Titre abrégé: Proc Natl Acad Sci U S A
Pays: United States
ID NLM: 7505876

Informations de publication

Date de publication:
06 Aug 2024
Historique:
medline: 30 7 2024
pubmed: 30 7 2024
entrez: 30 7 2024
Statut: ppublish

Résumé

Dihydrouridine (D), a prevalent and evolutionarily conserved base in the transcriptome, primarily resides in tRNAs and, to a lesser extent, in mRNAs. Notably, this modification is found at position 2449 in the

Identifiants

DOI: 10.1073/pnas.2401981121 PMID: 39078675
pubmed: 39078675
doi: 10.1073/pnas.2401981121
doi:

Substances chimiques

RNA, Ribosomal, 23S 0
Uridine WHI7HQ7H85
Escherichia coli Proteins 0
RNA, Bacterial 0

Types de publication

Journal Article

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

e2401981121

Subventions

Organisme : Agence Nationale de la Recherche (ANR)
ID : 20-CE92-0030
Organisme : Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)
ID : 439669440 - TRR-319-TP C01 and HE 3397/21-1
Organisme : Science Ministry | Forskerakademiet (Danish Research Academy)
ID : FNU-rammebevilling 10-084554
Organisme : Animal Health and Welfare ERA-Net (ANIHWA)
ID : GM132254

Déclaration de conflit d'intérêts

Competing interests statement:The authors declare no competing interest.

Auteurs

Sabrine Toubdji (S)

Sorbonne Université, CNRS, Institut de Biologie Paris Seine, Biology of Aging and Adaptation, Institut de Biologie Paris-Seine, F-75252 Paris Cedex 05, France.
Collège De France, Sorbonne Université, CNRS, Laboratoire de Chimie des Processus Biologiques, F-75231, Paris Cedex 05, France.
ORCID: 0009-0001-7594-5020

Quentin Thullier (Q)

Université de Lorraine, CNRS, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Ingénierie-Biologie-Santé en Lorraine, Epitranscriptomique et Séquençage Core Facility, F-54000 Nancy, France.
Université de Lorraine, CNRS, Ingénierie Moléculaire, Cellulaire et Physiopathologie, F-54000 Nancy, France.

Lea-Marie Kilz (LM)

Institut für Pharmazeutische und Biomedizinische Wissenschaften, Johannes Gutenberg-Universität, Mainz D-55128, Germany.

Virginie Marchand (V)

Université de Lorraine, CNRS, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Ingénierie-Biologie-Santé en Lorraine, Epitranscriptomique et Séquençage Core Facility, F-54000 Nancy, France.
Université de Lorraine, CNRS, Ingénierie Moléculaire, Cellulaire et Physiopathologie, F-54000 Nancy, France.

Yifeng Yuan (Y)

Department of Microbiology and Cell Science, University of Florida, Gainesville, FL 32611.

Claudia Sudol (C)

Sorbonne Université, CNRS, Institut de Biologie Paris Seine, Biology of Aging and Adaptation, Institut de Biologie Paris-Seine, F-75252 Paris Cedex 05, France.
Collège De France, Sorbonne Université, CNRS, Laboratoire de Chimie des Processus Biologiques, F-75231, Paris Cedex 05, France.

Catherine Goyenvalle (C)

Sorbonne Université, CNRS, Institut de Biologie Paris Seine, Biology of Aging and Adaptation, Institut de Biologie Paris-Seine, F-75252 Paris Cedex 05, France.

Olivier Jean-Jean (O)

Sorbonne Université, CNRS, Institut de Biologie Paris Seine, Biology of Aging and Adaptation, Institut de Biologie Paris-Seine, F-75252 Paris Cedex 05, France.
ORCID: 0000-0001-6502-9937

Simon Rose (S)

Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Southern Denmark, DK-5230 Odense M, Denmark.

Stephen Douthwaite (S)

Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Southern Denmark, DK-5230 Odense M, Denmark.
ORCID: 0000-0001-5468-8486

Léo Hardy (L)

Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3525, Unité Plasticité du Génome Bactérien, F-75015 Paris, France.

Zeynep Baharoglu (Z)

Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3525, Unité Plasticité du Génome Bactérien, F-75015 Paris, France.
ORCID: 0000-0003-3477-2685

Valérie de Crécy-Lagard (V)

Department of Microbiology and Cell Science, University of Florida, Gainesville, FL 32611.
Genetics Institute, University of Florida, Gainesville, FL 32610.
ORCID: 0000-0002-9955-3785

Mark Helm (M)

Institut für Pharmazeutische und Biomedizinische Wissenschaften, Johannes Gutenberg-Universität, Mainz D-55128, Germany.

Yuri Motorin (Y)

Université de Lorraine, CNRS, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Ingénierie-Biologie-Santé en Lorraine, Epitranscriptomique et Séquençage Core Facility, F-54000 Nancy, France.
Université de Lorraine, CNRS, Ingénierie Moléculaire, Cellulaire et Physiopathologie, F-54000 Nancy, France.

Djemel Hamdane (D)

Collège De France, Sorbonne Université, CNRS, Laboratoire de Chimie des Processus Biologiques, F-75231, Paris Cedex 05, France.
ORCID: 0000-0002-1737-8320

Damien Brégeon (D)

Sorbonne Université, CNRS, Institut de Biologie Paris Seine, Biology of Aging and Adaptation, Institut de Biologie Paris-Seine, F-75252 Paris Cedex 05, France.
ORCID: 0000-0003-1113-7574

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