Microcalorimetry as a tool in enzymatic kinetics research

Mikrokalorymetria jako narzędzie w badaniach kinetyki enzymatycznej.

Journal

Postepy biochemii
ISSN: 0032-5422
Titre abrégé: Postepy Biochem
Pays: Poland
ID NLM: 0023525

Informations de publication

Date de publication:
01 07 2024
Historique:
received: 11 03 2024
accepted: 15 04 2024
medline: 31 7 2024
pubmed: 31 7 2024
entrez: 31 7 2024
Statut: epublish

Résumé

Enzymes, as biocatalysts, are an important target of many therapies and are also of great industrial importance, which is why repeatable and accurate parameterization of enzymatic catalysis is very important. The most popular spectrophotometric detection method in enzymology, despite its low cost and speed, often cannot be used directly due to the inappropriate spectral properties of substrates and products. It is then necessary to use auxiliary enzymes, chemical modification of substrates or post-reaction analysis, which may increase the cost of measurement, extend its time or affect the accuracy. Isothermal titration calorimetry is a method widely used mainly for the characterization of inter-molecular interactions, however, its use in enzyme kinetics is gaining more and more recognition due to the direct measurement of the reaction rate using the universal parameter of heat, high sensitivity and low reagent consumption. This work discusses two strategies for conducting a kinetic calorimetric experiment and their applications. Enzymy jako katalizatory większości procesów w organizmach żywych stanowią istotny cel wielu terapii, mają też duże znaczenie przemysłowe, dlatego powtarzalna i dokładna parametryzacja katalizy enzymatycznej jest bardzo istotna nie tylko w badaniach podstawowych, ale też wdrożeniowych. Najbardziej popularna w enzymologii metoda detekcji spektrofotometrycznej, mimo niskich kosztów i szybkości, często nie może być zastosowana bezpośrednio z uwagi na nieodpowiednie właściwości spektralne substratów i produktów. Konieczne jest wtedy korzystanie z pomocniczych enzymów, modyfikacji chemicznej substratów, bądź analizy poreakcyjnej, np. przy użyciu spektrometrii mas, co może zwiększać koszty pomiaru, wydłużać jego czas, bądź wpływać na dokładność oznaczeń. Izotermiczna kalorymetria miareczkowa jest metodą rozpowszechnioną głównie w celu charakterystyki oddziaływań między-molekularnych, jednakże jej użycie w kinetyce enzymatycznej zdobywa coraz większe uznanie z uwagi na bezpośredni pomiar prędkości reakcji przy użyciu uniwersalnego parametru jakim jest ciepło, brak konieczności stosowania sztucznych substratów lub przetwarzania poreakcyjnego, a także wysoką czułość i niskie zużycie reagentów. Niniejsza praca omawia dwie strategie przeprowadzania kinetycznego eksperymentu kalorymetrycznego,  a także ich przykładowe zastosowania.

Autres résumés

Type: Publisher (pol)
Enzymy jako katalizatory większości procesów w organizmach żywych stanowią istotny cel wielu terapii, mają też duże znaczenie przemysłowe, dlatego powtarzalna i dokładna parametryzacja katalizy enzymatycznej jest bardzo istotna nie tylko w badaniach podstawowych, ale też wdrożeniowych. Najbardziej popularna w enzymologii metoda detekcji spektrofotometrycznej, mimo niskich kosztów i szybkości, często nie może być zastosowana bezpośrednio z uwagi na nieodpowiednie właściwości spektralne substratów i produktów. Konieczne jest wtedy korzystanie z pomocniczych enzymów, modyfikacji chemicznej substratów, bądź analizy poreakcyjnej, np. przy użyciu spektrometrii mas, co może zwiększać koszty pomiaru, wydłużać jego czas, bądź wpływać na dokładność oznaczeń. Izotermiczna kalorymetria miareczkowa jest metodą rozpowszechnioną głównie w celu charakterystyki oddziaływań między-molekularnych, jednakże jej użycie w kinetyce enzymatycznej zdobywa coraz większe uznanie z uwagi na bezpośredni pomiar prędkości reakcji przy użyciu uniwersalnego parametru jakim jest ciepło, brak konieczności stosowania sztucznych substratów lub przetwarzania poreakcyjnego, a także wysoką czułość i niskie zużycie reagentów. Niniejsza praca omawia dwie strategie przeprowadzania kinetycznego eksperymentu kalorymetrycznego,  a także ich przykładowe zastosowania.

Identifiants

pubmed: 39083463
doi: 10.18388/pb.2021_529
doi:

Substances chimiques

Enzymes 0

Types de publication

Journal Article Review English Abstract

Langues

pol

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

223-229

Auteurs

Joanna Śliwiak (J)

Pracownia Inżynierii Białek, Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu.

Anna Urbanowicz (A)

Pracownia Inżynierii Białek, Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu.

Articles similaires

Anthraquinones Kinetics Water Purification Adsorption Thermodynamics
1.00
Humans Pyrophosphatases Protein Conformation Molecular Dynamics Simulation Kinetics
1.00
Calcium Carbonate Peptoids Carbon Dioxide Crystallization Microscopy, Atomic Force
Xylitol Zea mays Polysaccharides Xylose Candida tropicalis

Classifications MeSH