Titre : Transgènes

Transgènes : Questions médicales fréquentes

Termes MeSH sélectionnés :

RNA Editing
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Sources (10000 au total)

FLARE: a fast and flexible workflow for identifying RNA editing foci.

Fusion of RNA-binding proteins (RBPs) to RNA base-editing enzymes (such as APOBEC1 or ADAR) has emerged as a powerful tool for the discovery of RBP binding sites. However, current methods that analyze... We present FLagging Areas of RNA-editing Enrichment (FLARE), a Snakemake-based pipeline that builds on the outputs of the SAILOR edit site discovery tool to identify regions statistically enriched for... FLARE is a fast and flexible workflow that identifies significantly edited regions from RNA-seq data. The FLARE codebase is available at https://github.com/YeoLab/FLARE ....