NMR "Crystallography" for Uniformly (
dipolar couplings
membrane proteins
nuclear magnetic resonance
oriented samples
structure determination
Journal
Angewandte Chemie (International ed. in English)
ISSN: 1521-3773
Titre abrégé: Angew Chem Int Ed Engl
Pays: Germany
ID NLM: 0370543
Informations de publication
Date de publication:
24 02 2020
24 02 2020
Historique:
received:
26
11
2019
revised:
29
12
2019
pubmed:
31
12
2019
medline:
4
2
2021
entrez:
31
12
2019
Statut:
ppublish
Résumé
In oriented-sample (OS) solid-state NMR of membrane proteins, the angular-dependent dipolar couplings and chemical shifts provide a direct input for structure calculations. However, so far only
Identifiants
pubmed: 31887238
doi: 10.1002/anie.201915110
doi:
Substances chimiques
Carbon Isotopes
0
Lipid Bilayers
0
Membrane Proteins
0
Nitrogen Isotopes
0
Nitrogen-15
0
Viral Proteins
0
Carbon-13
FDJ0A8596D
Types de publication
Journal Article
Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
Langues
eng
Sous-ensembles de citation
IM
Pagination
3554-3557Informations de copyright
© 2019 Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim.
Références
S. H. White, W. C. Wimley, Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1999, 28, 319-365.
B. Bechinger, Curr. Opin. Chem. Biol. 2000, 4, 639-644.
A. G. Lee, Biochem. Soc. Trans. 2011, 39, 761-766.
A. Laganowsky, E. Reading, T. M. Allison, M. B. Ulmschneider, M. T. Degiacomi, A. J. Baldwin, C. V. Robinson, Nature 2014, 510, 172-175.
P. J. Hamilton, A. N. Belovich, G. Khelashvili, C. Saunders, K. Erreger, J. A. Javitch, H. H. Sitte, H. Weinstein, H. J. G. Matthies, A. Galli, Nat. Chem. Biol. 2014, 10, 582-589.
C. Martens, R. A. Stein, M. Masureel, A. Roth, S. Mishra, R. Dawaliby, A. Konijnenberg, F. Sobott, C. Govaerts, H. S. Mchaourab, Nat. Struct. Mol. Biol. 2016, 23, 744-751.
N. J. Traaseth, L. Shi, R. Verardi, D. G. Mullen, G. Barany, G. Veglia, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 10165-10170.
L. C. Shi, E. M. R. Lake, M. A. M. Ahmed, L. S. Brown, V. Ladizhansky, Biochim. Biophys. Acta Biomembr. 2009, 1788, 2563-2574.
S. D. Cady, K. Schmidt-Rohr, J. Wang, C. S. Soto, W. F. DeGrado, M. Hong, Nature 2010, 463, 689-692.
M. Sharma, M. G. Yi, H. Dong, H. J. Qin, E. Peterson, D. D. Busath, H. X. Zhou, T. A. Cross, Science 2010, 330, 509-512.
S. H. Park, B. B. Das, F. Casagrande, Y. Tian, H. J. Nothnagel, M. N. Chu, H. Kiefer, K. Maier, A. A. De Angelis, F. M. Marassi, S. J. Opella, Nature 2012, 491, 779-783.
M. Renault, M. P. Bos, J. Tommassen, M. Baldus, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 4175-4177.
S. L. Wang, R. A. Munro, L. C. Shi, I. Kawamura, T. Okitsu, A. Wada, S. Y. Kim, K. H. Jung, L. S. Brown, V. Ladizhansky, Nat. Methods 2013, 10, 1007-1012.
M. R. Elkins, J. K. Williams, M. D. Gelenter, P. Dai, B. Kwon, I. V. Sergeyev, B. L. Pentelute, M. Hong, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2017, 114, 12946-12951.
C. H. Wu, A. Ramamoorthy, S. J. Opella, J. Magn. Reson. Ser. A 1994, 109, 270-272.
S. V. Dvinskikh, D. Sandström, J. Magn. Reson. 2005, 175, 163-169.
S. V. Dvinskikh, K. Yamamoto, A. Ramamoorthy, J. Chem. Phys. 2006, 125, 034507.
A. A. Nevzorov, S. J. Opella, J. Magn. Reson. 2003, 164, 182-186.
A. A. Nevzorov, S. J. Opella, J. Magn. Reson. 2007, 185, 59-70.
T. Gopinath, G. Veglia, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 5754-5756.
S. Jayanthi, K. V. Ramanathan, J. Chem. Phys. 2010, 132, 134501.
S. Jayanthi, N. Sinha, K. V. Ramanathan, J. Magn. Reson. 2010, 207, 206-212.
S. H. Park, A. A. De Angelis, A. A. Nevzorov, C. H. Wu, S. J. Opella, Biophys. J. 2006, 91, 3032-3042.
A. A. De Angelis, S. C. Howell, A. A. Nevzorov, S. J. Opella, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 12256-12267.
R. Mahalakshmi, F. M. Marassi, Biochemistry 2008, 47, 6531-6538.
K. Bertelsen, B. Paaske, L. Thogersen, E. Tajkhorshid, B. Schiott, T. Skrydstrup, N. C. Nielsen, T. Vosegaard, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 18335-18342.
E. S. Salnikov, C. Aisenbrey, F. Aussenac, O. Ouari, H. Sarrouj, C. Reiter, P. Tordo, F. Engelke, B. Bechinger, Sci. Rep. 2016, 6, 20895.
S. H. Park, F. M. Marassi, D. Black, S. J. Opella, Biophys. J. 2010, 99, 1465-1474.
T. H. Walther, S. L. Grage, N. Roth, A. S. Ulrich, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 15945-15956.
K. R. Mote, T. Gopinath, N. J. Traaseth, J. Kitchen, P. L. Gor'kov, W. W. Brey, G. Veglia, J. Biomol. NMR 2011, 51, 339-346.
N. J. Gleason, V. V. Vostrikov, D. V. Greathouse, R. E. Koeppe, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2013, 110, 1692-1695.
A. Gayen, J. R. Banigan, N. J. Traaseth, Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 10321-10324;
Angew. Chem. 2013, 125, 10511-10514.
K. Yamamoto, M. Gildenberg, S. Ahuja, S. C. Im, P. Pearcy, L. Waskell, A. Ramamoorthy, Sci. Rep. 2013, 3, 2556.
D. T. Murray, C. Li, F. P. Gao, H. Qin, T. A. Cross, Biophys. J. 2014, 106, 1559-1569.
T. Vosegaard, N. C. Nielsen, J. Biomol. NMR 2002, 22, 225-247.
Y. Y. Yin, A. A. Nevzorov, J. Magn. Reson. 2011, 212, 64-73.
J. Lapin, A. A. Nevzorov, J. Biomol. NMR 2019, 73, 229-244.
Z. T. Gu, S. J. Opella, J. Magn. Reson. 1999, 140, 340-346.
N. Sinha, C. V. Grant, S. H. Park, J. M. Brown, S. J. Opella, J. Magn. Reson. 2007, 186, 51-64.
W. X. Tang, R. W. Knox, A. A. Nevzorov, J. Biomol. NMR 2012, 54, 307-316.
G. J. Lu, S. J. Opella, J. Biomol. NMR 2014, 58, 69-81.
J. Lapin, A. A. Nevzorov, J. Magn. Reson. 2018, 293, 104-114.
A. A. Nevzorov, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 11282-11283.
B. M. Fung, A. K. Khitrin, K. Ermolaev, J. Magn. Reson. 2000, 142, 97-101.
Z. Gan, J. Magn. Reson. 2000, 143, 136-143.
J. R. Tolman, J. M. Flanagan, M. A. Kennedy, J. H. Prestegard, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 9279-9283.
V. Yarov-Yarovoy, J. Schonbrun, D. Baker, Proteins Struct. Funct. Bioinf. 2006, 62, 1010-1025.
A. Leaver-Fay, M. J. O'Meara, M. Tyka, R. Jacak, Y. F. Song, E. H. Kellogg, J. Thompson, I. W. Davis, R. A. Pache, S. Lyskov, J. J. Gray, T. Kortemme, J. S. Richardson, J. J. Havranek, J. Snoeyink, D. Baker, B. Kuhlman in Methods in Protein Design, Vol. 523 (Ed.: A. E. Keating), Academic Press, San Diego, CA, 2013, pp. 109-143.
A. Shmygelska, M. Levitt, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 1415-1420.
S. J. Opella, A. C. Zeri, S. H. Park, Annu. Rev. Phys. Chem. 2008, 59, 635-657.
M. F. Mesleh, S. J. Opella, J. Magn. Reson. 2003, 163, 288-299.