Titre : Signaux de polyadénylation

Signaux de polyadénylation : Questions médicales fréquentes

Termes MeSH sélectionnés :

Sequence Analysis, RNA

Questions fréquentes et termes MeSH associés

Diagnostic 5

#1

Comment identifier les signaux de polyadénylation ?

L'analyse bioinformatique et les séquençages d'ARN permettent d'identifier ces signaux.
ARN Séquençage Bioinformatique
#2

Quels tests sont utilisés pour étudier la polyadénylation ?

Les tests RT-PCR et Northern blot sont couramment utilisés pour étudier la polyadénylation.
RT-PCR Northern blot Polyadénylation
#3

Les signaux de polyadénylation sont-ils visibles sur des gels ?

Oui, les produits de polyadénylation peuvent être visualisés sur des gels d'agarose après électrophorèse.
Électrophorèse Agarose ARN
#4

Peut-on détecter des anomalies dans la polyadénylation ?

Des anomalies peuvent être détectées par des variations dans la taille des ARNm sur des gels.
Anomalies ARNm Électrophorèse
#5

Quels marqueurs indiquent une polyadénylation efficace ?

La présence d'une queue poly-A et la stabilité de l'ARNm sont des marqueurs d'efficacité.
Queue poly-A Stabilité de l'ARN ARNm

Symptômes 5

#1

Quels symptômes sont liés à des défauts de polyadénylation ?

Des défauts peuvent entraîner une instabilité de l'ARNm, affectant la synthèse protéique.
Instabilité de l'ARNm Synthèse protéique Défauts
#2

Les maladies génétiques sont-elles liées à la polyadénylation ?

Oui, certaines maladies génétiques peuvent résulter de mutations affectant les signaux de polyadénylation.
Maladies génétiques Mutations Polyadénylation
#3

Comment la polyadénylation affecte-t-elle le cancer ?

Des altérations dans la polyadénylation peuvent conduire à une expression aberrante de gènes oncogènes.
Cancer Gènes oncogènes Expression génique
#4

Y a-t-il des symptômes associés à des ARNm instables ?

Oui, des ARNm instables peuvent entraîner des troubles métaboliques et des anomalies cellulaires.
Troubles métaboliques Anomalies cellulaires ARNm instables
#5

Les infections virales affectent-elles la polyadénylation ?

Certaines infections virales peuvent perturber les signaux de polyadénylation, affectant l'hôte.
Infections virales Perturbation Hôte

Prévention 5

#1

Peut-on prévenir les anomalies de polyadénylation ?

La prévention passe par une bonne santé génétique et des dépistages précoces des maladies.
Prévention Santé génétique Dépistages
#2

Quel rôle joue l'alimentation dans la polyadénylation ?

Une alimentation équilibrée peut influencer positivement la régulation des gènes liés à la polyadénylation.
Alimentation Régulation des gènes Polyadénylation
#3

Les facteurs environnementaux affectent-ils la polyadénylation ?

Oui, des facteurs comme les toxines peuvent perturber les mécanismes de polyadénylation.
Facteurs environnementaux Toxines Perturbation
#4

Comment le stress oxydatif influence-t-il la polyadénylation ?

Le stress oxydatif peut endommager l'ADN et affecter les signaux de polyadénylation.
Stress oxydatif ADN Signaux
#5

Les vaccinations influencent-elles la polyadénylation ?

Certaines recherches suggèrent que les vaccinations peuvent moduler l'expression des gènes liés.
Vaccinations Expression des gènes Modulation

Traitements 5

#1

Existe-t-il des traitements pour les anomalies de polyadénylation ?

Actuellement, il n'existe pas de traitements spécifiques, mais des thérapies géniques sont explorées.
Thérapies géniques Anomalies Traitements
#2

Comment les médicaments peuvent-ils influencer la polyadénylation ?

Certains médicaments peuvent moduler l'expression des gènes impliqués dans la polyadénylation.
Médicaments Expression génique Modulation
#3

Les thérapies ciblées peuvent-elles aider ?

Oui, les thérapies ciblées peuvent potentiellement corriger les défauts de polyadénylation.
Thérapies ciblées Défauts Polyadénylation
#4

Y a-t-il des approches expérimentales en cours ?

Des recherches sur des inhibiteurs spécifiques de la polyadénylation sont en cours dans des modèles précliniques.
Inhibiteurs Recherches Modèles précliniques
#5

Les suppléments nutritionnels peuvent-ils aider ?

Certaines études suggèrent que des nutriments spécifiques pourraient soutenir la polyadénylation.
Suppléments nutritionnels Soutien Polyadénylation

Complications 5

#1

Quelles complications peuvent survenir avec des défauts de polyadénylation ?

Des complications incluent des troubles métaboliques, des cancers et des maladies neurodégénératives.
Troubles métaboliques Cancers Maladies neurodégénératives
#2

Les complications sont-elles réversibles ?

Certaines complications peuvent être gérées, mais d'autres peuvent être irréversibles selon la gravité.
Réversibilité Gestion Gravité
#3

Comment les complications affectent-elles la qualité de vie ?

Les complications peuvent réduire la qualité de vie en limitant les capacités fonctionnelles.
Qualité de vie Capacités fonctionnelles Complications
#4

Y a-t-il des risques de complications à long terme ?

Oui, des risques de complications à long terme existent, notamment des cancers et des maladies chroniques.
Risques Complications à long terme Maladies chroniques
#5

Les complications peuvent-elles être prévenues ?

Certaines complications peuvent être prévenues par un suivi médical régulier et des interventions précoces.
Prévention Suivi médical Interventions

Facteurs de risque 5

#1

Quels sont les facteurs de risque pour les anomalies de polyadénylation ?

Les facteurs incluent des mutations génétiques, des expositions environnementales et des infections.
Facteurs de risque Mutations génétiques Infections
#2

L'âge est-il un facteur de risque ?

Oui, l'âge avancé peut augmenter le risque de mutations affectant la polyadénylation.
Âge Mutations Risque
#3

Les habitudes de vie influencent-elles la polyadénylation ?

Des habitudes comme le tabagisme et l'alcoolisme peuvent affecter les mécanismes de polyadénylation.
Habitudes de vie Tabagisme Alcoolisme
#4

Les maladies chroniques augmentent-elles les risques ?

Oui, certaines maladies chroniques peuvent prédisposer à des anomalies de polyadénylation.
Maladies chroniques Prédisposition Anomalies
#5

Les facteurs génétiques jouent-ils un rôle ?

Oui, des antécédents familiaux de maladies peuvent augmenter le risque d'anomalies de polyadénylation.
Facteurs génétiques Antécédents familiaux Risque
{ "@context": "https://schema.org", "@graph": [ { "@type": "MedicalWebPage", "name": "Signaux de polyadénylation : Questions médicales les plus fréquentes", "headline": "Signaux de polyadénylation : Comprendre les symptômes, diagnostics et traitements", "description": "Guide complet et accessible sur les Signaux de polyadénylation : explications, diagnostics, traitements et prévention. Information médicale validée destinée aux patients.", "datePublished": "2024-07-02", "dateModified": "2025-03-29", "inLanguage": "fr", "medicalAudience": [ { "@type": "MedicalAudience", "name": "Grand public", "audienceType": "Patient", "healthCondition": { "@type": "MedicalCondition", "name": "Signaux de polyadénylation" }, "suggestedMinAge": 18, "suggestedGender": "unisex" }, { "@type": "MedicalAudience", "name": "Médecins", "audienceType": "Physician", "geographicArea": { "@type": "AdministrativeArea", "name": "France" } }, { "@type": "MedicalAudience", "name": "Chercheurs", "audienceType": "Researcher", "geographicArea": { "@type": "AdministrativeArea", "name": "International" } } ], "reviewedBy": { "@type": "Person", "name": "Dr Olivier Menir", "jobTitle": "Expert en Médecine", "description": "Expert en Médecine, Optimisation des Parcours de Soins et Révision Médicale", "url": "/static/pages/docteur-olivier-menir.html", "alumniOf": { "@type": "EducationalOrganization", "name": "Université Paris Descartes" } }, "isPartOf": { "@type": "MedicalWebPage", "name": "Composants de gène", "url": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D040461", "about": { "@type": "MedicalCondition", "name": "Composants de gène", "code": { "@type": "MedicalCode", "code": "D040461", "codingSystem": "MeSH" }, "identifier": { "@type": "PropertyValue", "propertyID": "MeSH Tree", "value": "G05.360.340.024.340.137" } } }, "about": { "@type": "MedicalCondition", "name": "Signaux de polyadénylation", "alternateName": "RNA 3' Polyadenylation Signals", "code": { "@type": "MedicalCode", "code": "D039104", "codingSystem": "MeSH" } }, "author": [ { "@type": "Person", "name": "Xiaohui Wu", "url": "https://questionsmedicales.fr/author/Xiaohui%20Wu", "affiliation": { "@type": "Organization", "name": "Department of Automation, Xiamen University, Xiamen, China." } }, { "@type": "Person", "name": "Guoli Ji", "url": "https://questionsmedicales.fr/author/Guoli%20Ji", "affiliation": { "@type": "Organization", "name": "Department of Automation, Xiamen University, Xiamen, China." } }, { "@type": "Person", "name": "Congting Ye", "url": "https://questionsmedicales.fr/author/Congting%20Ye", "affiliation": { "@type": "Organization", "name": "National Institute for Data Science in Health and Medicine, Xiamen University, Xiamen, China." } }, { "@type": "Person", "name": "Bin Tian", "url": "https://questionsmedicales.fr/author/Bin%20Tian", "affiliation": { "@type": "Organization", "name": "Gene Expression and Regulation Program, The Wistar Institute, Philadelphia, PA 19104, USA." } }, { "@type": "Person", "name": "Mihaela Zavolan", "url": "https://questionsmedicales.fr/author/Mihaela%20Zavolan", "affiliation": { "@type": "Organization", "name": "Computational and Systems Biology, Biozentrum, University of Basel, Spitalstrasse 41, 4056 Basel, Switzerland." } } ], "citation": [ { "@type": "ScholarlyArticle", "name": "mRNA vaccine quality analysis using RNA sequencing.", "datePublished": "2023-09-21", "url": "https://questionsmedicales.fr/article/37735471", "identifier": { "@type": "PropertyValue", "propertyID": "DOI", "value": "10.1038/s41467-023-41354-y" } }, { "@type": "ScholarlyArticle", "name": "Small RNA transcriptome analysis using parallel single-cell small RNA sequencing.", "datePublished": "2023-05-09", "url": "https://questionsmedicales.fr/article/37160973", "identifier": { "@type": "PropertyValue", "propertyID": "DOI", "value": "10.1038/s41598-023-34390-7" } }, { "@type": "ScholarlyArticle", "name": "Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis reveals diagnostic and prognostic signatures and immunoinfiltration in gastric cancer.", "datePublished": "2023-07-09", "url": "https://questionsmedicales.fr/article/37450965", "identifier": { "@type": "PropertyValue", "propertyID": "DOI", "value": "10.1016/j.compbiomed.2023.107239" } }, { "@type": "ScholarlyArticle", "name": "REPAC: analysis of alternative polyadenylation from RNA-sequencing data.", "datePublished": "2023-02-09", "url": "https://questionsmedicales.fr/article/36759904", "identifier": { "@type": "PropertyValue", "propertyID": "DOI", "value": "10.1186/s13059-023-02865-5" } }, { "@type": "ScholarlyArticle", "name": "Comparison of RNA-Sequencing Methods for Degraded RNA.", "datePublished": "2024-06-02", "url": "https://questionsmedicales.fr/article/38892331", "identifier": { "@type": "PropertyValue", "propertyID": "DOI", "value": "10.3390/ijms25116143" } } ], "breadcrumb": { "@type": "BreadcrumbList", "itemListElement": [ { "@type": "ListItem", "position": 1, "name": "questionsmedicales.fr", "item": "https://questionsmedicales.fr" }, { "@type": "ListItem", "position": 2, "name": "Phénomènes génétiques", "item": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D055614" }, { "@type": "ListItem", "position": 3, "name": "Structures génétiques", "item": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D040342" }, { "@type": "ListItem", "position": 4, "name": "Génome", "item": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D016678" }, { "@type": "ListItem", "position": 5, "name": "Composants de génome", "item": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D040481" }, { "@type": "ListItem", "position": 6, "name": "Gènes", "item": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D005796" }, { "@type": "ListItem", "position": 7, "name": "Composants de gène", "item": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D040461" }, { "@type": "ListItem", "position": 8, "name": "Signaux de polyadénylation", "item": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D039104" } ] } }, { "@type": "MedicalWebPage", "name": "Article complet : Signaux de polyadénylation - Questions et réponses", "headline": "Questions et réponses médicales fréquentes sur Signaux de polyadénylation", "description": "Une compilation de questions et réponses structurées, validées par des experts médicaux.", "datePublished": "2025-05-01", "inLanguage": "fr", "hasPart": [ { "@type": "MedicalWebPage", "name": "Diagnostic", "headline": "Diagnostic sur Signaux de polyadénylation", "description": "Comment identifier les signaux de polyadénylation ?\nQuels tests sont utilisés pour étudier la polyadénylation ?\nLes signaux de polyadénylation sont-ils visibles sur des gels ?\nPeut-on détecter des anomalies dans la polyadénylation ?\nQuels marqueurs indiquent une polyadénylation efficace ?", "url": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D039104?mesh_terms=Sequence+Analysis,+RNA#section-diagnostic" }, { "@type": "MedicalWebPage", "name": "Symptômes", "headline": "Symptômes sur Signaux de polyadénylation", "description": "Quels symptômes sont liés à des défauts de polyadénylation ?\nLes maladies génétiques sont-elles liées à la polyadénylation ?\nComment la polyadénylation affecte-t-elle le cancer ?\nY a-t-il des symptômes associés à des ARNm instables ?\nLes infections virales affectent-elles la polyadénylation ?", "url": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D039104?mesh_terms=Sequence+Analysis,+RNA#section-symptômes" }, { "@type": "MedicalWebPage", "name": "Prévention", "headline": "Prévention sur Signaux de polyadénylation", "description": "Peut-on prévenir les anomalies de polyadénylation ?\nQuel rôle joue l'alimentation dans la polyadénylation ?\nLes facteurs environnementaux affectent-ils la polyadénylation ?\nComment le stress oxydatif influence-t-il la polyadénylation ?\nLes vaccinations influencent-elles la polyadénylation ?", "url": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D039104?mesh_terms=Sequence+Analysis,+RNA#section-prévention" }, { "@type": "MedicalWebPage", "name": "Traitements", "headline": "Traitements sur Signaux de polyadénylation", "description": "Existe-t-il des traitements pour les anomalies de polyadénylation ?\nComment les médicaments peuvent-ils influencer la polyadénylation ?\nLes thérapies ciblées peuvent-elles aider ?\nY a-t-il des approches expérimentales en cours ?\nLes suppléments nutritionnels peuvent-ils aider ?", "url": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D039104?mesh_terms=Sequence+Analysis,+RNA#section-traitements" }, { "@type": "MedicalWebPage", "name": "Complications", "headline": "Complications sur Signaux de polyadénylation", "description": "Quelles complications peuvent survenir avec des défauts de polyadénylation ?\nLes complications sont-elles réversibles ?\nComment les complications affectent-elles la qualité de vie ?\nY a-t-il des risques de complications à long terme ?\nLes complications peuvent-elles être prévenues ?", "url": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D039104?mesh_terms=Sequence+Analysis,+RNA#section-complications" }, { "@type": "MedicalWebPage", "name": "Facteurs de risque", "headline": "Facteurs de risque sur Signaux de polyadénylation", "description": "Quels sont les facteurs de risque pour les anomalies de polyadénylation ?\nL'âge est-il un facteur de risque ?\nLes habitudes de vie influencent-elles la polyadénylation ?\nLes maladies chroniques augmentent-elles les risques ?\nLes facteurs génétiques jouent-ils un rôle ?", "url": "https://questionsmedicales.fr/mesh/D039104?mesh_terms=Sequence+Analysis,+RNA#section-facteurs de risque" } ] }, { "@type": "FAQPage", "mainEntity": [ { "@type": "Question", "name": "Comment identifier les signaux de polyadénylation ?", "position": 1, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "L'analyse bioinformatique et les séquençages d'ARN permettent d'identifier ces signaux." } }, { "@type": "Question", "name": "Quels tests sont utilisés pour étudier la polyadénylation ?", "position": 2, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Les tests RT-PCR et Northern blot sont couramment utilisés pour étudier la polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Les signaux de polyadénylation sont-ils visibles sur des gels ?", "position": 3, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, les produits de polyadénylation peuvent être visualisés sur des gels d'agarose après électrophorèse." } }, { "@type": "Question", "name": "Peut-on détecter des anomalies dans la polyadénylation ?", "position": 4, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des anomalies peuvent être détectées par des variations dans la taille des ARNm sur des gels." } }, { "@type": "Question", "name": "Quels marqueurs indiquent une polyadénylation efficace ?", "position": 5, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "La présence d'une queue poly-A et la stabilité de l'ARNm sont des marqueurs d'efficacité." } }, { "@type": "Question", "name": "Quels symptômes sont liés à des défauts de polyadénylation ?", "position": 6, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des défauts peuvent entraîner une instabilité de l'ARNm, affectant la synthèse protéique." } }, { "@type": "Question", "name": "Les maladies génétiques sont-elles liées à la polyadénylation ?", "position": 7, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, certaines maladies génétiques peuvent résulter de mutations affectant les signaux de polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Comment la polyadénylation affecte-t-elle le cancer ?", "position": 8, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des altérations dans la polyadénylation peuvent conduire à une expression aberrante de gènes oncogènes." } }, { "@type": "Question", "name": "Y a-t-il des symptômes associés à des ARNm instables ?", "position": 9, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, des ARNm instables peuvent entraîner des troubles métaboliques et des anomalies cellulaires." } }, { "@type": "Question", "name": "Les infections virales affectent-elles la polyadénylation ?", "position": 10, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Certaines infections virales peuvent perturber les signaux de polyadénylation, affectant l'hôte." } }, { "@type": "Question", "name": "Peut-on prévenir les anomalies de polyadénylation ?", "position": 11, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "La prévention passe par une bonne santé génétique et des dépistages précoces des maladies." } }, { "@type": "Question", "name": "Quel rôle joue l'alimentation dans la polyadénylation ?", "position": 12, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Une alimentation équilibrée peut influencer positivement la régulation des gènes liés à la polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Les facteurs environnementaux affectent-ils la polyadénylation ?", "position": 13, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, des facteurs comme les toxines peuvent perturber les mécanismes de polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Comment le stress oxydatif influence-t-il la polyadénylation ?", "position": 14, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Le stress oxydatif peut endommager l'ADN et affecter les signaux de polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Les vaccinations influencent-elles la polyadénylation ?", "position": 15, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Certaines recherches suggèrent que les vaccinations peuvent moduler l'expression des gènes liés." } }, { "@type": "Question", "name": "Existe-t-il des traitements pour les anomalies de polyadénylation ?", "position": 16, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Actuellement, il n'existe pas de traitements spécifiques, mais des thérapies géniques sont explorées." } }, { "@type": "Question", "name": "Comment les médicaments peuvent-ils influencer la polyadénylation ?", "position": 17, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Certains médicaments peuvent moduler l'expression des gènes impliqués dans la polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Les thérapies ciblées peuvent-elles aider ?", "position": 18, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, les thérapies ciblées peuvent potentiellement corriger les défauts de polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Y a-t-il des approches expérimentales en cours ?", "position": 19, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des recherches sur des inhibiteurs spécifiques de la polyadénylation sont en cours dans des modèles précliniques." } }, { "@type": "Question", "name": "Les suppléments nutritionnels peuvent-ils aider ?", "position": 20, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Certaines études suggèrent que des nutriments spécifiques pourraient soutenir la polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Quelles complications peuvent survenir avec des défauts de polyadénylation ?", "position": 21, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des complications incluent des troubles métaboliques, des cancers et des maladies neurodégénératives." } }, { "@type": "Question", "name": "Les complications sont-elles réversibles ?", "position": 22, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Certaines complications peuvent être gérées, mais d'autres peuvent être irréversibles selon la gravité." } }, { "@type": "Question", "name": "Comment les complications affectent-elles la qualité de vie ?", "position": 23, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Les complications peuvent réduire la qualité de vie en limitant les capacités fonctionnelles." } }, { "@type": "Question", "name": "Y a-t-il des risques de complications à long terme ?", "position": 24, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, des risques de complications à long terme existent, notamment des cancers et des maladies chroniques." } }, { "@type": "Question", "name": "Les complications peuvent-elles être prévenues ?", "position": 25, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Certaines complications peuvent être prévenues par un suivi médical régulier et des interventions précoces." } }, { "@type": "Question", "name": "Quels sont les facteurs de risque pour les anomalies de polyadénylation ?", "position": 26, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Les facteurs incluent des mutations génétiques, des expositions environnementales et des infections." } }, { "@type": "Question", "name": "L'âge est-il un facteur de risque ?", "position": 27, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, l'âge avancé peut augmenter le risque de mutations affectant la polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Les habitudes de vie influencent-elles la polyadénylation ?", "position": 28, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Des habitudes comme le tabagisme et l'alcoolisme peuvent affecter les mécanismes de polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Les maladies chroniques augmentent-elles les risques ?", "position": 29, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, certaines maladies chroniques peuvent prédisposer à des anomalies de polyadénylation." } }, { "@type": "Question", "name": "Les facteurs génétiques jouent-ils un rôle ?", "position": 30, "acceptedAnswer": { "@type": "Answer", "text": "Oui, des antécédents familiaux de maladies peuvent augmenter le risque d'anomalies de polyadénylation." } } ] } ] }
Dr Olivier Menir

Contenu validé par Dr Olivier Menir

Expert en Médecine, Optimisation des Parcours de Soins et Révision Médicale


Validation scientifique effectuée le 29/03/2025

Contenu vérifié selon les dernières recommandations médicales

Auteurs principaux

Xiaohui Wu

6 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Automation, Xiamen University, Xiamen, China.
  • National Institute for Data Science in Health and Medicine, Xiamen University, Xiamen, China.
  • Innovation Center for Cell Signaling Network, Xiamen University, Xiamen, China.

Guoli Ji

6 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Automation, Xiamen University, Xiamen, China.
  • National Institute for Data Science in Health and Medicine, Xiamen University, Xiamen, China.
  • Innovation Center for Cell Signaling Network, Xiamen University, Xiamen, China.

Congting Ye

5 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • National Institute for Data Science in Health and Medicine, Xiamen University, Xiamen, China.
  • Key Laboratory of the Ministry of Education for Coastal and Wetland Ecosystems, College of the Environment and Ecology, Xiamen University, Xiamen, China.

Mihaela Zavolan

5 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Computational and Systems Biology, Biozentrum, University of Basel, Spitalstrasse 41, 4056 Basel, Switzerland.
  • Swiss Institute of Bioinformatics, Biozentrum, University of Basel, Spitalstrasse 41, 4056 Basel, Switzerland.

Wenbin Ye

4 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Automation, Xiamen University, Xiamen 361005, China.
  • Xiamen Research Institute of National Center of Healthcare Big Data, Xiamen 361005, China.

Christina J Herrmann

4 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Computational and Systems Biology, Biozentrum, University of Basel, Spitalstrasse 41, 4056 Basel, Switzerland.
  • Swiss Institute of Bioinformatics, Biozentrum, University of Basel, Spitalstrasse 41, 4056 Basel, Switzerland.

Alexander Kanitz

4 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Computational and Systems Biology, Biozentrum, University of Basel, Spitalstrasse 41, 4056 Basel, Switzerland.
  • Swiss Institute of Bioinformatics, Biozentrum, University of Basel, Spitalstrasse 41, 4056 Basel, Switzerland.

Matthew R Gazzara

3 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Biochemistry and Biophysics, Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA 19104, USA; Graduate Group in Genomics and Computational Biology, Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA 19104, USA.

Sven Danckwardt

3 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Institute for Clinical Chemistry and Laboratory Medicine, University Medical Center of the Johannes Gutenberg University, 55131 Mainz, Germany.
  • Center for Thrombosis and Hemostasis (CTH), University Medical Center of the Johannes Gutenberg University, 55131 Mainz, Germany.
  • German Center for Cardiovascular Research (DZHK), Rhine-Main, Germany.

Hongjuan Fu

3 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Automation, Xiamen University, Xiamen, China.

Dinghai Zheng

3 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Microbiology, Biochemistry and Molecular Genetics, Rutgers New Jersey Medical School, Newark, NJ 07103, USA.

Kevin Struhl

3 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts, USA.
Publications dans "Signaux de polyadénylation" :

Gregor Rot

3 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Institute of Molecular Life Sciences, Winterthurerstrasse 190, 8057 Zurich, Switzerland.
  • Swiss Institute of Bioinformatics, Amphipôle, Quartier UNIL-Sorge, 1015 Lausanne, Switzerland.

Joseph V Geisberg

3 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology, Harvard Medical Schoolgrid.471403.5, Boston, Massachusetts, USA.
Publications dans "Signaux de polyadénylation" :

Zarmik Moqtaderi

3 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology, Harvard Medical Schoolgrid.471403.5, Boston, Massachusetts, USA.
Publications dans "Signaux de polyadénylation" :

Wei Li

3 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Division of Computational Biomedicine, Department of Biological Chemistry, School of Medicine, University of California, Irvine, CA, United States. Electronic address: wei.li@uci.edu.

Leonard Schärfen

3 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Molecular Biophysics & Biochemistry, Yale University, New Haven CT, USA.

Ran Elkon

2 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Department of Human Molecular Genetics and Biochemistry, Sackler School of Medicine, Tel Aviv University, Tel Aviv, Israel.

Stefano Spada

2 publications dans cette catégorie

Affiliations :
  • Institute for Clinical Chemistry and Laboratory Medicine, University Medical Center of the Johannes Gutenberg University, 55131 Mainz, Germany.
  • Center for Thrombosis and Hemostasis (CTH), University Medical Center of the Johannes Gutenberg University, 55131 Mainz, Germany.

Sources (10000 au total)

Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis reveals diagnostic and prognostic signatures and immunoinfiltration in gastric cancer.

Early diagnosis and prognostic predication of gastric cancer (GC) pose significant challenges in current clinical practice of GC treatments. Therefore, our aim was to explore relevant gene signatures ... Here, we established a single-cell transcriptional atlas of GC, focusing on the expression of T-cell-related genes for cell-cell communication analysis, trajectory analysis, and transcription factor r... Based on 10 tumor samples and corresponding normal samples from GC patients, we selected 18,416 cells for subsequent analysis using single-cell sequencing. From these, we identified 3,284 T-cells and ... This study explored prognostic gene signatures associated with T-cells in GC patients, providing insights into predicting patients' survival rates and immunoinfiltration levels....

ROGUE: an R Shiny app for RNA sequencing analysis and biomarker discovery.

The growing power and ever decreasing cost of RNA sequencing (RNA-Seq) technologies have resulted in an explosion of RNA-Seq data production. Comparing gene expression values within RNA-Seq datasets i... Here, we describe ROGUE (RNA-Seq Ontology Graphic User Environment, https://marisshiny.... chop.edu/ROGUE/ ), a user-friendly R Shiny application that allows a biologist to perform differentially expressed gene analysis, gene ontology and pathway enrichment analysis, potential biomarker ide... User-friendly tools for the analysis of next generation sequencing data, such as ROGUE, will allow biologists to efficiently explore their datasets, discover expression patterns, and advance their res...

CLN3 transcript complexity revealed by long-read RNA sequencing analysis.

Batten disease is a group of rare inherited neurodegenerative diseases. Juvenile CLN3 disease is the most prevalent type, and the most common pathogenic variant shared by most patients is the "1-kb" d... We leveraged PacBio long-read RNA sequencing datasets from ENCODE to investigate the full range of CLN3 transcripts across various tissues and cell types in human control samples. Then we sought to va... We found that a readthrough gene affects the quantification and annotation of CLN3. After taking this into account, we detected over 100 novel CLN3 transcripts, with no dominantly expressed CLN3 trans... Overall, these findings provide valuable insights into the complexity of CLN3 transcription, highlighting the importance of studying both canonical and non-canonical CLN3 protein isoforms as well as t...

Full-length transcriptome combined with RNA sequence analysis of Fraxinus chinensis.

The dry root or stem bark of Fraxinus chinensis is a famous herb Qin Pi which is known for its anti-inflammatory, analgesic, anti-tumor, liver protective and diuretic pharmacological effects, the fund... To generate a complete transcriptome of Fraxinus chinensis and to clarify the differentially expressed genes (DEGs) in leaves and stem barks.... In this study, full-length transcriptome analysis and RNA-Seq were combined to characterize Fraxinus chinensis transcriptome.... A total of 69,145 transcripts were acquired and regarded as reference transcriptome, 67,441 transcripts (97.47%) were annotated to NCBI non-redundant protein (Nr), SwissProt, the Kyoto Encyclopedia of... It laid the foundation for further exploration of the biosynthetic pathway of phenylpropanoids and related key enzyme genes....

RNA Sequencing and Gene Ontology Analysis in Acute Invasive Fungal Sinusitis.

Acute invasive fungal sinusitis (AIFS) is an aggressive and dangerous disease of the paranasal sinuses with high morbidity and mortality. The immune response at the level of the nasal mucosa, the site... To evaluate differential gene expression in the sinonasal mucosa of AIFS patients as compared to control patients using RNA sequencing.... Sinonasal tissue samples were prospectively obtained from consenting patients undergoing surgery between November, 2020 and November, 2021. RNA extraction and sequencing were performed and differentia... Tissue samples were collected from 4 patients with active AIFS diagnoses, 2 patients with recovered AIFS, 1 patient with a diagnosis of non-invasive fungal ball, and 4 healthy controls. 255 genes were... Transcriptional differences were noted between AIFS and control patients in sinonasal tissue samples. Future work is necessary to determine causes of the differential gene expressions between AIFS and...