Increased diagnostic yield in complex dystonia through exome sequencing.


Journal

Parkinsonism & related disorders
ISSN: 1873-5126
Titre abrégé: Parkinsonism Relat Disord
Pays: England
ID NLM: 9513583

Informations de publication

Date de publication:
05 2020
Historique:
received: 03 12 2019
revised: 27 03 2020
accepted: 03 04 2020
pubmed: 26 4 2020
medline: 13 4 2021
entrez: 26 4 2020
Statut: ppublish

Résumé

A strategy based on targeted gene panel sequencing identifies possibly pathogenic variants in fewer than 20% of cases in early-onset and familial form of dystonia. By using Whole Exome Sequencing (WES), we aimed to identify the missing genetic causes in dystonic patients without diagnosis despite gene panel sequencing. WES was applied to DNA samples from 32 patients with early-onset or familial dystonia investigated by sequencing of a 127 movement disorders-associated gene panel. Dystonia was described according to the familial history, body distribution, evolution pattern, age of onset, associated symptoms and associated movement disorders. Rate of diagnoses was evaluated for each clinical feature. We identified causative variants for 11 patients from 9 families in CTNNB1, SUCLG1, NUS1, CNTNAP1, KCNB1, RELN, GNAO1, HIBCH, ADCK3 genes, yielding an overall diagnostic rate of 34.4%. Diagnostic yield was higher in complex dystonia compared to non-complex dystonia (66.7%-5.9%; p < 0.002), especially in patients showing intellectual disability compared to the patients without intellectual disability (87.5%-16.7%; p < 0.002). Our approach suggests WES as an efficient tool to improve the diagnostic yield after gene panel sequencing in dystonia. Larger study are warranted to confirm a potential genetic overlap between neurodevelopmental diseases and dystonia.

Identifiants

pubmed: 32334381
pii: S1353-8020(20)30098-5
doi: 10.1016/j.parkreldis.2020.04.003
pii:
doi:

Types de publication

Journal Article Research Support, Non-U.S. Gov't

Langues

eng

Sous-ensembles de citation

IM

Pagination

50-56

Informations de copyright

Copyright © 2020 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Déclaration de conflit d'intérêts

Declaration of competing interest T.W. received grants from the Revue Neurologique, the Fondation Planiol and the APTES organizations and travels funding from LVL medical; C.T. received honoraria from Allergan and Merz; A.M. received travel funding from Abbvie; E.R received research support from Merz-Pharma, Orkyn, Aguettant, Elivie, Ipsen, Fondation Desmarest, AMADYS, Agence Nationale de la Recherche and Fonds de Dotation Brou de Laurière; has served on scientific advisory boards for Orkyn, Aguettant, Merz-Pharma and has received honoraria from Orkyn, Aguettant, Merz-Pharma, and Medday-Pharma; S.B. received honoraria from Aguettant and Orkyn and travel funding from Ellivie, Ipsen and Aguettant; V.L. is member of the scientific board of the AFM-Telethon, and received honoraria from PTC Therapeutics, Sarepta Therapeutics, Biogen France SAS, AveXis Inc; M.A. received honoraria from Teva, Merz, AbbVie, Actelion, Johnson and Johnson, Aguettant, Orkyn, LVL, Elivie.N.D, B.K, C.M., L.C, R.L, L.L-F., A.G., C.L., P.B., O.L-B., M-A.S., M.B., E.O., P.N., D.D., G.R., J.C. declare no conflict of interest.

Auteurs

Thomas Wirth (T)

Département de Neurologie, Hôpital de Hautepierre, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France; Unit of Functional Neurosurgery, National Hospital for Neurology and Neurosurgery, London, United Kingdom; Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France. Electronic address: thomas.wirth@etu.unistra.fr.

Christine Tranchant (C)

Département de Neurologie, Hôpital de Hautepierre, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France; Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France.

Nathalie Drouot (N)

Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France.

Boris Keren (B)

APHP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Centre de Référence Déficience Intellectuelle de Causes Rares, GRC UPMC «Déficience Intellectuelle et Autisme», Paris, France.

Cyril Mignot (C)

APHP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Centre de Référence Déficience Intellectuelle de Causes Rares, GRC UPMC «Déficience Intellectuelle et Autisme», Paris, France; Faculté de Médecine de Sorbonne Université, INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, ICM, Paris, France.

Laura Cif (L)

Département de Neurochirurgie, Centre Hospitalier Régional Montpellier, Montpellier, France.

Romain Lefaucheur (R)

Département de neurologie, Hôpitaux Universitaires de Rouen, Rouen, France.

Laurence Lion-François (L)

Service de Neuropédiatrie, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France.

Aurélie Méneret (A)

Faculté de Médecine de Sorbonne Université, INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, ICM, Paris, France; AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Neurologie, Paris, France.

Domitille Gras (D)

Service de Neuropédiatrie, Hôpital Robert Debré, AP-HP, Paris, France.

Emmanuel Roze (E)

Faculté de Médecine de Sorbonne Université, INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, ICM, Paris, France; AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Neurologie, Paris, France.

Cécile Laroche (C)

Département de pédiatrie, hôpital mère enfant, Limoges, France.

Pierre Burbaud (P)

CHU de Bordeaux, Service d'explorations Fonctionnelles du système nerveux, Bordeaux, France.

Stéphanie Bannier (S)

Service de neurologie, Centre hospitalier de la Côte Basque, Bayonne, France.

Ouhaid Lagha-Boukbiza (O)

Département de Neurologie, Hôpital de Hautepierre, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France.

Marie-Aude Spitz (MA)

Service de pédiatrie, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France.

Vincent Laugel (V)

Service de pédiatrie, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France.

Matthieu Bereau (M)

Service de Neurologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon, Besançon, France.

Emmanuelle Ollivier (E)

Institut IMAGINE, IMAGINE Bioinformatics Platform, Université Paris Descartes, Paris, France.

Patrick Nitschke (P)

Institut IMAGINE, IMAGINE Bioinformatics Platform, Université Paris Descartes, Paris, France.

Diane Doummar (D)

Service de Neuropédiatrie, CHU Paris Est-Hôpital Armand-Trousseau, Paris, France.

Gabrielle Rudolf (G)

Département de Neurologie, Hôpital de Hautepierre, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France; Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France.

Mathieu Anheim (M)

Département de Neurologie, Hôpital de Hautepierre, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France; Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France.

Jamel Chelly (J)

Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France; Laboratoire de Diagnostic Génétique, Nouvel Hôpital Civil, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France.

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