Physins in digestive system neoplasms.
The physin family of proteins, synaptophysin (SYP), synaptophysin like 1 (SYPL1), synaptophysin like 2 (SYPL2) and synaptoporin (SYNRP), are tetratransmembrane transport vesicle proteins distributed t...
RNA-Seq : Questions médicales fréquentes
Questions fréquentes et termes MeSH associés
Diagnostic 5
#1
Comment l'RNA-Seq est-il utilisé dans le diagnostic ?
Il permet d'identifier les niveaux d'expression des gènes et les mutations associées.
#2
Quels types de maladies peuvent être diagnostiqués par RNA-Seq ?
Il est utilisé pour des cancers, des maladies génétiques et des infections virales.
#3
L'RNA-Seq peut-il détecter des mutations ?
Oui, il peut identifier des mutations dans les gènes exprimés, influençant le traitement.
#4
Quelle est la précision de l'RNA-Seq pour le diagnostic ?
L'RNA-Seq offre une haute précision pour quantifier l'expression génique.
#5
L'RNA-Seq est-il standardisé pour le diagnostic ?
Il existe des protocoles standardisés, mais leur adoption varie selon les laboratoires.
Symptômes 5
#1
Quels symptômes peuvent être analysés par RNA-Seq ?
L'RNA-Seq peut aider à comprendre les symptômes liés à des déséquilibres d'expression génique.
#2
L'RNA-Seq peut-il identifier des biomarqueurs de symptômes ?
Oui, il peut révéler des biomarqueurs associés à des symptômes spécifiques de maladies.
#3
Peut-on prédire des symptômes futurs avec RNA-Seq ?
L'RNA-Seq peut aider à prédire des symptômes en analysant les profils d'expression génique.
#4
Les symptômes sont-ils liés à l'expression génique ?
Oui, des variations dans l'expression génique peuvent être corrélées à des symptômes cliniques.
#5
L'RNA-Seq peut-il aider à comprendre des symptômes complexes ?
Oui, il permet d'analyser des réseaux de gènes impliqués dans des symptômes complexes.
Prévention 5
#1
L'RNA-Seq peut-il aider à la prévention des maladies ?
Oui, il peut identifier des facteurs de risque génétiques, permettant des mesures préventives.
#2
Comment l'RNA-Seq contribue-t-il à la recherche préventive ?
Il permet d'étudier les mécanismes moléculaires sous-jacents aux maladies pour mieux les prévenir.
#3
Peut-on utiliser RNA-Seq pour le dépistage précoce ?
Oui, il peut être utilisé pour le dépistage précoce de certaines maladies génétiques.
#4
Quels types de prévention sont possibles avec RNA-Seq ?
La prévention ciblée et la surveillance des individus à risque sont possibles grâce à RNA-Seq.
#5
L'RNA-Seq peut-il aider à la prévention des cancers ?
Oui, il peut identifier des biomarqueurs de risque pour des interventions préventives.
Traitements 5
#1
Comment l'RNA-Seq influence-t-il les traitements ?
Il permet de personnaliser les traitements en fonction des profils d'expression génique.
#2
L'RNA-Seq peut-il guider le choix des médicaments ?
Oui, il aide à identifier les médicaments les plus efficaces selon l'expression des gènes.
#3
Quels traitements peuvent être optimisés par RNA-Seq ?
Les traitements du cancer et des maladies auto-immunes peuvent être optimisés grâce à RNA-Seq.
#4
L'RNA-Seq peut-il aider à surveiller l'efficacité des traitements ?
Oui, il permet de suivre les changements d'expression génique en réponse aux traitements.
#5
Y a-t-il des traitements spécifiques basés sur RNA-Seq ?
Des thérapies ciblées sont développées en fonction des résultats d'RNA-Seq pour certains cancers.
Complications 5
#1
Quelles complications peuvent être détectées par RNA-Seq ?
Il peut révéler des complications liées à des mutations génétiques ou à des déséquilibres d'expression.
#2
L'RNA-Seq peut-il prédire des complications ?
Oui, il peut aider à prédire des complications en analysant les profils d'expression génique.
#3
Comment RNA-Seq aide-t-il à gérer les complications ?
Il permet d'adapter les traitements en fonction des complications identifiées par l'analyse.
#4
Y a-t-il des complications spécifiques liées à RNA-Seq ?
Les complications sont généralement liées à l'interprétation des données plutôt qu'à la technique elle-même.
#5
L'RNA-Seq peut-il aider à éviter des complications ?
Oui, en identifiant les risques, il peut contribuer à éviter certaines complications cliniques.
Facteurs de risque 5
#1
Quels facteurs de risque peuvent être identifiés par RNA-Seq ?
Il peut identifier des facteurs génétiques et environnementaux associés à des maladies.
#2
L'RNA-Seq peut-il révéler des risques pour des maladies spécifiques ?
Oui, il peut révéler des risques pour des maladies comme le cancer ou les maladies cardiovasculaires.
#3
Comment RNA-Seq aide-t-il à évaluer les facteurs de risque ?
Il analyse l'expression des gènes pour déterminer les facteurs de risque potentiels.
#4
Peut-on utiliser RNA-Seq pour des études épidémiologiques ?
Oui, il est utilisé pour étudier les facteurs de risque dans des populations spécifiques.
#5
L'RNA-Seq peut-il aider à identifier des risques environnementaux ?
Oui, il peut révéler comment les facteurs environnementaux influencent l'expression génique.
Contenu validé par Dr Olivier Menir
Expert en Médecine, Optimisation des Parcours de Soins et Révision Médicale
Validation scientifique effectuée le 29/03/2025
Contenu vérifié selon les dernières recommandations médicales
Auteurs principaux
Rency S Varghese
2 publications dans cette catégorie
Affiliations :
- Genomics & Epigenomics Shared Resource, Lombardi Comprehensive Cancer Center, Georgetown University Medical Center, Washington, DC, USA.
Publications dans "RNA-Seq" :
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RNA-Seq Data Analysis.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
-
Short-Read RNA-Seq.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
Habtom W Ressom
2 publications dans cette catégorie
Affiliations :
- Genomics & Epigenomics Shared Resource, Lombardi Comprehensive Cancer Center, Georgetown University Medical Center, Washington, DC, USA. hwr@georgetown.edu.
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Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
-
Short-Read RNA-Seq.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
Qi Zhao
2 publications dans cette catégorie
Affiliations :
- Oujiang Laboratory, Zhejiang Lab for Regenerative Medicine, Vision and Brain Health, Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang Province, China.
Publications dans "RNA-Seq" :
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Deep annotation of long noncoding RNAs by assembling RNA-seq and small RNA-seq data.
The Journal of biological chemistry 2023-08-04
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Functional evaluation of LTR-derived lncRNAs in porcine oocytes and zygotes with RNA-seq and small RNA-seq.
Frontiers in genetics 2022-10-13
Hongdi Cui
2 publications dans cette catégorie
Affiliations :
- Oujiang Laboratory, Zhejiang Provincial Key Laboratory of Medical Genetics, Key Laboratory of Laboratory Medicine, Ministry of Education, School of Laboratory Medicine and Life Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang Province, China.
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Xu Yang
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- Oujiang Laboratory, Zhejiang Provincial Key Laboratory of Medical Genetics, Key Laboratory of Laboratory Medicine, Ministry of Education, School of Laboratory Medicine and Life Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang Province, China.
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Frontiers in genetics 2022-10-13
Jörg Vogel
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Affiliations :
- University of Würzburg, Würzburg, Germany. joerg.vogel@uni-wuerzburg.de.
- Helmholtz Institute for RNA-based Infection Research, Helmholtz Centre for Infection Research, Würzburg, Germany. joerg.vogel@uni-wuerzburg.de.
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-
A MATQ-seq-Based Protocol for Single-Cell RNA-seq in Bacteria.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
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Analysis of the RNA and Protein Complexome by Grad-seq.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
Masahide Seki
2 publications dans cette catégorie
Affiliations :
- Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Kashiwa, Chiba, Japan.
Publications dans "RNA-Seq" :
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Evaluation and application of RNA-Seq by MinION.
DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
-
Single-Cell DNA-Seq and RNA-Seq in Cancer Using the C1 System.
Advances in experimental medicine and biology
Ayako Suzuki
2 publications dans cette catégorie
Affiliations :
- Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Kashiwa, Chiba, Japan.
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Sarun Sereewattanawoot
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- Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Kashiwa, Chiba, Japan.
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Advances in experimental medicine and biology
Yutaka Suzuki
2 publications dans cette catégorie
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- Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Kashiwa, Chiba, Japan.
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Advances in experimental medicine and biology
Zhaokui Cai
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Affiliations :
- Key Laboratory of RNA Biology, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.
- University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.
Publications dans "RNA-Seq" :
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RIC-seq for global in situ profiling of RNA-RNA spatial interactions.
Nature 2020-05-06
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Global in situ profiling of RNA-RNA spatial interactions with RIC-seq.
Nature protocols 2021-05-21
Changchang Cao
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Affiliations :
- Key Laboratory of RNA Biology, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.
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Nature 2020-05-06
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Rong Ye
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Affiliations :
- Key Laboratory of RNA Biology, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.
- University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.
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Nature 2020-05-06
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Nature protocols 2021-05-21
Naijing Hu
2 publications dans cette catégorie
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- Key Laboratory of RNA Biology, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.
- University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.
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RIC-seq for global in situ profiling of RNA-RNA spatial interactions.
Nature 2020-05-06
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Nature protocols 2021-05-21
Yuanchao Xue
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- Key Laboratory of RNA Biology, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China. ycxue@ibp.ac.cn.
- University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China. ycxue@ibp.ac.cn.
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RIC-seq for global in situ profiling of RNA-RNA spatial interactions.
Nature 2020-05-06
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Nature protocols 2021-05-21
Artyom A Egorov
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- Phystech School of Biological and Medical Physics, Moscow Institute of Physics and Technology (State University), Dolgoprudny, 141700, Russian Federation.
- Belozersky Institute of Physico-Chemical Biology, Lomonosov Moscow State University, Moscow, 119234, Russian Federation.
- Sirius University of Science and Technology, Sochi, 354340, Russian Federation.
Publications dans "RNA-Seq" :
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Ribo-Seq and RNA-Seq of
F1000Research 2021-11-16
Desislava S Makeeva
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- Belozersky Institute of Physico-Chemical Biology, Lomonosov Moscow State University, Moscow, 119234, Russian Federation.
- Sirius University of Science and Technology, Sochi, 354340, Russian Federation.
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Ribo-Seq and RNA-Seq of
F1000Research 2021-11-16
Nadezhda E Makarova
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- Belozersky Institute of Physico-Chemical Biology, Lomonosov Moscow State University, Moscow, 119234, Russian Federation.
- Sirius University of Science and Technology, Sochi, 354340, Russian Federation.
- Faculty of Bioengineering and Bioinformatics, Lomonosov Moscow State University, Moscow, 119234, Russian Federation.
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Ribo-Seq and RNA-Seq of
F1000Research 2021-11-16
Dmitri A Bykov
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- Belozersky Institute of Physico-Chemical Biology, Lomonosov Moscow State University, Moscow, 119234, Russian Federation.
- Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences, Moscow, 119991, Russian Federation.
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Ribo-Seq and RNA-Seq of
F1000Research 2021-11-16
Yanislav S Hrytseniuk
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- Belozersky Institute of Physico-Chemical Biology, Lomonosov Moscow State University, Moscow, 119234, Russian Federation.
- Department of Chemistry, Lomonosov Moscow State University, Moscow, 119234, Russian Federation.
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Ribo-Seq and RNA-Seq of
F1000Research 2021-11-16
Sources (10000 au total)
Practice patterns for reporting digestive system neuroendocrine neoplasms: results from a large, comprehensive international survey.
Criteria for the interpretation of digestive system neuroendocrine neoplasms (NENs) continue to evolve. Although there are some literature recommendations regarding workup and diagnosis of these lesio... We created an online survey with multiple questions pertaining to digestive NENs. The results were analysed based on type of practice setting, years of sign-out experience, and practice location. Resp... There existed scenarios wherein practice patterns varied despite recommendations in the literature, and there were also scenarios lacking clear guidelines wherein pathologists used varying judgement. ...
Efficacy and safety of a novel TKI (anlotinib) for the treatment of advanced digestive system neoplasms: a systematic review and meta-analysis.
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Intratumoral microorganisms in tumors of the digestive system.
Tumors of the digestive system pose a significant threat to human health and longevity. These tumors are associated with high morbidity and mortality rates, leading to a heavy economic burden on healt...
SURGICAL SITE INFECTION IN RESECTIONS OF DIGESTIVE SYSTEM TUMOURS.
Postoperative infectious complications are extremely important to surgeons and the entire medical care team. Among these complications, surgical site infection (SSI) appears to be one of the earliest ...
METTL14‑mediated RNA methylation in digestive system tumors.
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Diagnostic and Prognostic Roles of Thrombospondin-2 in Digestive System Cancers.
Cancers of digestive system have high case-fatality rate. It is important to find more appropriate methods in diagnosing and predicting gastrointestinal malignances. And thrombospondin-2 (TSP-2) was r... PubMed, Embase, Web of Science, Cochrane Library, and Clinicaltrial.gov were searched for relevant studies. Data were extracted from these involved records. For the meta-analysis of diagnostic test, b... Nine records were eligible for the analysis of diagnostic test. Pooled results were as follows: sensitivity 0.60 (0.52, 0.68), specificity 0.96 (0.91, 0.98), positive likelihood ratio (PLR) 15.4 (7.3,... TSP-2, as a diagnostic marker, has a high specificity but a moderate sensitivity. Meanwhile, it plays a role in predicting OS. Therefore, making TSP-2 a routine assay could be beneficial to high-risk ...
Role of m6A modification in immune microenvironment of digestive system tumors.
Digestive system tumors are huge health problem worldwide, largely attributable to poor dietary choices. The role of RNA modifications in cancer development is an emerging field of research. RNA modif...
Mechanism underlying circRNA dysregulation in the TME of digestive system cancer.
Circular RNAs (circRNAs) are a new series of noncoding RNAs (ncRNAs) that have been reported to be expressed in eukaryotic cells and have a variety of biological functions in the regulation of cancer ...